并行安装vasp步骤

intelfortran9.1.036安装过程IntelFortranCompiler这个编译器性能极佳，它在x86和Itanium级Linux主机上会有光明的未来，因为Intel的编译器组整合了曾在DEC、Compaq和HP确立声誉的工程团队。它的发行版有Windows和Linux两种，这2种都分别提供Non-Commercial版免费下载，但不提供技术支持。而性能则与商业版相同。其中Windows版需要VisualStudio的支持才可以使用。以下是整个的安装过程。1、 登陆intel网站下载Non-commercial版。登陆/software/products/global/eval.htm，选择Intel?FortranCompilerforLinux*下的第二项Non-CommercialUnsupportedVersion点击进入。或者直接登陆/software/products/compilers/flin/noncom.htm，简单的看一下说明，整个下载过程需要好几步，可以慢慢来进行，首先点击“Continue”按钮进入下一页；第二页有个调查表，填好之后进入下一页；第二页有个调查表，填好之后进入下一页；第三页是软件协议页面，可以粗略看一下，选择“Accept”进入下一页；第四页是注册页面，其中Email栏一定要填好，填写之后选择“Submit”进入下一页；这是最后一页，说明已经注册成功，intel会给你发一封电子邮件，并且其中包含一个协议附件。剩下的工作是收取邮件，然后根据邮件中提供的地址下载软件即可。我这里下载的软件是l_fc_p_9.1.036.tar.gz，大约130M，另外把邮件中的附件另存在刚才下载的软件的同一目录下，我这里的文件名是l_for_******.lic，每个人的文件名可能不同，它是一个协议文件。下来以root用户进行以下的安装工作，假设前面的2个文件存放在/usr/src/intel目录下，这也是我们的工作目录：2、 解压安装文件tarxzvfl_fc_p_9.1.036.tar.gz3、安装并指定协议，我们这里编译器的是安装在/opt/intel_fc_91目录下，协议则在该目录下的*s文件夹中。最后还要指定*s的位置。mkdir-p/opt/intel_fc_91/*scp/usr/src/intel/*.lic/opt/intel_fc_91/*sexportINTEL_LICENSE_FILE=opt/intel_fc_91/*s4、 装程序进行安装cd/usr/src/intel/l_fc_p_9.1.036./install.sh正确的话，会看到下面的提示：ThefollowingIntel(R)productsandrelatedproductsareinstalled.Intel(R)FortranCompilerfor32-bitapplications,Version8.0LinuxApplicationDebuggerfor32-bitapplications,Version7.3.1Whichofthefollowingwouldyouliketoinstall?Intel(R)FortranCompilerfor32-bitapplications,Version8.0LinuxApplicationDebuggerfor32-bitapplications,Version7.3.1x.Exit先选择1安装IntelFortranCompiler，默认安装即可，默认目录就是/opt/intel_fc_91。安装编译器完成之后，继续可以安装LinuxApplicationDebuggerfor32-bitapplications,Version7.3.1，选择2即可，它默认安装在/opt/intel_idb_73下。最后选择x退出安装程序。5、 现在安装完成，可以删掉安装文件lcd/usr/srcrm-rfintel6、 退出root用户的登陆，然后以一个个人用户登陆，登陆以后修改用户根目录下的.bash_profile文件，在最后一行加入这么一行：./opt/intel/fc/bin/ifortvars.sh注：其中点号之后有空格。然后重新登陆或者：source.bash_profile这样一切安装与配置就完成了，可以简单的测试一下。编辑一个简单的源文件first.f90。(在终端输入vifirst.f90编辑源代码esc键，shift:wq保存退出)programfirstprint*,“HelloWorld!print*,sin(123.4)endprogramfirst下来编译，编译命令与以前版本的IntelFortranCompiler不同，以前采用的是ifc命令，从这个版本开始将使用ifort命令ifortfirst.f90-ofirst运行./first将显示HelloWorld!-0.7693915这说明一切OK,可以正常使用该编译器了。ifort的具体使用可以用ifort-help获得详细帮助，一般用法类似于g77和gcc。在/opt/intel_fc_91/doc下有详细的使用文档，有pdf格式文档也有htm格式网页文档。