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1、精选优质文档-倾情为你奉上精选优质文档-倾情为你奉上专心-专注-专业专心-专注-专业精选优质文档-倾情为你奉上专心-专注-专业华南师范大学考研生物化学名词解释总结糖类糖类的生物学作用书P1、考试点P44光学异构体(Cptical Ismer):像甘油醛这样具有旋光性差异的立体异构体就称为光学异构体,常用D、L表示。甘油醛的构型P4认真看。差向异构体(epimer):又称表异构体,只有一个不对称碳原子上的基因排列不同的非对称异构体。变旋现象(mutarotation):在溶液中,糖的链状结构和环状结构(、)之间可以相互转变,最后达到一个动态平衡,称为变旋现象。糖苷(glycosides):单糖环
2、状结构上的半缩醛羟基与醇或酚的羟基缩合失水成为缩醛式衍生物,称为糖苷。糖的颜色鉴别 考试点P58糖的鉴别鉴别糖与非糖:Molisch试剂,-萘酚,生成紫红色。蒽酮反应生成蓝绿色。(3) 鉴别酮糖与醛糖:用Seliwanoff 试剂,酮糖在20-30秒内生成鲜红色,醛糖反应慢,颜色浅,增加浓度或长时间煮沸才有较弱的红色。但蔗糖容易水解,产生颜色。(4)鉴定戊糖:Bial 反应,用甲基间苯二酚(地衣酚)与铁生成深蓝色沉淀(或鲜绿色,670nm),可溶于正丁醇。己糖生成灰绿或棕色沉淀,不溶。N-糖肽键:指-构型的N-乙酰葡糖胺异头碳与天冬酰胺(Asn)的-酰胺N原子共价连接而成的N-糖苷键。O-糖肽
3、键:是指单糖的异头碳与羟基氨基酸的羟基O原子共价结合而成的O-糖苷键。蛋白糖基化(浙大):蛋白糖基化是蛋白质翻译后的一种重要的加工过程,在肽链合成的同时或合成后,在酶的催化下糖链被接到肽链上的特定糖基化位点,称为蛋白糖基化。蛋白糖基化的种类主要有N-糖苷、O-糖苷、糖基磷脂酰肌醇等。糖的变旋性(川大):糖的变旋性是由开链结构与环状结构在形成平衡体系过程中的比旋光度变化所引起的。在溶液中-D-葡萄糖可转变为开链式结构,再由开链式结构转变为-D-葡萄糖;同样-D-葡萄糖也转变为开链式结构,再转变为-D-葡萄糖。经过一段时间后,三种异构体达到平衡,形成一个互变异构平衡体系,其比旋光度亦不再改变。糖类
4、的生物学作用(可背):(1)提供能量。植物的淀粉和动物的糖原都是能量的储存形式。 (2) 物质代谢的碳骨架。为蛋白质、核酸、脂类的合成提供碳骨架。 (3) 细胞的骨架。纤维素、半纤维素、木质素是植物细胞壁的主要成分,肽聚糖是细胞壁的主要成分。 (4) 细胞间识别和生物分子间的识别。细胞膜表面糖蛋白的寡糖链参与细胞间的识别。一些细胞的细胞膜表面含有糖分子或寡糖链,参与细胞通信。含n个手性碳的化合物,旋光异构体的数目=2n,组成的2n/2对对映体。蔗糖性质: 无变旋现象 无还原性 不能成脎。其他糖类性质与之相反。直链淀粉是由1,4糖苷键连接的-葡萄糖残基组成的。以碘液处理变成紫蓝色。支链淀粉的直链
5、是 -1,4糖苷键连接的链,而每个分支是 -1,6糖苷键连接的链。-淀粉酶与-淀粉酶的异同点,考试点P67 (认真看)淀粉没有还原性,因为淀粉不具有半缩醛羟基()解析:淀粉不具有醛基,首先糖类的还原性并不是来自其上的羟基,而是醛基。纤维素和淀粉都有很长的分子链,链之间也有很多氢键作用等等,都大大削弱的它们的还原性。-淀粉酶水解糖原的产物是混合物()解析:麦芽糖、麦芽三糖等-淀粉酶是降解淀粉的外切酶,它作用于(A)A -1,4糖苷键 B -1,4糖苷键 C -1,6糖苷键 D -1,6糖苷键脂质脂质(lipid 也译脂类或类脂):是一类低溶于水而高溶于非极性溶剂的生物有机分子。对大多数脂质而言,
6、其化学本质是脂肪酸和醇所形成的脂类及其衍生物。哺乳动物不能合成多不饱和脂肪酸,如亚油酸、亚麻酸、花生四烯酸等。必需脂肪酸:(essential fatty acid):我们把维持哺乳动物正常生长所必需的而体内又不能合成的脂肪酸称为必需脂肪酸。自由基(free radical):也称游离基,是指含有奇数价电子并因此在一个轨道上具有一个未(不)成对电子的原子或原子团。乳化(emulsification):当有去污剂存在时,油滴被裹上一层去污剂分子,即油滴处于微团中,这样油滴作为亲水物体悬于水中而成乳胶,此过程称为乳化。皂化作用(saponification):油脂的碱水解作用,称为皂化作用。脂肪酸
7、 书 P82 酸败 考试点P97 干化考试点 P98皂化值(价)(saponification value or number):皂化1g油脂所需的KOH mg数,称为皂化值(价)。皂化值公式P94. 酸值公式 考试点P97。 脂肪酸平均分子量,考试点P95碘值:指100g油脂卤化时所能吸收碘的克数。胆固醇(Cholesterol):是高等动物生物膜的重要成分,对调节生物膜的流动性有一定的意义,它易溶于有机溶剂,不能皂化。血浆脂蛋白的分类,见考试点P110,了解下列物质中,(D)不是类脂。A 卵磷脂 B 胆固醇 C 糖脂 D 甘油二酯 E 鞘脂解析:类脂包括磷脂,鞘脂,糖脂,脂蛋白,类固醇。甘
