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文档简介
转座子和逆转座子演示文稿目前一页\总数五十五页\编于一点(优选)转座子和逆转座子目前二页\总数五十五页\编于一点DiscoveryofTransposableElementsMcClintock’sexperimentsinmaize:theDselement
1940-19503转座因子的发现目前三页\总数五十五页\编于一点印第安彩虹玉米,具有从最大到最小易于区分的10对染色体。解离因子
(Dissociation,Ds):locatedatthesiteofthebreak激活因子
(Activator,Ac)
:unlinkedgeneticfactor4目前四页\总数五十五页\编于一点5目前五页\总数五十五页\编于一点
TransposableelementinE.coli
,
19606目前六页\总数五十五页\编于一点转座子的分类7非复制性的转座(占已经发现的多数)复制性逆转座逆转座病毒样的转座子目前七页\总数五十五页\编于一点第一节细菌的转座因子TransposableelementsinBacteria
两大类:简单转座因子:只包含和转座有关的基因序列。Simpletransposableelements
whichcarryonlytheinformationrequiredformovement.复合转座因子:除了含有与转座相关的基因外还有其它基因(如抗生素抗性基因)。ComplextransposableelementswhichcontainDNAsequencesnotdirectlyrelatedtotransposition.8目前八页\总数五十五页\编于一点1.插入序列
(Insertionsequences,IS)
9不含任何宿主基因的可转位的DNA序列,是最简单的转座因子。目前九页\总数五十五页\编于一点插入序列的结构ThestructureofISelement10目前十页\总数五十五页\编于一点11正向重复序列反向重复序列目前十一页\总数五十五页\编于一点12目前十二页\总数五十五页\编于一点插入序列末端两重复序列高度相似但不完全相同。AnISelementendsinshortinvertedterminalrepeats;usuallythetwocopiesoftherepeatarecloselyrelatedratherthanidentical.插入序列的中间序列常具有编码转座酶的功能。ISelementscodeforthetransposase.插入序列转座后常导致靶位点的重复。WhenanISelementtransposes,asequenceofhostDNAatthesiteofinsertionisduplicated.13插入序列特点:目前十三页\总数五十五页\编于一点DuplicationofashortsequenceofDNAattheinsertionsite14目前十四页\总数五十五页\编于一点TheISelementsarenormalconstituentsofbacterialchromosomesandplasmids.15目前十五页\总数五十五页\编于一点FormationofaconjugativeRplasmidbyrecombinationbetweenISelements16(Resistancetransferfactore,RTF)细菌耐药性目前十六页\总数五十五页\编于一点2.复合转座子CompositeTransposons
CompositetransposonscontainavarietyofgenesthatresidebetweentwonearlyidenticalISelements.CompositetransposonisdesignatedbyTn,followedbyanumber.17四环素目前十七页\总数五十五页\编于一点18氯霉素四环素卡拉霉素目前十八页\总数五十五页\编于一点一些复合转座子两端的IS序列完全相同的,如Tn9和Tn903。Insomecases,ISmodulesareidentical,suchasTn9(directrepeatsofIS1)orTn903(invertedrepeatsofIS903).另外一些转座子中,IS非常相似但不完全相同,因而用R和L表示。Inothercases,themodulesarecloselyrelated,butnotidentical.SowecandistinguishtheLandRmodulesinTn10orinTn5.复合转座子特点:目前十九页\总数五十五页\编于一点Aschematicmapofaplasmidcarryingsimpleandcompositetransposon-resistancegenes.20目前二十页\总数五十五页\编于一点IS序列既可以自我转座又可以和复合转座子共同转座。AfunctionalISmodulecantransposeeitheritselfortheentiretransposon.当IS序列完全相同时,两者均可独立进行转座。WhenthetwoISmodulesareidentical,eithermodulecansponsorthetransposition.当IS序列不完全相同时,两者之一引发转座,L。Whenthemodulesaredifferent,transpositioncandependononeofthemodules目前二十一页\总数五十五页\编于一点3.非复合型转座子Noncompositetransposons22转座酶抑制酶氨苄青霉素抗性反向重复序列目前二十二页\总数五十五页\编于一点23共整合体目前二十三页\总数五十五页\编于一点第二节真核生物的转座因子
TransposableElementsinEukaryotesDNA转座子
(cutandpastetransposons)AcandDselementsinmaizePelementsinDrosophila反转座子(Retrotransposons)24目前二十四页\总数五十五页\编于一点1.玉米的Ac-Ds转座系统
(TheAc-Dssysteminmaize)BarbaraMcClintock(1902-1992)1940s~1950s1983NobelPrize25目前二十五页\总数五十五页\编于一点26Movie目前二十六页\总数五十五页\编于一点玉米中转座因子效应27?目前二十七页\总数五十五页\编于一点28目前二十八页\总数五十五页\编于一点其它植物中的转座因子Transposableelementinotherplantspeassnapdragons29SBE直链支链目前二十九页\总数五十五页\编于一点杂交劣育(Hybriddysgenesis):aconditioncausingsterility,elevatedmutationrate,andachromosomerearrangementintheoffspringofcrossesbetweencertainstrainsoffruitflies.
