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1、秦巴山区智力低下儿童FRAXF基因多态性研究张素珍,张富昌,谢学建,魏亚宁,舒青【关键词】儿童StudynFRAXFgeneplyrphisinhildrenithentalretardatininQinbauntaindistrit【Abstrat】AI:TinvestigatetheassiatinbeteenFRAXFgeneplyrphisandthehildintelligeneinQinbauntaindistrit.ETHDS:FRAXFgentypeasdetetedin84entalretardatin(R)hildrenand74nralntrlsbyusingPRandp
2、lyarylaidegeleletrphresis(PAGE)ethds.TheassiatinfFRAXFgeneplyrphisandthehildintelligeneasstudied.RESULTS:NineteenalleleshadbeenhekedutinRgrupiththerepeatfrequenyranging728.Tentynealleleshadbeenhekedutinntrlgrup,therepeatfrequenyranging120.ThedistributinfFRAXFgentypeassignifiantlydifferentbeteenRandn
3、trlgrups(2=14.05,P0.005).NLUSIN:ThereasanassiatinbeteenFRAXFgeneplyrphisandthehildintelligene.FRAXFgeneaybeneftheandidategenespredispsingtR.【Keyrds】plyrphis(genetis);hild;intelligene;FRAXF【摘要】目的:研究秦巴山区儿童FRAXF位点多态性与儿童智力之间的关系.方法:应用多聚酶链式反响PR结合聚丙烯酰胺电泳凝胶分析系统分析技术对84例智力低下儿童及对照组72例智力正常儿童的FRAXF基因多态性进展检测比拟,讨论
4、FRAXF基因多态性对儿童智力的影响.结果:病例组共检出该位点19个等位基因,重复次数范围为728.对照组共检出该位点21个等位基因,重复次数范围在120.通过2检验,两组之间等位基因多态性分布差异显著2=14.05,P0.005.结论:结果提示FRAXF基因的不稳定性可能与儿童的智力发育有关.FRAXF基因可能是儿童智力低下的易感基因之一.【关键词】多态现象遗传学;儿童;智力;FRAXF0引言1969年Lubs等首次发现X染色体上具有1个脆性位点FRAXA1,此后遗传学家相继在人类基因组上发现了26个脆性位点,其中3个位于Xq2728区带上FRAXA,FRAXF及FRAXE2-4.过去认为除
5、FRAXA和FRAXE之外,其他24个脆性位点只是人类基因组中正常的多态性位点5.FRAXF基因是否可以作为R的候选基因尚在讨论.秦巴山区地处秦岭深处,交通不便,地域因素造成了互相较为隔绝的人群,平均每个自然村智力低下患者到达7%8%,是智力低下儿童基因多态性研究的一个特殊群体.本研究通过对这个特殊地区的正常儿童及智力低下儿童FRAXF基因多态性的检测,讨论了FRAXF基因多态性与儿童智力之间的关系.1对象和方法1.1对象智力低下entalretardatin,R组为84(男45,女39)例,均为柞水安康两地经智商测定(采用韦克斯勒儿童智力表法)为R儿童,年龄014岁.对照组72(男35,女3
6、7)例,为同一地区同龄智力正常儿童,年龄014岁.R者与对照组在年龄上进展了匹配,二者无显著性差异.引物由上海博亚生物技术合成,TaqDNA聚合酶购自鼎国公司.PR扩增试剂盒购自宝生物公司.测序由上海基康生物公司完成.采集研究对象的外周静脉血5L,加AD抗凝,保存于-20冰箱中,全血经蛋白酶K消化,采用酚/氯仿法抽提基因组DNA.1.2方法1.2.1基因多态性检测PR引物序列参照文献Fu等,1991.基因序列从美国生物信息中心NBI网站上查询.扩增片段长度为360bp.引物序列P1:5TGAGGTTATGGGGAGAA3,P2:5GTATAGTAT3.PR反响体系:模板DNA50g/L2L,引
7、物50pl/3L1.5L,10ldNTP2.4L,Taq酶33.34kat/L1L,10Buffer(g+)3L,H221.6L,总体积30L.扩增反响在PerkinEler9600扩增仪中进展.反响条件:95变性7in后加Tag酶;94变性2in,55退火1in,72延伸2in,循环30次后,72延伸7in,扩增产物4冰箱保存.通过15g/LAgrse凝胶电泳观察是否有PR扩增产物,通过80/L聚丙烯酰胺凝胶电泳,凝胶分析系统分析,确定PR扩增产物碱基个数,同时随机挑选PR产物由上海基康技术测序,进一步确定所扩片段是否准确以及侧翼序列的碱基个数.多态位点G重复次数nPR扩增产物碱基数量-侧翼
8、序列碱基个数/3,从而确定G的个数.鉴定基因型.统计学处理:组间基因频率差异用2检验.所用统计软件为SPSS10.0软件包.2结果2.1智力低下儿童FRAXF基因多态性检测了84例智力低下儿童外周血标本,72例正常儿童对照.病例组共检出该位点19个等位基因,片段大小381444bp,基因频率在0.8%13.3%之间,重复次数范围为728.重复次数多为11,13.对照组共检出该位点21个等位基因,片段大小360420bp,基因频率在1.8%11.9%之间,重复次数范围为120,重复次数多为9次(图1).两组之间等位基因多态性分布差异显著2=14.05,P0.05,表2.2.3PR产物测序确定扩增
9、片段(G)重复次数及片段大小(图2).表1FRAXF基因多态性在病例组与对照组之间的分布略表2FRAXF基因在病例组及对照组中男女之间的分布略图1FRAXF基因多态性在病例组及对照组中的柱形分布图略图2FRAXF基因多态性的测序图谱略3讨论1943年artin首次报道了一个X连锁形式的智力低下家系,以后命名为脆性X综合症.FRAX系X性遗传疾病,是儿童R的常见原因,在人群中发病率男性约1/4000,女性稍低5.其分子学机制是因FR1基因第1外显子非翻译区G重复区异常扩增及异常甲基化,引起FR1基因此不转录,或转录后翻译效率低,生成编码蛋白脆X智力低下蛋白(fragileXentalretard
10、atinprtEin,FRP)减少或不能生成FRP所致6.因为中枢神经系统发育多有FRI基因的高度表达,假设FR1RNA缺乏可能会损害皮层和边缘系统的发育,影响依赖于皮层和边缘系统功能意志、学习和记忆行为7.现研究说明,除FRAXA基因外,其他FRAX基因尚无足够的证据证明其与R有关.提示FRAXF基因多态性与儿童智力有相关性.该基因G重复次数大于20时,儿童智力异常的可能性较大.本研究是在秦巴山地区这个物殊儿童群体进展FRAXF基因多态性的研究,发现FRAXF基因多态性与儿童智力可能有相关性,该位点等位基因分布符合Hardyeinberg平衡遗传定律8,具有代表性.多态信息量PI:0.86,结果说明该位点具有
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