8、油二酯是脂。氨基酸20种氨基酸的分类(必背)书P125-127名称三字母符号名称三字母符号丙氨酸Ala亮氨酸Leu精氨酸Arg赖氨酸Lys天冬酰胺Asn甲硫氨酸(蛋氨酸)Met天冬氨酸Asp苯丙氨酸pHe半胱氨酸Cys脯氨酸Pro谷氨酰胺Gln丝氨酸Ser谷氨酸Glu苏氨酸Thr甘氨酸Gly色氨酸Trp组氨酸His酪氨酸Tyr异亮氨酸Ile缬氨酸Val按R基的化学结构可将20种常见氨基酸分为:脂肪族(包括中性、碱性、酸性、含羟基或硫基氨基酸)、芳香族、杂环族三类。中性氨基酸(R基不带电荷):甘氨酸(Gly)、丙氨酸(Ala)、缬氨酸(Val)、亮氨酸(Leu)、异亮氨酸(Ile)。含羟基或硫基
9、氨基酸(R基不带电荷):丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)、半胱氨酸(Cys)、甲硫氨酸(Met)。酸性氨基酸(水解产生H+,R基带负电荷):天冬氨酸(Asp)、天冬酰胺(Asn)、谷氨酸(Glu)、谷氨酰胺(Gln)。碱性氨基酸(水解产生OH-,R基带正电荷):赖氨酸(Lys)、精氨酸(Arg)、组氨酸(His)、脯氨酸(Pro)。芳香族氨基酸:苯丙氨酸(pHe)、酪氨酸(Tyr)、色氨酸(Trp)。杂环族氨基酸:组氨酸(His)、脯氨酸(Pro)。Met的R基中含有甲硫基(-S-CH3),硫原子有亲核性,易发生极化,甲硫氨酸可作为通用甲基供体,在生物合成中,甲硫氨酸是一种重要的甲基供体。A
10、rg是碱性最强的氨基酸,其胍基碱性很强,与NaOH相当。His含咪唑环,在接近中性pH时,可离解平衡。它是在生理pH条件下唯一具有缓冲能力的氨基酸。在pH为7时,氨基酸按其R基的极性分类为,见书P127兼性离子(zwitterion):指氨基酸分子含有一个正电荷和一个负电荷的形式。氨基酸在晶体中或中性水溶液中以兼性离子形式存在。氨基酸的等电点和解离常数图,总结整理 P133氨基酸-COOHpKa或pK1-NH3+pKa或pK2R基pKa或pK3(主要看)pI甘氨酸(Gly)2.349.605.97丙氨酸(Ala)2.349.696.02缬氨酸(Val)2.329.625.97亮氨酸(Leu)2
11、.369.605.98异亮氨酸(Ile)2.369.686.02丝氨酸(Ser)2.219.155.68苏氨酸(Thr)2.6310.436.53天冬氨酸(Asp)2.099.823.86(COOH)2.97天冬酰胺(Asn)2.028.85.41谷氨酸(Glu)2.199.674.25(COOH)3.22谷氨酰胺(Gln)2.179.135.65精氨酸(Arg)2.179.0412.48(胍基)10.76赖氨酸(Lys)2.188.9510.53(NH3+)9.74组氨酸(His)1.829.176.00(咪唑基)7.59半胱氨酸(Cys)1.7110.788.33(SH)5.02甲硫氨酸(
12、Met)2.289.215.75苯丙氨酸(pHe)1.839.135.48酪氨酸(Tyr)2.209.1110.07(OH)5.66色氨酸(Trp)2.389.395.89脯氨酸(Pro)1.9910.606.30对于侧链(R基)不解离的中性氨基酸来说,其等电点为pI=0.5(pKa1+pKa2)氨基酸的pH值为:pH=pKa+lg等电点(isoelectric point 缩写为pI):指氨基酸处于净电荷为零的兼性离子状态时的pH。等电点与离子浓度无关,只决定于等电兼性离子两侧的pKa值。当pH大于等电点时,氨基酸带净负电荷,在电场中向正极移动。当pH小于等电点时,氨基酸带净正电荷,在电场中
13、向负极移动。在一定的pH范围内,氨基酸溶液的pH离等电点愈远,氨基酸所携带的净电荷愈大。等电点时的性质:1、氨基酸的溶解度最小;2、氨基酸在电场中不移动。中性氨基酸(含一个氨基和一个羧基)pI为6.0左右碱性氨基酸(含二个氨基和一个羧基)的pI比较大酸性氨基酸(含二个羧基和一个氨基)的pI比较小疏水氨基酸:丙氨酸(Ala)、缬氨酸(Val)、亮氨酸(leu)、异亮氨酸(Ile)、脯氨酸(Pro)、苯丙氨酸(pHe)、色氨酸(Ser)、甲硫氨酸(Met)。氨基酸的反应 考试点P146-150看。氨基酸的光谱性质P145(紫外最大吸收波长280nm),P155 (色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸在紫外区有
14、光吸收。) 考试点P155,P167。氨基酸与茚三酮反应,生成紫色物质。氨基酸的检验 考试点P150(了解)在近紫外区只有芳香族氨基酸有光吸收;甲醛滴定法(了解):氨基酸还可以与甲醛反应,生成羟甲基化合物。由于氨基酸在溶液中以偶极离子形式存在,所以不能用酸碱滴定测定含量。与甲醛反应后,氨基酸不再是偶极离子,其滴定终点可用一般的酸碱指示剂指示,因而可以滴定,这叫甲醛滴定法,可用于测定氨基酸。氨基酸的分离方法:1、柱层析;2、纸层析(相对迁移率,非极性性质);3、薄层层析;4、离子交换层析(电荷和非极性);5、气相层析;6、高效液相层析。蛋白质的最大紫外吸收峰在280nm处。用纸层析法分离天冬氨酸
15、、异亮氨酸和丙氨酸,他们的相对迁移率RF值从小到大的顺序为(D)A、Ile Ala Asp B、Ile Asp Ala C、Ala Ile Asp D、Asp Ala Ile解析:极性越大、迁移率越小。非极性迁移率极性组成蛋白质的氨基酸除甘氨酸外都含有“手性碳”,它们有D-型和L-型之分()解析:都是L型氨基酸组成蛋白质的氨基酸均为L-构型,蛋白质的一级结构为肽链,所以,组成活性肽的氨基酸也均为L-构型。()Asp的pK1(-COOH)为2.09, pK2(-NH3+)为9.82, pK3 (-COOH)为3.86,其pI是(2.975),当氨基酸所处溶液环境pH大于pI时,它以(负)离子形式
