如何应用经典检索工具

如何应用经典检索工具第1页，共144页，2023年，2月20日，星期六子宫内膜异位症（Endometriosis,

EM）诱导因素的研究进展及其相关问题近年来有关其诱导因素哪些是研究热点？哪些具有现实意义?哪些与先进学说（分子生物学、遗传学、生化）和技术（细胞纯度分析）有关？问题的提出?第2页，共144页，2023年，2月20日，星期六

PubMed网址/PubMed与其它数据库资源不同，为全免费系统第3页，共144页，2023年，2月20日，星期六欲通过PubMed查找“利用抗生素（antibiotics）治疗耳痛（earache）”主题的文献，应如何进行操作？第4页，共144页，2023年，2月20日，星期六基本检索提问框特征栏提供辅助检索功能侧栏提供其他检索如期刊数据库检索、主题词数据库检索、特定文献检索执行检索第5页，共144页，2023年，2月20日，星期六利用PubMed您可以干什么？查找某一主题的文献：标准（默认）检索、主题词检索以及文本词检索方式；查找某一作者撰写的文献：ZhongSZ；查找某一期刊发表的文献：JournalofSouthernMedicalUniversity；第6页，共144页，2023年，2月20日，星期六利用PubMed您可以干什么？查找某一篇特定文献：

SingleCitationMatcher；查找某疾病的临床相关信息：ClinicalQueries；定期获取预设的主题信息：MyNCBI；与NCBI其它资源的链接信息。第7页，共144页，2023年，2月20日，星期六第8页，共144页，2023年，2月20日，星期六教学目标找出标准检索、字段限定和主题词检索方式查找文献信息的区别与联系；学会将筛选出的文献，按常用格式进行显示、存盘、打印、EMAIL发送等输出操作；掌握检索结果扩大或缩小的调整方法以及检索式的保存方式等。熟悉常用功能按钮的使用；熟悉全文获取的方式。第9页，共144页，2023年，2月20日，星期六

PubMed概况检索方式选择*检索条件限制检索结果处理*：显示、输出检索式浏览与保存*：个性化或定题服务全文获取技巧*PubMed特点分析第10页，共144页，2023年，2月20日，星期六概况第11页，共144页，2023年，2月20日，星期六免费使用，是查找众多与健康医学主题密切相关信息的优秀数据库系统；1997年6月26日，美国副总统戈尔宣布免费开放；文摘型数据库，但能提供部分文献的全文链接信息（如PubMedCentral和其他网站上的免费全文链接）；第12页，共144页，2023年，2月20日，星期六数据来自包括美国在内的70多个国家出版的约4,900多种生物医学期刊；记录从1950年至今已超过1700多万条；第13页，共144页，2023年，2月20日，星期六数据周二至周六每天更新,包括

MEDLINE(mid-1960’s)、OLDMEDLINE(1950-1965)以及PREMEDLINE中的Medlinereferencesinprocess

和referencessuppliedbypublishers。第14页，共144页，2023年，2月20日，星期六MEDLINE数据库是美国国立医学图书馆的重要书目数据库系统,覆盖医学、护理、牙科、兽医、卫生保健等学科。第15页，共144页，2023年，2月20日，星期六PubMed提供的结果文献题录或摘要信息；文献免费或收费全文链接信息。第16页，共144页，2023年，2月20日，星期六检索方式选择第17页，共144页，2023年，2月20日，星期六主题检索(SubjectSearch)*作者检索(AuthorSearch)*期刊检索(JournalSearch)截词检索(Truncation)词组检索(PhraseSearch)单个引文匹配器(SingleCitationMatcher)*临床信息查询(ClinicalQueries)相关文献(Relatedarticles)第18页，共144页，2023年，2月20日，星期六主题检索标准检索(StandardSearch)：默认的智能检索方式文本词检索(TextWord)：字段限定主题词检索(MeSHDatabase)第19页，共144页，2023年，2月20日，星期六标准检索提问框

