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1、蛋白质化学医学讲座蛋白质化学医学讲座 第一节 蛋白质的元素组成 N含量在各种蛋白质中比较接近 15%18% ,平均为16%。 每1g 氮相当于 6.25g 的蛋白质 蛋白质平均含N量为16,这是凯氏定氮法测定蛋白质含量的理论依据: 粗蛋白质含量蛋白质含N量6.252蛋白质化学医学讲座 第一节 蛋白质的元素组成 N含量在各方法:常用6 mol/L的盐酸或4 mol/L的硫 酸,回流煮沸时间约 20 h。优点:不引起消旋作用,得到的是L-氨基酸。缺点:色氨酸被沸酸完全破坏;含有羟基的氨 基酸(丝氨酸、苏氨酸)有一小部分 被分解;天冬酰胺和谷氨酰胺的酰胺基 被水解成了羧基。第二节 蛋白质的氨基酸组成
2、 1. 酸水解一、蛋白质的水解3蛋白质化学医学讲座方法:常用6 mol/L的盐酸或4 mol/L的硫 第二节2. 碱水解方法:一般用5 mol/L氢氧化钠煮沸1020 h。 优点:色氨酸在水解中不受破坏。 缺点:多数氨基酸受到不同程度的破坏,产生 消旋现象,得到的是D-和L-氨基酸的混 合物。此外,引起精氨酸脱氨(生成鸟 氨酸和尿素)。4蛋白质化学医学讲座2. 碱水解方法:一般用5 mol/L氢氧化钠煮沸10203. 酶水解方法:用于蛋白质肽链断裂的蛋白水解酶或称 蛋白酶(proteinase)已有十多种,常用 的有胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶(或称糜 蛋白酶)及胃蛋白酶等。优点:不产生消旋作用,也
3、不破坏氨基酸。水解 位点特异,用于一级结构分析,肽谱 缺点:使用一种酶往往水解不彻底,需几种酶协同作用才能使蛋白质完全水解。该法主要用于部分水解。5蛋白质化学医学讲座3. 酶水解方法:用于蛋白质肽链断裂的蛋白水解酶或称5蛋白质二、氨基酸的功能:1. 组成蛋白质2. 一些aa及其衍生物充当化学信号分子-amino butyric acid (-氨基丁酸)、Serotonic(5-羟色胺,血清紧张素)、melatonin(褪黑激素,N-乙酰-甲氧基色胺),都是神经递质,后二者是色氨酸衍生物(神经递质是一个神经细胞产生的影响第二个神经细胞或肌肉细胞功能的物质)。Thyroxine(甲状腺素,动物甲状
4、腺thyroid gland产生的Tyr衍生物)和吲哚乙酸(植物中的Trp衍生物)都是激素(激素就是一个细胞产生的调节其它细胞的功能的化学信号分子)。6蛋白质化学医学讲座二、氨基酸的功能:1. 组成蛋白质6蛋白质化学医学讲座3. 氨基酸是许多含N分子的前体物 核苷酸和核酸的含氮碱基、血红素、叶绿素的合成都需要aa4. 一些基本氨基酸和非基本aa是代谢中间物 精氨酸、Citrulline(瓜氨酸)、Ornithine(鸟氨酸)是尿素循不(Urea cycle)的中间物,含氮废物在脊椎动物肝脏中合成尿素是排除它们的一种重要机制。7蛋白质化学医学讲座3. 氨基酸是许多含N分子的前体物7蛋白质化学医学
5、讲座三、氨基酸的结构与分类1809年发现Asp,1938年发Thr,目前已发现180多种。但是组成蛋白质的aa常见的有20种,称为基本氨基酸(编码的蛋白质氨基酸),还有一些称为稀有氨基酸,是多肽合成后由基本aa经酶促修饰而来。此外还有存在于生物体内但不组成蛋白质的非蛋白质氨基酸(约150种)。(一)编码的蛋白质氨基酸(20种)也称基本氨基酸或标准氨基酸,有对应的遗传密码。 8蛋白质化学医学讲座三、氨基酸的结构与分类8蛋白质化学医学讲座-氨基酸的一般结构氨基在-位,为L-构型.除脯氨酸外,均为-氨基酸除甘氨酸外,均为手性氨基酸9蛋白质化学医学讲座-氨基酸的一般结构除脯氨酸外,均为-氨基酸9蛋白质
