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文档简介
主讲人:王文锋E-mail:wwf5718@163.com质粒DNA电泳检测实验七质粒DNA的电泳检测专家讲座第1页一、试验目标1.掌握利用溴化乙锭(EB)在紫外下检测DNA原理。2.掌握水平式琼脂糖凝胶电泳法检测DNA方法、步骤。3.掌握在紫外灯下判断DNA浓度、分子量大小、纯度等方法。
实验七质粒DNA的电泳检测专家讲座第2页二、试验原理
依据分离DNA大小及类型不一样,DNA电泳主要分两类:聚丙烯酰胺凝胶电泳琼脂糖凝胶电泳
实验七质粒DNA的电泳检测专家讲座第3页
DNA电泳影响原因(1)DNA分子大小
DNA分子越大在胶中摩擦阻力就越大,泳动也越慢,迁移速率与线状DNA分子质量对数值成反比。(2)DNA分子构型超螺旋最快、线状分子次之,开环分子最慢。(3)不一样胶浓度对于同种DNA分子胶浓度越高,电泳速率越慢。
实验七质粒DNA的电泳检测专家讲座第4页(4)电场强度电场强度偏高时电泳分离线性范围会变窄,电压过高时也会因为电泳中产生大量热量造成DNA片段降解。(5)电泳缓冲液当前有3种缓冲液适合用于天然双链DNA电泳:TAE、TBE和TPE。
(6)溴化乙锭简称EB,电泳中染色剂,含有扁平结构,能嵌入到DNA碱基对间.实验七质粒DNA的电泳检测专家讲座第5页DNA电泳上样缓冲液主要作用以下:预防电泳过程中DNA被降解,普通上样缓冲液中含10mmol/lEDTA。增加样品密度以确保DNA沉入加样孔内,普通上样缓冲液中加入一定浓度甘油或蔗糖,增加样品比重。指示剂监测电泳行进过程。实验七质粒DNA的电泳检测专家讲座第6页三、操作步骤1.称取0.5g琼脂糖粉,放入三角瓶,加入50mlTAE电泳缓冲液(1),放入微波炉中烧开(1min)。50ml恰好倒两块小胶。2.注意观察烧瓶中琼脂糖粉末,待完全熔化后停顿微波炉(切不可让胶溶液溢出到微波炉中!)。3.戴上线手套,从微波炉中取出三角瓶,置桌面上冷却致不烫手(约50~60C)。实验七质粒DNA的电泳检测专家讲座第7页4.把梳子插到凝胶灌制模具正确位置后缓缓倒入胶溶液。胶溶液倒至与模具矮边缘相平即可,不要把胶溶液溢到外面。在桌面上静置10~20min待胶完全凝固。(剩下胶溶液封口后留待以后再熔化使用)。5.在水平电泳槽中加满1TAE电泳缓冲液。依据电泳槽长度把电泳仪电压调至170V(10V/cm),注意正负电极位置连接正确。实验七质粒DNA的电泳检测专家讲座第8页6.待胶完全凝固后(15~20min),小心拔出梳子。用手指捏住模具两侧高边缘取出模具和凝胶放入电泳槽中间平台上,凝胶要没入电泳液中。凝胶上有样品孔一侧要朝向电泳槽负极。7.剪1片光面纸(或封口膜),点6l蒸馏水、1l10加样缓冲液,再加入3l质粒DNA溶液制成10lDNA样品。实验七质粒DNA的电泳检测专家讲座第9页8.在凝胶上选择相邻加样孔。用10l吸液头分别将管中样品加入凝胶加样孔中(假如需要时,在相邻加样孔中加入1.5~3lDNA分子量标准物)。看到蓝色样品吸管尖头伸进加样孔后(不能伸得太深,以免穿破凝胶底部)缓缓将蓝色样品压入加样孔中。切不可使蓝色样品流到孔外。实验七质粒DNA的电泳检测专家讲座第10页9.打开电源开关,样品将形成一条蓝色横带向前移动(假如发觉蓝色向后移动,马上关闭电源,调换电极)。电泳将进行约30min。10.当蓝色溴酚蓝迁移到距凝胶边缘1cm时,关闭电源。取出模具和凝胶。实验七质粒DNA的电泳检测专家讲座第11页11.把凝胶小心反扣放入盛有EB搪瓷盒中。放置约10min后,取出用自来冲洗两次。放入凝胶成像系统中拍照。12.清理垃圾。染有EB凝胶要放到专用垃圾袋中作专门处理,以免污染环境。13.撰写试验汇报。实验七质粒DNA的电泳检测专家讲座第12页四、作业1.泳道中质粒DNA有几条带
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