计算数理実践-HPC-课件

1、12009年度計算数理実践-HPC-第3回遠藤 敏夫2009年10月19日OpenMP共有(1)12009年度計算数理実践-HPC-第3回遠藤 敏夫Op2並列，分類逐次/共有分散達共通可能 OpenMP(言語拡張) pthread() CUDA (言語拡張)間通信必要 MPI () socket () UPC, HPF(言語拡張)2並列，分類逐次3並列分類分類MIMD(multiple instruction, multiple data)共有分散必一対一対応3並列分類分類共有4共有様対称型共有Symmetric multi-processor(SMP)分散共有Distributed shar

2、ed memory(DSM)同性能 PC性能差 TSUBAME各 Origin 20004共有様対称型共有5TSUBAME内:共有間:分散近年共有分散組合BlueGene, RoadRunner, T2K, 地球28DSM6556個2個図Tesla, ClearSpeed省5TSUBAME内:共有6内場合(TSUBAME16並列以下)共有 (OpenMP)分散 (MPI)場合分散分散共有 (MPI + OpenMP)共有分散分散SMPDSM分散共有最適化違考慮6内場合(TSU7OpenMP共有並列APIC言語，C+, Fortran対応並列化指示文，関数指示文：#pragma openmp 基

3、本Fork-Join変数基本的間共有以下明示的記述分割間同期変数共有区別7OpenMP共有並列A8OpenMP並列Region#include int main()A;#pragma omp parallelB;C;#pragma omp parallelD;E;ABCDE#pragma omp parallel直後文並列Region並列Region呼関数並列実行forkjoin8OpenMP並列Region#include omp.9数指定取得数指定外，OMP_NUM_THREADS環境変数n1ge-smp n内omp_set_num_threads(n)関数#pragma omp para

4、llel num_threads(n)数取得omp_get_num_threads()関数自番号取得omp_get_thread_num()関数0以上数未満9数指定取得数指定10OpenMP対応近年増加PGI (pgcc)時時-mp並列?(7.2確認)Intel (icc)時時-openmp並列(10.1確認)Gcc 4.2以降時時-fopenmpTSUBAME残念4.110OpenMP対応近年増加OpenMP用円周率tendo/aahpc09/pi-omp実行例： ./pi 1000000行列積tendo/aahpc09/mm1-omp 実行例: ./mm1 500 500 500実行前、e

5、xport OMP_NUM_THREADS=4 数指定利用指示文、次回紹介11OpenMP用円周率1112参考文献OpenMP official site: OpenMP http:/phase.hpcc.jp/Omni/openmp-tutorial/index.htm東大OpenMPhttp:/www.cc.u-tokyo.ac.jp/seminar/kosyu/kosyu-openmp_c.pdf牛島省，OpenMP並列数値計算法，丸善，2006Red-black SOR, LU分解，FFTFORTRAN言語12参考文献OpenMP official site: ht13連絡先/ContactTSUBAME，以下連絡計算世界観課金登録endois.titech.ac.jp題名：計算数理実践subject: HPC lecture account専攻研究室学年氏名名E-mail (titech.ac.jp)Lecture web page:http:/compview.titech.ac.jp/Members/endot/