6、化学医氨基酸的分类1. 按R基的化学结构分类 可以分为三类:脂肪族、芳香族和杂环族 脂肪族氨基酸 含一氨基一羧基的中性氨基酸甘氨酸 Gly, G丙氨酸 Ala, A缬氨酸 Val, V亮氨酸 Lue, L异亮氨酸 Ile, I10蛋白质化学医学讲座氨基酸的分类1. 按R基的化学结构分类甘氨酸 Gly R基均为中性烷基(Gly为H),R基对分子酸碱性影响很小,它们几乎有相同的等电点。(6 .00.03) Gly是唯一不含手性碳原子的氨基酸,因此不具旋光性。 从Gly至Ile,R基团疏水性增加,Ile 是这20 种a.a 中脂溶性最强的之一(除Phe 2.5、Trp3.4 、Tyr 2.3以外)。
7、 11蛋白质化学医学讲座 R基均为中性烷基(Gly为H),R基对分子酸碱丝氨酸 (Ser,S)苏氨酸 (Thr,T)半胱氨酸 (Cys,C)甲硫氨酸 (Met,M)含羟基或硫脂肪族氨基酸12蛋白质化学医学讲座丝氨酸 (Ser,S)苏氨酸 (Thr,T)含羟基的有两种:Ser和Thr Ser的-CH2 OH基(pKa=15),在生理条件下不解离,但它是一个极性基团,能与其它基团形成氢键,具有重要的生理意义。在大多数酶的活性中心都发现有Ser残基存在。 Thr 中的-OH是仲醇,具有亲水性,但此-OH形成氢键的能力较弱,因此,在蛋白质活性中心中很少出现。Ser和Thr的-OH往往与糖链相连,形成糖
8、蛋白。含硫的两种:Cys、Met Cys中R含巯基(-SH),Cys 具有两个重要性质: (1)在较高pH值条件,巯基离解。 (2)两个Cys的巯基氧化生成二硫键,生成胱氨酸 ( CysssCys) 13蛋白质化学医学讲座含羟基的有两种:Ser和Thr13蛋白质化学医学讲座 二硫键在蛋白质的结构中具有重要意义。 Cys还常常出现在酶的活性中心。Met的R中含有甲硫基(-SCH3),硫原子有亲核性,易发生极化,因此,Met是一种重要的甲基供体。Cys与结石在细胞外液如血液中,Cys以胱氨酸(Cystine)氧化形式存在,胱氨酸的溶解性最差。胱氨酸尿(Cystinuria)是一种遗传病,由于胱氨酸
9、的跨膜运输缺陷导致大量的胱氨酸排泄到尿中。胱氨酸在肾(Kidney)、输尿管(ureter)、膀胱(urinary bladder)中结晶形成结石(Calculus, calculi),结石会导致疼痛、发炎甚至尿血。大量服用青霉胺(Penicillcemine)能降低肾中胱氨的含量,因为青霉胺与半胱氨酸形成的化合物比胱氨酸易溶解。14蛋白质化学医学讲座 二硫键在蛋白质的结构中具有重要意义。14蛋白质化学酸性氨基酸及酰胺天冬氨酸 (Asp,D)谷氨酸 (Glu,E)天冬酰胺 (Asn,N)谷氨酰胺 (Gln,Q)15蛋白质化学医学讲座酸性氨基酸及酰胺天冬氨酸 (Asp,D)谷氨酸 Asp、Glu
10、,一般称酸性氨基酸Asp侧链羧基pKa(-COOH)为3.86,Glu侧链羧基pKa(-COOH)为4.25它们是在生理条件下带有负电荷的仅有的两个氨基酸。Asn、Gln 酰胺基中氨基易发生氨基转移反应,转氨基反应在生物合成和代谢中有重要意义16蛋白质化学医学讲座Asp、Glu,一般称酸性氨基酸16蛋白质化学医学讲座碱性氨基酸赖氨酸 (Lys,K)精氨酸 (Arg,R)组氨酸 (His,H)杂环17蛋白质化学医学讲座碱性氨基酸赖氨酸 (Lys,K)精氨酸 (Lys的R侧链上含有一个氨基,侧链氨基的pKa为10.53。生理条件下,Lys侧链带有一个正电荷(NH3+),同时它的侧链有4个C的直链,
