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文档简介
1、卫生信息素养及网络医学信息资源利用四川省医学情报研究所 研 究 员中华医学图书情报杂志 编 委 中华医学会西文生物医学期刊文献数据库 电子版编辑部 副 总 编刘德齐 Deqiliu2003 2011,10/31 江苏南京主要内容一、信息素养(Information Literacy)概述1.信息素养基本概念 ;2. 信息素养对医务人员的意义;3.医务人员面临信息时代的新形势4. 医生获得有价值文献的困难二、外文生物医学文献网络资源的获取通道1. 一站式的情报检索服务系统简介2. 常用的生物医学文献数据库: 1)Pubmed/Medline:最重要的生物医学信息资源及新改版的特点 2) 科学引文
2、索引(SCI) 3)荷兰医学文摘EMBASE 4)Google Scholar 5)重要全文医学文献数据库 6)AltaVista-仅次于Google 的世界第二大搜索引擎三、信息检索技术的医学应用最新进展:二代智能检索工具 Uptodate、GoPubmed、Searchmedica、CureHunter等简析四、附件附件1:SCI投稿指南附件2:如何检索最佳医学文献证据-POEMs文献 一、信息素养(Information Literacy)概述 2002年3月7-8日在德国柏林召开了由世界知名企业家和教育家参加的“21世纪素养峰会” ,主题是“界定21世纪素养” 。 会议提出了一个重要观
3、点:知识经济新世纪里,信息和知识变得前所未有的重要,对信息和知识的有效应用,单靠读、写、算等传统的能力基础已经不能胜任。教师、学生、雇员和公民必须形成新的素养以提高他们的知识和批判思维能力。1.信息素养基本概念 (1)信息素养( information literacy)概念的酝酿始于美国图书检索技能的演变, 即将图书检索技能和计算机技能集合成为一种综合的能力、素质,即信息素养。 主要包含两方面的含义:第一,信息意识,即知道何时需要何信息的直观意识。第二,获取所需信息的能力,即采用有效方法获取需要的信息的知识和技能。 什么是信息素养? 1989 年美国国家图书馆协会下属的“信息素养总统委员会”
4、给信息素养人下了定义: 要成为一个有信息素养的人,他必须能够确定何时需要信息,并且他具有检索、评价和有效使用所需信息的能力 To be information literate, a person must be able to recognize when information is needed and have the ability to locate, evaluate, and use effectively the needed information (ALA,1989).世界各国对卫生信息素养的理解卫生信息素养是一种阅读、理解和处理卫生信息的能力。 -Pfizer, 200
5、2医生需具备获得、处理和理解临床工作所需的基本卫生信息和服务的能力以做出正确的医疗决策. -Healthy People 2010, 2000 卫生信息素养是一种能力,包括认识卫生信息需求的必要性;能确定信息资源并利用这些资源去检索相关文献;能评价信息的质量及其在特殊场合的作用;能分析、理解和利用信息去进行正确的医疗决策。- Medical Library Association, July 23, 2003 /resources/healthlit/define.html 15美国Miami Dade 医学院医学中心图书馆的专家提出,良好的卫生情报素养( Health Information
6、 Literate )包括:对卫生信息需求的认识 Recognize a health information need能找到医学信息资源 Identify likely information sources能通过信息资源检索相关的医学情报 Search the information sources to retrieve relevant information能评价这些信息的质量 Evaluate the quality of the information能利用这些信息进行正确的卫生决策 Use the information to make good health decision
7、s资料来源:/medical/library/HealthInformationLiteracy.ppt 3.医务人员面临信息时代的新形势 医学信息环境主要特点一(依赖性) 人类对信息的依赖性不断加重,现代医学已经由经验医学进入知识医学时代,其显著特点是医生更加依赖对现有信息和知识的挖掘和利用来战胜疾病和伤残;专家认为,临床医生平均每天必须阅读大量专业文献,才可能跟上现代医学发展的速度刘建平临床医疗实践需要循证医学中国胸心血管外科临床杂志,1999,6(2):封三) 。 美国国立医学图书馆馆长Donald A. B. Lindeberg 教授最近在一次讲话中指出:“现代医学的研究和创新离不开计
