生化名词解释(同名7868)

《生物化学和分子生物学》名词解释PAGE4第二章蛋白质1、GSH即谷胱甘肽，是由谷氨酸，半胱氨酸和甘氨酸通过肽键缩合而成的三肽。2、蛋白质变性（proteindenaturation）蛋白质在某些物理和化学因素作用下其特定的空间构象被改变，从而导致其理化性质的改变和生物活性的丧失，这种现象称为蛋白质变性。3、α-螺旋(α-helix)蛋白质中常见的一种二级结构，肽链主链绕假想的中心轴盘绕成螺旋状，一般都是右手螺旋结构，螺旋是靠链内氢键维持的。每个氨基酸残基（第n个）的羰基氧与多肽链C端方向的第3个残基（第n＋3个）的酰胺氮形成氢键。在典型的右手α-螺旋结构中，螺距为0.54nm，每一圈含有3.6个氨基酸残基，每个残基沿着螺旋的长轴上升0.15nm。4、β-折叠片层(β-sheet)是蛋白质中的常见的二级结构，是由伸展的多肽链组成的。折叠片的构象是通过一个肽键的羰基氧和位于同一个肽链或相邻肽链的另一个酰胺氢之间形成的氢键维持的。氢键几乎都垂直伸展的肽链，这些肽链可以是平行排列（走向都是由N到C方向）；或者是反平行排列（肽链反向排列）。5、β-转角（β-turn）也是多肽链中常见的二级结构，连接蛋白质分子中的二级结构（α-螺旋和β-折叠），使肽链走向改变的一种非重复多肽区，一般含有2～16个氨基酸残基。含有5个氨基酸残基以上的转角又常称之环（loops）。常见的转角含有4个氨基酸残基，有两种类型。转角I的特点是：第1个氨基酸残基羰基氧与第4个残基的酰胺氮之间形成氢键；转角II的第3个残基往往是甘氨酸。这两种转角中的第2个残基大都是脯氨酸。6、功能蛋白质组（functionalproteome）

指的是特定时间、特定环境和实验各种下，基因组活跃表达的蛋白质。7、肽键(peptidebond)在蛋白质分子中，一分子氨基酸的α-羧基与另一分子氨基酸的α-氨基脱水缩合后而形成的酰胺键称为肽键。8、基序/模体（motif）模体属于蛋白质的超二级结构，由2个或2个以上具有二级结构的的肽段，在空间上相互接近，形成一个特殊的空间构象，并发挥专一的功能。一种类型的模体总有其特征性的氨基酸序列。9、结构域（domain）在蛋白质三级结构内的独立折叠单元。结构域通常都是几个超二级结构单元的组合。10、氨基酸残基在多肽链中的氨基酸，由于其部分基团参与了肽键的形成，剩余的结构部分则称氨基酸残基。它是一个分子的一部分，而不是一个分子。11、蛋白质二级结构（secondarystructureofprotein）指某段多肽链中主链骨架在局部空间有规律的盘绕和折叠，即蛋白质分子中某段肽链主链原子的相对空间位置，不包括与其他链段的相互关系及侧链构象的内容。12、蛋白质三级结构（Tertiarystructureofprotein）指在二级结构、模体的基础上，由于侧链R基团的相互作用，整条肽链进一步折叠和盘曲成球状分子，即整条肽链所有原子在三维空间的排布位置。13、蛋白质四级结构（Quaternarystructureofprotein）由两条或两条以上具有独立三级结构的多肽链以非共价键连接的空间排布和接触部位的布局称蛋白质的四级结构。14、别构效应（allostericeffect）当蛋白质（酶）与它的配体（某种小分子物质）结合后，引起蛋白质（酶）的空间结构（构象）发生改变，使其适合功能的需要，这种变化称别构效应或变构效应。15、盐析（Saltingout）向某些蛋白质溶液中加入某些无机盐溶液后，可以使蛋白质凝聚而从溶液中析出，这种作用叫作盐析，可复原。16、亚基（subunit）有四级结构的蛋白质的每条具有独立三级结构的多肽链称为亚基或亚单位。