标题:ifc和mpich并行编译vasp(个人经验)(interfortran10.1.018,mpich-2,fftw3.1.12，GOTOBlas1/24,vasp4.6并行编译(parralcomplice))我是在Redhat7.3和8.0的机器上，用ifc6.01版本，mpich-，编译vasp4.6版本。BLAS:采用libgoto_p4_512-r0.94.soLAPACK:采用vasp.4.lib中的lapack_double.o大致步骤如下：这里不再讲述ifc的安装，假设ifc已经安装好了。1、 下载mpich-，并安装。从/mpi/mpich/downloads/mpich.tar.gz下载。使用命令tarxzvfmpich.tar.gz来解压它。得到mpich-目录。进入该目录，以此使用下面的命令：./configure--prefix=/usr/local/mpich-rsh=ssh--with-cflags=-O\-f90="ifc-FR-lowercase"--with-f77flags=-O--without-romio-fc=ifc还是：-f90="ifort-FR-lowercase"--with-f77flags=-O--without-romio-fc=ifortmake改用root帐号，进入改目录进行安装。makeinstall则把mpich安装到/usr/local/mpich目录。2、 设置与mpich有关的环境变量在主目录下把下面的几行加入.bash_profile文件中exportPATH=$PATH:/usr/local/mpich/binexportMPI_USEP4SSPORT=yesexportMPI_P4SSPORT=22exportP4_RSHCOMMAND=ssh然后采用下面的命令更新该文件..bash_profile或source.bash_profile3、 采用mpif90来编译vasp这里假设把libgoto_p4_512-r0.94.so放在/usr/local/lib目录中。进入vasp.4.lib目录中，编辑gotoblas(GotoBLAS的安装遏程(Core2Duo)舆如何加入VASP渺亍瀚睾)把/usr/local/gotoblas/include/libgoto.alibgoto_core2p-r1.14.alibgoto_core2p-r1.14.so系统曹自勤依你的CPU型式来取名将所得到的3彳固重要函式康其中之一，丢逵vasp.4.lib内把makefile.linux_ifc_P4拷贝成makefile修改makefile中FC=ifort键入make命令，开始编译得到libdmy.a进入vasp.4.6目录中，1.并行编译fftw3(详见fftw安装指南)并行编译./configure--prefix=/home/tlu--with-gcc--disable-fortran--enable-mpi拷贝/usr/local/fftw/include/fftw3.f(fftw3.hfftw3.mpi)把makefile.linux_ifc_P4拷贝成makefile把第50行的FC=ifc前加上注释号，也就是#第80行至82行的CPP有关内容加上注释号，改成下面的#CPP=$(CPP_)-DHOST=\"LinuxIFC\"\-Dkind8-DNGXhalf-DCACHE_SIZE=12000-DPGF90-Davoidalloc\-DRPROMU_DGEMV-DRACCMU_DGEMV把第136行的BLASBLAS=/opt/libs/libgoto/libgoto_p4_512-r0.6.so该成如下的内容：BLAS=/usr/local/lib/libgoto_p4_512-r0.94.so我的为：BLAS=/vasp/src/vasp.4.lib/libgoto_core2p-r1.14.so把第166行和167行有关FFT3D的行前加上注释号，如下面的#FFT3D =fft3dfurth.offt3dlib.o#FFT3D =fftw3d.offt3dlib.o/opt/libs/fftw-3.0.1/lib/libfftw3.a把202行和203行的FC等改为如下的内容：FC=mpif90FCL=$(FC)把212行有关CPP的行前的注释号去掉，改成如下的内容：CPP=$(CPP_)-DMPI-DHOST=\"LinuxIFC\"-DIFC\-Dkind8-DNGZhalf-DCACHE_SIZE=4000-DPGF90-Davoidalloc\-DMPI_BLOCK=500\-DRPROMU_DGEMV-DRACCMU_DGEMV把226和227行有关SCA的行，加上注释号，改成如下的#SCA=$(SCA_)/libscalapack.a\#$(BLACS)/LIB/blacsF77init_MPI-LINUX-0.a$(BLACS)/LIB/blacs_MPI-LINUX-0.a$(BLACS)/LIB/blacsF77init_MPI-LINUX-0.a表小不用scalapack库。