16、存在。解析: Asp显酸性 pI=(pK1+pK3)/2= 2.975在近紫外光域(200nm-400nm),氨基酸中仅(苯丙氨酸)、(酪氨酸)、(色氨酸)(芳香族氨基酸)具有光吸收,含有这些氨基酸的蛋白质,在近紫外光域也有吸收,其最大吸收峰一般在(280)nm。书P145谷胱甘肽(glutathione)(南京农大):是由谷氨酸、半胱氨酸和甘氨酸组成的,含有巯基的的三肽,具有抗氧化作用和整合解毒作用,还能帮助细胞保持正常的免疫系统的功能。它的分子中有一个特殊的-肽键,由谷氨酸的-羧基与半胱氨酸的-氨基缩合而成,这与蛋白质分子中的肽键不同。亮氨酸拉链(leucine zipper,中科大):亮
17、氨酸拉链是反式作用因子DNA结合结构域中的一种基序结构,由约35个氨基酸残基形成的两性卷曲螺旋形成-螺旋,疏水侧链位于一侧,解离基团位于另一侧,每两圈螺旋有一个亮氨酸,单体通过疏水侧链二聚化,形成拉链结构。该结构借助N端-螺旋而与DNA结合起作用,表现出较高的结合能力。蛋白质的共价结构凯氏定氮法公式:蛋白质含量=蛋白氮6.25(6.25是1g氮所代表的蛋白质量(g)蛋白质分子量公式:蛋白质分子量=氨基酸数目110(110是氨基酸的平均质量)蛋白质的功能(可记):细胞中含量最丰富、功能最多的生物大分子。1. 酶2. 结构成分(结缔组织的胶原蛋白、血管和皮肤的弹性蛋白、膜蛋白)3. 贮藏(卵清蛋白
18、、种子蛋白)4. 物质运输(血红蛋白、Na+-K+-ATPase、葡萄糖运输载体、脂蛋白、电子传递体)5. 细胞运动(肌肉收缩的肌球蛋白、肌动蛋白)6. 激素功能(胰岛素)7. 防御(抗体、皮肤的角蛋白、血凝蛋白)8. 接受、传递信息(受体蛋白,味觉蛋白)9. 调节、控制细胞生长、分化、和遗传信息的表达(组蛋白、阻遏蛋白)。蛋白质的一级(1)结构(primary structure):即共价结构,指蛋白质多肽链中氨基酸残基的线性排列顺序。蛋白质的二级(2)结构(secondary structure):是指多肽链借助氢键排列成自己特有的螺旋和折叠股片段。蛋白质的三级(3)结构(tertiary
19、 structure):是指多肽链在二级结构、超二级结构和结构域的基础上借助各种非共价键(或非共价力)弯曲、折叠成具有特定走向的紧密球状构象。蛋白质的四级(4)结构(quaternary structure):二个或二个以上具有独立的三级结构的多肽链(亚基),彼此间借助次级键(疏水键、离子键、氢键、范德华力等)相连,形成一定的空间结构,称为蛋白质的四级结构。蛋白质酸水解与碱水解的优缺点,见考试点P182-183。肽的理化性质,考试点P188。凡是有肽键结构的化合物都会发生双缩脲反应,且可用于定量分析。双缩脲反应是肽和蛋白质特有的反应,游离氨基酸无此反应,双缩脲反应生成紫色物质。重要的天然活性肽
20、,考试点P191-192。肽(peptide):是两个或以上的氨基酸通过脱水缩合形成若干个肽键,这些肽键相互连接而形成的化合物。它含有羧基和氨基,是一种两性化合物。肽键(peptide bond):肽键是一分子氨基酸的羧基和一分子氨基酸的氨基脱水缩合形成的酰胺键,即CONH。肽键的特点(可记):1、具有部分双键的性质;2、肽键比一般碳-氮键短;3、与肽键连接的氢原子和氧原子呈反式构型;4、肽键不可自由旋转。构象(conformation):指具有相同结构式和相同构型的分子在空间里可能的多种形态,构象形态间的改变不涉及共价键的破裂。每一种天然蛋白质都有自己特有的空间结构或三维结构,称之为蛋白质的
21、构象。氨基酸残基(amino-acid residue):肽链中的氨基酸由于参加肽键的形成因而不是原来完整的分子,称为氨基酸残基,每个氨基酸残基的平均分子量为110。谷胱甘肽(glutathione):广泛存在于动物、植物、微生物细胞内,在细胞内参与氧化还原过程,清除内源性过氧化物和自由基,维护蛋白质活性中心的巯基处于还原状态。蛋白质一级结构测定方法 考试点P195-198 书P169-175 认真看蛋白质一级结构的测定,考试点P195(了解)蛋白质N-末端测定、C-末端测定、二硫键断裂方法,考试点P196-197(最好背)。各种酶或化学试剂水解蛋白质肽键的方式(背)书P173-174:胰蛋白
22、酶:专一性强,断裂Lys或Arg的羧基端参与形成的肽键。糜蛋白酶(也叫胰凝乳蛋白酶):断裂pHe,Trp,Tyr,Leu等疏水氨基酸的羧基端肽键。嗜热菌蛋白酶:专一性差,断裂Val,Leu,pHe,Tyr,Trp、Ile或Met等氨基端参与形成的肽键。胃蛋白酶:要求断裂点两侧的残基都是疏水性氨基酸(如pHe、Leu、Trp、Tyr等),并且断裂其羧基端肽键。胃蛋白酶也可水解含二硫键的蛋白质。溴化氰(CNBr):只断裂Met的羧基端形成的肽键。羟氨(NH2OH):在pH=9时,与一性断裂Asn-Gly之间的肽键,其它条件下不专一。同源蛋白质:在不同生物体中行使相同或相似功能的蛋白质称为同源蛋白质