302.果蝇的P因子
PelementtransposonsinDrosophilia目前三十页\总数五十五页\编于一点31目前三十一页\总数五十五页\编于一点32反向重复序列体细胞生殖细胞终止密码子阻遏蛋白转座酶目前三十二页\总数五十五页\编于一点66KD的转座阻遏蛋白是造成现象差异的主要原因。(The66KDrepressorproteinisprovidedasamaternalfactorintheegg)33目前三十三页\总数五十五页\编于一点P-element-mediatedgenetransferinDrosophila34目前三十四页\总数五十五页\编于一点3.反转录病毒与反转座子
RetrovirusesandRetroposons
反转录病毒:单链的RNA病毒,依靠独立的双链DNA中间体结构进行感染。Retroviruses
aresingle-strandedRNAanimalvirusesthatemployadouble-strandedDNAintermediateforreplication.35目前三十五页\总数五十五页\编于一点36目前三十六页\总数五十五页\编于一点※Thelifecycleofaretrovirus※37目前三十七页\总数五十五页\编于一点Thetypicalgenomeofaretroviruscontainsgag,pol,andenvgenes逆转录病毒基因表达38菱形衣壳蛋白外壳蛋白逆转录酶病毒侧翼序列目前三十八页\总数五十五页\编于一点逆转录病毒可随机整合到宿主细胞。TheviralDNAintegratesintothehostgenomeatrandomlyselectedsites.有时(几率较小)逆转录病毒可能将宿主细胞转化为肿瘤细胞。Sometimes(probablyratherrarely),theintegratedretroviruscanconvertahostcellintoatumorigenicstatethroughactivatingcertaintypesofhostgenes.39目前三十九页\总数五十五页\编于一点40启动子增强子目前四十页\总数五十五页\编于一点逆转座子(Retroposon)
逆转录转座子指通过RNA为中介,反转录成DNA后进行转座的转座因子。逆转座作用出现在真核生物。
(TransposableelementsthatutilizereversetranscriptasetotransposethroughanRNAintermediatearetermedretrotransposons.)退化的逆病毒目前四十一页\总数五十五页\编于一点42目前四十二页\总数五十五页\编于一点
逆转座子在真核生物中可分为两类:
病毒样逆转座子
(Viralretrotransposons):
与反转录病毒结构类似,不同之处在于不形成病毒颗粒。
如YeastTyelements,Drosophila
copia
elements
非病毒样逆转座子
(Nonviralretrotransposons)
:
不形成逆转录酶和整合酶,依靠外源提供的转座酶,真核生物基因组中所占比例最高。
LINEs(longinterspersedelements)and
SINEs
inmammals43目前四十三页\总数五十五页\编于一点病毒与真核生物基因组中逆转座子结构比较44鼠白血病毒目前四十四页\总数五十五页\编于一点酵母TY系列(YeastTyelements)About35Ty1copiesintheyeastgenome.
δsequences:330bp,about100copies.soloδelement.45目前四十五页\总数五十五页\编于一点**3.Basesubstitutionformarkingoneδ
TranspositionthroughanRNAintermediate462.半乳糖诱导启动子1实验证明:目前四十六页\总数五十五页\编于一点Drosophila
copiaelements47目前四十七页\总数五十五页\编于一点转座因子的频率不同的转座因子的转座频率不同。每个世代转座频率约为10-3~10-4
。Newgerm-linetranspositionsareestimatedtooccuronceinevery50to100humanbirths.每个世代中转座插入靶位点使某个基因所引起的突变和自发突变概率相当,约为10-5~
10-7
。48第三节转座的遗传学效应
Geneticeffectoftransposition目前四十八页\总数五十五页\编于一点49TransposableelementsasgeneticparasitesReplicationandspreadofTesmayservenopurposeforthecell.TheinsertionofTesintoagenewilloftendestroyitsfunction,withharmfulconsequencesforthecell.ThetimeandenergyrequiretoreplicatelargenumbersofTesarelikelytoplaceametabolicburdenonthecell.目前四十九页\总数五十五页\编于一点人类中的转座子ElementtypeLengthCopiesingenome%ofgenomeLINEs1-6kb850,00021SINEs100-500bp1,500,00013%LTRelements<5kb443,0008DNAelements80-300bp294,0003Unclassified-3,0000.1%50目前五十页\总数五十五页\编于一点Repetitiveeleme
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