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文档简介
2013级动医预防兽医实习5-多聚酶链式反应(PCR)技术第一页,共34页。1.学习掌握PCR反应原理;
2.掌握PCR技术的操作过程;
3.掌握琼脂糖凝胶电泳的原理和方法。一、实验目的第二页,共34页。二、实验材料(一)试剂:
1、DNA模板
2、dNTP(三磷酸脱氧核糖核苷),包含dATP,dGTP,dTTP,dCTP。
3、10×PCR缓冲液(含Mg2+)
4、rTaq酶5、上、下游引物
上游引物:5`-GGGGAATTCATGGTGAGCAAGGGC-3`
下游引物:5`-GACCTGCAGGCATGCAAGCTTGGC-3`
6、琼脂糖
7、DNA相对分子质量标准物
8、吸头、PCR管和EP管等。
第三页,共34页。二、实验材料(二)器材
PCR仪,电泳仪,电泳槽,微量移液器,凝胶成像系统等第四页,共34页。三、PCR技术背景
1953年,DNA被发现是细胞里的携带遗传信息的分子。1971年,Khorana等提出在体外经DNA变性,与适当引物杂交,再用DNA聚合酶延伸,克隆DNA的设想。1973年,台湾女科学家钱嘉韵分离出耐热的Taq聚合酶。1985年,
美国KaryMullis发明了PCR技术,并在science杂志上发表了关于PCR技术的第一篇学术论文。1988年Saiki等将耐热DNA聚合酶(Taq)引入了PCR技术1989年美国《Science》杂志列PCR为十余项重大科学发明之首,比喻1989年为PCR爆炸年,KaryMullis荣获1993年诺贝尔化学奖。第五页,共34页。凯利·穆利斯(KaryBanksMullis)第六页,共34页。四、实验原理PCR技术是80年代中期发展起来的一种体外扩增特异DNA片段的技术。此法操作简便,可在短时间内在试管中获得数百万个特异的目的DNA序列的拷贝,PCR技术虽然问世仅数年时间,但它已迅速渗透到分子生物学的各个领域,引起了生物技术发展的一次革命.目前它在分子克隆,目的基础检测,遗传病的基因诊断,法医学,考古学等方面得到了广泛的应用。第七页,共34页。PCR
基本工作原理就是以拟扩增的DNA分子为模板,以一对分别与模板互补的寡核苷酸片段为引物,在DNA聚合酶的作用下,按照半保留复制的机理沿着模板链延伸直至完成新的DNA合成。通过不断重复这一过程,可以使目的DNA片段得到扩增。另一方面,新合成的DNA片段也可以作为模板,因而PCR技术可使DNA的合成量呈指数型增长。
四、实验原理第八页,共34页。PCR三个基本反应步骤:1.变性:在加热或碱性条件下可使DNA双螺旋的氢键断裂,形成单链DNA,称之为变性。2.退火:将温度下降至适宜温度,使引物与模板DNA退火结合;3.延伸:从结合在特定DNA模板上的引物为出发点,将四种脱氧核苷酸以碱基配对形式按5’→3’的方向沿着模板顺序合成新的DNA链。四、实验原理第九页,共34页。PCR技术的原理:1.变性:在加热或碱性条件下可使DNA双螺旋的氢键断裂,形成单链DNA,称之为变性。2.退火:是模板与引物的复性。引物是与模板某区序列互补的一小段DNA片段。3.延伸:从结合在特定DNA模板上的引物为出发点,将四种脱氧核苷酸以碱基配对形式按5’→3’的方向沿着模板顺序合成新的DNA链。四、实验原理第十页,共34页。第十一页,共34页。第十二页,共34页。第十三页,共34页。第十四页,共34页。1234522557294时间(min)温度(℃)PCR的基本原理适温延伸3高温变性1低温退火2重复1-3步25-30轮目的DNA片段扩增100万倍以上DNA双螺旋DNA单链与引物复性DNA变性形成2条单链子链延伸DNA加倍第十五页,共34页。PCR的基本原理PCR反应条件PCR过程PCR的特点1234522557294时间(min)温度(℃)适温延伸3高温变性1低温退火2重复1~3步25~30轮目的DNA片段扩增100万倍以上DNA双螺旋DNA单链与引物复性子链延伸DNA加倍DNA变性形成2条单链模板DNA95℃第十六页,共34页。PCR的基本原理PCR反应条件PCR过程PCR的特点55℃引物1引物2DNA引物第十七页,共34页。PCR的基本原理PCR反应条件PCR过程PCR的特点引物1引物2DNA引物72℃Taq酶Taq酶第十八页,共34页。PCR的基本原理PCR反应条件PCR过程PCR的特点第1轮结束95℃第2轮开始第十九页,共34页。PCR的基本原理PCR反应条件PCR过程PCR的特点55℃TaqTaqTaqTaq第二十页,共34页。PCR的基本原理PCR反应条件PCR过程PCR的特点72℃第2轮结束第二十一页,共34页。PCR的基本原理PCR反应条件PCR过程PCR的特点模板DNA第1轮扩增第2轮扩增第3轮扩增第4轮扩增第5轮扩增第6轮扩增第二十二页,共34页。25uL的PCR反应体系纯水16.0
uL10*Buffer
2.5uL4种dNTP混合物2.0uL引物(上、下)2.5uL模板DNA
2.3uLTaqDNA聚合酶0.3uL五、实验内容第二十三页,共34页。五、实验内容PCR反应程序:(1)95℃变性5min,(2)95℃变性1min,(3)57℃退火30sec,(4)72℃延伸1min。
重复(2)-(4)35次(5)72℃延伸10min。三个步骤为一个循环,每一循环的产物均可作为下一个循环的模板,经过n次循环后,目的DNA以2n的形式增加。第二十四页,共34页。五、实验内容PCR反应五要素:1.引物(primer)2.酶(TaqDNApolymerase)3.dNTP(dATP,dGTP,dCTP,dTTP)4.模板(template)5.Mg2+(magnesium)第二十五页,共34页。五、实验内容第二十六页,共34页。五、实验内容第二十七页,共34页。五、实验内容第二十八页,共34页。五、实验内容第二十九页,共34页。六、实验结果M:对照;
1-6:PCR产物(5ul样品)第三十页,共34页。特异性强灵敏度高皮克(pg=10-12)量级扩增到微克(ug=10-6)水平能从100万个细胞中检出一个靶细胞病毒检测的灵敏度可达3个RFU细菌检测的最小检出率为3个细菌简便、快速一次性加好反应液,2~4小时完成扩增扩增产物一般用电泳分析对标本的纯度要求低血液、体腔液、洗嗽液、毛发、细胞、活组织等组织的粗提DNA七、PCR特点第三十一页,共34页。八、注意事项1、污染PCR能够从极少的样品中,分离出其中的DNA作为模板,对其特定的序列进行大量的扩增。如果样品污染了,特别是扩增系统化中混入了以前扩增的靶序列,将会与样品一样大量扩增,使实验结果难以区别。2、设对照实验。即除不加入模板DNA外,实验的全过程与本实验完全相同的条件同时进行,对照试验不出现扩增电泳带,说明PCR操作过程没有受到污染,反之,说明已污染。。第三十二页,共34页。八、注意事项3、隔离操作PCR扩增仪应与PCR操作场所分开。操作中应戴未污染薄胶手套,所用的试剂及操作仪器应尽可能放在专用柜中
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