17、蛋白质的等电点（pI）溶液处于某一PH时，氨基酸解离成正负离子的趋势相等，即成为两性离子，净电荷为零，在电场中不向阳极也不向阴极移动，此时溶液的pH称为氨基酸的等电点。第三章核酸1、DNA变性在某些理化因素作用下，DNA分子互补碱基对之间的氢键断裂，使DNA双螺旋结构松散，变为单链，即为DNA变性。2、核酶（ribozyme）具有催化活性的RNA，即化学本质是核糖核酸RNA，却具有酶的催化功能。3、增色效应变性的DNA，分子两条互补链可完全解开成为两条单链，使得碱基暴露，260nm处紫外吸收增强，这种现象称为增色效应。4、Tm值即解链温度，DNA的变性从开始解链到完全解链，是在一个相当窄的温度内完成，在这一范围内，紫外光吸收值达到最大值50%时的温度称为DNA的解链温度，这一现象和结晶的融解过程类似，又称融解温度（Tm）。5、DNA超螺旋（DNAsupercoil）DNA双螺旋本身进一步盘绕称超螺旋。超螺旋有正超螺旋和负超螺旋两种。当盘旋方向与DNA双螺旋方向相同时，其超螺旋结构为正超螺旋，反之则为负超螺旋，负超螺旋的存在对于转录和复制都是必要的。6、hnDNA即核不均一RNA，是mRNA的前体。7、DNA复性DNA的复性指变性DNA在适当条件下，二条互补链全部或部分恢复到天然双螺旋结构的现象，它是变性的一种逆转过程。第四、五章酶1、同工酶（isoenzyme）能够催化相同的化学反应，而酶蛋白的分子结构、理化性质乃至免疫学性质不同的一组酶。2、酶活性中心（activecenter）酶分子中必需基团在一级结构上可能相距很远，但在空间结构上彼此靠近，构成具有特定动态构象的局部空间结构，直接参与酶促反应，与外部的底物特异地结合并使底物转变为产物的区域称为酶的活性中心或活性部位。3、Km值是当酶反应速度达到最大反应速度一半时的底物浓度的大小。4、共价修饰（covalentmodification）酶分子上某些特殊基团在其他酶作用下，发生可逆的共价结合而被修饰，并快速改变的活性称共价修饰调节或化学修饰。5、酶原（zymogen）在细胞内合成及初分泌时处于无活性状态的酶的前体。6、全酶（holoenzyme）酶蛋白和辅助因子结合形成的具有催化作用的复合物称为全酶。7、米氏方程（Michaelis-Mentenequation）表示酶促反应的起始速度与底物浓度关系的速度方程，V＝Vmax[S]/（Km+[S]）。8、别构酶（allostericenzyme）别构酶一种其活性受到结合在活性部位以外部位的其它分子调节的酶。9、辅酶（coenzyme）辅酶是一类可以将化学基团从一个酶转移到另一个酶上的有机小分子，与酶较为松散地结合，对于特定酶的活性发挥是必要的。10、辅基(prostheticgroup)酶的辅助因子或结合蛋白质的非蛋白部分，其中较小的非蛋白质部分称辅基，与酶或蛋白质结合的非常紧密，用透析法不能除去。第六章糖代谢1、糖酵解(glycolysis)糖无氧分解即糖酵解，是指葡萄糖在无氧条件下分解生成乳酸并释放出能量的过程。2、糖异生（gluconeogenesis）4、范登堡试验（VandenBerghreaction）用重氮试剂（重氮苯磺酸）与胆红素吡咯环上亚氨基反应，形成偶氮化合物，其在中性介质中呈紫红色，用来鉴别结合胆红素和未结合胆红素。第十二章DNA的生物合成1、半保留复制（semiconservativereplication）DNA的复制方式，亲代双链分离后，每条单链均作为新链合成的模板。因此，复制完成时将有两个子代DNA分子，且每个分子的核苷酸序列均与亲代分子相同。2、拓扑异构酶DNA拓扑异构酶是存在于细胞核内的一类酶，能够催化DNA链的断裂和结合，从而控制DNA的拓扑状态，以克服DNA复制过程中解链时产生的扭结现象。