8、算机信息检索。如果一个医生每天晚上读2篇文献而不去作大规模计算机检索,一年下来,将落后800年。” -我国医疗离信息化还有多远?专家探讨我国医疗信息化进程 /show.aspx?id=182&cid=44)知识是疾病的敌人Knowledge is the Enemy of Disease 英国国家卫生数字图书馆馆长兼剑桥大学卫生研究院临床知识部主任 Muir Gray爵士最近指出:知识是疾病的敌人。在未来的十年中,知识将比药物和技术对临床医疗工作产生更大的冲击力。 “Knowledge is the enemy of disease and, by getting what we know i
9、nto practice, we will have a bigger impact on health and disease than any drug or technology likely to be developed in the next decade”.-Dr Muir Gray, Director of the National electronic Library for Health. .uk/publications/updatemagazine/archive/archive2003/march/update0303b.htm 信息海啸(The Informatio
10、n Tsunami)5,000?per day1,500 per day55 per dayFrom “Evidence Based Practice, Paul Glasziou University of Queensland & Oxford哈佛大学医学院院长,著名心脏病专家 Charles Sidney Burwell 教授告诉他的学生: “在十年之内,作为医学生你们学到的一半知识都会被证明是错误的;而且麻烦的是没有老师能够告诉你们哪一半是错误的。” -resource:Quote in Pickering G W. BMJ 1956;2:113-6 “这么多的文章,这么多的期刊,而且
11、情况变得总是越来越糟。PUBMed数据库中2005年产生五十万篇文献,2006年产生的六十多万篇文献中只有5%的文献方法学设计完善;其中仅只有5%的文献具有临床使用意义,也即在2006年实际有用的文献只有1558篇。我们怎么才能找出这1558篇临床有用且方法学完善的精品文献?” -www.f1000/about/blogs/f1000m/category/Genera医学信息环境主要特点三(规范化) 对现代医生的信息素养的要求已经成为合格的全球执业医师的金标准:美国Tufts大学医学院校长 Louis Lasagna 改写的现代版的希波克拉底新誓言成为全球医生的座右铭;哈里逊内科学宗旨(当医生
12、治疗病人时,需要有操作技能、科学知识与人文关怀)和国际医学教育委员会对全球职业医生资格的等信息标准的出笼;临床指南和系统评价成为临床决策的金标准。现代版的希波克拉底誓言“我将非常尊重和学习我们的医学前辈历尽千辛万苦所获得的科学成果及医学知识。我也将十分乐意去传授这些知识给我的后来者及未来的医生。” -1964年由Louis Lasagna(时任 Tufts大学医学院的校长)改写的现代版的希波克拉底誓言,现今在美国被很多医学院采用。 国际医学教育委员会(CORE COMMITTEE, INSTITUTE FOR INTERNATIONAL MEDICAL EDUCATION )的“全球最低基本要
13、求(Global minimum essential requirements in medical education)”中要求全球临床医生(global physicians )应该符合以下五个标准条件:1)从不同的数据库和数据源中检索、收集、组织和分析有关卫生和生物医学信息(search, collect, organize and interpret health and biomedical information from different databases and sources);2)从临床医学数据库中检索病人相关的信息( retrieve patient-specific
14、 information from a clinical data system);3)运用信息和通讯技术帮助诊断、治疗和预防,以及对健康状况的调查和监控(use information and communication technology to assist in diagnostic, therapeutic and preventive measures, and for surveillance and monitoring health status);4)了解信息技术的应用和限制(understand the application and limitations of inf
15、ormation technology); 5)保留工作记录以便分析和改善临床工作( maintain records of his/her practice for analysis and improvement.)-Global minimum essential requirements in medical education CORE COMMITTEE, INSTITUTE FOR INTERNATIONAL MEDICAL EDUCATION* Institute for International Medical Education, White Plains, New Yo