11、柔性较大,使侧链的氨基反应活性增大。(如肽聚糖的短肽间的连接)Arg是碱性最强的氨基酸,侧链上的胍基是已知碱性最强的有机碱,pKa值为12.48,生理条件下完全质子化。His含咪唑环,咪唑环的pKa在游离氨基酸中和在多肽链中不同,前者pKa为6.00,后者为7.35,它是20种氨基酸中侧链pKa值最接近生理pH值的一种,在接近中性pH时,可离解平衡。它是在生理pH条件下唯一具有缓冲能力的氨基酸。 His含咪唑环,一侧去质子化和另一侧质子化同步进行,因而在酶的酸碱催化机制中起重要作用。 18蛋白质化学医学讲座Lys的R侧链上含有一个氨基,侧链氨基的pKa为10.53。2、芳香族氨基酸苯丙氨酸 (
12、Phe,F)酪氨酸 (Tyr,Y)色氨酸 (Trg,W)19蛋白质化学医学讲座2、芳香族氨基酸苯丙氨酸 (Phe,F)酪氨酸 都具有共轭电子体系,易与其它缺电子体系或电子体系形成电荷转移复合物( charge-transfer complex)或电子重叠复合物。在受体底物、或分子相互识别过程中具有重要作用。这三种氨基酸在近紫外区有特殊吸收峰,蛋白质的紫外吸收主要来自这三种氨基酸,在280nm处,TrpTyrPhe。Phe疏水性最强.。酪氨酸的-OH磷酸化是一个十分普遍的调控机制,Tyr在较高pH值时,酚羟基离解。Trp有复杂的共轭休系,比Phe和Tyr更易形成电荷转移络合物。 20蛋白质化学医
13、学讲座都具有共轭电子体系,易与其它缺电子体系或电子体系形成电荷3、杂环氨基酸组氨酸 (His,H)脯氨酸 (Pro,P)21蛋白质化学医学讲座3、杂环氨基酸组氨酸 (His,H)脯氨酸 Pro,有时也把His、Trp归入此类。Pro是唯一的一种环状结构的氨基酸,它的-亚氨基是环的一部分,因此具有特殊的刚性结构。它在蛋白质空间结构中具有极重要的作用,一般出现在两段-螺旋之间的转角处,Pro残基所在的位置必然发生骨架方向的变化22蛋白质化学医学讲座Pro,有时也把His、Trp归入此类。22蛋白质化学医学讲2. 按R基的极性分类(能否与水形成氢键) 20种基本氨基酸可以分成以下四组: 1、非极性氨
14、基酸(八种) Ala、Val、Leu、Ile、Phe、Trp、Met、 Pro 这类氨基酸的R基都是疏水性的,在维持蛋白质的三维结构中起着重要作用。2、极性不带电荷的氨基酸(七种) 6种,丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸、半胱氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺。这类氨基酸的侧链都能与水形成氢键,因此很容易溶于水。酪氨酸的-OH磷酸化是一个十分普遍的调控机制,Ser和Thr的-OH往往与糖链相连,Asn和Gln的-NH2很容易形成氢键,因此能增加蛋白质的稳定性。23蛋白质化学医学讲座2. 按R基的极性分类(能否与水形成氢键) 3、极性带正电荷的氨基酸 三种碱性氨基酸:Lys、Arg、His 在 pH7 时带正电荷。
15、当胶原蛋白中的Lys侧链氧化时能形成很强的分子间(内)交联。Arg的胍基碱性很强,与NaOH相当。His是一个弱碱,在 pH6.0 时,His 的 R 基 50% 以上质子化,但 pH7.0 时,质子化的分子不到10% His 是 R 基的pK值在7附近的唯一的氨基酸。 是天然的缓冲剂,它往往存在于许多酶的活性中心。 24蛋白质化学医学讲座3、极性带正电荷的氨基酸 三种碱性氨基酸:Lys、Arg、H 4、极性带负电荷的氨基酸 两种酸性氨基酸:Asp、Glu。在pH67时,谷氨酸和天冬氨酸的第二个羧基解离,因此,带负电荷。酶的活性中心:His、Ser、Cys非极性aa一般位于蛋白质的疏水核心,带