23、。蛋白质激活:在生物体内有些蛋白质是以前体形式合成,不具有活性,只有按一定方式裂解除去部分肽链后才具有生物活性,称之为蛋白质激活,如酶原激活。固相肽合成(了解):详见考试点P208,书P193。重叠肽(了解):由于不同的断裂方法即断裂的专一性不同,产生的切口彼此错位,使两套肽段正好跨国切口而重合的肽段。(详见考试点 P202)。酸水解(了解) 考试点P199蛋白质等电点:当溶液在某一定pH的环境中,使蛋白质所带的正电荷与负电荷恰好相等,即净电荷为零,在电场中,蛋白质分子既不向阳极移动,也不向阴极移动,这时溶液的pH称为蛋白质等电点。二硫键:二硫键通过两个(半胱氨酸)巯基的氧化形成的共价键。二硫
24、键在稳定某些蛋白质的三维结构上起着重要的作用。异肽键(南京师范):(isopeptide bond):是指两个氨基酸通过侧链羧基或侧链氨基形成的肽键。Edman降解:Edman降解又称苯异硫氰酸酯法,是指从肽链的游离的N-末端测定氨基酸残基的序列的过程。N-末端氨基酸被PITC修饰,然后从肽链上分离修饰的氨基酸,再用乙酸乙酯抽提后,可用层析等方法鉴定。余下一条缺少一个氨基酸残基的完整的肽链再进行下一轮循环。-半胱谷氨酰胺(-carboxygutamate,上海交大):是由谷氨酸的-羧基与半胱氨酸的-氨基缩合而成,这与蛋白质分子中的肽键不同。肽键:是一分子氨基酸的羧基和一分子氨基酸的氨基脱水缩合
25、形成的酰胺键,即-CO-NH-。肽:两个或以上的氨基酸脱水缩合形成若干个肽键从而组成一个肽,含有羧基和氨基,是一种两性化合物。Peptide bond 肽键胰蛋白酶是一种肽链内切酶,能水解组氨酸和精氨酸的羧基形成的肽链。()解析:水解赖氨酸和精氨酸依据肽键的存在,用于蛋白质定量分析的方法是B 。A.凯氏定氮法 B.双缩脲法 C.茚三酮反应 D.紫外分光光度法今有八肽化合物A,经测定发现含Ala、Arg、Clu、Gly、Ile、Lys、Tyr等7种氨基酸。用DNFB处理,得到DNPAla。用羧肽酶短时间处理,得到第1个可鉴定的氨基酸为游离Glu。用胰蛋白酶水解该八肽A,得到3个小肽:B含有Ala
26、、Arg,C含有Gly、Lys,D由Glu、Gly、Ile和Tyr组成。用胰凝乳蛋白酶水解肽D,得到二肽E和F,分别由Ile、Tyr和Glu、Gly组成。请问:该八肽化合物A的氨基酸排列顺序如何?(请列出推导过程)答案解析:用DNFB处理,得到DNPAla。说明N末端为Ala;用羧肽酶短时间处理,得到第1个可鉴定的氨基酸为游离Glu。羧肽酶为肽链外切酶,作用于C末端,可知C末端为Glu;用胰蛋白酶水解该八肽A,得到3个小肽:B含有Ala、Arg,C含有Gly、Lys,D由Glu、Gly、Ile和Tyr组成。胰蛋白酶水解Arg、Lys的羧基端,所以,B为Ala-Arg-,C为Gly-Lys-。用
27、胰凝乳蛋白酶水解肽D,得到二肽E和F,分别由Ile、Tyr和Glu、Gly组成。胰凝乳蛋白酶水解Tyr、pHe、Trp羧基形成的肽键,所以E为Ile-Tyr-,F为Gly-Glu。由此可知D的排列顺序为Ile-Tyr-Gly-Glu。所以该八肽化合物A的氨基酸排列顺序为Ala-Arg-Gly-Lys-Ile-Tyr-Gly-Glu。蛋白质的三维结构研究蛋白质构象的方法:如今研究蛋白质三维结构的主要方法是X-射线衍射法。 1、氢键 非共价键(次级键) 2、范德华力 稳定蛋白质三维结构的作用力 3、疏水作用:突出地位 4、离子键(盐键、静电引力) 共价键:二硫键,重要作用维持蛋白质构象的作用力(可
28、记)一级结构:肽键、二硫键(共价键)二级结构:氢键三级结构:疏水相互作用力、氢键、范德华力、盐键四级结构:范德华力、盐键二硫键对稳定蛋白质构象很重要,二硫键越多,蛋白质分子构象越稳定。-螺旋:是蛋白质中最常见、最典型、含量最丰富的二级结构原件。在-螺旋中每3.6个氨基酸残基螺旋上升一圈,每圈螺旋的高度为0.54nm,每个氨基酸残基沿轴上升0.15nm,螺旋上升时,每个残基沿轴旋转100。Pro可中断-螺旋。R侧链对螺旋的影响(可记)R侧链的大小和带电性决定了能否形成螺旋以及形成的螺旋的稳定性。1、多肽链上连续出现带同种电荷基团的氨基酸残基,(如Lys,或Asp,或Glu),则由于静电排斥,不能
29、形成链内氢键,从而不能形成稳定的螺旋。如多聚Lys、多聚Glu。而当这些残基分散存在时,不影响螺旋稳定。2、Gly的的R基太小,使形成螺旋所需的二面角的机率很小,不易形成螺旋。丝心蛋白含50%Gly,不形成螺旋。3、R基大(如Ile)不易形成螺旋。4、Pro、脯氨酸中止螺旋。5、R基较小,且不带电荷的氨基酸利于螺旋的形成。如多聚丙氨酸在pH=7的水溶液中自发卷曲成螺旋。 -螺旋的比旋不等于构成其本身的氨基酸比旋的加和,而无规卷曲的肽链比旋则等于所有氨基酸比旋的加和(了解)。折叠片:是蛋白质的一种二级结构。肽键平面折叠成锯齿状,相邻肽链主链的N-H和C=O之间形成有规则的氢键,在-折叠中,所有的
30、肽键都参与链间氢键的形成,氢键与-折叠的长轴呈垂直关系。-折叠片有平行与反平行两种类型。-转角:是一种常见的蛋白质二级结构。是球状蛋白质分子中出现的180回折,有人称之为发夹结构,由第一个氨基酸残基的C=O与第四个氨基酸残基的N-H间形成氢键。有Pro出现的地方容易形成转角。无规卷曲(randon coil):泛指哪些不能被归入明确的二级结构如折叠片或螺旋的多肽区段。无规卷曲也是蛋白质的一种二级结构。超二级结构(super-secondary structure):由若干相邻的二级结构元件(主要是-螺旋和-折叠片)组合在一起,彼此相互作用,形成种类不多的,有规则的二级结构组合或二级结构串,并在
