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文档简介

1、第十三章 基因表达调控思路:系列酶促反应的调节 基因表达调控 基因表达 调控 定义 特点 方式 意义 调节点 基本要素 特点 机制共性原核(主)真核第一节 基因表达调控基本概念与原理 一、基因表达(一).定义 基因表达:基因在各种调节机制下,经过系列 步骤表现出其生物功能的过程。 即基因转录或转录与翻译的过程。 转录+翻译 蛋白质(主) 转录 rRNA、tRNA基因:载有特定遗传信息的DNA片段.基因组:一个细胞或病毒所携带的全部遗传 信息或整套基因 (二)、特点 具有时空性1时间特异性(阶段特异性) 定义:指某一特定基因的表达严格按 特定时间顺序发生。 e.g :不同时间、阶段表达多少不同

2、感染、发育(早期表达多)2空间特异性(细胞,组织特异性) 定义:指某一基因的表达按不同组织 空间顺序发生。 e.g :不同组织、细胞表达产物多少不同(三)、方式 基本表达 对刺激反应小 适应性表达(诱导或阻遏) 对刺激反应大 1基本表达(组成性基因表达) a.定义:不易受环境变化影响的基因表达。 即管家基因表达 管家基因:在机体所有细胞中持续表达的基因; 表达产物是整个生命过程中都持续需要的。 即进行基本表达的基因。b. 影响因素: 启动序列 启动子与RNA-pol相互作用 c.意义:维持生命的基本途径。2适应性表达 定义:易受环境变化影响的基因表达。 形式: 诱导:受环境条件变化基因表达增强

3、的现象。 阻遏:受环境条件变化基因表达减弱的现象。 影响因素: 启动序列 启动子与RNA-pol相互作用 其他机制(含对特定刺激的反应元件) 意义:适应环境的基本途径。3.协调表达:在基本和适应性表达中,功能相关的 基因表达协调一致。1.特异DNA序列(调节功能) (1).原核生物 操纵子 a.定义:原核基因的转录单位,由功能相关的 一组结构基因及其上游的调节序列(启动 子.操纵序列和其它调节序列)组成。 b. 结构、作用: 编码序列 转录的mRNA为多顺反子 (结构基因) 启动序列 RNA-pol识别、结合部位 操纵序列 阻遏蛋白结合部位,控制 转录的开关,负调节 其它调节序列 激活蛋白结合

4、部位,正 调节(2)、真核生物 顺式作用元件 a.定义:是指真核生物DNA分子中参与基因转 录调控的特异DNA序列。 b.成分和功能: 启动子 RNA-pol识别、结合的部位 增强子 决定基因表达时空性,增强启动 子作用。 正调节 沉默子 抑制基因转录.负调节 增强子: 是指能决定基因表达时空性,增 强启动子活性的特异DNA序列。 其作用方式与方向、距离无关。 沉默子: 是指能抑制基因转录的特异 DNA序列。 反式作用因子 a. 定义:结合另一基因的顺式作用元件, 并激活该基因转录的蛋白质。 b.分类: 基本转录因子:是作用于启动子, 维持基因基础转录 (即转录成 mRNA.tRNA.rRNA

5、) 包括:TFI、TFII、TFIII。 特异转录因子:作用于增强子和沉默子, 为个别基因转录所必需, 决定该基因表达的时空性 包括 转录激活因子 增强子 转录抑制因子 沉默子 c.结构 DNA结合域 识别、结合特 锌指结构(主) 异DNA顺式元件 碱性-亮氨酸拉链 碱性螺旋-环-螺旋 转录激活域 调节基因 酸性-螺旋结构域 转录效率 富含Gln结构域 富含Pro结构域 二聚化结构域 与DNA结构域 结构有关3调节蛋白与DNA结合方式 直接 (DNA-蛋白质相互作用, 多指反式作用): 调节蛋白直接识 别、 结合 特异DNA序列 。反式作用 间接(主) (蛋白-蛋白-DNA相互作用): 调节蛋