16、电荷的aa和极性aa位于表面。 25蛋白质化学医学讲座 4、极性带负电荷的氨基酸25蛋白质化学医学讲座三个有特性的氨基酸 一是脯氨酸(Pro),因为它是一个环状的亚 氨基酸。它的氨基和其它氨基酸的羧基形成的 肽键有明显的特点,较易变成顺式肽键。26蛋白质化学医学讲座三个有特性的氨基酸 一是脯氨酸(Pro),因为它是一个环状的二是甘氨酸(Gly),它是唯一的在碳原子上只有两个氢原子,没有侧链的氨基酸。为此它既不能和其它残基的侧链相互作用,也不产生任何位阻现象,进而在蛋白质的立体结构形成中有其特定的作用。第三个是半胱氨酸(Cys)。它的个性不仅表现在其侧链有一定的大小和具有高度的化学反应活性,还在
17、于两个 Cys 能形成稳定的带有二硫(桥)键的胱氨酸。二硫键不仅可以在肽链内,也可以在肽链间存在。更有甚者,同样的一对二硫键能具有不同的空间取向。 27蛋白质化学医学讲座二是甘氨酸(Gly),它是唯一的在碳原子上只有两个氢原子(浙江大学2006年题)按氨基酸R基的极性性质将其分为哪几类?请写出各类的性质,氨基酸的名称以及三字符号和单子符号解析:主要考察编码蛋白质的20种氨基酸的结构和极性及单字和三字符号28蛋白质化学医学讲座(浙江大学2006年题)按氨基酸R基的极性性质将其分为哪几类二、非编码的蛋白质氨基酸也称修饰氨基酸,是在蛋白质合成后,由基本氨基酸修饰而来。Prothrombin(凝血酶原
18、)中含有-羧基谷氨酸,能结合Ca2+。结缔组织中最丰富的蛋白质胶原蛋白含有大量4-羟脯氨酸和5-羟赖氨酸。 (1)4-羟脯氨酸 (2)5-羟赖氨酸这两种氨基酸主要存在于结缔组织的纤维状蛋白(如胶原蛋白)中。(3)6-N-甲基赖氨酸(存在于肌球蛋白中) (4)-羧基谷氨酸 存在于凝血酶原及某些具有结合Ca2+离子功能的蛋白质中。(5)Tyr的衍生物: 3.5 -二碘酪氨酸、甲状腺素 (甲状腺蛋白中)(6)锁链素由4个Lys组成(弹性蛋白中)。29蛋白质化学医学讲座二、非编码的蛋白质氨基酸29蛋白质化学医学讲座(三)非蛋白质氨基酸除参与蛋白质组成的20多种氨基酸外,生物体内存在大量的氨基酸中间代谢
19、产物,它们不是蛋白质的结构单元,但在生物体内具有很多生物学功能,如尿素循环中的L-瓜氨酸和L-鸟氨酸。(1)L-型 氨基酸的衍生物 L-瓜氨酸 L-鸟氨酸(2)D-型氨基酸 D-Glu、D-Ala(肽聚糖中)、D-Phe(短杆菌肽S)(3)-、-、-氨基酸-Ala(泛素的前体)、-氨基丁酸(神经递质)。30蛋白质化学医学讲座(三)非蛋白质氨基酸30蛋白质化学医学讲座 -丙氨酸是遍多酸(泛酸)(一种维生素)的前体成分 氨基丁酸是传递神经冲动的化学介质 L-瓜氨酸、L-鸟氨酸是尿素循环的中间体31蛋白质化学医学讲座 -丙氨酸是遍多酸(泛酸)(一种维生素)的前体成分31蛋白甜菜碱肌氨酸鸟氨酸胍氨酸3
20、2蛋白质化学医学讲座甜菜碱肌氨酸鸟氨酸胍氨酸32蛋白质化学医学讲座四、氨基酸的重要理化性质(一)一般物理性质 -氨基酸为无色晶体,熔点极高,一般在200以上。有的无味、有的味甜、有的味苦、谷氨酸的单钠盐有鲜味,是味精的主要成分。 各种氨基酸在水中的溶解度差别很大,除胱氨酸和酪氨酸外一般都能溶于水,并能溶解于稀酸或稀碱中,但不能溶解于有机溶剂。通常酒精能把氨基酸从其溶液中沉淀析出。 脯氨酸和羟脯氨酸能溶于乙醇或乙醚中。33蛋白质化学医学讲座四、氨基酸的重要理化性质(一)一般物理性质33蛋白质化学医学(二)氨基酸的光吸收构成蛋白质的20种氨基酸在可见光区都没有光吸收,但在远紫外区(3.5,-羧基以
21、-COO-形式存在。-氨基pK2在9.4左右,当pH3.5,-羧基以氨基酸的两性解离性质及等电点 pH = pI 净电荷=0 pH pI净电荷为负CHRCOOHNH3+CHRCOONH2CHRCOONH3+ + H+ OH- + H+ OH-(pK1)(pK2)在一定的pH条件下,氨基酸分子中所带的正电荷数和负电荷数相等,即净电荷为零,在电场中既不向阳极也不向阴极移动,此时溶液的pH值称为该种氨基酸的等电点(isoelectric point,pI)。即氨基酸的等电点是它呈现电中性时所处环境的pH值。1、概念39蛋白质化学医学讲座氨基酸的两性解离性质及等电点 氨基酸的解离常数可用测定滴定曲线的
