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文档简介
第五章
核苷酸
提要
一、碱基
二、核苷
三、核苷酸
碱基
嘧啶
①胞嘧啶(DNA,RNA)②尿嘧啶(RNA)③胸腺嘧啶(DNA)嘌呤
①腺嘌呤(DNA,RNA)②鸟嘌呤(DNA,RNA)嘧啶环和嘌呤环的编号以及各种碱基的化学结构
茶碱和咖啡因的化学结构
碱基的性质
?碱基几乎不溶于水,这与其芳香族的杂环结构有关。
?互变异构
?酸碱解离
?强烈的紫外吸收,其最大吸收值在260nm。
碱基的互变异构
核糖和脱氧核糖
?D-核糖
存在于RNA?2-脱氧-D-核糖
存在于DNA?差别:-2'-OHvs2'-H?这种差别影响到二级结构和稳定性。
核苷
?核苷是由戊糖和碱基通过β-N糖苷键形成的糖苷。核苷中的戊糖有D-核糖和2-脱氧-D-核糖两种,它们都以呋喃型环状结构存在。前者形成核糖核苷,后者形成脱氧核苷。核苷中的糖苷键由戊糖的异头体C原子与嘧啶碱基的N1或嘌呤碱基N9形成。为了避免碱基环上原子的编号与呋喃糖环上原子编号混淆,在呋喃环上各原子编号的阿拉伯数字后需加“′”.
?在核苷中,碱基在糖苷键上的旋转受到空间位阻的限制。结果核苷和核苷酸能以顺式和反式两种构象存在。顺式核苷的碱基与戊糖环在同一个方向,反式核苷的碱基与戊糖环在相反的方向。
?由于嘧啶环O2和戊糖环C5′之间的空间位阻,嘧啶核苷通常为反式构象。嘌呤核苷可采取两种构象。自由的嘌呤核苷(特别是鸟苷)更容易形成顺式构象,但是,DNA和RNA螺旋中的嘌呤核苷主要为反式构象。
嘧啶核苷和嘌呤核苷的化学结构
几种修饰核苷
核苷酸
?核苷酸是核苷的戊糖羟基的磷酸酯。核糖核苷的磷酸酯为核糖核苷酸,脱氧核苷的磷酸酯为脱氧核苷酸。理论上,核苷的5′-OH、3′-OH和2′-OH均可以被磷酸化而分别形成核苷-5′-磷酸、核苷-3′-磷酸和核苷-2′-磷酸。但是,自然界的核苷酸多为核苷-5′-磷酸。
?核苷单磷酸(NMP)是指核苷的单磷酸酯。核苷单磷酸可以通过一次成酐反应形成核苷二磷酸(NDP)。核苷二磷酸再通过一次成酐反应生成核苷三磷酸(NTP)。为了将核苷二磷酸和核苷三磷酸上不同的磷酸根区分开来,将直接与戊糖5′-羟基相连的磷酸定为α磷酸根,其余两个磷酸根从里到外依次被称为β磷酸根和γ磷酸根。
常见的核糖核苷酸的化学结构
AMP、ADP和ATP环核苷酸的化学结构
核苷酸的生物功能
①能量货币,通常是ATP,有时使用UTP(糖原合成)、CTP(磷脂合成)和GTP(蛋白质合成);
②核酸合成的前体:NTP→RNA,dNTP→DNA;
③信息传导,例如cAMP和cGMP作为某些激素的第二信使,鸟苷酸能构调节G蛋白的活性;
④作为其它物质的前体或辅酶/辅基的成分,如ADP为辅酶I和II的组分,鸟苷酸作为第一类内含子的辅酶;
⑤活化的中间物,如UDPGlc和CDP-乙醇胺分别参与糖原和磷脂酰乙醇胺的合成;
⑥作为酶的别构效应物参与代谢的调节,如ATP为磷酸果糖激酶-1的负别构效应物,AMP作为糖原磷酸化酶的正别构效应物;⑦调节基因表达。例如鸟苷-5‘
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