(Thestandardsearchbox)检索词：逻辑式、叙述性语句、实质意义词；作者名：查找2002年以前文献需采用姓全称、名缩写方式，如：ZhongSZ；刊物名：全称、简称、ISSN号。第20页，共144页，2023年，2月20日，星期六第21页，共144页，2023年，2月20日，星期六布尔逻辑运算符(大写)ORANDNOTOtitismediaANDantibioticsOtitismediaORantibioticsOtitismediaNOTantibiotics第22页，共144页，2023年，2月20日，星期六在PubMed中,逻辑运算遵循从左到右的次序：antibioticsAND(earacheORotitis)不同于

antibioticsANDearacheORotitis第23页，共144页，2023年，2月20日，星期六PubMed检索结果页面第24页，共144页，2023年，2月20日，星期六链接图标(Iconlinks)

表示是否有文摘或免费全文。第25页，共144页，2023年，2月20日，星期六第26页，共144页，2023年，2月20日，星期六输词方式:earache[TW]

此外，利用*截词功能也将只运行文本词检索。文本词检索(TextWord)第27页，共144页，2023年，2月20日，星期六PubMed记录字段说明文摘第一著者单位地址出版商提供文献识别号著者群版权说明参考评论文献合著者文献参考评论定稿版校样版输入日期输入完成日期电子出版日期第28页，共144页，2023年，2月20日，星期六电子出版日期文献出版日期数据加入PubMed日期文献勘误参考文献勘误全部著者姓名全部调研者姓名作为文章主题的著者全称文献相关注释基金编号基因符号期编号资助调研者资助调研单位国际标准期刊号美国立医学图书馆识别号期刊全称第29页，共144页，2023年，2月20日，星期六最后修订日期规范词表词规范词确立日期系统组织的文摘版权拥有者题录提供机构的识别号病史相关与原始记录其他关键词提供其他关键词的机构数据提供者机构文章总页数出版商提供数据时间期刊出版国数据库文献编号第30页，共144页，2023年，2月20日，星期六作为主题词的个人姓名出版状态文献类型出版模式（纸张或电子）参考文献数已撤回的文献酶或化学物质代码正在撤消中的文章初版文献修订和再版的文章子专题文档太空署提供的数据二次文献数据库以及文章讨论的分子序列访问号原文来源引用了病例的文献内部处理代码标准期刊缩写文献标题翻译标题更新文献文献正在更新期刊卷号第31页，共144页，2023年，2月20日，星期六利用标题[ti]字段限定方式查找维生素C(vitaminc)与感冒(commoncold)主题的文献。第32页，共144页，2023年，2月20日，星期六第33页，共144页，2023年，2月20日，星期六查找标题中含有acupuncture一词且2000年出版的文献。第34页，共144页，2023年，2月20日，星期六第35页，共144页，2023年，2月20日，星期六MeSH:MedicalSubjectHeadings；医学主题词(MeSH)是由标引员为所有的PubMed记录所指定的词；标引员使用能恰当描述文章内容的最相关MeSH词；通常一篇文章可有几个MeSH词。主题词检索(MeSHDatabase)第36页，共144页，2023年，2月20日，星期六主要标题词(MajorTopic)

当标引员为一篇文章确定MeSH词的同时，通常要进一步分析它为文章的主要论点还是次要论点；限制检出文献量的一种方法是将检索限制在majorMeSH字段，这意味着检出文献虽少但内容更相关。第37页，共144页，2023年，2月20日，星期六PubMed能自动地为输入的检索词寻找相应的MeSH词；用户利用一个MeSH词能找出所有含有该主题的文献；多数MeSH词还包括副主题词(subheadings)。第38页，共144页，2023年，2月20日，星期六副主题词

(MeSHSubheadings)一个MeSH词的某特定方面,如:

cost-effectiveness

或

adverseeffects用户可根据课题内容挑选专门的副主题词。这些副主题词不仅适用于用户输入的MeSH词，而且还适用于该MeSH词的其它下位词。第39页，共144页，2023年，2月20日，星期六MeSH词优点不同拼写:paediatric/pediatric；同义词:tumor,tumour,