3、冈崎片段（Okazakifragment）DNA双链进行半保留复制时，在DNA后随链的不连续合成期间生成的片段。4、复制叉（replicationfork）DNA复制时在DNA链上通过解旋、解链和SSB蛋白的结合等过程形成的Y字型结构称为复制叉。在复制叉处，作为模板的双链DNA解旋，同时合成新的DNA链。5、端粒酶（telomerase）是基本的核蛋白逆转录酶，可将端粒DNA加至真核细胞染色体末端。6、前导链（leadingstrand）与复制叉移动的方向一致，通过连续的5ˊ-3ˊ聚合合成的新的DNA链。7、后随链（laggingstrand）与复制叉移动的方向相反，通过不连续的5ˊ-3ˊ聚合合成的新的DNA链。8、半不连续复制(Semi-ondisctinuousreplication)DNA复制的基本过程，指DNA复制时，前导链上DNA的合成是连续的，后随链上是不连续的，故称为半不连续复制。9、Klenow片段（Klenowfragment）E.coli（大肠杆菌）DNA聚合酶I经部分水解生成的C末端605个氨基酸残基片段。该片段保留了DNA聚合酶Ⅰ的5ˊ-3ˊ聚合酶和3ˊ-5ˊ外切酶活性，但缺少完整酶的5ˊ-3ˊ外切酶活性。10、引发体（primosome）蛋白复合体，主要成份是引物酶和DNA解旋酶，是在合成用于DNA复制的RNA引物时装配的。引发体与DNA结合后随即由引物酶合成RNA引物。11、反转录（reversetranscription）反转录是以反义RNA为模板通过反转录酶合成DNA的过程，也称逆转录，是DNA生物合成的一种特殊方式。12、滚环复制（rolling-circlereplication）噬菌体中常见的DNA复制方式。亲代DNA的一条链在复制起点处被切开，其5ˊ端游离出来。这样，DNA聚合酶Ⅲ便可以将脱氧核糖核苷酸聚合在3ˊ-OH端。当复制向前进行时，亲代DNA上被切断的5ˊ端继续游离下来，并且很快被单链结合蛋白所结合。因为5ˊ端从环上向下解链的同时伴有环状双链DNA环绕其轴不断的旋转，而且以3ˊ-OH端为引物的DNA生长链则不断地以另一条环状DNA链为模板向前延伸，因而称为滚环复制。13、双向复制（bidirectionalreplication）DNA合成时从一个单独的复制起始点上形成两个复制叉，然后相背而行，这种复制方式称为双向复制。第十三章RNA的生物合成1、启动子（Promoters）RNA聚合酶特异性识别和结合的DNA序列，指导着RNA复制，控制基因表达（转录）的起始时间和表达的程度。2、核心酶（coreenzyme）大肠杆菌的RNA聚合酶全酶由5个亚基组成σ、β、βˊ和两个α亚基，可写作α2ββˊσ，失去σ亚基的叫核心酶（α2ββˊ）。3、RNA聚合酶（RNApolymerase）以一条DNA链或RNA为模板催化由核苷-5′-三磷酸合成RNA的酶，是催化以DNA为模板、三磷酸核糖核苷为底物、通过磷酸二酯键而聚合的合成RNA的酶，也称转录酶。4、内含子（introns）基因内的间隔序列，不出现在成熟的RNA分子中，在转录后通过加工被切除。大多数真核生物的基因都有内含子。5、外显子(expressedregion)真核生物基因的一部分，它在剪接后仍会被保存下来，所有的外显子一同组成了遗传信息，并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。6、RNA剪接（RNAsplicing）从DNA模板链转录出的最初转录产物中除去内含子，并将外显子连接起来形成一个连续的RNA分子的过程。7、不对称转录（Asymmetrictranscription）有两方面含义：一是DNA分子双链上的某一区段，一股链用作模板指引转录，另一股链不转录；其二是模版链并非永远在同一单链上。