31、多种蛋白质中充当三级结构的构件,称为超二级结构。已知的超二级结构有3种基本的组合形式:、。(背)结构域(structure domain):多肽链在二级结构或超二级结构的基础上形成三级结构的局部折叠区,它是相对独立的紧密球状实体,称为结构域,结构域是蛋白质三级结构的构件。功能域(function domain):是蛋白质分子中能独立存在的功能单位。功能域可以是一个结构域,也可以是由两个结构域或两个以上结构域组成。球状蛋白质可以根据它们的结构域类型分为4类:1、全-结构;2、,(或/)-结构;3、全-结构;4、小的富含金属或二硫键结构。EF手:钙结合蛋白中,含有Helix-Loop-Lelix结
32、构(了解)锌指:DNA结合蛋白中,2个His、2个Cys结合一个Zn(了解)亮氨酸拉链:DNA结合蛋白中,由亮氨酸倒链形成的拉链式结构(了解)亚基(subunit):是具有独立三级结构的多肽链单位。四级结构的实质是亚基在空间排列的方式。单独的亚基,无生物学功能,当亚基聚合成为具有完整四级结构的蛋白质后,才有功能。球状蛋白聚集成四级结构具有下列优势(可记)书P247结构更复杂,以便行使更复杂的功能。通过协同作用,实现对酶活性的调节。把中间代谢途径中各种酶分子聚在一起,提高催化效率。形成一定的几何形状,细菌鞭毛。适当降低溶液渗透压。别构蛋白(allosteric protein):是指除了具有结合
33、底物的活性部位,还具有结合调节物别构部位的蛋白质。活性部位和别构部位可以分属不同的亚基(活性亚基和调节亚基),活性部位之间以及活性部位与调节部位之间通过蛋白质构象的变化而相互作用。别构效应(allosteric effect):多亚基蛋白质一般具有多个结合部位,结合在蛋白质的特定部位上的配体对该分子的其他部位所产生的影响(如改变亲和力或催化能力),称为别构效应。具有别构效应的蛋白质称为别构蛋白,如别构酶。别构蛋白与一种配基的结合可影响后续同种配基的结合能力(别构效应),包括同促效应和异促效应。同促效应(homotropic effect):发生作用的部位是相同的,也即一种配体的结合对在其他同种
34、部位的同种配体的亲和力的影响。正协同效应:一种配体的结合促进后续配体的结合,这种同促效应被称为正协同效应,表现为S型结合曲线。正效应物(activator):可降低为使活性部位达到饱和所需的配体的浓度,即它是促进活性部位与配体结合的别构效应物。负协同效应:一种配体的结合抑制后续配体的结合,这种同促效应被称为负协同效应,不表现为S型结合曲线。负效应物(inhibitor):可升高为使活性部位达到饱和所需的配体的浓度,即它是抑制活性部位与配体结合的别构效应物。异促效应(heterotropic effect):发生作用的部位是不同的,也即活性部位的结合行为将受到别构部位与效应物结合的影响。蛋白质变
35、性(protein denaturation):蛋白质受到某些物理或化学因素作用时,引起生物活性个失,溶解度降低以及其他的物理化学常数的改变,这种现象称为蛋白质变性。变性实质是非共价键破裂,天然构象解体,但共价键未遭到破坏,故其一级结构仍保持完好。蛋白质变性往往发生下列现象(具体内容,书P233):1、生物活性个失;2、一些测链基团的暴露;3、一些物理化学性质的改变;4、生物化学性质的改变、结构域:也指功能域,在较大的蛋白质分子或亚基中,多肽链往往由两个或两个以上相对独立的三维实体,综合而成三维结构,三维实体之间靠松散的肽链连接,这种相对独立的三维实体称为结构域,例如免疫球蛋白就含有12个结构
36、域,每条重链上有4个结构域,每条轻链上有2个结构域。在蛋白质的二级结构中,只要存在(C),-螺旋结构就会被中断。ACys B.His C. Pro D. Thr E.Trp解析:R侧链对螺旋的影响:脯氨酸(Pro)中止螺旋。就蛋白质的三级结构而言,下列哪个说法是对的?(D)A 二硫键位于分子表面B 亲水基团位于分子内部C 羧基多位于分子内部D 疏水基团位于分子内部解析:二硫键位于分子内部;亲水基团位于分子外部、表面;羧基多位于分子外部。蛋白质四级结构可以看成一些特定三级结构的肽链通过共价键形成的大分子体系。()解析:弱次级键:如氢键、疏水作用、范德华力维系蛋白质二级结构的主要作用力是(氢键),
37、它成键方式不一样,使得(多肽链主链)折叠盘绕形式不同。其中螺旋的成键是在(链内),而折叠的成键是在(链间)。蛋白质结构与功能的关系肌红蛋白(myoglobin,Mb):是哺乳动物细胞主要是肌细胞贮存和分配氧的蛋白质,它的辅基是血红素。CO能与O2竞争肌红蛋白的第6配位键,且结合能力比O2的大200倍, CO中毒原理(了解)。肌红蛋白的氧合曲线双曲线,考试点P265,书P256。血红蛋白(hemoglobin,Hb):它的主要功能是在血液中结合并转运氧气。它存在于血液的红细胞中。血红蛋白的氧合曲线S型曲线,考试点P267,书P261。波尔效应:当pH下降时,Hb的氧分数饱和曲线向右移动,这种pH
38、对血红蛋白对氧亲和力的影响被称为波尔效应。它具有缓冲血液pH的生理意义。书P264。抗原(antigen):能引起免疫反应的任何分子或病原体称为抗原,抗原可以是一种病毒,细菌细胞壁或蛋白质或其他大分子。抗原决定簇(antigenic determinant):抗原性由抗原分子表面特殊的化学基团决定(一级结构或空间结构),这种决定或控制抗原性的化学基团称抗原决定簇。抗原决定簇的作用:被免疫活性细胞识别,从而激活免疫活性细胞产生抗体。与相应抗体的Fab结合。抗体(antibody):是在对抗原刺激的免疫应答中,B淋巴细胞产生的一类糖蛋白,它是能与相应抗原特异性结合、产生免疫反应的球蛋白,称免疫球蛋