6、白 先形成蛋白聚体 (二聚 体为主),蛋白聚体再结合特 异DNA序列。第二节 原核基因转录调节多级调控,最关键点是转录起始E.g :转录起始一、调节特点 1因子决定RNA-pol识别特异性 2操纵子模式具有普遍性 3阻遏调节具有普遍性(负性调节占主导)2调节 方式 负性调节 协调调节 正性调节(1)负性调节 (阻遏蛋白控制) 图 乳糖 无:阻遏蛋白结合操纵序列,抑制转录。 有:阻遏蛋白结合乳糖,不能结合 操纵序列, 转录开启。(去阻遏) (2)正性调节 (CAP控制) 图 葡萄糖 无:CAP活化(活化形式为CAP-cAMP), 结合调节序列,促转录。 有 :CAP失活(cAMP少), 不能结合

7、调节序列,抑制转录。 (3)协调调节: 定义:负性调节和正性调节相互协调。 目的:适应环境(根据环境碳源,进行 不同代谢)。 机制:一种调节方式有某种调节意向时, 另一 种方式即会作出相应的支持。 E.g:分解代谢阻遏 图 葡萄糖对lac操纵子的阻遏作用 a. 葡萄糖与半乳糖并成时, 细菌首选利用葡萄糖; cAMP , 不能合成cAMP-CAP, CAP不能结合调节序 列 , 抑制转录。 b. 此时、即使阻遏蛋白从操纵序列上脱落, 也不能转录。 阻遏蛋白 (脱落)负调节 支持 CAP负调节 负性调节占主导(二)其它调节机制 1转录衰减 产物对酶的抑制。 机制:e.g: E.coli Trp 操

8、纵子 Trp 多,Trp阻遏蛋白复合 物结合O序列,阻断转录。 图 转录衰减 前导肽诱导形成衰减子(发 夹结构)阻断转录。 图 2基因重组 引起变异, 逃避宿主免疫监视。 3SOS反应 产生修复蛋白, 急救修复损伤DNA。第三节 真核基因转录调节多级性(较原核复杂),核心途径: 环境信号传导 染色体活化 基因转录激活本节讲mRNA转录激活(转录起始)一、真核基因组特点1基因组庞大,且结构复杂。 基因组:一个细胞所携带的全部遗传信 息或整套基因。 人:3109bp 编码基因6、 重复基因510、 无遗传学功能基因80-90。2单顺反子3重复序列多 多拷贝序列 高度重复序列(106次) tRNA.

9、 中度重复序列(103104次) rRNA 单拷贝序列 重复一次或几次 结构基因4是断裂基因(三)调节机制 (不清)复杂、多样。DNA元件和TF不同,调节方式与效果不同。 基本转录因子 协助RNA-pol与启动子 结合,形成PIC。 特异转录因子(TAF,EBP) 决定组织特 异性转录。转录起始过程:转录起始激活过程: TFIID(含TBP)识别TATA盒 TAF TFIID-启动子复合物 RNA-pol TFIIA-F PIC(不稳定,不能有效启动mRNA转录) EBP(增强子结合因子) 转录起始复合物(稳定,此时RNA-pol II才有 活性,启动转录。但其组织 特异性由TAF和EBP共同

10、决 定。) 1) 启动序列(启动子):是RNA聚合 酶结合并启动转录的特异DNA序列。 2) 操纵序列(operator):是阻遏蛋白的结合位点 当操纵序列结合有阻遏蛋白时,会阻碍RNA聚合酶与启动序列的结合,或使RNA聚 合酶不能沿DNA向前移动,阻碍转录。 TF (一)乳糖操纵子的结构R (二)阻遏蛋白的负性调节没有乳糖存在时 有乳糖存在时 (三)CAP的正性调节 (四)协调调节 ().转录衰减 转录衰减(attenuation): 是指转录可正常起动,但在转录进入第一个结构基因前即突然停止的过程。由于这一终止作用并不能使正在进行的结构基因转录中途停止,而仅是部分中途停止转录,所以称为转录

