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文档简介

2023/2/61医学文献数据库

MEDLINEIE6.0以下版本,应用火狐浏览器

(下载网址及软件)2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室22023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室3一、数据库概况(一)编制单位:美国国立医学图书馆(NLM)。(二)收录学科内容:主要收录生物医学、卫生保健以及生命科学相关文献。包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺学,基础研究和临床、护理、公共卫生、卫生政策发展或相关教育活动的内容。2000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面的研究内容。2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室5二、MEDLINE的检索平台广域网免费平台:NCBI-PubMed(含非MEDLINE数据)2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室6校园网内可用平台(IP控制):OvidSP(含非MEDLINE数据)WebofKnowledgeEBSCOOCLCFirstSearch二、MEDLINE的检索平台2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室7校园网内可用平台的Medline2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室9(一)开发机构:NCBI(美国国立生物技术信息中心)

NCBI的任务:

建立基于计算机信息处理的分子生物学、生物化学、遗传学知识的自动存储和分析系统,并开展相关先进方法的研究。促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用。促进全世界范围内生物技术信息收集的合作。一、PubMed简介2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室10NCBI网站2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室11NCBI提供的数据库检索大分子生物学数据获取GenBank,EMBL等数据库的核酸序列;获取Swiss-port,PIR,PRF,PDB等蛋白质序列,从核酸序列翻译到蛋白质的序列;获取基因和染色体图谱;蛋白质三维结构数据及大分子模式(MMDB)等其他生物信息数据库检索。PubMed等文献数据。2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室13MDENLINEIndexed 1966toprensent的MEDLINE已标引数据,有MeSH字段和摘要,每条记录标有:[PubMed-indexedforMEDNLINE]

OldMDENLINE 1949-1965年间的MEDLINE数据,无MeSH字段和摘要,每条记录标有:[PubMed-OLDMDENLINEforPre1966]

(三)PubMed收录数据2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室14MDENLINEInprocess

最新的MDENLINE处理中数据,未标引,无MeSH字段。每条记录标有:[PubMed-inprocess]。Publisher-Supplied

出版商提供的电子文献题录,每条记录标有: [PubMed-assuppliedbypublisher],分为两类:

MEDLINE收录,逐步转为InProcess,Indexed状态。

NotMEDLINE:PubMed收录,MDELINE不收录,一直标注[PubMed-assuppliedbypublisher]或[PubMed](三)PubMed收录数据2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室15二、PubMed的检索功能基本检索输入框检索限制高级检索检索指南检索工具:特定文献检索临床查询专题查询其他资源:规范词数据库期刊数据库临床试验等个人空间2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室17检索栏可输入布尔逻辑运算式:如:OmeprazoleAND(analogsORderivatives)字段限定符:[],空格按词组匹配如:Stemcelltransplantation[ti](空格=词组运算)如:Omeprazole[ti]pharmacology[ti](空格=“and”运算)三、PubMed基本检索规则2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室18字段限定

stemcelltransplantation[ti]2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室192023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室19stemcell[ti]ANDtransplantation[ti]比空格多检出400篇2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室21著者检索:姓全称在前,名首字母在后,[au]。 如:smithab[au]“paulsene”[au]三、PubMed基本检索规则逻辑运算式输入:PaulsenE撰写的芦荟治疗牛皮癣的文章2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室22刊名检索:全称或MEDLINE认可的标准缩写,[so]

如:Journalofinvestigativedermatology[so] Jinvestdermatol[so]三、PubMed基本检索规则输入刊名检索发表在该刊上的文献(限定出处字段SO)2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室23PubMed记录字段说明文摘第一著者单位地址出版商提供文献识别号著者群版权说明参考评论文献合著者文献参考评论定稿版校样版输入日期输入完成日期电子出版日期2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室25最后修订日期规范词表词规范词确立日期系统组织的文摘版权拥有者题录提供机构的识别号病史相关与原始记录其他关键词提供其他关键词的机构数据提供者机构文章总页数出版商提供数据时间期刊出版国数据库文献编号2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室26作为主题词的个人姓名出版状态文献类型出版模式(纸张或电子)参考文献数已撤回的文献酶或化学物质代码正在撤消中的文章初版文献修订和再版的文章子专题文档太空署提供的数据二次文献数据库以及文章讨论的分子序列访问号原文来源引用了病例的文献内部处理代码标准期刊缩写文献标题翻译标题更新文献文献正在更新期刊卷号2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室29自动转换匹配检索词: 对常用医学名词自动在规范词索引(主题词、副主题词、物质名称)中转换、并在所有记录字段中匹配。

如:tonguecancer"tongueneoplasms"[MeSHTerms]OR("tongue"[AllFields]AND"neoplasms"[AllFields])OR"tongueneoplasms"[AllFields]OR("tongue"[AllFields]AND"cancer"[AllFields])OR"tonguecancer"[AllFields]三、PubMed基本检索规则2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室30结果显示页右侧Details显示系统自动匹配转换的检索词2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室31自动转换匹配检索词:

