现代生物学基础

1、“现代生物学基础”授课时间表2010-2011学年第一学期（秋季学期）地点：北大2教106时间：周一：9:50-11:25周三：8:00-9:35授课教师授课日期（周一）授课日期（周三）饶毅博士9/89/139/159/20（中秋节）王晓东博士9/279/2910/1110/13白书农博士10/1810/2010/2510/27龙漫远博士11/111/311/811/10陈晔光博士11/1511/1711/2211/24朱冰博士11/2912/112/612/8张博博士1Z1312151Z201Z22纪建国博士1Z271Z291/3 （清华考试周）1/5 （清华考试周）现代生物学基础教学模块汇

2、总序号教师 姓名模块中文名称模块英文名称模块简介模块教学大纲经臼力秋季1饶毅发育生物学原理Principles of developmental biology从受精卵开始，如何发育出神奇 的神经系统？本课程着重早期神 经发育的分子和细胞基础2王晓东生物化学方法Biochemical approaches to study biological process3白书农植物发育生物学研 究的意义Significance of study on plant developmental biology从动植物发育比较的角度，介绍 植物发育生物学的发展概要与前 沿。帮助学生理解植物发育研究 在认识生命

3、本质及其规律方囿不 可或缺的重要性。帮助学生从更 加本质的层面上思考生命科学的 研究，而/、是仅仅将自己训练成 升-个匠人。.发育的本质.植物发育研究的发展历程 （几个转折点的介绍）.当前植物发育研究所面临的 问题，如何提出新的问题并 加以功效的检验白书农植物发育生物学（第二版）。（撰写中）4龙漫远演化生物学Evolutionary biology无5陈晔光细胞信号转导基础The basics of cell signaling介绍信号转导的基本概念，重点 举例几个主要的信号通路信号转导的基本概念、规律； 几个主要的信号通路（MAPK,GPCR, TGFbeta, Wnt 等）1.分子细胞生物

4、学 陈晔光、张传茂、陈全； 清华大学出版社；序号教师 姓名模块中文名称模块英文名称模块简介模块教学大纲经臼力2. Signal transduction Gomperts, Kramer, Tatham.科学出版社，第二版6朱冰真核生物的转录Eukaryotic transcription介绍真核生物的转录真核生物转录的分子基础， 真核 生物共转录修饰，真核生物转录 的调控，真核生物转录与染色质 模板Gene IX7张博遗传学技术在斑马 鱼发育研究中的应 用Genetic Manipulation in Zebrafish to Study Vertebrate Development本模块将

5、介绍模式脊椎动物斑马 鱼在遗传学与发育生物学研究中 的应用，重点介绍如何用遗传学 的理念与方法研究发育生物学的 问题，主要内容包括斑马鱼的特 点与作为模式动物的优劣、斑马 鱼常用实验技术、斑马鱼遗传学 研究技术的现状与发展，以及遗 传学技术在斑马鱼发育研允中的 应用实例。.斑马鱼是遗传与发育研究的 理想模式.斑马鱼的繁养与常用实验技 术简介.斑马鱼遗传学研究技术介绍.斑马鱼遗传与发育研究实例8纪建国蛋白质化学Protein Chemistry重点介绍蛋白质多维分离、质谱 鉴定、动态表达和翻译后修饰研 究进展。使学生了解蛋白质组学研究领域的最新进展，了解蛋白质研究 过程中的样品制备，色谱分离，

6、生物质谱鉴定，生物信息学分析 方法以及蛋白质组学研究技术序号教师 姓名模块中文名称模块英文名称模块简介模块教学大纲经臼力在生物学和医学研究中的应用， 为解决研究过程中的蛋白质一 级结构及其修饰等问题提供理 论基础。杳芋9颜宁结构生物学导论Introduction toStructural Biology以结构生物学发展中的大事记来 介绍它的发展历史及前景.结构生物学的研究方法.结构生物学的研究历史.蛋白质结构的基本概念1.蛋白质以外生物大分子的 结构研究The Double HelixIntroduction of Protein Structure10施一公细胞信号通路的结 构生物学机理St