16、rk, USA /documents/gmer.htm医学信息环境主要特点四(网络化) 医生只有改变原有的学习方式特别是阅读习惯,才能跟上信息时代的发展。学会上网以及树立终身学习的理念尤为重要。掌握获取信息知识的技能特别是通过互联网获取知识的技能,以及对各种网上医学信息资源通道的检索和利用能力必须提高,善于利用整合的一站式检索平台和尽可能多的全文通道揭示等。改变阅读方法,书籍阅读逐步向网上阅读或掌上阅读过渡,教科书阅读向期刊特别是电子期刊阅读; 全文阅读变为标题结论浏览和摘要精读为主等;最新证据显示:美国医师现在主要利用互联网来获得所需的医学信息美国TPMG医师教育和发展训练部博士Philip
17、Bellman最近对美国医师的调查发现:89%的美国医师已经主要使用在线信息资源来提高医疗知识、决定临床治疗方案、更新自己的知识或其他临床目的。而且在利用网络各种信息资源方面,年轻医师比老年医师具有更大的热情。-Philip Bellman,et al. Facilitaing physician access to medical reference information. The Permanente J .2005; V.9 No.4:27 - Pravikoff, D.S. (2004). The Evidence-Based Practice Dilemma. CINAHLnews
18、 23(1): 6-7.为什么我们需要新的素养?医学实践的困境:已有的证据和我们能利用的证据之间的巨大差距信息焦虑症/“Information anxiety”“The frustration that occurs when there is a great deal of information, but it doesnt tell us what we want or need to know.” -Richard Wurman. 面临如此大量的信息,没人告诉我们,我们应该或者需要知道的信息在哪儿。 4. 医生获得有价值文献的困难1)寻找有证据的文献的困难:英国的研究证实,尽管科学研究
19、已经积累了大量的证据,但是现有的证据还是远远不能满足各种医疗卫生决策的需要; 2)发表文献的偏倚:a) 许多研究者懒于将其研究结果总结发表;b) 投稿偏倚(研究结果呈阴性不愿发表; 制药公司由于担心不利结果的公开的负面影响不将结果发表);c) 狭义发表偏倚(杂志迎合读者希望看到好消息的心理而选择性地拒绝刊登小规模的阴性研究);d) 语言偏倚(阳性结果发表在英文杂志上,而阴性结果可能刊登在地区性的或非英文杂志上);e) 方法学偏倚(如不适当的随机分组);f) 文摘偏倚(文摘过于强调阳性结果)等。 3)检索文献的困难:a) 数据库的缺陷,例如:Medline和Embase的局限性在于,只包括全世界
20、近两万种生物医学杂志的六千多种;未收录所包括杂志中的所有文章;收录杂志以英文为主 ;b) 文献索引系统的缺陷,使用最权威的最优的检索方案,可能只能检索Medline中一半的临床试验,一个颇有检索经验的医务人员往往只能检索出约四分之一的相关文献。 -Adams CE,et al. Psychol Med, 1994:24:741-8), 4)判断研究质量的困难 a) 误导性的文摘:筛出相关文章的简单方法就是阅读论文摘要,但是摘要可能会夸大或强调阳性结果,也可能根本没有准确地反映实际结果。例如在世界顶级医学杂志的文摘中,18%到68%的文摘没有忠实地反映实际结果,它们可能或者与全文中的结果不符,或
21、者全文中根本没有文摘中提及的数据 -Pikin RM, et al. Accuracy of data in abstracts of published research articles. JAMA,1999;281:1110-1)。 b)误导性的正文:两种偏倚-研究方法上的缺陷和用有误导性的结果表达方式:如相对危险度( RR ),会造成一种“装潢效应”,引起高估效果的阳性偏倚。 -Fahey T, et al. Evidence-based purchasing: understanding results of clinical teials and systematic review
22、s. BMJ,1995;311:1056-60)。 资料证实:临床医生获取所需信息很难,主要在于文献检索能力的原因美国哈佛大学的 Bennet NL 等(2004)对3347名医师的问卷调查发现医师在互联网检索信息时存在一些障碍,认为自己对数据库不熟悉、检索技巧不佳、面对太多信息无法过滤精准的信息以及网速太慢等等Bennett NL, Casebeer LL, Kristofco RE, Strasser SM. Physicians Internet information-seeking behaviors. J Contin Educ Health Prof. 2004 Winter;2
23、4(1):31-8.PubMed PMID: 15069910。美国Iowa大学医学院的 Ely JW等(2002)也指出医师在为临床问题检索文献时的障碍在于检索时间太长、难以拟定有效的检索策略及确定适当的信息资源等Ely JW, Osheroff JA, Ebell MH, Chambliss ML, Vinson DC, Stevermer JJ, Pifer EA. Obstacles to answering doctors questions about patient care with evidence:qualitative study. BMJ. 2002 Mar 23;32