如:hypertensiontherapy

Details: ("hypertension"[MeSHTerms]OR "hypertension"[AllFields])AND ("therapy"[Subheading]OR"therapy"[AllFields]OR"therapeutics"[MeSHTerms]OR"therapeutics"[AllFields])三、PubMed基本检索规则2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室32四、PubMed检索限制:LimitsPubMed主页、结果显示页、高级检索界面均有Limits链接。2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室33全文、免费全文、摘要限定出版日期限定文献类型限定语种限定研究对象人/动物限定性别限定年龄限定各种专题的子数据库限定2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室34五、PubMed高级检索功能一个网页中集多种功能于一体基本检索检索细节检索式编制检索历史其他检索资源检索词索引结果预览2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室35SearchBuilder(检索式编制):检索框中只能输入检索词,不能输入检索式。多个字段检索要分多次输入。SearchHistory(检索历史):检索历史中显示历次检索式、时间和检出篇数。可组配检索式,如:#1OR#2,#1ANDchild点击编号可对检索式进行删除、保存等操作。Preview(结果预览):在History中快速显示检索式与检出篇数Details(检索词匹配细节):显示转换规范词及运算的详细过程,可确定规范词五、PubMed高级检索规则2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室36六、PubMed其他资源1.MeshDatabase(规范化主题词表)功能:确定规范化主题词查看主题词词义注释、树状结构表选择副主题词、扩展下位主题词、指定主要主题词进入途径:MeSHDatabase链接:PubMed主页,AdvancedSearch界面MeSH选项:基本检索框前Search下拉菜单的2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室37进入MeSH2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室38MeSH词检索例1:2006-10年关于舌根癌药物治疗的文献。课题分析:舌根癌的不同表达形式(OR):

tonguebasecancer、 cancer/carcinoma/tumoroftonguebase、 cancerofthebaseoftongue…药物治疗的不同表达形式(OR):

drugtherapy/treat/treatment两个概念之间:舌根癌AND药物治疗2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室39输入检索词,查找规范词未匹配到规范词改用上级概念“舌癌”匹配2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室40只查重点论述的文献2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室41输入舌根的自由词检索式,进行AND运算。2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室42初步结果,未限定年份2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室432023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室44设定的限制2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室45输入(tonguebase[ti]AND(cancer*[ti]ORcarcinoma*[ti]ORtumor*[ti]))AND(therapyORtreatORtreatment)自由词检索最新文献2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室462023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室47加工中,无MeSH词2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室48比MeSH多3篇2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室49排序方式选择Abstract格式提供全文链接、规范词等信息2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室50点击标题显示文摘增强格式文献归类功能免费全文链接2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室51文摘增强格式相关论文MeSH词、物质名、文献类型等信息LinkOut外部资源链接全文链接,我校订购的数据库可链全文,需在校园网内设免费代理相关的网上免费医学指南信息全文链接2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室522023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室53输出方式选择2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室54输出方式选择(sendto)File:保存检索结果为文本文件Clipboard剪贴板,多次检索,可暂存每次检索需下载的记录,最后一起保存。最多允许存储500条,保留8小时。Email:通过邮件发送Collections:将检索结果存到MyNCBI中Order:全文传递服务,需帐号、收费。2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室542023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室55订阅最新结果点击后点“XML”按钮2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室56需IE7.0以上版本2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室57定期点击链接,接收课题最新相关论文2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室58MeSH词检索例2:2003-09年期间关于霉酚酸酯治疗肾衰竭疗效观察的文献。课题分析:MeSH匹配规范词:mycophenolatemofetilMeSH匹配规范词:

renalfailure,treatmentefficacy(AND)匹配副主题词:

drugtherapy2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室59补充概念(规范词):MeSH主题词未涵盖的药物、物质名称、疾病名、方案。无副主题词选项2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室602023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室612023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室622023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室632023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室64MeSH检索的优点查全同义词:

如:renal/kidneyfailure;tonguecancer/tumor…查全子概念:

如:chronic/acutekidneyfailure,ATN2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室65查全子概念:自动扩展检索下位词勾选后不扩展下位词树形结构上位词MeSH检索的优点查全同义词2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室66MeSH检索的优点根据树形结构调整检索词缩小:不扩展下位词,或选用某个下位词;扩大:选用上位词,或选用多个同位词;了解同一概念的同义词、近义词,供自由词检索参考款目词:规范词所替代的不同表达形式的自由词2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室67MeSH检索的优点提高文献相关度标有MeSH词的都是文章的主题,筛去非主题的文章MajorTopicHeadings(加权,重点论述的主题)带*的是文献重点论述的主题2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室68MeSH检索的缺陷人工标引费时,近6个月左右的论文还未标MeSH词(InProcess),用MeSH会漏检。Medline不收录的文献,Suppliedbypublisher的文献,不标MeSH词。新词、一些很专指的概念没有对应的规范词。如:SARS(03年词表中没有),舌根癌查上述类型的文献需结合自由词检索2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室69六、PubMed其他资源2.JournalsinNCBIDatabase(期刊信息库)通过输入刊名全称或缩写、ISSN号等浏览期刊出版社等详细信息。提供期刊:在PMC中的免费全文链接相关的其他期刊……2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室70输入待检期刊名期刊详细信息全文等链接2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室71

GoPubmed文献分析2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室72GoPubmed——文献分析工具GoPubMed是德国Transinsight公司和德国德累斯顿大学合作开发,对PubMed检索结果进行筛选、分析的工具。智能搜索、交互式筛选找出重要论文。2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室73GoPubMed的功能包括生物医学所有概念及其语义关系GO基因词库MeSH主题词表PRO蛋白质词库2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室74

GoPubMed可以告诉我们4W

WhatWhoWhereWhen2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室752023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室76自动显示备选主题词鼠标移动至主题词可显示注解、同义词等2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室77最近检索历史2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室78四个“W”查看发表文献最多的作者2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室79著者关系图2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室802023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室81案例分析H1N1流感的研究进展利用GoPubMed查找相关文献,并了解以下四个“W”:What,Who,Where,When;了解涉及甲流病毒研究的文章;查找中国(不含省港澳)关于甲流病毒的研究文章2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室82输入规则同PubMed2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室83分析功能2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室84时间分析国家分析2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室85城市分析刊物分析2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室86地区分布图2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室87主题分析作者分析2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室88研究人员关系网线条越多,线形越多,地位越重要2023/2/6复旦大学图书馆文献检索教研室89课题发展趋势2023/

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