教学培训-外文医学文献检索工具Medline-与-PubMed课件

1、Medline 与 PubMed山西医科大学信息检索教研室第四章 外文医学文献检索工具Medline 与 PubMed山西医科大学信息检索教研室Medline & PubMedIndex Medcus(1879-2006) 印刷版Medline(1969-) 国际联机DIALOGMedline(1983-) 光盘版 PubMed(1997-) 网络版Medline & PubMedIndex Medcus(1 第一节 MEDLINE一、概况 收录范围：1950年至今 国立医学图书馆(NLM) 世界权威的生物医学文献数据库 70多个国家的3700多种期刊（中国50种）内容涉及生物医学各个领域 网

2、络检索入口多 第一节 MEDLINE一、概况一、 概况3种索引： Index Medicus (医学索引) Index to Dental Literature(牙科索引) International Nursing Index(国际护理索引) 除了不能进行分类和中文主题词途径检索外，其他与CBM(中国生物医学文献数据库)相似。 一、 概况3种索引：二、数据库结构 (数据库常用字段)TI：Title 篇名AU：Authors 著者姓名AD：Address 著者地址SO：Source 文献出处（刊名，年卷期页）PY：Publication Year 出版年AB：Abstract 文摘 PT：Pu

3、blication Type 出版类型MeSH: Medical Subject Headings 医学主题词二、数据库结构 (数据库常用字段)TI：Title MJME： 主要主题词MIME： 次要主题词ISSN: International Standard Serial Number 国际标准连续出版号LA: Language of Article 文献语种CP: Country of Publication 出版国AN: Accession Number 登录号UD: Update Code 更新号二、数据库结构 (数据库常用字段)MJME： 主要主题词二、数据库结构 (数据库常用三、

4、检索途径与方法自由词检索（Searches）索引词检索（Index）主题词检索（Thesaurus）字段检索（Specific Fields）指定词检索（Add to Search）主题词提示检索（Suggest）三、检索途径与方法自由词检索（Searches）基本检索索引检索工具按钮栏检索区检索 区结果显示区主题词检索主题词提示检索界面指定词检索其它功能基本检索索引检索工具按钮栏检索区检索 区结果显示区主题词检四、医学主题词表-MeSHMedical Subject Headings使用CBM、Medline、PubMed的指南用于医学主题词的规范由字顺表和树状结构表组成主题词约2万个，副主

5、题词83个动态性四、医学主题词表-MeSHMedical Subject字顺表（Alphabetic List)按字顺排列提供主题词、副主题词、分类号注释及相关词树状结构部分词倒置，如KIDNEY FAILURE, ACUTE帮助用户规范和了解主题词字顺表（Alphabetic List)按字顺排列主题词树状结构号注释与说明相关检索词副主题词 注释树状结构主题词树状结构号注释与说明相关检索词副主题词 注释树状结构树状结构表（Tree Structrue ）根据词义范畴和学科属性排列16类（解剖学、生物、疾病)较好的体现了词间的隶属、平行、派生关系一个主题词可有多个树状结构号帮助用户查找规范主题

6、词树状结构表（Tree Structrue ）根据词义范畴和学教学培训_外文医学文献检索工具Medline-与-PubMed课件教学培训_外文医学文献检索工具Medline-与-PubMed课件第二节 PubMed1、主办单位 国立医学图书馆(NLM)2、收录学科内容 主要收录生物医学和健康科学以及生命科学相关领域的文献。包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺学，基础研究和临床、护理、公共卫生、卫生 发展或相关教育活动的内容。2000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面的研究内容。2022/10/415第二节 PubMed1、主办单位 国立

7、医学图书馆(NL3、文献来源 全球70多个国家和地区近5000种生物医学期刊涉及40多个语种47%为 本土出版文献，90%为英文文献，79%的文献有著者撰写的英文文摘2022/10/416一、数据库概况3、文献来源 2022/10/216一、数据库概况4、PubMed收录数据 MEDLINE Indexed1966 to prensent的MEDLINE已标引数据，有MeSH字段和摘要，每条记录标有PubMed-indexed for MEDLINE OldMDENLINE1949-1965年间的MEDLINE数据，没有MeSH字段和摘要，每条记录标有PubMed-OLDMEDLINE for