cancer,neoplasm；同音异义词:depression；排除不相关的文献；第40页，共144页，2023年，2月20日，星期六MeSH词独有特征扩展(EXPLODE)：选择MeSH词及其更加专指的下位词检索。主要标题词(MAJORTOPIC):MeSH词为文章的主要研究内容(*)。副主题词(SUBHEADINGS)第41页，共144页，2023年，2月20日，星期六MEDLINE-MeSHHeadings第42页，共144页，2023年，2月20日，星期六举例：通过MeSH查找“利用抗生素(antibiotics)治疗耳痛(earache)”主题的文献第43页，共144页，2023年，2月20日，星期六第44页，共144页，2023年，2月20日，星期六第45页，共144页，2023年，2月20日，星期六第46页，共144页，2023年，2月20日，星期六利用MeSH数据库构建讨论economicsofcommunity-acquiredpneumonia主题文献。第47页，共144页，2023年，2月20日，星期六第48页，共144页，2023年，2月20日，星期六作者检索(AuthorSearch)用于查找某一特定作者撰写的文献。格式为作者姓全称在前、名缩写在后，如SMITHBJ。利用作者全称可检索2002年以来出版的文献，但采用第一作者进行检索时，需用传统的名字书写方式。第49页，共144页，2023年，2月20日，星期六检索词后加上作者字段标识符，如FOOT[AU]，则系统只在作者字段进行检索。

利用History

功能可将作者字段检索与其它检索词进行组配。第50页，共144页，2023年，2月20日，星期六期刊检索(JournalsDatabase)

用于查找某特定期刊中的文献。可输入刊名全称、MEDLINE简称或期刊的ISSN号，如：

MOLECULARBIOLOGYOFTHECELL(fullname)MOLBIOLCELL(abbreviation)。第51页，共144页，2023年，2月20日，星期六如若在检索词后加上期刊的字段名，则系统只在该字段进行检索，如CHEST[TA],BLOOD[TA]

等。第52页，共144页，2023年，2月20日，星期六利用期刊数据库（JournalsDatabase）查看PubMed是否收录了期刊ProteinScience。若是，从JournalsDatabase对该刊进行检索。第53页，共144页，2023年，2月20日，星期六第54页，共144页，2023年，2月20日，星期六截词(Truncation)

PubMed中的截词符是“*”，用于查找具有相同词根的词(＜150)，如输入cell*会查出文章中包含有cell,celliferous,cellophane,cells,cellular等内容文献。注意：使用截词功能后，将关闭MeSH自动扩展及检索词匹配功能。

第55页，共144页，2023年，2月20日，星期六词组检索(PhraseSearching)需使用引号标记词组“...”,如：“glueear”

。由于词组检索将关闭自动匹配和MeSH扩展功能，检索时将不包含更加专指的词即下位词。第56页，共144页，2023年，2月20日，星期六单个引文匹配器

（SingleCitationMatcher）

用于查找著录信息不全的文献；用户可通过对刊名、出版年、卷号、期号、首页、作者名等组配方式查找某特定文献；第57页，共144页，2023年，2月20日，星期六作者与期刊检索字段提供有名称自动匹配功能；利用第一作者方式检索时姓名不能采用全称形式；需注意的是许多期刊不在MEDLINE收录范围之列(4,900种)。第58页，共144页，2023年，2月20日，星期六查找南方医院侯凡凡教授2006年发表于NewEnglandJournalofMedicine354卷2期上关于苯那普利(benazepril)临床应用的那篇文献及其相关信息。第59页，共144页，2023年，2月20日，星期六通过PubMed的SingleCitationMatcher和下列信息查找相关文献:(1)ArthritisRheum,1982年,1271页

(2)V.Lee,BiochemicalPharmacology,29卷,14期

(3)"Apowderformulationofmeaslesvaccineforaerosoldelivery"第60页，共144页，2023年，2月20日，星期六PubMed提供了根据预先设计好的检索策略而建立的嵌入式过滤器（ClinicalQueries）；临床信息查询

(ClinicalQueries)第61页，共144页，2023年，2月20日，星期六其中的ClinicalQueriesusingResearchMethodologyFilters提供有四种研究类型（therapy,diagnosis,etiology,prognosis）和二种检索强调（sensitivityandspecificity）选择。第62页，共144页，2023年，2月20日，星期六Sensitivity–扩大检索,虽能使相关的文献量增加，但也会包含一些不相关文献;Specificity–缩小检索,虽能排除不相关文献，但也会漏掉相关的文献。第63页，共144页，2023年，2月20日，星期六能提供由PubMed收录的生物医学期刊发表的生物领域系统评价及其它类型研究；比其它的循证医学资源汇集的要多，但未能对同一标题不同综述的质量进行单独评价和比较评估，文摘通常由作者或期刊提供。系统评价(SystematicReviews)第64页，共144页，2023年，2月20日，星期六另一种检索方式是将ANDsystematic[sb]