把239和243行有关FFT3D的行，改成如下的内容：FFT:fftmpi.owithfft3dlibofJuergenFurthmuellerFFT3D=fftmpi.offtmpi_map.offt3dlib.offtw.3.0.1isslighlyfasterandshouldbeusedifavailable#FFT3D=fftmpiw.offtmpi_map.offt3dlib.o/opt/libs/fftw-3.0.1/lib/libfftw3.a我的为FFT:fftmpi.owithfft3dlibofJuergenFurthmueller#FFT3D=fftmpi.offtmpi_map.offt3dlib.offtw.3.0.1isslighlyfasterandshouldbeusedifavailableFFT3D=fftmpi.o(原软件为：fftmpiw.o因vasp此处报错所以修改)fftmpi_map.offt3dlib.o/opt/libs/fftw-3.0.1/lib/libfftw3.a把这些都修改后，保存。再make。就好了。GotoBLAS的安装遏程(Core2Duo)舆如何加入VASP逵行褊言睾下戴位置：/resources/software/software.php?免费登言己言主册，即可下戴现在最新版本是2007.03.21养睾出的GotoBLAS-1.14.tar.gz，已完全支援Core2Duo彳系列其中新版安装方式非常人性化，舆在Linux的sourcecode使用configure方式略有不同辇寸Linux底下使用x86和x86_64CPU者，提供一侗快速安装的script，可快速筒测你的SMP和褊^器丰重羹朗至於支援的褊言睾器丰重羹页依此』原序舄依披PathScale一PGI—Intel一gfortran一g95—g77Step1：解凰编tarzxvfGotoBLAS-1.14.tar.gzStep2：安装GotoBLAS,在32bit和64bit的安装分别如下For32bit安装：./quickbuild.32bitFor64bit安装：./quickbuild.64bit安装完彳爰，即曹把函式康建在网搁。解厘编彳爰的资料夹内以Core2Duo舄例，曹主要走生3侗禧案libgoto.alibgoto_core2p-r1.14.a系统曹自勤依你的CPU型式来取名libgoto_core2p-r1.14.so若舄特殊檄器，则需藉由改舄getarch.c和Makefile.rule,将符合本身檄器的参敷前面言主养睾拿掉，业重新褊^即可走生函式康，主要安装遏程言青^^Quickinstallat.txtNote:(安装完后的提示如下)Done.Thislibraryiscompiledwithfollowingconditions.Binary...64bitFortran...INTELSMP...Enabled.Youhavetolinklibrarywith-lpthreadoption. 装哉GotoBLAS照非就是想言襄vasp的斡行速度加快，如何修改Makefile?步骤如下Step1：将所得到的3侗重要函式康其中之一，丢逵vasp.4.lib内，或另言殳资料夹将其置入/vasp/src/vasp.4.lib/libgoto_core2p-r1.14.soStep2：修改Makefile的BLAS路彳至，先将全部售有的BLAS路彳至以#符虢注养睾起来，而彳爰加入新的BLAS路彳至BLAS=../vasp.4.lib/libgoto_core2p-r1.14.so可参考量化^页相^文章：/Experience/CommonSoftwares/VASP/CompileInstallation/200512/27.htmlStep3：重新褊言睾Makefile即可By阿建仔阈立成功大孥FFTW安装指南FFTW(theFastestFourierTransformintheWest)库是由MIT(MassachusettsInstituteofTechnology)的MatteoFrigo和StevenGJohnson开发的，用于一维和多维实数或复数的离散傅里叶变换。下载fftw-2_1_3_tar.gz(,or)tarzxvffftw-2_1_3_tar.gz展开压缩文件在Linux中安装FFTW:./configure--enable-type-prefix--prefix=/usr/local/fftw--with-gcc--disable-fortran--enable-i386-hacks并行编译./configure--prefix=/home/tlu--with-gcc--disable-fortran--enable-mpi其中，--enable-type-prefix参数是为了同时使用singleprecision(单精度)和doubleprecision(双精度)，如果不使用它，最后只有以rfftw开头的文件被安装(realfftw)；--prefix=参数是设定安装目录；--with-gcc使用gcc编译器；--disable-fortran参数为了不包含Fortran调用的机制；--enable-i386-hacks为Pentium和x86以后的CPU优化gcc的编译速度。make编译makeinstall安装，这一次安装完后，在安装目录中存在以dfftw和drfftw开头文件，但没有sfftw开头的文件makeclean还需要安装一次，先清除./configure--enable-float--enable-type-prefix--prefix=/usr/local/fftw--with-gcc--disable-fortran--enable-i386-hacks其中，--enable-float为了生成单精度计算的头文件和库文件，即以sfftw开头的文件。