8、转录（transcription）是遗传信息从DNA到RNA的转移。即以双链DNA中的一条链为模板，以4种核苷三磷酸为原料，在RNA聚合酶催化下合成RNA的过程。9、转录因子(transcriptionfactor)一些蛋白质因子可以直接或间接结合RNA聚合酶，通过识别DNA序列中的顺式作用元件而调节启动转录，这类蛋白质因子称为转录因子。10、核酶（ribozyme）是具有催化功能的RNA分子，是生物催化剂，又称核酸类酶、酶RNA、核酶类酶RNA。11、剪接体（splicesome）进行RNA剪接时形成的多组分复合物，其大小为60S，主要是由小分子的核RNA和蛋白质组成，具有识别mRNA前体的5′剪接位点、3′剪接位点和分支点的功能。12、RNA复制（RNAreplication）以RNA作为基因组的病毒称为RNA病毒，这类病毒除逆转录病毒外，在宿主细胞都是以病毒的单链RNA为模板合成RNA，这种RNA依赖的RNA合成称为RNA复制。第十四章蛋白质的生物合成1、遗传密码（geneticcodon）mRNA上每三个相邻的核苷酸的特定排列顺序，在蛋白质合成中体现为某种氨基酸或其合成的起始和终止信号，统称为遗传密码，或三联体密码。2、SD序列（Shine-Dalgarno）核糖体小亚基内部的16SrRNA的3′端，有富含嘧啶的序列，而在mRNA上起始密码子AUG上游的5′端处大约有10个核苷酸，为富含嘌呤碱基的序列，称为SD序列，又称为核糖体结合位点（RBS）。3、起始密码子（initiatorcodon）为AUG，它除作为起始信号外，还代表蛋氨酸密码(原核生物在起始位代表甲酰蛋氨酸）。4、终止密码子（terminatorcodon）为UAA、UAG和UGA，不代表任何氨基酸，又称无义密码。5、翻译（translation）mRNA核苷酸排列顺序和蛋白质氨基酸排列顺序存在一种特殊关系，就好象从一种语言翻译成另一种语言的情形相似，故把mRNA到蛋白质过程称为翻译，即蛋白质的生物合成。6、反密码子（anticodon）tRNA看上去像三叶草形，其一端是携带氨基酸的部位，另一端有3个碱基，这3个碱基可以与mRNA上的密码子互补配对，因而叫反密码子。7、氨酰-tRNA活化氨基酸转移到tRNA分子上，与tRNA的-CCA中腺苷酸所含的核糖3′位的游离羟基以酯键结合，形成相应的氨酰-tRNA。8、信号肽（signalpeptide）N-端的一段疏水氨基酸组成的肽，约由15～30个氨基酸残基构成。9、核蛋白体循环（ribosomecycle）狭义：肽链的延长。包括进位、转肽、移位、脱落的连续循环过程，每循环一次肽链延长一个氨基酸，此过程也称核糖体循环。广义：以氨基酰tRNA形式存在的活化氨基酸，即可投入氨基酸缩合成肽的过程，此过程称为核糖体循环或核蛋白循环。10、分子伴侣（molecularchaperones）一类在序列上没有相关性但有共同功能的蛋白质，它们在细胞内帮助其他含多肽的结构完成正确的组装，而且在组装完毕后与之分离，不构成这些蛋白质结构执行功能时的组份。11、干扰素（interferon，IF）病毒感染真核细胞后由宿主细胞释放的蛋白质因子。能作用于邻近细胞，诱导产生抗病毒蛋白，从而抑制病毒的繁殖。12、开放阅读框架（openreadingframe，ORF）按5′至3′方向，从mRNA上起始密码子AUG开始，连续读取密码子，一直到终止密码子，即为编码区域。如果这一段密码子序列编码有功能的多肽链，可称为一个开放阅读框架。第十五章基因表达调控1、顺式作用元件（cis-actingelement）位于基因旁侧调节（激活或阻遏）基因转录的DNA序列。