与检索词组配。[sb]表示将检索限定在PubMed含有系统评价的子集中。该种检索方式比ClinicalQueries的sensitivity或specificity特异性高。

第65页，共144页，2023年，2月20日，星期六查找有关“皮质类固醇（corticosteroids）治疗早产儿（Infant,premature）的系统评价”。第66页，共144页，2023年，2月20日，星期六MedicalGenetics查找医学遗传学各主题方面的文献信息。第67页，共144页，2023年，2月20日，星期六专科信息查找(SpecialQueries)提供特定标题（topic-specific）的PubMed检索需求指引，提供快速检索的入口。第68页，共144页，2023年，2月20日，星期六相关文献(RelatedArticles)PubMed通过分析篇名、文摘及MeSH字段中出现词的权重值来筛选PubMed中与已查出文献相似的信息；PubMed将产生一系列以某一文献为起始的相关文献，且其总列在首位。第69页，共144页，2023年，2月20日，星期六用户利用Display下拉式菜单中的RelatedArticles，可找出与当前屏幕中显示内容相关的所有文献。

第70页，共144页，2023年，2月20日，星期六检索条件限制

(Limits)第71页，共144页，2023年，2月20日，星期六作者限定添加作者姓名输入框清除限定期刊限定作者姓名索引选词多作者逻辑匹配选项全文、免费全文、摘要限定日期限定第72页，共144页，2023年，2月20日，星期六出版日期限定入库日期限定研究对象人/动物限定研究对象性别限定语种限定子文档限定文献类型限定研究对象年龄限定第73页，共144页，2023年，2月20日，星期六检索字段限定执行检索清除所有限定第74页，共144页，2023年，2月20日，星期六请找出2005年以来标题/摘要(Title/Abstract)字段含有“Babywalkers”主题的文献。第75页，共144页，2023年，2月20日，星期六第76页，共144页，2023年，2月20日，星期六2000年以来麻疹爆发（Measlesoutbreak）统计学（statistics）方面的免费英文文献。第77页，共144页，2023年，2月20日，星期六第78页，共144页，2023年，2月20日，星期六检索结果处理第79页，共144页，2023年，2月20日，星期六检索结果的处理结果显示：Summary、Abstract、AbstractPlus、Citation、MEDLINE结果输出(Output)：检索结果的长期保存(SendtoFile&MyNCBICollections)、多次检索结果的一次性暂时保存(Savingfrommultiplesearches)、检索结果打印(Print)、检索结果邮件发送(Email)。第80页，共144页，2023年，2月20日，星期六检索结果显示

(DisplayResults)检索结果通常以Summary格式显示，包含基本的引文信息:author(s)

articletitle

abbreviatedjournaltitle

publicationdetails

aPubMedIdentificationnumber

stageofindexing

第81页，共144页，2023年，2月20日，星期六SummaryDisplay第82页，共144页，2023年，2月20日，星期六AbstractDisplay

包含全部引文信息:题录+文摘(若有).

如若可能，还包含全文链接按钮(iconsforfulltextarticleretrieval)以及出版物类型(Publicationtype(s))。第83页，共144页，2023年，2月20日，星期六在Abstract格式基础上增加了前5条相关文献的信息。AbstractPulsDisplay

第84页，共144页，2023年，2月20日，星期六CitationDisplay

在文摘格式基础上还包含有标引信息，如MeSH词、化学物质名(Substances)等。第85页，共144页，2023年，2月20日，星期六MEDLINEDisplay

用两个字母作为字段标识符显示引文信息，主要用于书目型数据库的管理，如EndNote,ReferenceManager和Papyrusetc,不包括全文链接按钮。第86页，共144页，2023年，2月20日，星期六文献全文链接按钮

PubMed在Abstract、AbstractPlus和Citation

三种显示格式中提供全文链接按扭。第87页，共144页，2023年，2月20日，星期六检出文献显示设定(Show)