make重新编译makeinstall再一次安装，安装完后，目录中便会同时存在sfftw和dfftw开头的文件（用于复数函数/complexfunction的FFT变换）和srfftw与drfftw开头的文件（用于实数函数的FFT变换）例如，如果需要用到双精度的实数FFT变换/FFTs，那么在编译的链接命令中需要按如下顺序加入-ldrfftw-ldfftw参数VASP4.4.6编译过程1、 所需文件和程序VASP源代码：vasp.4.4.6.tar.gz和vasp.4.lib.tar.gz数学库：ATLAS（/）Fortran编译器：ifc_9.1.036fortran 可以从网站下载到免费的版本。2、 这里已经安装好了fortran编译器，所有文件都放在/home/xxx/VASP目录下，机器的操作系统是Linux:Redhat9.0。a） 用如下命令解压vasp.4.6.tar.gz和vasp.4.lib.tar.gz：tarxzvfvasp.4.6.tar.gztarxzvfvasp.4.lib.tar.gz解压后分别得到目录vasp.4.6和vasp.4.lib，目录vasp.4.6中文件是vasp的主要源代码，vasp.4.lib是编译vasp时需要的一些特定的数学库程序，在这两个目录中都有编译时所用的makefile文件，针对机器和fortran编译器，选择相应的makefile。b） 从/下载atlas3.6.0_Linux_P4SSE2.tar.gz，并用如下命令解压：tarxzvfatlas3.6.0_Linux_P4SSE2.tar.gz解压后得到一个目录Linux_P4SSE2,在此目录下有个lib子目录，该lib子目录中的文件为libatlas.a,libcblas.a,libf77blas.a,liblapack.a,这些就是编译vasp时所需要的数学库文件之一，将lib复制到vasp目录下，并将其中的四个文件复制到vasp.4.lib目录下我这里安装了fftw-3.1.2.tar这个东西，（见FFTW安装指南）完毕后，将/usr/local/fftw/include/T的fftw3.f复制到vasp/vasp4.6.c） 进入vasp.4.lib目录，选择makefile.linux_ifc_P4，并把它拷贝成makefile，然后键入make命令开始编译。整个命令如下：cdvasp.4.libcpmakefile.linux_ifc_P4makefilemake编译成功后，得到libdmy.a文件。先到安装的ifc9.1的安装目录中，找到lib目录，里面有个libsvml.a的库文件。1、 比如你的ifc9.1装在/opt/intel/fc/9.1.036的目录下。则在.bash_profile文件中加入下面的：exportLD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/fc/9.1.036/lib:$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/lib:/usr/lib:/lib2、 source.bash_profile3、 在vasp的makefile中，对BLAS或LAPACK后面加上-lvml。比如：BLAS= -lsvml其中的.....是你用libgoto库的路径d）退出vasp.4.lib目录，进入vasp.4.6目录，选择makefile.linux_ifc_P4，并把它拷贝成makefile，编辑makefile文件，通过修改LIB变量的赋值而采用基于ATLAS的数学库文件，修改其中：ATLASHOME=../libBLAS=-L$（ATLASHOME）-lf77blas-latlas-lsvmlLAPACK=../vasp.4.lib/lapack_double.o修改后保存makefile文件，键入make命令开始编译vasp。整个命令为：cd..cdvasp.4.6cpmakefile.linux_ifc_P4makefile编辑修改makefile文件make编译成功后，就可以得到VASP的可执行文件vasp。e)以root帐号登录机器，把成功编译VASP后得到的vasp放到/bin目录下，则任何一个普通用户都可以使用vasp。此时vasp可以当成于一个linux的命令来使用了，不再需要把vasp拷贝到当前的计算目录下。2:00-安装frotran9双核不支持，安装fortran10有RPMERROR没有libstdc++.so.5库3：40-安装成功见：d：\vasp'安装'并行\f.10.1\4:30-vasp出错：进入vasp.4.6目录中，把makefile.linux_ifc_P4拷贝成makefileMake2008-8-318：50-又出现问题：make：***[fft3dlib.o]错误1解决方式：将第343行$(FC)-FR-lowercase-O1-tpp7-xW-prefetch--unroll0-e95-vec_report3-c$*$(SUFFIX)去掉"-e95”燮敷改成$(FC)-FR-lowercase-O1-tpp7-xW-prefetch--unroll0-vec_report3-c$*$(SUFFIX)因舄"-e95”燮敷曹把F95褊^F77程式码走生的警告(warning)改成金昔森(error)型式输出，造成褊^弓鱼迫停止照法忽略跳遏!』