7、ructuralMechanisms ofSignaling I以代表性的结构做引子，讲述细 胞信号通路的分子机理。2.细胞凋亡通路TGF-beta 通路P53与癌症以综述论文作为参考阅 读材料11陈国强微生物系统（合成） 生物学System Biology of Microorganisms介绍利用基因组学、转录组学、 蛋白质组学、代谢组学等研究微 生物的代谢活动。.微生物基因组学简介.微生物转录组学研究.微生物蛋白质组学.微生物代谢组学等研究.系统生物学在微生物遗传育 种中的应用暂无12苏晓东分子生物物理MolecularBiophysics对目前国际上进展很快的生物物 理领域前沿，特别是

8、单分子生物 物理，超高分辨率荧光显微镜等 前沿学科有所了解，鼓励交叉协 作，特而#开设此课程，课程邀暂无（开课时介绍参考 义就）序号教师 姓名模块中文名称模块英文名称模块简介模块教学大纲经臼力请到国际单分子生物物理领域著 名专家，我校长江讲座教授，哈 佛大学谢晓亮教授（终生）授课。 课程还邀请国内外多位生物物理 学专家，对生物物理领域进行全 方位、多领域的介绍。不需要学生们具有特殊专业基础，修过生 物化学，分子生物学一般课程以 及相关物理、化学课程的高年级 本科生和研究生均可选修此课。13黄牛计算生物物理学Theoretical andComputational Biophysics基于物理学

9、原理，利用计算科学 技术来研究生物学问题.基本理论和计算方法.大分子构象变化的模拟.蛋白-配体相互作用及药物 分子设计.蛋白三维结构预测计算机辅助药物分子设 计（徐筱杰等编著，化 学工业出版社，2004）14祁海免疫多样性之分子 细胞生物学基础Cellular and molecular basis for immunological diversity为了保护宿主抵抗各种可能的病 原感染，哺乳动物免疫系统在多 个层次上表现出多样性。比如， 在固有免疫系统里，多种 pathogen-associated molecular pattern receptors 帮助机体识别 不同类别的病原。乂比

10、如在获得 性免疫系统里，体细胞基因重组 而产生的数以亿计的抗原受体可.免疫系统功能、组成总论（1学时）.抗原受体多样性及体细胞基因重组与突变（1学时）.效应细胞分化、发育及多样 性（1学时）.免疫耐受（1学时）. Toll样受体、树突状细胞、 及免疫诱导（1学时）Janeway s ImmunobiologyFundamental Immunology (William E. Paul)序号教师 姓名模块中文名称模块英文名称模块简介模块教学大纲经臼力以精确识别不同的抗原；淋巴细 胞通过与多种抗原呈递细胞相互 作用来实现激活与分化并形成多 类型的效应细胞，用以控制不向 类病原；相同抗原特异性的效

11、应 细胞又可以依据给定病原感染的 特性在体内表现出相应的时空分 布特性。这些及其它方面的免疫 多样性又要因宿主自我耐受需要 而受到调控。本模块将讲述实现 这些免疫多样性的分子细胞生物 学机制。.免疫细胞间协同与通讯（1 学时）.免疫应答的时空分布多样性（1学时）.总结与讨论（1学时）15罗述金分子进化和系统发 育MolecularEvolution andPhylogenetics探讨分子进化和系统发育学的基 本原理，系统地介绍用于蛋白质 和DNAS化研究的统计方法。.进化的分子基础、核甘酸突 变和突变速率、同义与非同义 的核甘酸替代、氨基酸序列的 进化演变、DN际列的进化演 变；.分子钟与线性树；.系统发育树的构建原理和方 法、系统树的精确性和统计 检验；.用遗传标记构建群体树；.溯祖理论。Molecular Evolution (Li 2006);Fundamentals of Molecular Evolution (Graur and Li 2000);Phylogenetic Trees Made Easy: A How-to Manual (Hall 2007)16吕植保护生物学：概念Conservation保护生物学基本概念的介绍及全保护生物学基本概念与原则；生M. J. Groom, G. K.序号教师 姓名模块中文名称模块英文名称模块简介模块教