每屏默认显示值是20。

第88页，共144页，2023年，2月20日，星期六检索结果输出(Output)

通过点击各篇文献左边的复选框选择文献，以进行显示、存盘及打印操作(出现一个√)；选择文献后再点击Display按钮，则屏幕只显示被选中的文献。第89页，共144页，2023年，2月20日，星期六检索结果打印(Print)通过“Text”功能实现文本格式的转换；修改每页显示的文献量(最多500条),从而一次性打印所有选定的记录；点击Sendto按钮浏览并打印所有选定文献的纯文本格式，而无需打印PubMed边框。第90页，共144页，2023年，2月20日，星期六检索结果的长期保存

(SaveReferences)选择Sendto下拉式菜单中的File功能；可保存那些选中的文献；用户可保存多至10,000条的文献。第91页，共144页，2023年，2月20日，星期六对多次检索结果进行一次性暂时保存

(SavingfromMultipleSearches)选择Sendto下的剪帖板(Clipboard)；用户可将从多次检索操作中获得的多至500条记录放到Clipboard中；如若浏览选中的文献,点击位于检索提问框下的Clipboard。第92页，共144页，2023年，2月20日，星期六从检索结果中筛选出的所需文献，在去掉重复部分后，会形成一个特定数据集。点击下拉式菜单中的ClipRemove。清空Clipboard第93页，共144页，2023年，2月20日，星期六MyNCBICollectionsMyNCBI是用户在NLM计算机系统中用于存储检索式的个人使用空间，并对检出文献进行再过滤（filters）；为使用MyNCBI，用户需将其web浏览器设置接受cookies状态；需要注册（Registration）；需先将检索结果发送至Clipboard；第94页，共144页，2023年，2月20日，星期六在Clipboard中将所选出的检索结果发送至MyNCBICollections中；每个用户名下最多能设100个文件夹；每个文件夹下最多能保存1500条记录;利用Clipboard方便对一次检索操作中的几个查询课题结果进行打印输出。MyNCBICollections第95页，共144页，2023年，2月20日，星期六检索结果邮件发送(Email)以HTML格式email文件，产生的email将实现与PubMed数据库的超链接,方便用户进一步查看相同主题的abstracts,relatedarticles和books等。对大多数用户来说，纯文本格式是他们将检索结果转存至EndNote理想格式。第96页，共144页，2023年，2月20日，星期六MyNCBI检索结果的过滤

（Filters）MyNCBI中的过滤器Filters提供有不同类型的过滤条件，方便用户对检出的结果按预先设定好的过滤条件进行分类浏览。用户在任何一个检索结果页面，只要点击屏幕中部的图标，即可进入Filter选择界面。需注意用户每次最多只能设定5个过滤条件。第97页，共144页，2023年，2月20日，星期六检索式浏览与保存第98页，共144页，2023年，2月20日，星期六结果预览与索引词表

(Preview/index)检索史(History)检索式匹配(Details)MyNCBI的SaveSearch第99页，共144页，2023年，2月20日，星期六结果预览(Preview)浏览检索式；组合检索式：可用检索式编号：#1OR#2第100页，共144页，2023年，2月20日，星期六检索预览检索历史索引加词检索第101页，共144页，2023年，2月20日，星期六索引字顺表(Index)选择限定字段；输入检索词（词根）；在字顺表中选择检索词；选用逻辑算符建立检索式；点击GO。第102页，共144页，2023年，2月20日，星期六步骤3索引选词步骤4确定与检索栏中检索提问的逻辑关系步骤2输入待选词步骤1点击预览和索引第103页，共144页，2023年，2月20日，星期六

检索式回顾；编辑检索式，如：#3ANDchild；History虽有用但也有缺点，停用8小时后PubMed自动将其中的内容删除，所以用户不能用该功能来存储检索式。检索史(History)第104页，共144页，2023年，2月20日，星期六检索历史回顾检索式检索时间检出篇数第105页，共144页，2023年，2月20日，星期六检索式匹配(Details)显示检索词转换匹配运算详细过程；用途：转换、确定规范词，如：

livercancer

liverneoplasms；修改检索策略。第106页，共144页，2023年，2月20日，星期六检索明细数据库匹配过程检索词转换显示用户输入的检索式第107页，共144页，2023年，2月20日，星期六利用URL存储检索式