11、衰减。 衰减子(attenuator): 操纵子前导区内类似于终止子结构 的一段DNA序列,称为衰减子。其作用 是减弱操纵子的转录。 转录衰减机制: 实质上是转录与一个前导肽翻译过程的偶联。当色氨酸浓度高时: 当色氨酸浓度低时: (二)基因重组沙门菌鞭毛素基因的调节 (三)SOS反应 2. 转录调节因子结构 DNA结合域 转录激活域 蛋白质蛋白质结合域(二聚化结构域) 常见的DNA结合域: 锌指(zinc finger) 亮氨酸拉链(leucine zipper) 螺旋环螺旋(helix-loop-helix)总结:基因表达调控基因表达 :定义 特点 方式调控的共性:意义 调节点 基本要素原核

12、的调控(主):特点 机制(乳糖操纵子学说)真核的调控:基因组特点 调控特点 第十三章 基因表达调控第一节 基因表达调控基本概念与原理一、基因表达定义 基因转录或转录与翻译的过程。基因组:一个细胞或病毒所携带的全部遗传 信息或整套基因二、基因表达特点 具有时间特异性和空间特异性三、基因表达 方式 基本表达 和适应性表达(诱导或阻遏)四、基因表达调控意义 适应环境、 维持生长和增殖 、 维持个体发育与分化第二节 基因表达调控基本原理一、调控点多、转录起始为基本点二、基因表达调控转录激活基本要素: 特异DNA序列、调节蛋白、RNA聚合酶 、即其间的作用方式第三节 原核基因转录调节一、特点 因子决定R

13、NA-pol识别特异性、操纵子模式具有普遍性 、负性调节占主导。二、乳糖操纵子 调节序列( R序列+O序列+P序列)+结构基因+终止子 三、乳糖操纵子调节机制 阻遏蛋白结合操纵序列、负性调节 、抑制转录; CAP结合R序列、正性调节 、诱导转录;正性调节与负性调节 相互协调、负性调节占主导。四、其它调节机制 转录衰减、基因重组 、SOS反应第四节 真核基因转录调节一、真核基因组结构特点 基因组结构庞大、单顺反子、重复序列多、是断裂基因。二、真核基因表达调控特点 TF 协助RNA-pol识别DNA序列、活性染色体结构发生变化 、正性调节占主导、转录与翻译分隔进行、转录后加工修饰复杂。 三、基本概

14、念顺式作用元件:真核生物DNA分子中参与基因转 录调控的特异DNA序列。启动子 : RNA-pol识别、结合的DNA序列增强子: 是指能决定基因表达时空性,增 强启动子活性的特异DNA序列。其作用方式与方向、距离无关。沉默子: 是指能抑制基因转录的特异DNA序列。反式作用因子 :结合另一基因的顺式作用元件、并激活该基因转录的蛋白质。基本转录因子:是作用于启动子,维持基因基础转录。特异转录因子:作用于增强子和沉默子, 为个别基因转录所必需,决定该基因表达的时空性。 第十四章 基因重组与基因工程第一节 自然界的基因转移和重组一、基因重组定义:指细胞基因组中DNA顺序重新 排列组合的现象。二、基因重组类型:位点特异重组、同源重组三、方式: 接合、转化、转导、转座四、基本概念接合:指供体细胞(细菌)和受体细胞(细菌)接触,使DNA从一个细胞(细菌)转移到另一个细胞 (细菌)的过程。转化:指外源DNA被引入细胞,导致其遗传和生 物性状改变的过程。转导:以病毒为媒介、将供体菌的DNA片段转移到受体菌基因组的过程。转座:游动基因从基因组的一处移动到另一处 的过程。 第二节 基因工程一、基因工程定义:指在体外用人工的

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