8、 Pre1966 2022/10/417一、数据库概况4、PubMed收录数据 2022/10/217一、数据库概4、PubMed收录数据 MEDLINE Inprocess最新的MDENLINE尚未标引的处理中数据。每条记录标有PubMed-in process。Not MEDLINE是出版商提供的电子文献，PubMed 收录，而MDENLINE不收录的数据。每条记录标有PubMed-as supplied by publisher。2022/10/418一、数据库概况4、PubMed收录数据 2022/10/218一、数据库概2022/10/419基本检索输入框工具与资源：提供期刊数据库检

9、索、规范词数据库检索、特定文献检索等高级检索5、主页介绍数据库选择2022/10/219基本检索输入框工具与资源：提供期刊数据2022/10/420可以在检索栏中输入一个或多个检索词（空格=AND） 如：placenta growth oxygen可以在检索栏中输入布尔逻辑运算式（运算符大写） 如：asthma AND (therapy OR treatment)二、基本检索规则2022/10/220可以在检索栏中输入一个或多个检索词（空二、PubMed 基本检索规则字段限定符： ，按词组匹配 如：Stem cell transplantationti截词符：treat*强迫短语检索符：“in

10、terleukin 2” 严格按输入形式匹配，不再自动转换匹配和扩展检索，常用于词组和专有名词检索。2022/10/421二、PubMed 基本检索规则字段限定符： ，按词组匹二、PubMed 基本检索规则自动转换匹配检索词：对常用医学名词进行自动在规范词索引、文本词及所有记录字段中转换匹配。renal failure kidney failureMESH OR kidneyAll Field OR renal failure All Field2022/10/422二、PubMed 基本检索规则自动转换匹配检索词：2022/二、PubMed 基本检索规则自动扩展检索：系统自动对主题词、副主题

11、词扩展检索。如：输入hypertension therapy，系统自动检索高血压的药物治疗（drug therapy）、饮食疗法(diet therapy)2022/10/423二、PubMed 基本检索规则自动扩展检索：2022/10/二、PubMed 基本检索规则著者检索(authors)：姓全称在前，名缩写在后 加字段限定符如： genbacev oau moore amau2002年以后的文章可以查著者全名 如：joshua lederberg au2022/10/424二、PubMed 基本检索规则著者检索(authors)：2二、PubMed 基本检索规则期刊检索（journals

12、）：刊名全称检索new england journal of medicinesoMEDLINE认可的标准刊名缩写检索例：N Engl J Medso国际标准期刊号检索例：0028-4793so2022/10/425二、PubMed 基本检索规则期刊检索（journals）：PubMed记录字段说明2022/10/426文摘第一著者单位地址出版商提供文献识别号著者群版权说明参考评论文献合著者文献参考评论定稿版校样版输入日期输入完成日期电子出版日期PubMed记录字段说明2022/10/226文摘2022/10/427电子出版日期文献出版日期数据加入PubMed日期文献勘误参考文献勘误全部著者姓

13、名全部调研者姓名作为文章主题的著者全称文献相关注释 编号基因符号期编号资助调研者资助调研单位国际标准期刊号 立医学图书馆识别号期刊全称2022/10/227电子出版日期2022/10/428最后修订日期规范词表词规范词确立日期系统组织的文摘版权拥有者题录提供机构的识别号病史相关与原始记录其他关键词提供其他关键词的机构数据提供者机构文章总页数出版商提供数据时间期刊出版国数据库文献编号2022/10/228最后修订日期2022/10/429作为主题词的个人姓名出版状态文献类型出版模式（纸张或电子） 参考文献数已撤回的文献酶或化学物质代码正在撤消中的文章初版文献修订和再版的文章子专题文档太空署提供的

14、数据二次文献数据库以及文章讨论的分子序列访问号原文来源引用了病例的文献内部处理代码标准期刊缩写文献标题翻译标题更新文献文献正在更新期刊卷号2022/10/229作为主题词的个人姓名1、基本检索 2、高级检索3、MeSH数据库检索4、期刊检索5、临床咨询2022/10/430三、检索方法1、基本检索 2022/10/230三、检索方法2022/10/431综述免费全文输入多个检索词placenta growth oxygen2022/10/231综述免费全文输入多个检索词2022/10/432字段限定 stem cell transplantationti2022/10/232字段限定2022/

