多聚酶链式反应扩增片段_第1页
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文档简介

1、关于多聚酶链式反应扩增片段第一张,PPT共四十五页,创作于2022年6月温故知新1:组成DNA分子的基本单位是什么?这些基本单位是如何连接成DNA分子的?DNA分子结构有什么特点?第二张,PPT共四十五页,创作于2022年6月12345DNA的基本单位脱氧核苷酸第三张,PPT共四十五页,创作于2022年6月OOPOHO碱基OOHOOPOHOOH碱基碱基脱氧核糖磷酸基团碱基脱氧核糖碱基脱氧核糖53脱氧核苷酸链结构简图磷酸二酯键第四张,PPT共四十五页,创作于2022年6月ATGCAGCTDNA分子的平面结构氢键5端3端5端3端第五张,PPT共四十五页,创作于2022年6月DNA分子的复制过程是怎

2、样的?DNA分子的复制需要哪些条件?温故知新2第六张,PPT共四十五页,创作于2022年6月DNA母链:提供复制的模板解旋酶:打开DNA双链4种脱氧核苷酸:合成子链的原料DNA聚合酶:催化合成DNA子链ATP:为复制过程提供能量引物:使DNA聚合酶从引物的3端开始连接脱氧核苷酸DNA复制的条件第七张,PPT共四十五页,创作于2022年6月复制特点半保留复制,边解旋边复制,多起点复制。DNA复制的方向DNA的合成方向总是从子链的5端向3端延伸第八张,PPT共四十五页,创作于2022年6月1、 DNA聚合酶特性不能从头合成DNA,只能从DNA的3端开始延伸DNA链,因此, DNA复制需要引物2、

3、DNA聚合酶作用过程当引物与DNA母链通过碱基互补配对结合后, DNA聚合酶就能从引物的3端开始延伸DNA链, DNA的合成方向总是从子链的5端向3端延伸一、基础知识(一)PCR原理:第九张,PPT共四十五页,创作于2022年6月第十张,PPT共四十五页,创作于2022年6月在80100的温度范围内, DNA的双螺旋结构将解体,双链分开,这个过程称为变性3、 PCR原理当温度缓慢降低后,两条彼此分离的DNA链又会重新结合成双链 PCR利用了DNA的热变性原理,通过控制温度来控制双链的解聚与结合,现在使用的PCR仪实质上也是一台能够自动调控温度的仪器第十一张,PPT共四十五页,创作于2022年6

4、月第十二张,PPT共四十五页,创作于2022年6月高温解决了打开双链的问题,但是,又导致DNA聚合酶失活的问题,耐高温的Taq DNA聚合酶解决了高温导致DNA聚合酶失活的问题,促成了PCR技术的自动化4、 Taq DNA聚合酶的应用5、 缓冲液需要为PCR反应提供的物质DNA模板,分别与两条模板链相结合的两种引物,四种脱氧核苷酸,耐热的DNA聚合酶,同时通过控制温度使DNA复制在体外反复进行第十三张,PPT共四十五页,创作于2022年6月PCR技术是80年代中期发展起来的体外核酸扩增技术。 它具有特异、敏感、产率高、 快速、 简便、重复性好、易自动化等突出 6、 PCR技术的特点第十四张,P

5、PT共四十五页,创作于2022年6月 PCR过程需要的引物是RNA或DNA,而是人工合成的DNA单链,其长度通常为2030个脱氧核苷酸7、细胞内复制和PCR不同点 PCR过程中DNA的解旋不依靠解旋酶,而是通过对反应温度的控制来实现的第十五张,PPT共四十五页,创作于2022年6月细胞内DNA的复制PCR不同点解旋解旋酶,边解旋边复制80100高温解旋,双链完全分开酶DNA解旋酶,DNA聚合酶,DNA连接酶TaqDNA聚合酶引物RNADNA或RNA能量ATP不加温度体内温和条件高温子链合成一条链连续(先导链),另一条链不连续,先合成片段,再由DNA连接酶连接(滞后链)两条子链均连续合成相同点需

6、要提供DNA复制模板四种脱氧核苷酸作为原料子链延伸的方向都是从5端到3端细胞内DNA的复制与PCR的比较第十六张,PPT共四十五页,创作于2022年6月PCR技术的原理总结利用DNA分子的热变性原理,通过控制温度来控制双链的解旋与结合,从而完成体外DNA分子的扩增。体外DNA复制的条件:四种脱氧核苷酸、耐高温的DNA聚合酶、引物、 模板;缓冲溶液和严格控制温度的温控设备。复制的方向:子链的5端向 3端延伸。第十七张,PPT共四十五页,创作于2022年6月(二) PCR的反应过程1、PCR的反应步骤PCR一般经历三十多次循环,每次循环可以分为三个基本步骤变性、复性和延伸变性(模板DNA解旋)模板

7、DNA经加热至900C以上。一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使成为单链,以便于它与引物结合,为下轮反应作准备2、循环过程第十八张,PPT共四十五页,创作于2022年6月靶序列靶序列PCR 循环第一步 :加热变性第十九张,PPT共四十五页,创作于2022年6月复性(退火) 模板DNA经加热变性成单链后,温度降到500C左右, 引物与模板DNA单链的互补序列配对结合第二十张,PPT共四十五页,创作于2022年6月靶序列靶序列引物 引物 53553533PCR 循环第二步 :引物与靶序列退火第二十一张,PPT共四十五页,创作于2022年6月延伸DNA模板引物结合物在T

