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文档简介
第六章基因文库技术
(Thetechnologyofgenelibraries)
一、基因文库(Genelibraries)
汇集着基因组所有的DNA序列的重组体DNA群体为
基因文库(Genelibraries)或基因库(genelibraries),
DNA文库(DNAlibraries)。
由基因组DNA所制成的基因文库称为基因组文库
(genomiclibraries),由互补DNA所制成的称为
cDNA文库(cDNAlibraries)。
(bank,libraries,pool,reservoir)二、基因组文库
(genomiclibrary)1、基因组文库的概念将某种生物的全部遗传组成(DNA)切成适当长度的片段,连接在载体上,转化到宿主细胞中而构建的基因文库,就称为基因组文库。为了要分离到一个确实含有目的基因的克隆,究竟要筛选多少个重组体克隆呢?3、基因组文库的大小
1976年,L.Clark和J.Carbon提出了一个经验公式:
N=ln(1-p)/ln(1-x/y)N:完全基因文库所应包含的重组DNA的转化子克隆数(基因文库大小)P:在重组体群体中出现目的基因序列的概率(一般为99%)X:文库中每个克隆所含的外源DNA片段的平均长度Y:该生物基因组的大小(单倍体基因组长度)举例:
为了获得猪垂体生长激素PGH基因,用猪垂体细胞分离制取构建PGH基因文库时,用上式计算,
X:插入的DNA片段平均长度16kb,Y:单倍体长度3.30×106kb,
N=9.67×105个,如果实验中得到106个重组噬菌体,符合基因组文库大小的要求,即99%可能筛选出所需的PGH基因。三、cDNA文库1、概念:通过一系列的酶催作用,使总Poly(A)mRNA转变成双链cDNA群体,并插入到适当的载体分子上,然后再转化给大肠杆菌寄主菌株的细胞内。如此便构成了包含着所有基因编码序列的cDNA基因文库。分离细胞总RNA,然后从中纯化出主要含mRNA的部分合成第一链cDNAoligo(dT)引导的cDNA合成法、随机引物引导的cDNA合成法将mRNA-DNA杂交分子转变为双链cDNA分子自我引导合成法、RNaseH酶降解取代法将cDNA甲基化及加连接子将合成的双链cDNA重组到质粒载体或噬菌体载体上导入寄主细胞增殖
总RNA的完整性的鉴定libraries以λ噬菌体构建cDNA文库4、cDNA文库的优点1、cDNA克隆以mRNA为起始材料,这对于有些RNA病毒来说非常适用。因为它们的增殖并不经过DNA中间体。2、cDNA基因文库的筛选简单易行。3、每一个cDNA克隆都含有一种mRNA序列,在选择中出现假阳性几率比较低。4、克隆在细菌中表达的基因和基因序列结构的测定。5、表达序列标签的研究(expressedsequencetags,EST)5、cDNA文库的应用用于筛选基因。通过c
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