(SavingSearchesUsingURL)用户可将检索式存入收藏夹中以方便查看自上一次检索操作以来PubMed新增文献；PubMed将为当前检索式提供一个url地址；PubMed将为收藏夹自动指定一个无效名字(Entrez-PubMed)；用户可自行指定一有意义的名字。第108页，共144页，2023年，2月20日，星期六MyNCBI的SaveSearch每一检索结果页面有SaveSearch链接，点击后检索式即存于SavedSearches；MyNCBI中的SavedCollections可长期保存检索结果；SavedSearches可长期保存检索式；每个用户名下最多能存储100个检索式。第109页，共144页，2023年，2月20日，星期六用户在MyNCBI中不能对已存储检索式进行修改，必须删掉旧的，再创建一个新的检索式；允许用户每月、每周或每天以Email方式接收系统对这些检索式进行自动更新的结果，从而大大方便了用户对课题进行定期检索的需求。第110页，共144页，2023年，2月20日，星期六全文获取技巧第111页，共144页，2023年，2月20日，星期六利用PubMed获取全文途径有三种：

第一种:检索时进入Limits界面，通过激活Linkstofreefulltext或Linkstofulltext选择框，直接查找出带有全文链接的记录；第112页，共144页，2023年，2月20日，星期六第二种:在MyNCBI的过滤条件Filters中，选择LinkOut下的Miscellaneous中所提供的Freefulltext、Fulltext、FreeregistrationRequired或Freeresources等过滤条件；第113页，共144页，2023年，2月20日，星期六在检索结果页面，将查看到系统按照这些条件对检出的结果进行分组排列情况，进而可集中查看带有全文链接的文献记录；第114页，共144页，2023年，2月20日，星期六第三种:对于PubMed中的检出记录，通过点击该记录Links下的LinkOut链接，查看FullTextSources下排列的电子全文资源，只要有所在局域网已订购的全文数据库，如我校的ScienceDirect、Ovid、Blackwell、ProQest、EBSCO和SpringerLink等，即可通过PubMed后台操作系统直接获取该记录的全文。第115页，共144页，2023年，2月20日，星期六第116页，共144页，2023年，2月20日，星期六第117页，共144页，2023年，2月20日，星期六另外，在PubMed检出结果页面，若一条记录在网上有免费全文提供，则在Abstract、AbstractPlus和Citation三种显示格式中，用户也可根据图标指引实现全文链接。第118页，共144页，2023年，2月20日，星期六PMC(PubMedCentral)生命科学期刊资源中心；免费提供130多种期刊的30多万篇全文；不包括PubMed动态免费全文。第119页，共144页，2023年，2月20日，星期六第120页，共144页，2023年，2月20日，星期六PubMed特点分析

第121页，共144页，2023年，2月20日，星期六

可随时查找全球范围内与健康医学主题密切相关的信息；允许所有Internet用户免费查询；能采用文本词、主题词、刊名、作者等途径进行检索；第122页，共144页，2023年，2月20日，星期六通过强大的链接功能方便用户查找相关主题信息及获取全文信息；提供检索限制功能(Limits)；可进行词组与截词检索；第123页，共144页，2023年，2月20日，星期六

能查找系统收录的某一特定文献；提供多种结果显示格式；提供多种结果输出方式；第124页，共144页，2023年，2月20日，星期六可保存检索式并查看检索史；可分类浏览检索结果；可定期自动更新检索课题；可获取循证医学信息；可获取全文索取信息。第125页，共144页，2023年，2月20日，星期六WasThatTooMuch?第126页，共144页，2023年，2月20日，星期六下列哪个检索式能用于查找对鸡蛋或花生发生的变态反应（allergiestoeggsorpeanuts）？AallergiesNOTpeanutsANDeggs

B(peanutsOReggs)andallergies

CallergiesANDpeanutsOReggs

DallergiesAND(peanutsOReggs)Exercise第127页，共144页，2023年，2月20日，星期六下列哪个sentto中的功能可用于对多次检索结果同时保存以便一次性打印、保存或定购原文？AsendtoClipboard