8、aqDNA聚合酶的作用下以脱氧核苷酸为原料,以母链为模板,按碱基互补配对的原则与半保留复制的原理,合成一条新的DNA链第二十二张,PPT共四十五页,创作于2022年6月靶序列靶序列引物引物53553533Taq DNA聚合酶PCR 循环第三步 :引物延伸第二十三张,PPT共四十五页,创作于2022年6月靶序列 靶序列第1个 PCR 循环完成后 :得到两个拷贝的靶序列第二十四张,PPT共四十五页,创作于2022年6月第二十五张,PPT共四十五页,创作于2022年6月3、30次循环后靶序列扩增的数量循环次数DNA数量1 22 43 820 1,048,57630 1,073,741,824第二十六

9、张,PPT共四十五页,创作于2022年6月二、PCR的反应过程小结5/3/3/5/5/3/引物5/3/引物变性95oC复性55oC延伸72oC5/3/3/5/第二十七张,PPT共四十五页,创作于2022年6月5引物15引物2第二次复制第一次复制55 55 5 5模板DNA55 555 5 552530 次循环(复制)后,模板DNA的含量可以扩大100万(220)倍以上。第二十八张,PPT共四十五页,创作于2022年6月每个循环包括:变性 复性延伸从第二轮循环开始,上一次循环的产物也可以作为模板参与反应,并且由引物延伸而成的DNA单链会与引物结合,进行DNA的延伸,这样,DNA聚合酶只能特异性地

10、复制处于两个引物之间的DNA序列,使这段固定长度的序列呈指数扩增。PCR的反应过程:第二十九张,PPT共四十五页,创作于2022年6月PCR反应条件: 稳定的缓冲液环境 DNA模板 分别与两条模板链相结合的两种引物 A、T、G、C四种脱氧核苷酸 耐热的DNA聚合酶,一般用TaqDNA聚合酶 能严格控制温度变化的温控设备第三十张,PPT共四十五页,创作于2022年6月三、 PCR 的实验操作1、PCR仪(一)设备及用具实质上一台能够自动调控温度的仪器2、微量离心管一种薄壁塑料管,总容积为0.5ml3、微量移液器用于定量转移PCR配方中的液体,其上的一次性吸液枪头用一次更换一次第三十一张,PPT共

11、四十五页,创作于2022年6月PCR仪第三十二张,PPT共四十五页,创作于2022年6月微量离心管微量移液器第三十三张,PPT共四十五页,创作于2022年6月1、准备2、移液(二)实验操作步骤按照PCR反应体系的配方将所需用的试剂摆放在实验桌上用微量移液器按照PCR反应体系配方往微量离心管里面加入各种试剂第三十四张,PPT共四十五页,创作于2022年6月过程:盖严微量离心管口的盖子,用手指轻轻弹击管壁。注意:3、混合B、手指轻轻弹击微量离心管的管壁,目的是使反应液混合均匀。A、离心管口的盖子一定盖严,防止实验中脱落或液体外溢。第三十五张,PPT共四十五页,创作于2022年6月将离心管放入PCR

12、仪上,设置好PCR仪的循环程序。过程:将微量离心管放在离心机上,离心约10s。4、离心5、反应离心目的:使反应液体集中在离心管底部,提高反应效果。第三十六张,PPT共四十五页,创作于2022年6月PCR三步曲 预变性保温 变 性94 30s延伸 721min复性 5530s94 5min第三十七张,PPT共四十五页,创作于2022年6月循环数变性复性延伸预变性94,5min30次94,30s55,30s72,1min最后一次94,1min55,30s72,1min第三十八张,PPT共四十五页,创作于2022年6月PCR技术高度灵敏,为了避免外源DNA等因素的污染而造成干扰实验,PCR操作时要注

13、意做到:6、注意事项隔离操作区,所用微量离心管、枪头、缓冲液以及蒸馏水等在使用必须进行高压灭菌;PCR所用的缓冲液和酶应分装成小份,并在-20储存。使用前,将所需试剂从冰箱拿出,放在冰块上缓慢融化。分装试剂,简化操作程序,使用一次性枪头第三十九张,PPT共四十五页,创作于2022年6月(一)理论上DNA扩增数目的计算四、课题成果评价1 、一条DNA,复制n次, DNA为2 n2 、 a条DNA,复制n次, DNA为a x2 n(二)实验中DNA含量的测定1 、原理可以通过计算DNA含量来评价扩增的效果,DNA在260nm的紫外线波段有一强烈的吸收峰,峰值的大小与DNA的含量有关第四十张,PPT

14、共四十五页,创作于2022年6月稀释2LPCR反应液,加入98L蒸馏水,即将样品进行50倍稀释对照调零以蒸馏水作为空白对照,在波长260nm处,将紫外分光光度计的读数调节至零测定取DNA稀释液100L至比色杯中,测定260nm处的光吸收值计算DNA含量( g /ml )50 (260nm的读数)稀释倍数2.过程第四十一张,PPT共四十五页,创作于2022年6月第四十二张,PPT共四十五页,创作于2022年6月比色杯第四十三张,PPT共四十五页,创作于2022年6月五、实验小结 PCR仪加热使( )变性, 复性使引物与模板DNA( ),延伸需将反应温度升至中温( ),在( )的作用下,以 ( )为原料,以( )

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