15、10/433stem cellti AND transplantationti比空格多检出400篇2022/10/233stem cellti AND t2022/10/434输入renal failure自动转换匹配检索词2022/10/234输入renal failure自动转换2022/10/435自动扩展检索2022/10/235自动扩展检索2022/10/436著者检索moore amau2022/10/236著者检索2022/10/437期刊检索: New england journal of medicineso 2022/10/237期刊检索: New england j教学培

16、训_外文医学文献检索工具Medline-与-PubMed课件主题词约2万个，副主题词83个AN: Accession Number 登录号多栏复合检索时，检索框中只能输入检索词，不能输入检索式四、医学主题词表-MeSH山西医科大学信息检索教研室由字顺表和树状结构表组成包括SCI Expanded、SSCI、A&HCI三个数据库全文、免费全文、摘要限定严格按输入形式匹配，不再自动转换匹配和扩展检索，常用于词组和专有名词检索。索引词检索（Index）全世界最大、最全面的化学化工领域的学术信息数据库除了不能进行分类和中文主题词途径检索外，其他与CBM(中国生物医学文献数据库)相似。例：0028-47

17、93so使用CBM、Medline、PubMed的指南MEDLINE IndexedIndex Medicus (医学索引)MeSH: Medical Subject Headings 医学主题词MEDLINE: （最完整，有标识符）2、高级检索在一个网页中集基本检索、检索 、多栏复合检索、索引查询、逻辑算符选择、检索限制于一体 检索史中显示历次检索式、时间和检出篇数 多栏复合检索时，检索框中只能输入检索词，不能输入检索式 利用字段限制和逻辑算符，构建复杂检索式2022/10/439主题词约2万个，副主题词83个2、高级检索在一个网页中集基本检索 （Search History）以列表形式显示

18、历次检索式、检索时间和检出篇数Preview:系统不显示命中文献信息，而在History中直接显示检索式和检出篇数。2022/10/4复旦大学图书馆文献检索教研室40检索式检索时间检出篇数检索式编号可替代检索式进行输入检索如：#17 AND therapy检索 （Search History）2022/10/22022/10/441索引查询栏间逻辑组配查找Patrick Concannon于 年发表在The New England Journal of Medicine上的综述。多栏复合检索concannon p栏内不能输算符，检索词间空格默认AND运算2022/10/241索引查询栏间逻辑组

19、配查找Patrick检索限制(Limit)全文、免费全文、摘要限定研究对象人/动物限制性别限制文献类型限制语种限制子文档限制年龄限制2022/10/442检索限制(Limit)全文、免费全文、摘要限定2022/102022/10/443全文、免费全文、摘要限定Limit 检索限制研究对象人/动物限定语种限定子文档限定性别限定年龄限定文献类型限定2022/10/243全文、免费全文、摘要限定Limit 构建检索式构建检索式索引查询（Index）2022/10/445索引查询（Index）2022/10/245Details （检索的详细匹配过程）显示检索词转换匹配运算详细过程用途：转换、确定规范

20、词 如：liver cancer liver neoplasms修改检索策略2022/10/446Details （检索的详细匹配过程）2022/10/2462022/10/447检索明细数据库匹配过程检索词转换显示用户输入的检索式 2022/10/247检索明细数据库匹配过程检索词转换显示用3、Mesh Database 确定规范化主题词查看主题词词义注释树状结构表选择副主题词扩展主题词确定主要主题词检索（加权检索）2022/10/4483、Mesh Database 确定规范化主题词2022进入 MeSH进入 MeSH检索实例1：2006-09年有关舌根癌的治疗进展。要求： 用MeSH D

21、atabse(主题词表选词)检索PubMed数据库，并用自由词检索09年以来发表的最新文献。2022/10/450检索实例1：2006-09年有关舌根癌的治疗进展。2022/课题：提示舌根癌的不同表达形式：tongue base cancer、cancer/carcinoma/tumor of tongue base、cancer of the base of tongue治疗包括：drug therapy、therapy、surgery、radiotherapy、rehabilitation2022/10/451课题：提示舌根癌的不同表达形式：2022/10/2512022/10/45220

