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文档简介

SAGE基因表达系列分析SerialAnalysisOfGeneExpression是通过快速和详细分析成千上万个EST(expresssequencedtags)来寻找出表达丰富度不同的SAGE标签序列。主要应用:全基因组基因表达分析、寻找差异基因、发现新基因。能同时对大量的转录物进行定性和定量的分析,可以同时反映正常或异常等不同功能状态下细胞整个基因组基因的全貌,特别对低丰度表达基因有较高的检测结果。它不但能快速详细的分析成千上万个基因转录子的丰富信息,还能发现新的基因。SAGE的原理SAGE的主要依据有两个:1、一个9~10碱基的短核苷酸序列标签包含有足够的信息,能够唯一确认一种转录物。例如,一个9碱基顺序能够分辨262144个不同的转录物,而人类基因组估计仅能编码80000种转录物,所以理论上每一个9碱基标签能够代表一种转录物的特征序列。2、如果能将9碱基的标签集中于一个克隆中进行测序,并将得到的短序列核苷酸顺序以连续的数据形式输入计算机中进行处理,就能对数以千计的mRNA转录物进行分析。

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