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文档简介
原核生物及真核生物DNA复制内容提要:●DNA的半保留复制●与DNA复制有关的物质●DNA的复制过程(大肠杆菌为例)●DNA复制的其它方式●真核生物中DNA的复制特点1、定义:由亲代DNA生成子代DNA时,每个新形成的子代DNA中,一条链来自亲代DNA,而另一条链则是新合成的,这种复制方式称半保留复制。(一)DNA的半保留复制(semi-conservativereplication)(二)与DNA复制有关的物质1、原料:四种脱氧核苷三磷酸(dATP、dGTP、dCTP、dTTP)2、模板:以DNA的两条链为模板链,合成子代DNA3、引物:DNA的合成需要一段RNA链作为引物4、引物合成酶(引发酶):此酶以DNA为模板合成一段RNA,这段RNA作为合成DNA的引物(Primer)。实质是以DNA为模板的RNA聚合酶。5、DNA聚合酶:以DNA为模板的DNA合成酶●以四种脱氧核苷酸三磷酸为底物●反应需要有模板的指导●反应需要有3-OH存在●DNA链的合成方向为53原核生物中的DNA聚合酶(大肠杆菌)性质聚合酶Ⅰ聚合酶Ⅱ聚合酶Ⅲ3'5'外切活性+++5'3'外切活性+--5'3'聚合活性+中+很低+很高新生链合成--+主要是对DNA损伤的修复;以及在DNA复制时切除RNA引物并填补其留下的空隙。修复紫外光引起的DNA损伤DNA复制的主要聚合酶,还具有3’-5‘外切酶的校对功能,提高DNA复制的保真性真核生物中的DNA聚合酶
α
β
γ
δ
ε定位细胞核细胞核线粒体细胞核细胞核3‘-5’外切--+++酶活性功能引物合成修复作用线粒体DNA的复制核DNA的复制?
6、DNA连接酶(1967年发现):若双链DNA中一条链有切口,一端是3’-OH,另一端是5‘-磷酸基,连接酶可催化这两端形成磷酸二酯键,而使切口连接。但是它不能将两条游离的DNA单链连接起来
DNA连接酶在DNA复制、损伤修复、重组等过程中起重要作用3‘5‘3‘5‘OHP7、DNA拓扑异构酶(DNATopisomerase):拓扑异构酶І:使DNA一条链发生断裂和再连接,作用是松解负超螺旋。主要集中在活性转录区,同转录有关。
例:大肠杆菌中的ε蛋白拓扑异构酶Π:该酶能暂时性地切断和重新连接双链DNA,作用是将负超螺旋引入DNA分子。同复制有关。例:大肠杆菌中的DNA旋转酶7、DNA解螺旋酶/解链酶(DNAhelicase)通过水解ATP获得能量来解开双链DNA。中的rep蛋白就是解螺旋酶,还有解螺旋酶I、II、III。rep蛋白沿3’5’移动,而解螺旋酶I、II、III沿5’
3’移动。9、单链结合蛋白(SSBP-single-strandbindingprotein):稳定已被解开的DNA单链,阻止复性和保护单链不被核酸酶降解。(三)DNA的复制过程(大肠杆菌为例)双链的解开
RNA引物的合成
DNA链的延伸切除RNA引物,填补缺口,连接相邻的DNA片段1、双链的解开
DNA的复制有特定的起始位点,叫做复制原点。ori(或o)、富含A、T的区段。基本概念:从复制原点到终点,组成一个复制单位,叫复制子复制时,解链酶等先将DNA的一段双链解开,形成复制点,这个复制点的形状象一个叉子,故称为复制叉复制叉复制叉复制方向和速度:
单起点、双向等速多起点、双向等速双链解开、复制起始大约20个DnaA蛋白在ATP的作用下与oriC处的4个9bp保守序列相结合2、RNA引物的合成DnaB蛋白活化引物合成酶,引发RNA引物的合成。引物长度约为几个至10个核苷酸,DNA的半不连续复制(semi-discontinuousreplication)DNA复制时其中一条子链的合成是连续的,而另一条子链的合成是不连续的,故称半不连续复制。在DNA复制时,合成方向与复制叉移动的方向一致并连续合成的链为前导链;合成方向与复制叉移动的方向相反,形成许多不连续的片段,最后再连成一条完整的DNA链为滞后链。3、DNA链的延伸在DNA复制过程中,前导链能连续合成,而滞后链只能是断续的合成53的多个短片段,这些不连续的小片段称为冈崎片段。4、切除RNA引物,填补缺口,连接相邻的DNA片段(复制终止)在DNA聚合酶Ⅰ催化下切除RNA引物;留下的空隙由DNA聚合酶Ⅰ催化合成一段DNA填补上;在DNA连接酶作用下,连接相邻的DNA链双链环状、θ型复制、双向等速(五)真核生物中DNA的复制特点1、真核生物每条染色体上有多个复制起点,多复制子2、真核生物染色体在全部复制完之前,各个起始点不再重新开始DNA复制;而在快速生长的原核生物中,复制起点可以连续开始新的复制(多复制叉)。真核生物快速生长时,往往采用更多的复制起点。3、真核生物有多种DNA聚合酶。1复制概况a、多个复制子,双向复制b、复制子相对较小(13-900kb),复制速度较慢,大约500~5000bp/min(3000bp/min)冈崎片段100~200bpc、复制终止通过复制叉的相遇而终止(五)真核生物中DNA的复制d.不同的发育时期,真核的复制起始点和复制子的大小会变化。有些复制起点在不同的发育阶段就不再发挥作用。如果蝇受精后复制原点从五千个上升到五万个。发育早期,每个复制子长7.9Kb,成体时,每个复制子长40Kb,很多Ori区不再起作用。真核生物DNA聚合酶及有关蛋白
表真核生物五种DNA聚合酶DNA聚合酶αδεβγ位置核核核核线粒体功能引发合成修复修复复制相对活性80%
10-15%2-15%分子量300K170-230K250K40K180-300K亚基催化核心(180K)两个引物酶(60,50K)一个未知催化核心(125K)一个未知(25K)催化核心一个未知催化催化3’→5’外切-++-+双脱氧T不影响不影响弱抑制抑制蚜黄素抑制抑制抑制不影响不影响
表真核复制需要的酶和蛋白蛋白亚基功能DNA聚合酶α/引发酶4引物合成DNA聚合酶δ2DNA合成PCNA1延伸(滑动钳作用)复制因子RF-C
3延伸(载体作用)复制因子RF-A3单链结合拓扑异构酶Ⅰ和Ⅱ
维持DNA的拓扑结构2
SV40复制
双链环状DNA,具有核小体,全长5243bp2.1复制起始区:具有2个位点位点2包括以下:10bp的前期区,27bp的T抗原结合位点,含GAGGC17bp的A-T丰富区。真核生物DNA复制叉结构示意图3酵母的自主复制区ARS(autonomouslyreplicatingsequence)序列,在酵母染色体复制和质粒复制中均发挥复制起点的功能。A、B起主要作用,C区作用微弱。ARS1分为A,B,C三个功能区:A区:15bp,其中11个保守,称ACS
:5′ATTTAT(T/C)TTTA3′有复制起始子的功能。B区:约80bp,含B1,B2,B3三个区。B3:ABF1(ARS-bindingfactor1)结合区ABF14真核生物DNA末端的复制
(1)端粒DNATTGGGG(T2G4)序列高度重复的末端
5’TTGGGGTTGGGGTTGGGGTTGGGG3’(富含G链)
3’AACCCCAACCCCAACCCC5’(富含C链)
(2)端粒酶:首先在四膜虫中发现端粒酶:特殊的反转录酶,由蛋白质和RNA组成。端粒酶以自身携带的150bp的RNA为模板,在随从链模板DNA的3′OH末端延长DNA,再以这种延长的DNA为模板,继续合成随从链。Greider和Blackburn(1989),1)端粒酶与端粒DNA结合,端粒酶中的RNA与凸出的3’引物配对;2)以RNA为模板,在3’端上从头合成六个Nt;3)合成一个重
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