24、4(7339):710. University of Iowa College of Medicine, Iowa City, IA 52242, USA。加拿大McMaster大学的Walker CJ 等(1991)对Medline数据库终端用户的研究则指出:不了解资料库的设计逻辑、不知道如何利用逻辑检索及医学标题等进阶查询功能等因素是医师检索文献最难之处Walker CJ, McKibbon KA, Haynes RB, Ramsden MF. Problems encountered by clinical end users of MEDLINE and GRATEFUL MED. B
25、ull Med Libr Assoc. 1991 Jan;79(1):67-9. PubMed PMID: 1998823; PubMed Central PMCID: PMC225488.。医疗错误的发生主要是因为对药品和病人的信息掌握不充分l另一项美国研究显示,在每年发生的几百万件医疗错误中,可以预防的占70,有可能预防的占6,不可能预防的占24。而医疗错误中给药错误的严重性最为显见。在一个普通的医院里,每给药5次就有一个错误发生,对病人构成潜在伤害的占7。一家300张床的医院,每天就有40次错误发生,其中有超过70的错误是可以避免的。研究表明,其错误有三大来源,来自医生的占56,来自护士
26、的占34,来自药剂师的占10。而错误的发生主要是因为对药品和病人的信息掌握不充分。/medicalerrors.htm 二、外文生物医学文献网络资源的获取通道 如何认识、选择和掌握互联网上各种有用的情报信息资源通道将成为医学界特别是现代医生更新知识、迎接数字化时代挑战的历史契机。在海量的信息中找到有用信息方法之一是找到及利用适用的搜索引擎和网络整合资源。1. 一站式的情报检索服务系统简介我国高校的CALIS系统、科技系统NSTL(国家科技图书文献中心)和北京康健世讯公司的“外文生物医学期刊文献服务系统”(FMJS/FEBM)等情报服务系统,以及国外如澳大利亚的 “临床信息通道计划”(Clini
27、cal Information Access Project)等基于互联网的知识和情报信息的资源整合揭示和个性化情报知识咨询和服务) 平台展示了这类趋势。高校的CALIS系统国家科技图书文献中心NSTLFMJS/FEBM:康健临床决策循症数据库 作为中国人自己打造的一站式生物医学外文文献及循证医学文献信息挖掘机,FMJS/FEBM整合了8000余种著名生物医学期刊资源,是我国目前最好的基于Pubmed和 OA(Open-Access)医学资源的权威外文医学文献检索工具。康健FEBM开创了循证医学专业内的“第三代搜索引擎”的先河,同时实现了对药物的整合、PICO检索模式和国际疾病分类(ICD-1
28、0)检索等先进检索理念的引进,可解决了中国医生获取最新EBM信息难的问题,为临床医生带来了实践新的临床模式的福音。FMJS是国内首家全面整合揭示我国进口外文医学期刊文献检索的一站式平台北京康健世讯公司最新推出的循证医学知识库-中国人自己打造的FEBM整合库FEBM拥有的循证医学文献核心检索功能1、FEBM能进行循证核心期刊检索(对Pubmed、Cochorane database 和ACP 杂志以及OA 刊物的EBM资源的整合,约8000余种生物医学期刊)2、FEBM拥有当今国际流行的PICO和临床查询循证检索模式通道3、FEBM的多种过滤器能迅速从检索结果找到高质量的EBM文献摘要并揭示其网
29、络全文通道4、FEBM拥有对检索到的文献进行情报评价功能(filter)5、FEBM具备医学文献统计分析功能(ISI网站功能)6、FEBM能对证据文献结论分提取及机器自动翻译和系统检索导航,适合中国医生阅读英文文献的需要;7. FEBM独创的ICD-10疾病分类导航检索以及MeSH词检索自动转换:世界上首创的两种分类医学术语分类的自动转换检索系统,方便了临床路径在中国医院的积极推广。39FMJS/FEMB 主要功能特点 国内学术界研究证实:通过FMJS和FEBM的检索,我们不仅可以找到一次医学文献的揭示通道,而且可以帮助临床医生评价和删除垃圾信息,从而快速找到与临床决策相关的和最新的EBM文献
30、知识。这就使得中国医生能在一种先进的国际水准的检索平台上获取和利用医学信息,使他们能在正确的时间、以正确的方式去获取正确的有价值的文献信息,藉此解决医疗和科研中的临床决策问题。澳大利亚临床信息通道计划-CIAP其他重要的一站式医学重要数据库SUMSearch /TRIP数据库 A. SUMSearch(/) 该库由美国Texas大学卫生科学中心支持资助发维护并提供免费服务的非赢利网站。为保证尽力限制因利益冲突产生的偏倚,Sumsearch主要从三个政府机构数据库检取医学证据,即美国的国家医学图书馆的Medline、 NGC(National Guideline Clearing house)、