原道一提，若使用IntelCore2Duo的虚理器，可将以下的-xW燮敷改成-xT得到僵化第102行：OFLAG=-O3-xW-tpp7第343行：$(FC)-FR-lowercase-O1-tpp7-xW-prefetch--unroll0-vec_report3-c$*$(SUFFIX)改成第102行：OFLAG=-O3-xT-tpp7第343行：$(FC)-FR-lowercase-O1-tpp7-xT-prefetch--unroll0-vec_report3-c$*$(SUFFIX)2008-9-28：30-计算结果不正确，重新编译vasp出错：undefinedreferenceto'__svml_trunc2'Re:Vasp串行编译出错(22字)—nodel，2008年。5月04日11:25:31处理方法：在vasp的makefile中，对BLAS或LAPACK后面加上-lvml12：23-vasp成功，但还是一个cpu计算，搜索“单机双核运行并行程序”解决方案1：用虚拟机建立多个虚拟计算机，建立多节点的机群；/logs/17396382.html这里将在一台双核的PC上，利用虚拟机及MPICH2建立一个由3台PC节点构成的一个机群行计算环境。16：50-运行MPI并行程序前输入命令：mpirun-np16./vasp关键：串行运行正确，并行运行错误的原因，是傅里叶变换fftw没有进行编译的原因，

带MPI的fftw3的安装和使用2007-10-0816:26/motioo/blog/item/d44e6fd32c6ae7033af3cfbc.html0.下载程序，解压下载程序http:fftw-3.2alpha2.tar.gz(ftp:fftw-3.2alpha2.tar.gz)(3.1MB)mkdir-p/home/tlu/proj/cpfftw-3.2alpha2.tar.gz/home/tlu/proj/cd/home/tlu/proj/tarxzvffftw-3.2alpha2.tar.gzcdfftw-3.2alpha2configure后面参数--prefix=/home/tlu表示安装的位置是/home/tlu/include和/home/tlu/lib/下--enable-mpi表示要使用并行的MPI./configure--prefix=/home/tlu--enable-mpi编译make安装makeinstall安装后的头文件和库文件tlu:~$ls-rcltinclude/lib/lib/:总用量1336drwxr-xr-x2tlutlu-rwxr-xr-x1tlutludrwxr-xr-x2tlutlu-rwxr-xr-x1tlutlu-rwxr-xr-x1tlutlu7742007-10-0816:17libfftw3_mpi.la7622007-10-0816:17libfftw3.la16:17libfftw3.a-rw-r--r--1tlutlu12384922007-10-08-rw-r--r--1tlutlu1033882007-10-0816:17libfftw3_mpi.ainclude/:总用量3216:17libfftw3.a-rw-r--r--1tlutlu162362007-10-0816:17fftw3.h-rw-r--r--1tlutlu24472007-10-0816:17fftw3.f-rw-r--r--1tlutlu93422007-10-0816:17fftw3-mpi.h只要把include和lib下的文件copy到另一台机器上同样的位置，另一台机器就安装好了。最终并行编译vasp成功：我的正确的vasp.4.6中makefile为：.SUFFIXES:.inc.f.f90.F MakefileforIntelFortrancompilerforP4systems#ThemakefilewastestedonlyunderLinuxonIntelplatforms(Suse5.3-Suse9.0)thefollowincompilerversionshavebeentested5.0,6.0,7.0and7.1(some8.0versionsseemtofailcompilingthecode)presentlywerecommendversion7.1or7.0,sincethesereleaseshavebeenusedtocompilethepresentcodeversions#itmightberequiredtochangesomeoflibrarypathes,sinceLINUXinstallationvaryalotHencecheck***ALL****optionsinthismakefileverycarefully #BLASmustbeinstalledonthemachinethereareseveraloptions:1)veryslowbutworks:retrievethelapackagefromandcompiletheblasroutines(BLAS/SRCdirectory)pleaseuseg77orf77forthecompilation.WhenItriedtousepgf77orpgf90forBLAS,VASPhangupwhencallingZHEEV(howeverthiswaswithlapack1.1nowIuselapack2.0)2)mostdesirable:getanoptimizedBLAS#thetwomostreliablepackagesaroundarepresently:3a)IntelsownoptimisedBLAS(PIII,P4,Itanium)/software/products/mkl/thisisreallyexcellentwhenyouuseIntelCPU's#3b)orobtaintheatlasbasedBLASroutines/youcertainlyneedatlasontheAthlon,sincethemklroutinesarenotoptimalontheAthlon.IfyouwanttouseatlasbasedBLAS,checkthelinesaroundLIB=#3c)mindblowingfastSSE2(4GFlopsonP4,2.53GHz)KazushigeGoto'sBLAS/users/kgoto/signup_first.html# allCPPprocessedfortranfileshavetheextension.f90SUFFIX=.f90 fortrancompilerandlinker FC=ifortfortranlinkerFCL=$(FC) whereisCPP??(IneedCPP,can'tusegccwithproperoptions)that'sthelocationofgccforSUSE5.3#CPP_=/usr/lib/gcc-lib/i486-linux/2.7.2/cpp-P-C#that'sprobablytherightlineforsomeRedHatdistribution:#CPP_=/usr/lib/gccTib/i386-redhatTinux//cpp-P-C

#SUSEX.X,maybesomeRedHatdistributions:CPP_=./preprocess<$*.F|/usr/bin/cpp-P-C-traditional>$*$(SUFFIX)#possibleoptionsforCPP:NGXhalfwNGXhalfNGXhalfwNGXhalfavoidallocIFCCACHE_SIZERPROMU_DGEMVRACCMU_DGEMV1000forPII,PIII,5000forAthlon,8000-12000P4useDGEMVinsteadofDGEMMinRPRO(dependsonusedBLAS)useDGEMVinsteadofDGEMMinRACC(dependsonusedBLAS)CPP=$(CPP_)-DHOST=\〃LinuxIFC\〃\-Dkind8-DNGXhalf-DCACHE_SIZE=12000-DPGF90-Davoidalloc\# -DRPROMU_DGEMV-DRACCMU_DGEMV generalfortranflags(theremustatrailingblankonthisline) FFLAGS=-FR-lowercase-assumebyterecl optimizationwehavetestedwhetherhigheroptimisationimprovesperformance-axKSSE1optimization,butalsogeneratecodeexecutableonallmach.xKimprovesperformancesomewhatonXP,andaisrequiredinordertorunthecodeonolderAthlonsaswell-xWSSE2optimization-axWSSE2optimization,butalsogeneratecodeexecutableonallmach.-tpp6P3optimization-tpp7P4optimization OFLAG=-O1-xWOFLAG_HIGH=$(OFLAG)OBJ_HIGH=OBJ_NOOPT=DEBUG=-FR-O0INLINE=$(OFLAG) thefollowinglinesspecifythepositionofBLASandLAPACKonP4,VASPworksfastestwiththelibgotolibrarysothat'swhatIrecommend