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文档简介
1、v1.0可编写可改正动物血红蛋白构造剖析1、研究进展脊椎动物hemoglobin(Hb)蛋白有4个亚基组成,为22构造,每个亚基均有1条多肽链和拥有1个亚铁离子的血红素分子组成,含有1个血红素基团和1个氧联合部位,形成珠蛋白,联合4个血红素基团以后变形成了血红蛋白1。当血红蛋白与氧联合时,形成氧合血红蛋白,进而使得血液呈鲜红色2。血红蛋白的载氧功能与其亚基构造的2种状态有关,在缺氧组织(如肌肉组织)中,亚基处于紧张状态(T状态),使氧不可以与血红素联合,因此在需氧组织里能够快速地脱下氧,将氧气开释,而在含氧丰富的肺或鳃中,亚基构造呈废弛状态(R状态),使氧极易与血红素联合,进而快速地联合氧气,
2、将氧运载至需氧组织1。人血红蛋白自己能够产生NO,能够帮助把氧气输送到各样人体组织,起到扩充血管和稳固血压的作用3。血红蛋白能够保持机体内环境的酸碱稳固,拥有波尔效应1。人血红蛋白的研究在疾病方面也许多:如利用血红蛋白能够作为检测一些疾病的指标等。啮齿类动物等的脑血红蛋白履行储存氧气的功能,以保证当氧气供给不足时,大脑的氧气浓度的临时恒定4。2、立体依照动物血红蛋白不单拥有运载氧气的功能,还拥有氧化酶活性、过氧化物酶活性和抗菌等功能。动物血红蛋白功能及构造千差万别,特别是无脊椎动物,守旧性较低.可是其主要功能氧运载蛋白功能没有改变;因为血红蛋白的某些构造的变化,进而能够使得血红蛋白获取新的功能
3、。研究动物血红蛋白的构造对揭示生物进化拥有重要意义5。3、研究内容1v1.0可编写可改正对血红蛋白进行基天性质剖析、亚细胞定位剖析、跨膜性质剖析、二级构造展望、三级构造展望等。4、研究方案血红蛋白序列的获取进入BCBI主页选择protein搜寻hemoglobin,以fasta格式保留。基天性质剖析进入网址:;选择Primarystructureanaslysis的ProtParam程序;在对话框中输入血红蛋白原序列,点击剖析;记录结果并剖析。亚细胞定位进入PSORT主页:;将血红蛋白原序列输入对话框,点击剖析;4.3.3记录结果并剖析。跨膜性质展望进入网址:;在对话框中输入血红蛋白原序列,点
4、击剖析;4.4.3记录结果并剖析。二级构造剖析进入JPred主页,点击Email结果提交方式,输入血红蛋白原序列;设置各项参数,点击Run提交;在邮箱中找到构造地点,进行查察;4.5.4记录结果并剖析。三级构造剖析进入SWISS-MODLE三级构造展望服务器;填写Email地点,选择FirstApproachmode2v1.0可编写可改正在Resultoption选择Awiss-PdbViewermode;提交序列;4.6.5将邮箱中返回的PDB文件用rasmol软件阅读,用Awiss-PdbViewer软件进行简单剖析。5、结果剖析与评论血红蛋白序列gi|160797|gb|hemoglob
5、inPseudoterranovadecipiensMHSSIVLATVLFVAIASASKTRELCMKSLEHAKVGTSKEAKQDGIDLYKHMFEHYPAMKKYFKHRENYTPADVQKDPFFIKQGQNILLACHVLCATYDDRETFDAYVGELMARHERDHVKVPNDVWNHFWEHFIEFLGKTTLDEPTKHAWQEIGKEFSHEISHHGRHSVRDHCMNSLEYIAIGDKEHQKQNGIDLYKHMFEHYPHMRAFKGRENFTKEDVQKDAFFVNKDTRFCWPFVCCDSSYDDEPTFDYFVDALMDRHIKDDIHLPQEQWH
6、EKLFAEYLNEKSHQHLTEAEKHAWSTIGEDFAHEADKHAKAEKDHHEGEHKEEHH基天性质分子式:C1772H2616N490O515S16;总原子数:5409;氨基酸数:333;相对分子质量:;等电点:;负电荷氨基酸数:60,正电荷氨基酸数:42,呈酸性。各氨基酸数目及所占比率:氨基酸AlaArgAsnAspCysGlnGluGlyHisIleLeu3v1.0可编写可改正个数24119277113312331418比率%氨基酸LysMetPheProSerThrTrpTyrValPylSec个数31922915147121500比率%00亚细胞定位在细胞外的可能性
7、:%在过氧化酶体的可能性:%在溶酶体的可能性:19%在细胞膜上的可能性:10%跨膜性质4v1.0可编写可改正由上图可知血红蛋白不跨细胞膜,很可能所有位于细胞膜外,这与其生理功能:联合氧气有亲密关系,因为当其处于细胞膜外才能更好的与细胞外界的氧气接触,这样才能有联合氧气的可能。二级构造此中H表示螺旋。三级构造5v1.0可编写可改正从上图中很简单发现血红蛋白的三级构造是由16个大小的螺旋的二级构造相连而组成的,这与上述二级构造展望结果基本符合。它的这类构造可能和其以构象异构来运输氧气的功能有关。6、参照文件王镜岩,朱胜庚,徐长法.生物化学(上册)M.3版.北京:高等教育第一版社,2002:257-270陈耀强,王婧,万家义等.血红蛋白的分子构造及与其载氧功能有关的药物研究进展J.绵阳师范学院学报,2004,23(5):1-4.3DattaS,MachaalA,ThekkudanJ,etnitricoxideasrescuetherapyforrightventricularinsufficiencyafterorthotopichearttransplantationJ.HeartandLungTransplantation,2004,23(2):158.4SchelshornDW,SchneiderA,KuschinskyW,etofhemoglobini
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