31、和英国政府机构的DARE数据库取材。可针对病因、诊断、治疗、预后等进行检索。SUMSearch2自动查找Medline、DARE和NGC等重要循证数据库SUMSearch2能自动显示重要文献方便查找不同类型的EBM文献,例如原文、系统评价和临床指南等B. TRIP数据库()建立于1997年,其目标是为医生提供“一站式”的信息服务,目前该网站收集了来源于75家期刊及网站的信息,其中包括Cochrane图书馆的系统评价摘要,Cochrane疗效评价数据库、BestBETS,Bandolier,BMJ updatas等,并与相关杂志和电子教科书进行链接。既可直接检索出二级研究杂志上的系统评价等,也可
32、对一些在线的高质量的原始研究杂志进行检索。TRIP数据库()美1500万美元打造“一站式”科研资源网络集中试剂、细胞与组织库等资源;减少科学家不必要的时间耗费据科学家杂志报道,美国国立卫生研究院(NIH)下属国家科研资源中心,近日拨款1500万美元设立科研资源网络,通过集中试剂、细胞与组织库以及模式生物方法目录,使得科研人员不必花大量时间在网上搜索这些工具,或在不知情的情况下重建这些已有工具,从而可将更多的时间花在研究的实施和评估上。该项目名为雄鹰联盟,参与的大学包括哈佛医学院、达特默斯大学、密西西比杰克逊州立大学、莫尔豪斯医学院(Morehouse School of Medicine)、蒙
33、大拿州立大学、俄勒冈健康与科学大学、阿拉斯加大学、夏威夷大学以及波多黎各大学。学者许培扬 发表于 2009-11-10 20:48:11 /htmlnews/2009/11/224965.shtm2. 常用的生物医学文献数据库 Pubmed SCI 1)Pubmed/Medline:最重要的生物医学信息资源及新改版的特点被NLM LSTRC(美国国立医学图书馆文献选择技术评价委员会)收录的期刊 Scope and coverage 学科覆盖范围 quality of content 文献内容的质量 quality of editorial work 编辑工作质量 production qual
34、ity 产品质量 audience 读者群只有约15-20% 的推荐杂志能被Medline收录Christine Wickman, Marie Monik KIBPUBMed:目前国际上公认的检索生物医学文献的权威性数据库/PubMed/ PUBMed数据库由美国国立医学图书馆、国际MEDLARS成员及合作的专业组织共同研制开发,涉及临床医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学等领域,截止2008年一月共收录了自1960年中期以来七十一个国家出版的5,246余种生物医学期刊的一千多万条引文和文摘,约占世界医学文献期刊的80%以上,代表了英、美、法、荷兰、瑞士、德国等发达国家最高科技水平
35、。是目前国际上公认的检索生物医学文献的权威性数据库,也是我国卫生部认定的科技查新必须检索的国外医学数据库。Pubmed是全国医疗机构学术国际水平的试金石鉴于MEDLINE的全球影响和重要性,2003年,原科技部部长徐冠华院士作出重要指示,从2004年起,由中国科学技术信息研究所统计、分析和向全社会分布全国各医疗机构MEDLINE收录论文篇数和排行榜,其他四个检索工具是科学引文索引(SCI)、工程索引(EI)、科学技术会议录索引(ISTP)、和社会科学引文索引(SSCI)美国Duke大学医学中心的专家Crowley SD等(2003)认为:” 77%的临床问题答案来自MEDLINE并且改变了47
36、% 的临床决策”。Pubmed/Medline已经成为世界公认最权威的生物医学文献数据库,同时也是知识发现特别是循证医学(EBM)的宝贵资源,临床医生可以从中了解到最新的医学知识并将其中重要的变化应用到他们的实践中。Pubmed/Medline的EBM文献高达4,2000篇;它收录了美国最权威的EBM/POEMs文献ACP Journal Club中的97%的文献及Cochrane Database Syst Rev93%的文献;同时包含Embase的3000种杂志,得到包括欧盟在内的公认和推荐。1997年1月至2005年9月Pubmed每月的文献检索数量增长惊人1)词汇自动转换功能(Auto
37、matic Term Mapping) MeSH转换表(MeSH Translation Table),包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord词(题名词和文摘词)进行检索。例如:键入“hepatic fibrosis,系统将其转换成“liver cirrhosis MeSH Tems 后进行检索。 在主题词里配副主题词therapy然后自动检索获得文献主题词与关键词检索比较:肝硬化Pubmed Queries Time Result#1 Search: Hepatic Cirrhosis“ 07:16:
38、57 2698#2 Search: hepatic fibrosis“ 07:14:16 3243#3 Search: Liver CirrhosisMesh 07:13:34 56553Liver Cirrhosis MeSH 代表了以下11个入口词Entry Terms(同义词):Cirrhosis, Liver Cirrhoses, Liver Liver Cirrhoses Hepatic Cirrhosis Cirrhoses, Hepatic Cirrhosis, Hepatic Hepatic Cirrhoses Fibrosis, Liver Fibroses, Liver L