Atlasbasedlibraries#ATLASHOME=$(HOME)/archives/BLAS_OPT/ATLAS/lib/Linux_P4SSE2/#BLAS=-L$(ATLASHOME)-lf77blas-latlasusespecificlibraries(defaultlibrarypathmightpointtootherlibraries)#BLAS=$(ATLASHOME)/libf77blas.a$(ATLASHOME)/libatlas.ausethemklIntellibrariesforp4()mkl.5.1set-DRPROMU_DGEMV-DRACCMU_DGEMVintheCPPlines#BLAS=-L/opt/intel/mkl/lib/32-lmkl_p4-lpthreadmkl.5.2requiresalsoto-lguidelibraryset-DRPROMU_DGEMV-DRACCMU_DGEMVintheCPPlines#BLAS=-L/opt/intel/mkl/lib/32-lmkl_p4-lguide-lpthreadevenfasterKazushigeGoto'sBLAS/users/kgoto/signup_first.htmlBLAS=/vasp/src/vasp.4.lib/libgoto_core2p-r1.14.soLAPACK,simplestusevasp.4.lib/lapack_doubleLAPACK=../vasp.4.lib/lapack_double.ouseatlasoptimizedpartoflapack#LAPACK=../vasp.4.lib/lapack_atlas.o-llapack-lcblasusethemklIntellapack#LAPACK=-lmkl_lapack LIB=-L../vasp.4.lib-ldmy\../vasp.4.lib/linpack_double.o$(LAPACK)\$(BLAS)optionsforlinking(forcompilerversion6.X,7.1)nothingisrequiredLINK=compilerversion7.0generatessomevectorstatmentswhicharelocatedinthesvmllibrary,addtheLIBPATHandthelibrary(justincase)LINK=-L/usr/local/fc/lib/-lsvml fftlibraries:VASP.4.6canusefftw.3.0.X()sincethisversionisfasteronP4machines,werecommendtouseit #FFT3D=fft3dfurth.offt3dlib.o#FFT3DFFT3D=fftw3d.offt3dlib.o/opt/libs/fftw-3.0.1/lib/libfftw3.a#=======================================================================MPIsection,uncommentthefollowinglines#onecommentforusersofmpichorlam:Youmust*not*compilempiwithg77/f77,becausef77/g77appends*two*underscorestosymbolsthatcontainalreadyanunderscore(i.e.MPI_SENDbecomesmpi_send__).Thepgf90/ifccompilershoweverappendonlyoneunderscore.Precompiledmpiversionwillalsonotwork!!!#Wefoundthatmpich.1.2.1andlam-6.5.Xtolam-7.0.4arestablempich.1.2.1wasconfiguredwith./configure-prefix=/usr/local/mpich_nodvdbg-fc="pgf77-Mx,119,0x200000"\-f90="pgf90"\—without-romio—without-mpe-opt=-O\#lamwasconfiguredwiththeline./configure-prefix/opt/libs/lam-7.0.4—with-cflags=-O-with-fc=ifc\--with-f77flags=-O--without-romio#pleasenotethatyoumightbeabletousealamormpichversioncompiledwithf77/g77,butthenyouneedtoaddthefollowingoptions:-Msecond_underscore(compilation)and-g77libs(linking)#!!!PleasedonotsendmeanyqueriesonhowtoinstallMPI,Iwillcertainlynotanswerthem!!!!