22、实验方法求得40蛋白质化学医学讲座氨基酸的解离常数可用测定滴定曲线的实验方法求得40蛋白质化学在pH2.34和pH9.60处,Gly具有缓冲能力。滴定开始时,溶液中主要是Gly+。起点:100% Gly+ 净电荷:+1第一拐点: 50%Gly+ ,50%Gly 平均净电荷:+0.5第二拐点: 100%Gly 净电荷:0 等电点pI第三拐点: 50%Gly , 50%Gly- 平均净电荷:-0.5终点: 100% Gly- 净电荷:-1第一拐点:pH=pK+lgGly/Gly+,pH=pK1=2.34第二拐点:100%Gly,净电荷为0,此时的pH值称氨基酸的等电点pI。第三拐点:pH=pK2+
23、lgGly-/Gly=pK2=9.641蛋白质化学医学讲座在pH2.34和pH9.60处,Gly具有缓冲能力。41蛋白Handerson-Hasselbalch方程:pH=pKa+log 质子受体/质子供体计算缓冲溶液pH的主要公式 缓冲容量与缓冲对的浓度有关, 越浓缓冲能力越大 与pH及pK有关, pH=pK时缓冲能力最大 2. 计算缓冲对的浓度比值计算在任一pH条件下一种酸或碱(或氨基酸) 离子化的百分数42蛋白质化学医学讲座Handerson-Hasselbalch方程:42蛋白质化2、氨基酸等电点的计算 可见,氨基酸的pI值等于该氨基酸的两性离子两侧的基团pK值之和的二分之一。pI=2
24、pK1+pK2一氨基一羧基AA的等电点计算:pI=2pK2+pK3二氨基一羧基AA的等电点计算:pI=2pK1+pK2一氨基二羧基AA的等电点计算:43蛋白质化学医学讲座2、氨基酸等电点的计算 可见,氨基酸的pI值A. 等电点时,氨基酸的溶解度最小,容易沉淀。 利用该性质可分离制备某些氨基酸。例如谷氨酸的生产,即将微生物发酵液的pH值调至3.22(谷氨酸的等电点)而使谷氨酸沉淀析出。B. 利用各种氨基酸的等电点不同,可通过电泳法、离子交换法等在实验室或工业生产上进行混合氨基酸的分离或制备。 氨基酸的等电点可由其分子上解离基团的解离常数来确定 3、应用44蛋白质化学医学讲座A. 等电点时,氨基酸
25、的溶解度最小,容易沉淀。3、应用44蛋1. 某氨基酸溶于pH7的水中,所得氨基酸溶液的pH为8,问此氨基酸的pI是大于8、等于8还是小于8?解析:主要从氨基酸的解离特点考虑,先确定其两性离子状态(即等电点状态),然后分析氨基酸溶液变为8时是从水中吸收了质子还是释放了质子。解答:氨基酸晶体主要以两性离子形式存在,溶于pH7的水中,溶液的pH从7升为8,说明氨基酸在溶解的过程中从水中吸收了质子。溶液中有如下平衡:AA + H2O AA+ + OH-要使AA+ 所带电荷为零,必须加碱,这会使pH8, 故氨基酸的pI 8。45蛋白质化学医学讲座1. 某氨基酸溶于pH7的水中,所得氨基酸溶液的pH为8,
26、问2. 计算下列溶液的pH值:(1)0.1 mol/L Gly 0.05 mol/L NaOH的等体积混合液 (2) 0.1 mol/L Gly 0.05 mol/L HCl的等体积混合液解答: (1)Gly 和 NaOH的反应为:+H3N-CH2-COO- + NaOH H2N-CH2-COO-Na+ + H2OGlyGly-0.1 mol/L Gly 0.05 mol/L NaOH的等体积混合后Gly - = OH-=0.05/2=0.025 (mol/L)Gly = (0.1-0.05)/2 = 0.025 (mol/L)此时溶液存在如下平衡:+H3N-CH2-COO-H2N-CH2-C