39、白。抗体具有两个特点:高度特异性;多样性。蛋白质的分离、纯化和表征测定蛋白质相对分子质量的方法:书P291-298,考试点P277-2791、根据化学组成测定最低相对分子质量:最低相对分子质量=铁的原子量/铁的百分含量渗透压法;3、沉降法;4凝胶过滤法;5、SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳测定蛋白质分子的形状或构象,最精确的方法是X射线晶体结构分析。蛋白质的等电点:对某一蛋白质而言,当在某一pH时,其所带正负电荷正好相等(净电荷为零),这一pH值称为该蛋白质的等电点,处于等电点的蛋白质分子在电场中既不向阳极也不向阴极移动,蛋白质在等电点时溶解度最小。蛋白质的等离子点:在没有其他盐类干扰时,蛋白质的质子
40、供体基团解离出来的质子数与质子受体基团结合的质子数相等时的pH称为蛋白质的等离子点。蛋白质处于等电点(pI)时:(1)净电荷为零;(2)易沉淀析出,溶解度下降;(3)导电能力下降;(4)粘度最小。电泳(electropHoresis)移动的距离(速度)的影响因素:电荷、分子质量、颗粒大小、形状(SDS电泳只与分子质量有关,与其他3个因素无关)蛋白质的沉淀反应: 在水溶液中的蛋白质分子由于表面生成水化层和双电层而成为稳定的亲水胶体颗粒,在一定的理化因素影响下,蛋白质颗粒可因失去电荷和脱水而沉淀。 蛋白质变性后,有时由于维持溶液稳定的条件仍然存在(如电荷),并不析出。因此变性蛋白质并不一定都表现为
41、沉淀,而沉淀的蛋白质也未必都已变性。蛋白质沉淀方法(可记):书P300认真看1、盐析法:加入大量的中性盐,脱去水化层而沉淀。(不引起变性)2、有机溶剂沉淀法:加入极性的有机溶剂如甲醇等,脱去水化层以及降低介电常数而增加质点间的相互作用而沉淀。(引起变性)3、重金属盐沉淀法:当pH大于等电点时,蛋白质颗粒带净负电荷,易与重金属离子结合成不溶性盐而沉淀。(引起变性)4、生物碱或酸类沉淀法:当pH小于等电点时,蛋白质颗粒带净正电荷,易与生物碱或酸根负离子结合成不溶性盐而沉淀。(引起变性)5、加热变性沉淀法:蛋白质因加热变性凝固而沉淀。(引起变性)有机溶剂引起蛋白质沉淀的主要原因之一是改变了介质的介电
42、常数。书P307蛋白质变性(protein denaturation):天然蛋白因受物理或化学因素影响,高级结构遭到破坏,致使其理化性质和生物功能发生改变,但并不导致一级结构的改变,这种现象称为变性,变性后的蛋白称为变性蛋白。蛋白质变性的实质是分子中次级键被破坏,引起天然构象解体。变性不涉及共价键破坏,即蛋白质一级结构仍保持完好。蛋白质的复性(renaturation):在变性条件不剧烈,变性蛋白质内部结构变化不大时,除去变性因素,在适当条件下变性蛋白质可恢复其天然构象和生物活性,这种现象称为蛋白质的复性。引起变性的原因物理因素: 加热、紫外线、X-射线、超声波等。化学原因:酸、碱、有机溶剂、
43、蛋白变性剂(尿素、盐酸胍等)、重金属盐等。二硫键的改变引起的失活可看作变性。蛋白质变性的表现(可记):1、个失或部分个失生物活性,抗原性也发生改变。2、分子性质改变,溶解度降低、粘度增大,结晶能力个失。3、内部的疏水基团暴露于表面、导致光学性质改变,旋光度和红外、紫外光谱均发生变化。4、对蛋白酶降解的敏感性增大,易被水解,即消化率上升。分子伴侣(molecular chaperones):是一类与蛋白质折叠有关的蛋白质家族(来源相同、结构相似、功能相关),它们通过抑制新生肽链不正常的聚集并排除与其他蛋白质不合理的结合而协助多肽链的正确折叠。亚基缔合的驱动力主要是疏水相互作用。蛋白质的分离纯化方
44、法:1、分子大小;2、溶解度;3、电荷;4、吸附性质;5、对配体分子的生物学亲和力等。书P301-314(了解)电泳(electropHoresis):在外电场的作用下,带点颗粒,例如不处于等电状态的蛋白质分子,将向着与其电性相反的电极移动,这种现象称为电泳。测定蛋白质含量的常用方法有(了解)书P315:凯氏定氮法、双缩脲法、Folin-酚试剂法(Lowry法,标准测定方法) 、紫外吸收法、染料(考马斯亮蓝)结合法、胶体金法(带负电的疏水胶体,洋红色,遇蛋白质变蓝色,灵敏度最高)。若要使蛋白质从胶体溶液中沉淀析出,必须设法用乙醇沉淀蛋白质,作用主要是(降低介电常数和脱去蛋白质水化层),若要加快
45、沉淀作用,可用HCl或NaOH调整溶液的pH值至(等电点)。盐析:向某些蛋白质溶液中加入某些无机盐溶液后,可以降低蛋白质的溶解度,使蛋白质凝聚而从溶液中析出,这种作用叫作盐析,是物理变化,可复原。什么是蛋白质的盐析作用?一般可用什么试剂进行盐析?盐析的原理是怎么样的?蛋白质可用什么斱法脱盐?请简述脱盐的过程。1.在高盐溶液中蛋白质溶解度降低,沉淀析出的现象。2.常用的盐析试剂,饱和的硫酸铵,氯化钠,硫酸钠溶液等(饱和的中性盐溶液)3.盐析的原理:大量中性盐的加入,使水的活度降低,原来溶液中的大部分自由水转变为盐离子的水化水,从而降低蛋白质极性基团水分子间的相互作用,破坏蛋白质分子表面的水化层,