39、iver Fibroses Liver Fibrosis 2)截词检索功能 PubMed 允许使用“*”号作为通配符进行截词检索。如:键入“bacter *”,系统会找到那些前一部分是bacter的单词(如bacteria, bacterium, bacteriophage等),并对其分别进行检索。3)Phrase(短语或限定)检索功能 PubMed允许使用双引号(“”)来强制系统进行短语检索。例如,在PubMed主页的检索提问框中键入凹叶厚朴“Magnolia officinalis”,并用双引号引起来,然后点击“Go”,系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行检索。“Mag
40、nolia officinalis” 116篇如果键入:Magnolia officinalis 则得222篇4) 超级链接功能1)链接相关文献。PubMed系统中的每条文献记录均有一个相关文献链接,在检索结果的显示状态下,每条记录的右边均有 “ Related Articles”超链。点击该链,系统按文献的相关度从高到低显示相关文献。2)链接外部资源。PubMed提供从检索结果到期刊全文、生物学数据、序列中心等的链接。该功能通过链接上述资源站点的方式来实现。在检索结果显示状态下,点击“LinkOut”进入相关网站。 Related aritclesPubmed LinkOut 功能会把许多重
41、要全文获取通道自动告知 5)临床查询检索(Clinical Queries) “Clinical Queries”是专门为临床医生研究设计的内置的临床方法学“过滤器” (Clinical Methodology Filters)。由加拿大临床流行病学和生物统计学教授Haynes RB等人在1994年提出,并进行了查全率和查准率分析。用户通过这一临床方法学检索过滤器,不需掌握复杂的检索策略,即可检索所需的临床研究文献,特别是获得有用的循证医学文献。 Clinical Queries专为临床医生找到循证医学的文章而特别设置Systematic Reviews为查找系统评价、Meta分析及实践指南设
42、计了最佳的检索策略。 Clinical Study Category为临床各科医生设计了查找有关某一疾病的治疗、诊断、病因和预后等临床密切相关问题的循证医学资源的最优化检索策略,特别是考虑了用户查全率和查准率的不同需要。 检索实例:寻找有关高血压J型曲线图有关资料(北京阜外医院咨询课题) 检索式:(J*curve OR J*shap* OR J*type) and hypertension 检索途径: -Clinical Study Category(临床研究分类) -Systematic Reviews (系统综述评价) 检索结果:clinical study category 检索中 sp
43、ecific search 检得文献 10篇(查准率); sensitive search 检得文献 127篇(查全率 ); systematic Reviews 检索 获得文献 9 篇通过“Systematic Reviws”我们可以找到9篇RCT等重要文献通过显示Citation,我们可以了解到这些都是RCT和综述文献此外特别要注意:Pubmed在进行主题词检索的同时,应该注意与关键词检索二者的配合,否则可能造成大的漏检。下面四篇文献都是“in-process”和“epub ahead of print”都是主题词检索得不到的。因为这些文献都没有经过主题词处理。所以检索策略是非常重要的 否
44、则你会漏掉许多重要文献。Pubmed 推出新的二代搜索引擎 New Advanced Search改版后的Pubmed主页:突出了高级检索和循证检索的功能,增加了不懂检索的医生快速找到相关的和最新的医学文献的可能性。对作者 期刊和出版日期的揭示对文献类型 全文或免费文献等的揭示对循证医学文献的全面揭示临床试验注册中心Pubmed新的askMedline搜索引擎(试用版)非常有用,可以采用自由语言提出临床问题,是词义检索向语义检索过度的典型代表。案例:Is the Serotonin Agonists OR sumatriptan effective for patients with migr
45、aine disorder?立即获得相关EBM文献232篇可以立即阅读TBL(术语标记语言)形式的结论性意见(Conclusions)Pubmed的PICO检索格式完善了实时医学文献检索入口立即获得27篇文献Meta分析可立即阅读TBL(术语标记语言)形式的结论性意见(Conclusions)Systematic ReviewCochrane reviews/DARE Evidence based journals ACP J club, EBNComputerized Decision Support System (CDSS) 计算机决策支持系统 “ 5S ” 循证医学信息资源Origin