27、OO- + H+Ka2根据公式pH= pKa + lg 质子受体/质子供体混合后溶液的pH值为pH=pKa2 +lg(Gly- /Gly )=9.6+lg(0.025/0.025)=9.646蛋白质化学医学讲座2. 计算下列溶液的pH值:+H3N-CH2-COO- + (2)Gly 和HCl的反应为:+H3N-CH2-COO- + HCl Cl- +H3N-CH2-COOHGlyGly+0.1 mol/L Gly 0.05 mol/L HCl的等体积混合后Gly+ = H+ = 0.05/2=0.025 (mol/L)Gly = (0.1-0.05)/2 = 0.025 (mol/L)此时溶液
28、存在如下平衡:+H3N-CH2-COO- +H3N-CH2-COOHKa1根据公式pH= pKa + lg 质子受体/质子供体混合后溶液的pH值为pH=pKa1 +lg (Gly / Gly+ ) = 2.34 + lg(0.025/0.025)=2.3447蛋白质化学医学讲座(2)Gly 和HCl的反应为:+H3N-CH2-COO- 3. 制备1L pH 3.2, 0.1 mol/L 甘氨酸缓冲液, 需0.1 mol/L 甘氨酸盐酸盐(Cl- +H3N-CH2-COOH)和0.1 mol/L 甘氨酸(+H3N-CH2-COO-) 各多少?解答:甘氨酸盐酸盐(Cl- +H3N-CH2-COOH
29、) 实际上为二元酸,它的解离式为+H3N-CH2-COO- + H+ +H3N-CH2-COOHKa1GlyGly+pH=pKa1 + lg (Gly / Gly+ ), 3.2=2.34 + lg (Gly / Gly+ )lg (Gly / Gly+ ) = 3.2 - 2.34 = 0.86, Gly / Gly+ =7.24因为配制甘氨酸缓冲溶液所用的甘氨酸盐酸盐和甘氨酸的原始浓度相同,所以它们的浓度之比就是它们所用的体积之比,V Gly / V Gly+ = 7.24已知缓冲溶液的总体积为1 L,V Gly / (1-V Gly )= 7.24, V Gly = 0.879 (L),
30、 V Gly+ = 0.121 (L)48蛋白质化学医学讲座3. 制备1L pH 3.2, 0.1 mol/L 甘氨酸缓(四)氨基酸的化学性质 氨基酸是离子化合物,但在溶液状态时,存在 下列平衡:化学反应中可用左边的结构式表示氨基酸。氨基酸分子的-氨基、-羧基能参加反应,有的侧链R基团也能参加反应 49蛋白质化学医学讲座(四)氨基酸的化学性质 氨基酸是离子化合物,但在溶液状态时,1. -NH2参加的反应A. 酰化反应酰化试剂:苄氧酰氯、叔丁氧甲酰氯、苯二甲酸酐、对-甲苯磺酰氯。这些酰化剂在多肽和蛋白质的人工合成中被用作氨基保护剂。丹磺酰氯(DNS-Cl,5二甲基氨基萘-1-磺酰氯)DNSCl可
31、用于多肽链NH2末端氨基酸的标记和微量氨基酸的定量测定。N GlyAlaSerLeuPhe C N DNSGlyAlaSerLeuPhe C水解 DNSGly、 Ala、 Ser、 Leu、 PheDNS-氨基酸在紫外光激发后发黄色荧光。50蛋白质化学医学讲座1. -NH2参加的反应50蛋白质化学医学讲座(生物体内)在酶和ATP存在条件下,羧酸也可与氨基酸的氨基作用,形成酰基化产物。苯甲酸与Gly的氨基的酰基化反应是生物体内解毒作用的一个典型的例子。苯甲酸是食品防腐剂,在生物体内转变成N-苯甲酰-Gly后,可经尿排出。 51蛋白质化学医学讲座(生物体内)在酶和ATP存在条件下,羧酸也可与氨基酸
