部分中国鲤科(鲃亚科及野鲮亚科)的DNA条形码分析

1、部分中国鲤科(鲤亚科及野鳗亚科)的DN粽形码分析鲤科 (Cyprinidae) 隶属于硬骨鱼纲 (Osteichthyes) 辐鳍亚纲(Actinopterygii) 鲤形目 (Cypriniformes) 鲤亚目 (Cyprinoidei), 广泛分布于亚欧大陆、日本、东印度群岛、非洲以及北美洲 , 在全球淡水捕捞业及养殖业中均占着较大比重, 具有可观的经济价值。 近年内 , 受环境污染、 生境破坏和不适当的鱼类资源利用等因素影响 , 中国鲤科鱼类面临着低龄化、个体小型化及种群规模减少等问题 , 亟待相关的种质资源保护工作的开展。其中 , 作为鲤科的 2 类代表鱼类, 鲃亚科 (Barbin

2、ae) 及野鲮亚科(Labeoninae)的部分物种种间形态相似, 缺乏明显的分类特征, 其物种鉴定容易发生错误。 为探讨中国鲃亚科、 野鲮亚科鱼类的分类地位, 本研究测定了采自 13省46种共计 377尾样本的COI序列并结合从Genbank数据库下载的6属8种共计27条序列进行 相关的DN烁形码分析,结果如下。鲃亚科在基于 k2p 模型的邻接树上形成31 个明显分支, 分支间平均遗传距离(14.20%) 约为分支内平均遗传距离(0.5%) 的 28.40 倍。其中 , 北江光唇鱼(Acrossocheilus beijiangensis) 、侧条光唇鱼(Acrossocheilus par

3、allens) 、带光唇鱼 (Acrossocheilus cinctus) 、光唇鱼 (Acrossocheilus fasciatus) 、温 州光唇鱼 (Acrossocheilus wenchowensis) 、吉首光唇鱼(Acrossocheilusjishouensis) 、南方白甲鱼(Onychostoma gerlachi) 、细尾白甲鱼(Onychostomalepturum) 、白甲鱼 (Onychostoma simaum) 、高体白甲鱼(Onychostomaalticorpus) 、卵形白甲鱼(Onychostoma ovalis) 、云南光唇鱼(Acrossoche

4、ilusyunnanensis) 、中华倒刺鲃(Spinibarbus sinensis) 、云南倒刺鲃(Spinibarbus yunnanensis) 、 倒刺鲃 (Spinibarbus denticulatus) 、 鲈鲤 (Percocypris pingi) 、少鳞舟齿鱼(Scaphiodonichthys acanthopterus) 、金线鲃 (Sinocyclocheilusgrahami) 、黑脊倒刺鲃(Spinibarbus caldwelli) 、光倒刺鲃(Spinibarbushollandi) 、大鳞四须鲃(Barbodes vernayi) 、细尾长臀鲃(Myst

5、acoleucuslepturus) 、 长臀鲃 (Mystacoleucus marginatus) 、 斑尾小鲃 (Puntius sophore) 、中国结鱼 (Tor sinensis) 、异斑小鲃(Puntius ticto) 、史尼氏小鲃(Puntiussnyderi) 等 27 种鱼类均独立形成单个分支, 支持其分类有效性。其余种类出现混杂分布, 推测长鳍光唇鱼 (Acrossocheilus longipinnis) 和虹彩光唇鱼(Acrossocheilus iridescens) 属同种异名 , 细身光唇鱼(Acrossocheilus elongatus) 和细长白甲鱼(

6、Onychostoma elongatum) 属同种异名,从Genban椒据库下载的后鳍吻孔鲤(Poropuntius opisthopterus) 序列和云南吻孔鲃 (Poropuntius huangchuchieni) 则存在以下可能:1) 属于同一物种。 2)属于不同物种，从Genbank下载的疏斑小鲤(Puntius paucimaculatus) 序列 PunpauYunNK能隶属条纹小鲤(Puntius semifasciolatus) 。此外 , 中国结鱼进一步分成2 组 , 组间的遗传距离达到 5.50%,高于一般物种的种内遗传距离(2%), 表明其中存在隐藏的多样性。野鲮亚

7、科在基于 k2p 模型的邻接树上形成了 18个明显分支, 分支间的平均遗传距离(12.29%) 约为分支内平均遗传距离(0.29%) 的 42.38 倍。其中卷口鱼(Ptychidio jordani) 、泉水鱼 (Semilabeo prochilus) 、岩鲮(Semilabeo notabilis) 、直口鲮 (Rectoris posehensis) 、巴马缨鱼(Pseudocrossocheilus bamaensis) 、 双珠盘蒯(Discogobio bismargaritus) 、 长I盘蒯(Discogobio macrophysallidos) 、云南盘蒯(Discogobio yunnanensis)、 洞庭华鲮 (Bangana tungting) 、 华鲮 (Sinilabeo rendahl) 、 纹唇鱼 (Osteochilussalsburyi) 、 鲮鱼 (Cirrhinus molitorella) 、 条纹墨头鱼(Garra fasciacauda) 、印度墨头鱼(Garra salweenica) 、缺须盆唇鱼(Placocheilus cryptonemus) 、东方墨头鱼 (Garra orientalis) 均独立形成单个分支, 支持其分类有效性。无须墨头鱼 (Garra imberba) 和墨头鱼 (Garra pingi pin