22、22/10/2522022/10/453输入舌根的自由词检索式，与舌肿瘤治疗的检索式进行AND运算。2022/10/253输入舌根的自由词检索式，与舌肿瘤治疗的2022/10/454初步结果，未限定年份进入高级检索进一步限定2022/10/254初步结果，未限定年份进入高级检索进一步2022/10/4552022/10/2552022/10/456检索结果2022/10/256检索结果4、 Journal database检索 通过输入刊名全称或缩写等了解该刊基本情况浏览期刊上发表的文献获得相关期刊信息提供电子全文的超链按钮2022/10/4574、 Journal database检索 20

23、22/102022/10/458期刊数据库检索2022/10/258期刊数据库检索2022/10/459输入待检期刊名获得期刊详细信息相关期刊链接 2022/10/259输入待检期刊名获得期刊详细信息相关期刊5、临床咨询（Clinical Queries)专门检索临床研究方面文献，可进行治疗、诊断、病因、预后及临床实践指南五个类目限制，并选择强调查全还是强调查准2022/10/4605、临床咨询（Clinical Queries)专门检索临床出版模式（纸张或电子）BA(Biological Abstracts)Biosis Previews输出方式(Send to)SO：Source 文献出处

24、（刊名，年卷期页）UD: Update Code 更新号1907年至今CA的全部内容、Medline的生物医学文献以及欧美30多家专利机构的信息1949-1965年间的MEDLINE数据，没有MeSH字段和摘要，每条记录标有可以在检索栏中输入布尔逻辑运算式（运算符大写）2006-09年有关舌根癌的治疗进展。BIOSIS Previews主题词提示检索（Suggest）基于Web版的生物医学与药学数据库SO：Source 文献出处（刊名，年卷期页）International Nursing Index(国际护理索引)PT：Publication Type 出版类型2022/10/461查找系统评

25、价（Systematic Reviews)出版模式（纸张或电子）2022/10/261查找系统评价（S五、其它服务PubMed Central (PMC)Single Citation Matcher生物信息数据库OMIMGeneBLASTGenome3D Domains2022/10/462StructureTaxonomyNucleotideProteinBookshelf五、其它服务PubMed Central (PMC)2022进入PubMed Centre下拉主页滚动条至低进入PubMed Centre下拉主页滚动条至低PMC首页进入高级检索2022/10/464PMC首页进入高级检

26、索2022/10/264查找肾衰竭的药物疗法2022/10/465全文链接查找肾衰竭的药物疗法2022/10/265全文链接六、检索结果输出显示检索结果全文获取保存检索结果保存检索策略2022/10/466六、检索结果输出显示检索结果2022/10/266显示字段选择（Display）Summary：标题、著者、出处、ID号Abstract: 来源期刊、标题、著者、著者地址、记录性质、文献类型、勘误、评论、PMID或UI、摘要、MeSH词等 。MEDLINE: （最完整，有标识符）2022/10/467显示字段选择（Display）Summary：标题、著者、出2022/10/468显示格式选

27、择显示格式（Display Settings）点击标题显示文摘增强格式排序方式选择6篇有免费全文2022/10/268显示格式选择显示格式（Display 2022/10/469文摘增强格式相关论文论文涉及的MeSH词，文献类型等信息LinkOut外部资源链接收费全文链接，我校订购的数据库可链出全文其他相关的网上免费医学指南信息2022/10/269文摘增强格式相关论文论文涉及的MeSH下载全文下载全文2022/10/471输出方式(Send to)输出方式选择2022/10/271输出方式(Send to)输出方式选择输出方式选择（send to）File：保存检索结果Clipboard:

28、剪贴板，多次检索，可暂存每次检索需下载的记录，最后一起保存。 最多允许存储500条，保留8小时 Email: 通过邮件发送Collections：将检索结果送至My NCBI中Order：全文传递服务，需帐号、收费 2022/10/472输出方式选择（send to）File：保存检索结果2022Medline与PubMed的区别收录范围不同数据更新周期不同检索功能的区别Pubmed带有网络链接功能检索结果输出方式的区别Pubmed部分带有全文链接Medline与PubMed的区别收录范围不同其它外文检索工具IM(Index Medicus)Medline,PubMedBA(Biological Abstracts)Biosis PreviewsCA(Cemical Abstracts)SciFinder Schola