32、的氨基B. 烷基化反应-氨基中的氮是一个亲核中心,能发生亲核取代反应。Sanger反应(2,4一二硝基氟苯,DNFB或FDNB)二硝基苯基氨基酸(DNP-氨基酸),黄色,层析法鉴定,被Sanger用来测定多肽的NH2末端氨基酸。Edman反应(苯异硫氰酸酯,PITC)苯氨基硫甲酰衍生物(PTC-氨基酸) 苯乙内酰硫脲衍生物(PTH-氨基酸)PTH-氨基酸,无色,可以用层析法分离鉴定。被Edman用来鉴定多肽的NH2末端氨基酸 52蛋白质化学医学讲座B. 烷基化反应52蛋白质化学医学讲座 含硫氨基酸的烷基化反应硫原子也是亲核中心,可发生亲核取代反应。生物体内,最重要的甲基化试剂是S-腺苷甲硫氨酸
33、(SAM),是由Met与ATP作用得到的S-烷基化产物。在酶催化下,SAM可以使多种生物分子的氨基甲基化,如磷脂酰胆碱的生物合成。S-腺嘌呤核苷-高半胱氨酸(比Cys多一个-CH2)53蛋白质化学医学讲座 53蛋白质化学医学讲座C. 形成西佛碱反应西佛碱是以氨基酸为底物的某些酶促反应如转氨基反应的中间物。氨基酸的-氨基能与醛类化合物反应生成弱碱,即所谓西佛碱(Schiffs base)。54蛋白质化学医学讲座C. 形成西佛碱反应西佛碱是以氨基酸为底物的某些酶促反应如转D.与甲醛的反应 用NaOH滴定氨基酸甲醛滴定法 判断蛋白质水解或合成的进度55蛋白质化学医学讲座D.与甲醛的反应 用NaOH滴
34、定氨基酸甲醛滴定法 判断蛋E. 与亚硝酸的反应在标准条件下测定生成的N2体积,即可计算出氨基酸的量。用途:范斯莱克(Van Slyke)法测定氨基氮的基础。可用于氨基酸定量和蛋白质水解程度的测定。56蛋白质化学医学讲座E. 与亚硝酸的反应在标准条件下测定生成的N2体积,即可计算F. 与荧光胺反应荧光胺荧光产物荧光产物激发波长 x = 390 nm , 发射波长 M = 475 nm ,该反应非常灵敏(1ng),可根据荧光强度M测定氨基酸含量57蛋白质化学医学讲座F. 与荧光胺反应荧光胺荧光产物荧光产物激发波长 x = G. 脱氨基反应经相应的氨基酸氧化酶、转氨酶催化的反应。58蛋白质化学医学讲
35、座G. 脱氨基反应经相应的氨基酸氧化酶、转氨酶催化的反应。582、-羧基参加的反应脱羧基反应: 是生成胺类的重要反应成盐、成酯分别与碱、醇作用, 可用于羧基的保护成酰氯的反应(使羧基活化)氨基被保护后,羧基可与二氯亚砜或五氯化磷反应,生成酰氯。此反应使氨基酸的羧基活化,易与另一个氨基酸的氨基结合,在多肽的人工合成中常用。59蛋白质化学医学讲座2、-羧基参加的反应成盐、成酯59蛋白质化学医学讲座3、 -氨基和-羧基参加的反应(1)与茚三酮的反应 常用于氨基酸的定性或定量检测脯氨酸和羟脯氨酸与茚三酮反应产生黄色物质,其余所有的-氨基酸与茚三酮反应均产生蓝紫色物质。 60蛋白质化学医学讲座3、 -氨
36、基和-羧基参加的反应(1)与茚三酮的反应脯氨酸(2)成肽反应这是多肽和蛋白质生物合成的基本反应。61蛋白质化学医学讲座(2)成肽反应这是多肽和蛋白质生物合成的基本反应。61蛋白质(1)Tyr的酚基 在3和5 位上可发生亲电取代反应,如碘化、硝化。 Pauly反应可用于检测TyrTyr的酚基可以与重氮化合物,如重氮苯磺酸,结合生成橘黄色化合物橘黄色4. 侧链R基参加的反应62蛋白质化学医学讲座(1)Tyr的酚基Tyr的酚基可以与重氮化合物,如重氮苯磺酸(2)His的咪唑基与重氮盐(重氮苯磺酸)的反应棕红色附:咪唑基的性质 组氨酸含有咪唑基,它的pK2值为6.0,在生理条件下具有缓冲作用。组氨酸中