46、因此蛋白质就沉淀析出。4.透析脱盐:蛋白质是大分子物质,不能通过透析膜,但是小分子可自由通过透析膜,故常用透析的办法使蛋白质脱盐析出。破坏蛋白质的胶体溶液而使蛋白质沉淀的两个因素是(颗粒表面的电荷)和(水化膜);根据这一原理,请你举出三类沉淀蛋白质的化学试剂:硫酸铵(盐析法)、丙酮(有机溶剂沉淀法)、硝酸银(重金属盐沉淀法)。蛋白质的沉淀反应: 在水溶液中的蛋白质分子由于表面生成水化层和双电层而成为稳定的亲水胶体颗粒,在一定的理化因素影响下,蛋白质颗粒可因失去电荷和脱水而沉淀。蛋白质的沉淀反应可分为两类: (1)可逆的沉淀的反应:此时蛋白质分子的结构尚未发生显著发化,除去引起沉淀的因素后,蛋白
47、质的沉淀仍能溶解于原来的溶剂中,并保持其天然性质而不变性。(2)不可逆的沉淀反应:此时蛋白质分子内部结构发生重大改变,蛋白质变性而沉淀,不再溶于原来溶剂中。加热引起的蛋白质沉淀,蛋白质与重金属离子或某些有机酸的反应都属于此类。何谓蛋白质的沉淀反应?实验室常用硫酸铵、丙酮沉淀蛋白,试分别分析其沉淀反应的原理。蛋白质的沉淀反应(见上一题)硫酸铵沉淀蛋白质的方法属于盐析法,丙酮沉淀蛋白质的方法属于有机溶剂沉淀法。蛋白质沉淀方法,书P300认真看:1、盐析法:加入大量的中性盐,脱去水化层而沉淀。(不引起变性)2、有机溶剂沉淀法:加入极性的有机溶剂如甲醇等,脱去水化层以及降低介电常数而增加质点间的相互作
48、用而沉淀。(改变了介电常数,引起变性)3、重金属盐沉淀法:当pH大于等电点时,蛋白质颗粒带净负电荷,易与重金属离子结合成不溶性盐而沉淀。(引起变性)4、生物碱或酸类沉淀法:当pH小于等电点时,蛋白质颗粒带净正电荷,易与生物碱或酸根负离子结合成不溶性盐而沉淀。(引起变性)5、加热变性沉淀法:蛋白质因加热变性凝固而沉淀。(引起变性)下列变化中,(A)不是蛋白质变性引起的。A、分子量变小 B、氢键断裂 C、亚基解聚 D、生物学性质个失 E、疏水作用的破坏解析:分子量变小是由于蛋白质降解引起的。何谓蛋白质的等电点?等电点有何实际应用意义?某蛋白质溶液在pH为7的纯水中,所得溶液的pH为6,问此蛋白质的
49、等电点是大于6,等于6,或小于6.解答:1、蛋白质的等电点:对某一蛋白质而言,当在某一pH时,其所带正负电荷正好相等(净电荷为零),这一pH值称为该蛋白质的等电点,处于等电点的蛋白质分子在电场中既不向阳极也不向阴极移动,蛋白质在等电点时溶解度最小。 2、在实际中,常根据蛋白质在等电点时溶解度最小的特性来制备或沉淀蛋白质,以达到分离纯化蛋白质的目的。 3、此蛋白质的等电点小于6,因为蛋白质溶于pH为7的纯水中,使溶液的pH为6。根据溶液pH值下降,我们可知蛋白质的羧基端解离占优势,使得-COOH变成了-COO- ,同时解离释放出H+,因而使蛋白颗粒带负电。要使此蛋白质达到等电点,必须向溶液中加入
50、H+,使蛋白质不带电,这将导致溶液的pH进一步降低。因此此溶液的pHpI,即此蛋白质的等电点小于6。处于等电点的蛋白质,其质子供体基团解离出的质子数与质子受体基团结合的质子数相等。()解析:条件是在纯水中,无其他盐类干扰的情况下;上述内容讲的是等离子点,不是等电点。蛋白质的等电点:对某一蛋白质而言,当在某一pH时,其所带正负电荷正好相等(净电荷为零),这一pH值称为该蛋白质的等电点,处于等电点的蛋白质分子在电场中既不向阳极也不向阴极移动,蛋白质在等电点时溶解度最小。有一肽链混合物含有四种短肽,aAla-Gly-Leu-Ile,bIle-Leu-Glu-Asp,cIle-Glu-Asp,dArg
51、-Lys-Arg,在pH6.0的电极缓冲液中电泳,可以预料结果bc 将移向阳极,d 将移向阴极,从阳极到阴极的电泳谱带顺序为c b a d 。Isoprotein 同工蛋白ElectropHoresis 电泳用酒精消毒的机理是(D)A 使细菌蛋白质降解 B 破坏细菌蛋白质颗粒表面的双电层(不破坏)和水化层 C 破坏细菌蛋白质分子中的共价键(不破坏) D 使细菌蛋白质变性沉淀解析:酒精是有机溶剂,不仅使蛋白质变性还伴随沉淀。如果蛋白质的氨基数目和羧基数目相等,那么该蛋白质的pI为7.0()解析:蛋白质的R基不知,故其pI可大于7,也可小于7。当不同分子大小的蛋白质混合物经过凝胶过滤柱层析时候,小
52、分子的蛋白质因体积小而先被洗脱出来()解析:体积大的先被洗脱出来蛋白质变性(protein denaturation):天然蛋白因受物理或化学因素影响,高级结构遭到破坏,致使其理化性质和生物功能发生改变,但并不导致一级结构的改变,这种现象称为变性,变性后的蛋白称为变性蛋白。蛋白质变性的实质是分子中次级键被破坏,引起天然构象解体。变性不涉及共价键破坏,即蛋白质一级结构仍保持完好。蛋白质的复性(renaturation):在变性条件不剧烈,变性蛋白质内部结构变化不大时,除去变性因素,在适当条件下变性蛋白质可恢复其天然构象和生物活性,这种现象称为蛋白质的复性。第八章 酶通论酶(enzyme):具有生
53、物催化功能的蛋白质或核酸。酶作为生物催化剂具有高效性、高度专一性、活性调控和易失活等特点。酶的特性: 酶是生物体产生的,有催化能力的蛋白质。酶是一种生物催化剂,与一般催化剂一样,只改变反应速度,不改变化学平衡,并在反应前后本身不变。酶作为生物催化剂,与一般的无机催化剂相比有以下特点(具体内容,考试点P324):1、催化效率高;2、具有高度专一性;3、反应条件温和;4、酶的活性受多种因素调节和控制;5、稳定性差;6、酶易失活。酶的化学本质是蛋白质的依据,书P323。多酶体系(multienzyme system):催化机体内的一些连续反应的酶互相联系在一起,形成的反应链体系,一般分为可溶性的,结