#======================================================================= fortranlinkerformpi:ifyouuseLAMandcompileditwiththeoptionssuggestedabove,youcanusethefollowingline FC=/usr/local/mpich2/bin/mpif90FCL=$(FC) additionaloptionsforCPPinparallelversion(seealsoabove):NGZhalf chargedensityreducedinZdirectionwNGZhalf gammapointonlyreducedinZdirectionscaLAPACK usescaLAPACK(usuallysloweron100MbitNet) CPP=$(CPP_)-DMPI-DHOST=\〃LinuxIFC\〃-DIFC\-Dkind8-DNGZhalf-DCACHE_SIZE=4000-DPGF90-Davoidalloc\-DMPI_BLOCK=500\-DRPROMU_DGEMV-DRACCMU_DGEMVlocationofSCALAPACKifyoudonotuseSCALAPACKsimplyuncommentthelineSCA BLACS=$(HOME)/archives/SCALAPACK/BLACS/SCA_=$(HOME)/archives/SCALAPACK/SCALAPACK#SCA=$(SCA_)/libscalapack.a\$(BLACS)/LIB/blacsF77init_MPI-LINUX-0.a$(BLACS)/LIB/blacs_MPI-LINUX-0.a$(BLACS)/LIB/blacsF77init_MPI-LINUX-0.aSCA= librariesformpi LIB=-L../vasp.4.lib-ldmy\../vasp.4.lib/linpack_double.o$(LAPACK)\$(SCA)$(BLAS)FFT:fftmpi.owithfft3dlibofJuergenFurthmueller#FFT3D=fftmpi.offtmpi_map.offt3dlib.offtw.3.0.1isslighlyfasterandshouldbeusedifavailableFFT3D=fftmpi.offtmpi_map.offt3dlib.o/usr/local/fftw/lib/libfftw3.a generalrulesandcompilelines# BASIC=symmetry.osymlib.olattlib.o random.oSOURCE=base.ompi.osmart_allocate.o xml.o\constant.ojacobi.omain_mpi.oscala.o\asa.olattice.oposcar.oini.o setex.o radial.o\pseudo.omgrid.omkpoints.owave.o wave_mpi.o$(BASIC)\nonl.ononlr.odfast.ocholeski2.o \mix.ocharge.oxcgrad.oxcspin.o potex1.opotex2.o\metagga.oconstrmag.opot.ocl_shift.oforce.o dos.o elf.o \tet.ohamil.osteep.o\chain.odyna.orelativistic.oLDApU.osphpro.opaw.ous.o\ebs.owavpre.owavpre_noio.obroyden.o\dynbr.ormm-diis.oreader.owriter.otutor.oxml_writer.o\brent.ostufak.ofileio.oopergrid.ostepver.o\dipol.oxclib.ochgloc.osubrot.ooptreal.odavidson.o\edtest.oelectron.oshm.opardens.opaircorrection.o\optics.oconstr_cell_relax.ostm.ofinite_diff.o\elpol.osetlocalpp.oINC=vasp:$(SOURCE)$(FFT3D)$(INC)main.orm-fvasp$(FCL)-ovasp$(LINK)main.o$(SOURCE)$(FFT3D)$(LIB)makeparam:$(SOURCE)$(FFT3D)makeparam.omain.F$(INC)$(FCL)-omakeparam$(LINK)makeparam.o$(SOURCE)$(FFT3D)$(LIB)zgemmtest:zgemmtest.obase.orandom.o$(INC)$(FCL)-ozgemmtest$(LINK)zgemmtest.orandom.obase.o$(LIB)dgemmtest:dgemmtest.obase.orandom.o$(INC)$(FCL)-odgemmtest$(LINK)dgemmtest.orandom.obase.o$(LIB)ffttest:base.osmart_allocate.ompi.omgrid.orandom.offttest.o$(FFT3D)$(INC)$(FCL)-offttest$(LINK)ffttest.ompi.omgrid.orandom.osmart_allocate.obase.o$(FFT3D)$(LIB)kpoints:$(SOURCE)$(FFT3D)makekpoints.omain.F$(INC)$(FCL)-okpoints$(LI