37、的咪唑基能够发生多种化学反应。可以与ATP发生磷酰化反应,形成磷酸组氨酸,从而使酶活化。组氨酸的咪唑基也能发生烷基化反应。生成烷基咪唑衍生物,并引起酶活性的降低或丧失63蛋白质化学医学讲座(2)His的咪唑基与重氮盐(重氮苯磺酸)的反应棕红色附:咪简述组氨酸的作用解答:(1)His的咪唑基pK值在氨基酸和多肽链中分别为6.00和7.35,后者接近生理条件。故在生理条件下,咪唑基既可以作为质子受体,又可以作为质子供体,在pH7 附近具有明显的缓冲能力。血红蛋白由于含有较多的His 残基,使其在pH7附近有明显的缓冲能力。(2) His的咪唑基供出质子或接受质子的速度十分迅速,因而在很多酶的活性中
38、心均有His残基参与(3)组氨酸中的咪唑基能够发生多种化学反应。可以与ATP发生磷酰化反应,形成磷酸组氨酸,从而使酶活化。(4)组氨酸的咪唑基也能发生烷基化反应。生成烷基咪唑衍生物,并引起酶活性的降低或丧失 64蛋白质化学医学讲座简述组氨酸的作用64蛋白质化学医学讲座(3) Cys巯基(-SH)参加的反应性质很活泼作用:这些反应可用于巯基的保护。C6H5CH2ClA. 在弱碱性条件下,与卤代烃(如苄氯、碘乙酰胺等)反应,生成稳定的烃基衍生物。65蛋白质化学医学讲座(3) Cys巯基(-SH)参加的反应性质很活泼作用:这作用:与金属离子的螯合性质可用于体内解毒。B. 与各种金属离子,如对羟基汞苯
39、甲酸,形成稳定程度不同的络合物66蛋白质化学医学讲座作用:与金属离子的螯合性质可用于体内解毒。B. 与各种金属离作用:氧化还原反应可使蛋白质分子中二硫键形成或 断裂。胱氨酸+2H- 2HC. 很容易被氧化形成二硫键(SS)67蛋白质化学医学讲座作用:氧化还原反应可使蛋白质分子中二硫键形成或 次磺酸sulfenic 亚磺酸sulfinic磺酸sulfonicS-nitrosothiolS-nitrothiol68蛋白质化学医学讲座次磺酸sulfenic 亚磺酸sulfinic磺酸sulf(4)羟基参加的反应作用:可用于修饰蛋白质(酶)。二异丙基氟磷酸 Ser 和 Thr 的羟基能够与酸作用形成酯
40、。在蛋白质分子中,Ser 常与磷酸结合。 SersSer 是大多数蛋白水解酶活性中心的主要组分,多种酰基化试剂能与酶活性中心的 Ser 羟基作用,导致酶的失活。Ser69蛋白质化学医学讲座(4)羟基参加的反应作用:可用于修饰蛋白质(酶)。二异丙基氟(一)电泳分离举例:Glu、Leu 、His 、Lys,4种混合样,在pH6.0时,泳动方向及相对速度。 Glu Leu His LyspI 3.22 5.98 7.59 9.74五、 氨基酸的分析分离 70蛋白质化学医学讲座(一)电泳分离五、 氨基酸的分析分离 70蛋白质化学蛋白质化学医学讲座培训课件有效分配系数KeffKeff =某一物质在动相中
41、的总量某一物质在静相中的总量72蛋白质化学医学讲座有效分配系数KeffKeff =某一物质在动相中的总量某一物上述逆流分溶的结果可用曲线表示逆流分溶曲线管号各管中溶质的总含量73蛋白质化学医学讲座上述逆流分溶的结果可用曲线表示逆流分溶曲线管号各管中溶质的总分溶曲线与转移次数的关系溶剂系统体积相对浓度74蛋白质化学医学讲座分溶曲线与转移次数的关系溶剂系统体积相对浓度74蛋白质化学医(二)分配柱层析可以同检测器、记录仪、馏分收集器、输液泵构成层析系统。75蛋白质化学医学讲座(二)分配柱层析可以同检测器、记录仪、馏分收集器、输液泵构成(三)纸层析Rf主要与R基的极性有关,溶剂的pH可影响R基的极性,氨基酸与滤纸的吸附作用也影响Rf。76蛋白质化学医学讲座(三)纸层析Rf主要与R基的极性有关,溶剂的pH可影响R基的纸层析中的Rf值Rf=XY溶剂前沿氨基酸显色点滤纸原点77蛋白质化学医学讲座纸层析中的Rf值Rf=XY溶剂前沿氨基酸显色点滤纸原点77蛋2. 以正丁醇:乙酸:水体系为溶剂(pH4.5) ,对下列氨基酸进行纸层析分离,指出下列各组中氨基酸的相对移动
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