《基因组学》课程教学大纲

1、基因组学实验教学大纲 一、课程基本信息1课程编号：1117024092课程类别：课内实验3课程性质：选修课4学时/学分：10学时/0.5学分5先修课程：分子生物学、基因工程、遗传学6适用专业：生物技术专业二、课程目标及学生应达到的能力一、课程简介本课程是生物技术专业的一门专业选修课程，适宜于已有分子生物学和遗传学基础的学生。基因组学是随着人类等基因组计划的完成，独立形成的一门重要的生物学科。本课程讲授基因组学的基本技术和原理，同时讲授基因组学中的热点和最新进展，以达到掌握一定的专业知识同时拓宽知识面的目的。二、课程目标通过实验教学与操作练习，达到以下课程目标课程目标1 掌握常用的分析软件及数据

2、库构建方法；课程目标2 熟悉常用的分子图形学及分子模拟软件的使用；课程目标3培养学生分析处理大规模基因组数据的能力。课程目标对毕业要求的支撑关系毕业要求毕业要求指标点课程目标对毕业要求的支撑关系知识4：专业知识系统掌握命科学技术的基本理论、基础知识和实验基本技能1、2能力2：应用知识的能力从事生物技术及其相关领域科学研究与生产的能力；具有一定的生物技术产品研发能力。1、2、3三、课程教学内容与学时分配本课程课内实验学时为10学时，主要内容如下：知识单元知识点学时课程目标教学方式序号描述描述要求1常用基因组学数据库的使用1.NCBI、DDBJ和EMBL中基因组学数据库的使用和数据格式；理解21、

3、2、3讲授操作2. NCBI的数据库查询与下载方法；掌握2基因组中开放阅读框与转录调控序列分析1.使用ORFfinder预测基因组中的开放阅读框；掌握41、2、3讲授讨论操作2.使用CpG Plot预测基因的CpG island位置；掌握3.使用PolyAH预测基因可能的转录终止的位置掌握4.使用PromotorScan寻找基因上游序列里可能的转录因子调控区域掌握3基因组密码子偏好性及剪切位点的分析使用CodonW分析基因的密码子使用偏好，了解密码子偏好分析中各指数的含义掌握41、2、3讲授讨论操作练习两种预测剪切位点的软件的使用，NetGene2和Spidey掌握四、课程教学方法实验教学方法

4、包括：课前书写预习报告、实验课老师讲解示范操作、互动讨论实验方案、学生分小组协同或独立参与操作、书写实验报告等方面。重点培养学生实验操作技能和分析、解决专业问题的能力。五、课程的考核环节基因组学实验环节按15%占比记入平时成绩；其中实验表现50%、实验报告50%，成绩以“优秀、良好、中等、及格和不及格”五个等级评定实验成绩。实验成绩评分标准如下：等级完成情况得分优秀实验过程表现优秀，实验报告内容整齐清晰，结果分析全面90-100分良好实验过程表现较好，实验报告内容完整，结果分析较为准确80-89分中等实验过程表现一般，实验报告内容较为完整，缺少结果分析70-79分及格有请假现象，实验过程表现一般，实验报告内容马虎，缺少结果分析60-69分不及格有旷课现象或未提交实验报告60分以下六、本课程与其它课程的联系与分工先修课程和教学环节：分子生物学、基因工程、遗传学后续课程和教学环节：本课程是生物技术专业生物信息技术方向的一门专业选修课程，适宜于已有分子生物学和遗传学基础的学生。本课程讲授基因组学的基本技术和原理，同时讲授基因组学中的热点和最新进展，以达到掌握一定的专业知识同时拓宽知识面的目的。通过学习使学生具备基因组学分析，能运用基因组学知识分析鉴定重要的功能基因。培养学生分析处理大规模基因组数据的能力。七、建议教