2、反式作用因子（trans-actingfactor）直接或间接与顺式作用元件相互作用并影响基因表达的蛋白质，统称为反式作用因子。3、转录因子（transcriptionfactor）与顺势作用元件特异结合并启动转录的调节蛋白。4、阻遏物（repressor）基于某种调节基因所制成的一种控制蛋白质，具有抑制特定基因、产生特征蛋白质的作用。5、操纵子（Operon）原核生物结构基因及其表达调控序列共同组成的基因表达调控单元。6、结构基因（Structuralgene）是决定合成某一种蛋白质分子结构相应的一段DNA。结构基因的功能是把携带的遗传信息转录给mRNA,再以mRNA为模板合成具有特定氨基酸序列的蛋白质。7、亮氨酸拉链（leucinezipper）以同二聚体和（或）异二聚体形成的卷曲螺旋或纤维状的蛋白质。8、锌指基序（zincfinger）由25~30个保守的组氨酸-半胱氨酸残基与Zn2+配位结合并形成稳定紧凑的小结构域。9、增强子（enhancer）、端增强子元件（distantenhancerelement）能加强上游或下游基因转录的效率的DNA序列，又称远端增强子元件。10、沉默子（slilencer）与增强子的作用相反，能一直上游或下游基因转录的DNA序列。11、结构域（domain）许多大分子蛋白质中，其三级结构通常被分割为一个或数个球形或纤维状的区域，它们折叠得较为紧密，各行其功能。12、羧基末端结构域（CTD）RNAPⅡ最大亚基的羧基末端有一共有序列（Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser）的重复序列片段，这是一段由羧基氨基酸为主组成的重复序列，称为羧基末端结构域。13、单顺反子（monocistron）真核基因转录产物为单顺反子，即一种基因编码一种多肽链或RNA链，每个基因转录有各自的调节元件。14、多顺反子(polycistronic)在原核细胞中，通常是几种不同的mRNA连在一起，相互之间由一段短的不编码蛋白质的间隔序列所隔开，这种mRNA叫做多顺反子mRNA。15、RNA编辑(RNAediting)指在mRNA水平上改变遗传信息的过程。具体指基因转录产生的mRNA分子中，由于核苷酸的缺失，插入或置换，基因转录物的序列不与基因编码序列互补，使翻译生成的蛋白质的氨基酸组成，不同于基因序列中的编码信息现象。16、断裂基因（splitgene）真核生物结构基因，由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成，去除非编码区再连接后，可翻译出连续氨基酸组成的完整蛋白质，这些基因称为断裂基因。第十七章细胞信号转导1、受体（receptor）细胞膜或细胞内的一些天然分子，能够识别和结合有生物活性的化学信号物质（配体），从而启动一系列信号转导，最后产生相应的生物效应，多为糖蛋白。2、G蛋白(GTPbindingprotein)具有GTP酶活性，在细胞信号通路中起信号转换器或分子开关作用的蛋白质。3、MAPK(mitogen-activatedproteinkinases)即促分裂原活化蛋白激酶，一种丝氨酸/苏氨酸激酶，是真核生物信号传递网络中的重要途径之一，在基因表达调控和细胞质功能活动中发挥关键作用。4、第二信使（secondmessenger）是细胞外信号分子作用于细胞膜后产生的细胞内信号分子。5、PTK(phosphotyrosinekinase)酪氨酸激酶，可以催化酪氨酸残基自身磷酸化的蛋白激酶，分为受体酪氨酸蛋白激酶和非受体酪氨酸蛋白激酶。6、RTK（receptorproteintyrosinekinases）受体型蛋白酪氨酸激酶，受体本身具有PTK的活性，发生二聚体后自身具备活性并催化胞内区酪氨酸