46、al articles: Medline/ Clinical QueriesEvidence based textbooksUpToDate, DynaMed, ACP PIER,BMJ, Clinical Evidence研究Studies综述Syntheses摘要Synopses总结Summaries系統Systems-Haynes, R. (2006, November). Of studies, syntheses, synopses, summaries, and systems: the 5S evolution of information services for eviden
47、ce-based health care decisions. ACP Journal Club, 145(3), A8-A9. Pubmed的特殊限定符号限定在核心期刊:jsubsetaimtext系统评价;systematicsbmedline:medlinesb补充与替代医学里;camsb循证医学里;Evidence-Based PracticeMh最新文献(Pre-medline):NOT medlinesb从Pubmed中寻找文献的类型点开Display Settings,找到文献格式,点Abstract 再点Apply点开文献摘要后可在找到该文献的发表类型,例如RCTs2) 科学引
48、文索引(SCI) 由美国费城科学情报研究所 (The Institute for Scientific Information, 简称ISI)在1963年创刊。SCI核心版收录了全世界40多个国家出版的数、理、化、农、林、医、生命科学、天文、地理、环境、材料、工程技术等自然科学各学科的核心期刊。截止2008年底,SCI核心刊共收录3754种期刊,SCI扩大版(SCIE)收录期刊7756种。 SCI收录的文献能全面覆盖全世界最重要和最有影响力的研究成果。SCI期刊的发表是全世界科技人员的理想和最佳选择。作用:利用SCI数据库可以帮助科研人员获得重要情报信息: - 该项目的有关重要文献的全文该研究
49、项目领域中的核心学者的信息相关文献中实验与方法资料数据该研究领域中的核心期刊、热点课题研究成果如何向某种学术期刊投稿发表提高论文的引用率跟踪该研究领域的最新进展如何查证期刊是否属于SCI刊?了解ISI各类数据库收录了哪些期刊,可进入以下网址检索:/journals/SCI 分为两个版本,其来源期刊的网址分别为: SCI (Science Citation Index)网址:/cgi-bin/jrnlst/jloptions.cgi?PC=K SCI-E(Science Citation Index Expanded)网址:/cgi-bin/jrnlst/jloptions.cgi?PC=DIS
50、I Web of Knowledge/UA_GeneralSearch_input.do?product=UA&search_mode=GeneralSearch&SID=1Een7DpHdp1oml8clCb&preferencesSaved=Science网站 /journalsSCI(3783种)和SCIE(8355种)的种类(截至2011年06月)检索SCIE收录期刊通过期刊全名检索SCIE收录期刊:例如 英国放射线杂志找到该杂志通过A-Z字母检索SCIE收录期刊:例如 AAPG BULLETIN找到JCR报告通过杂志名查找影响因子通过JCR 找到该杂志并了解IF因子查找BRIT J
51、Radiol的IF(2.105,2009)3)荷兰医学文摘EMBASE-Pubmed的重要补充EMBASE.com-全球最大最具权威性的生物医学与药学文献数据库EMBASE荷兰医学文摘中九百多万条生物医学记录与六百多万条独特的MDELINE记录(1966年推出)相结合,形成全球最大最具权威性的 生物医学与药理学文献数据库。EMBASE.com 囊括了70多个国家/地区出版的5,000多种刊物,覆盖各种疾病和药物信息,尤其是它所涵盖的大量欧洲和亚洲医学刊物。EMBASE覆盖的学科领域药物研究、药理学、制药学、药剂学、不良反应与相互作用、毒理学人体医学(临床与实验)基础生物医学生物工艺学、生物医学
52、工程、医疗设备卫生政策与管理、药物经济学公共与职业卫生、环境卫生与污染控制物质依赖与滥用精神病学与心理学替代与补充医学(包括中医学)法医学4)Google Scholar (Google 学术搜索 GS) Google于2004年底推出的专门面向学术资源的免费搜索工具能够方便快速地帮助中外用户查找包括期刊论文、学位论文、书籍、预印本、文摘和技术报告在内的学术文献,内容涵盖自然科学、人文科学、社会科学等多种学科,涉及资源网页上亿并有评价机构严格把关,屏蔽掉许多无用资源。当前最值得推荐的适合中国医生的科技文献检索和评价工具Google Scholar主要功能 1. 帮助我们在全球的学术研究中找到最
53、相关的研究和尽可能多的全文。 2. 通过强大的学术网页搜索立刻查证某一位专家到底对科学作过多大贡献有多少人引用或继续他的研究结果。而且还可以同时检索引文的情况。 国内外专家认为:GS的出现不仅补充了专业数据库(例如 Pubmed)学科面太窄的缺点,而且可以让科学家及其研究结果通过网络学术搜索引擎而公开化和非专业化,使科学家的工作业绩变得更加透明,从而以防止造假、评审不公等弊病。 美国HighWire Press 844种期刊中各种网络资源的比例,Google占了绝对优势英国医学杂志2006年12月报道:澳大利亚医生研究证实GS可以帮助疑难病症的鉴别诊断,准确率达58%美国医学专家在 F1000