54、构化的,和在细胞结构上有定位关系的三种类型。多酶体系可提高总反应的速度和效率。多酶复合体(multienzyme complex):多种酶靠非共价键相互嵌合催化连续反应的体系,称为多酶复合体,也称酶系。多酶复合体结构包括:辅基、辅酶、辅因子;辅因子:酶蛋白中非蛋白质部分,它可以是无机离子也可以是有机化合物辅酶(coenzyme):有机辅因子与酶蛋白以非共价键结合即为辅酶,与酶蛋白结合松散。辅基(prosthetic group):有机辅因子与酶蛋白以共价键结合即为辅基。全酶=脱辅酶(决定酶反应的专一性)+辅因子(电子、原子或某些基团的载体)辅酶(或辅基)在酶催化作用中通常起传递电子、原子或某些
55、化学基团的作用。某些RNA分子具有催化作用,定名为核酶(ribozyme)。酶类每种酶类所包括的酶1、氧化还原酶类脱氢酶和氧化酶,如葡萄糖氧化酶,乳酸脱氢酶等2、转移酶类一碳基转移酶,磷酸基转移酶和糖苷转移酶3、水解酶类如蛋白酶,脂肪酶等4、裂合酶类醛缩酶、水化酶、脱羧酶等5、异构酶类消旋酶、异构酶,变位酶等6、合成酶(连接酶)类如DNA连接酶EC(Enzyme Commision):表示酶学委员会,第一个数字表示酶的类别,第二个数字表示酶的亚类,第三个数字表示酶的小组,第四个数字表示酶在小组中的序列号。酶的专一性可分为结构专一性和立体异构专一性两种类型。酶的结构专一性包括:1、绝对专一性:指
56、酶只催化一种底物,生成确定的产物。2、相对专一性:指酶催化一类底物或化学键的反应,它又包括:1、基团专一性:指酶作用与底物时,对键两端的基团要求程度不同,对键一端的基团是专一的(要求严格),而对键另一端的基团要求不严格;2、键的专一性:只要求作用于底物一定的键,而对键两端的基团并无严格要求,如酯酶只催化酯键。酶专一性的假说1.锁与钥匙学说:底物与酶的活性部位的结构非常吻合2.诱导契合假说:酶的结合部位不是僵硬的,而是具有一定的柔性。酶活力(enzyme activity):即酶活性,指酶催化某一化学反应的能力,酶活力的大小可以用在一定条件下所催化的某一化学反应的反应速率来表示,二者呈线性相关。
57、酶活力单位(U,activity unit):在一定条件下,一定时间内(1min)将一定量(umol)的底物转化为产物所需的酶量为一个活力单位。酶的含量用每克酶制剂或每毫升酶制剂含有多少酶单位表示(U/g或U/ml)国际单位(IU):在最适反应条件下(温度25)下,每分钟内催化1微摩尔底物转化为产物所需的酶量为一个酶活力单位,即1IU=1umol/min。酶的比活力(specific activity),也可看书P338:表示每mg蛋白质所含的酶活力单位数,其代表酶的纯度,也可用来比较每单位质量蛋白质的催化能力。单位是u/mg。比活越高则酶越纯。比活力=活力U/mg蛋白=总活力U/总蛋白mgs
58、pecific activity比活力对全酶分子而言,在下列功能中,( A ) 不是辅因子的功能。决定酶的专一性 B.基因转移 C.传递电子 D.催化反应解析:只有脱辅酶才能决定酶的专一性,辅因子不能决定。多酶体系(multienzyme system):催化机体内的一些连续反应的酶互相联系在一起,形成的反应链体系,一般分为可溶性的,结构化的,和在细胞结构上有定位关系的三种类型。多酶体系可提高总反应的速度和效率。multienzyme complex 多酶复合体限制性内切酶命名较为特殊,例如EcoR I,其中第一个大写字母表示大肠杆菌E.coRI属名的第一个字母,第二、第三小写字母表示种名的头
59、两个字母,第四个字母表示所用大肠杆菌的菌株,最后一个罗马数字表示该细菌已分离出来的这一类酶的编号。何谓酶作用的专一性?-葡萄糖苷酶可以催化所有-葡萄糖苷水解,是否违反专一性原则?为什么? 书P332答:1、酶催化特定的底物,发生一定的反应,生成特定的产物的特性就称为酶的专一性。2、不违反专一性原则。因为-葡萄糖苷酶既要求底物具有-糖苷键,而且它还要求-糖苷键的一端必须有葡萄糖残基,而对另一端R基团则要求不严,所以它可以催化所有-葡萄糖苷水解,这符合基团专一性原则,并未违反专一性原则。按化学本质可将酶的辅助因子分为(辅酶) 和(辅基) 两大类。在酶促反应中,辅助因子起着(载体)的作用,决定酶促反
60、应的类型。某酶的编号是EC2.1.1.1,其中EC是(酶学委员会)的简称,第一个数字2表示该酶属于(转移酶)类,脱羧酶属于(裂合酶)类。酶的比活力:表示每mg蛋白质所含的酶的活力单位数,其代表酶的纯度,也可用来比较每单位质量蛋白质的催化能力。单位是u/mg。比活越高则酶越纯。酶促反应动力学酶促反应动力学(了解):是研究酶促反应速率及影响此速率各种因素的科学。它是以化学动力学为基础,讨论底物浓度、抑制剂、pH、温度及激活剂等因素对酶反应速率的影响。 底物浓度与酶促反应速率的关系呈双曲线,即当底物浓度较低时,反应速率与底物浓度呈正比关系,表现为一级反应;当底物浓度逐渐增加时,反应速率不再按正比关系
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