54、 Medicine里对这篇文章给予高度评价,评为“推荐”文章Google Scholar检索举例:检索浙江大学医学院邵逸夫医院蔡秀军医生发表文献查见蔡秀军作者发表151篇文章,其中多篇文章被引用,引用次数最高达50次之多.5) 重要全文医学文献数据库HighWire Press / HighWire Press是全球最大的提供免费全文的学术文献出版商,于1995年由美国斯坦福大学图书馆创立。最初仅出版著名的周刊 “Journal of Biological Chemistry”,目前已收录电子期刊710多种,文章总数已达230多万篇,其中超过77万篇文章可免费获得全文;通过该界面还可以检索Me
55、dline收录的所有文献,并可获得文摘题录。 获得你所需要的文献6)AltaVista仅次于Google 的世界第二大搜索引擎/6.AltaVista是功能全面的搜索引擎,但现在其地位已被Google取代。即便如此,它仍被认为是功能最完善,搜索精度较高的全文搜索引擎之一。截止2002年6月,AltaVista宣称其数据库已存有11亿个Web文件,并且经过升级,其搜索精度已达业界领先水平。检索实例:急性胰腺炎研究近三年研究的综述性PDF文献可以直接获得大量综述性文献原文Altavista提供大量的PDF原文三、信息检索技术的医学应用最新进展 随着Google等通用搜索引擎的迅速兴起,整合式检索方
56、式和二代垂直搜索的网络文献检索工具逐步成为信息检索的主流方向。例如GoPubmed、 SearchMedica, CureHunter等)1. 什么是智能检索?智能检索与基于中文词义概念的传统检索不同,它以文献和检索词的相关度为基础,综合考查文献的重要性等指标,相关性采用各字段加权混合索引,相关性分析更准确,重要性指通过对文献来源权威性分析和引用关系分析等实现对文献质量的评价,这样的结果更能将与用户愿望最相关的文献排到最前面,提高检索效率。-/view/775705.htm?func=retitleWhat You Get is What You Want 所得即所需搜索引擎在使用者和互联网资
57、源这两者之间建立起一个联系,将用户真正想要的内容呈现给用户,同时用户不想要的内容不呈现给用户。这一要求被称为“所得即所需”(What You Get is What You Want)。第一代搜索引擎的特征是目录搜索,代表产品是YAHOO; 第二代搜索引擎提出了页面重要性分析技术和超链分析技术等,将最重要的页面优先呈现给用户。代表产品就是GOOGLE。 2.Gopubmed 新一代知识检索工具GoPubMed是一款新近推出的由德国人创建的对PubMed进行智能检索、分类导航和深度开发的理想工具,也是一种对检索结果进行多角度统计分析的软件。通过它检索者可以很快了解检索到的文献的概貌和本研究领域的
58、研究态势。例如年度分布、核心作者、核心期刊、合著者网络可视化、作者分布可视化地图(即四W分析-What Who Where When) /Go Pubmed新一代用基因本体(Gene Ontology, Go)和医学主题词表(MeSH)对PubMed进行探索的智能检索工具 Go Pubmed是什么? GoPubmed的数据源跟美国国立医学图书馆的PubMed完全一样,其本身并没有数据库,其原理为将读者检索提问词提交给PubMed,接收PubMed的检索结果,利用GO(gene ontology,GO-基因本体)词表和MESH(医学主题词表)对检索结果进行提炼,利用算法从中提取GO术语和MESH
59、主题词,自动生成临时基因本体词表和医学主题词表,从而对检索检索进行分类,读者可以根据这些分类快速找到自己需要的文献,而不需要将检索到所有文献进行阅读,大大缩短了阅读捡得文献的时间!自称可节约医生90%的检索时间。GO(gene ontology)一个陌生的概念对大家而言也许会是一个相对陌生的名词,但是它已经成为生物信息领域中一个极为重要的方法和工具,并正在逐步改变着我们对biological data的组织和理解方式,它的存在已经大大加快了我们对所拥有的生物数据的整合和利用,我们应该逐步学会理解和掌握这种思想和工具。到目前为止,Gene Ontology Consortium(GO的发起组织)
60、的数据库中有3大独立的ontology被建立起来:biological process 生物过程, molecular function分子功能及cellular component细胞组分。 GoPudMed 的主要功能GoPudMed 是第一次彻底地,自动地从成千上万的生物医学的科学文献里提取出合作研究网络。对于每个在特定语义上的概念,GoPubMed 的 “热点追踪“可以显示出在这个研究领域的专家们之间的合作网络。当用户要查找合适的专家时,GoPubMed 可以搜索这些网络去找出潜在的专家和他们的合作者,这样子就能够节省很多时间。当要在某个科学方向建立起临时的高水平的的研究团队时,这种搜
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