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文档简介
1、第十五部分基因工程15GeneticEngineering教学课件基因重组(gene recombination)是指DNA片段在细胞内、细胞间,甚至在不同物种之间进行交换,交换后的片段仍然具有复制和表达的功能。 基因工程(genetic engineering)是指采用人工方法将不同来源的DNA进行重组,并将重组后的DNA引入宿主细胞中进行增殖或表达的过程,从而改变生物特性或创造新的生物类型的技术。整合:外来DNA侵入宿主细胞,并与宿主细胞DNA进行重组,成为宿主细胞DNA的一部分,这一过程称为整合。 整合后的外来DNA仍然可随染色体DNA一起复制,并在适当的条件下进行表达,但也可在相当长的
2、一段时间内不表达。基因工程的操作过程主要由以下步骤组成:载体和目的基因的分离;载体和目的基因的切断;载体和目的基因的重组;重组DNA的转化和扩增;重组DNA的筛选和鉴定。(一)载体:可以将目的基因运载进入细胞并进行复制和表达的DNA分子。基因工程中常用的载体(vector)主要包括质粒(plasmid)、噬菌体(phage)和病毒(virus)三大类。这些载体均需经人工构建,除去致病基因,并赋予一些新的功能,如有利于进行筛选的标志基因、单一的限制酶切点等。载体构建的条件:1. 能在受体细胞中独立复制。2. 分子量小,易于分离、纯化、导入3. 有限制性内切酶位点。4. 有可供选择的遗传标志。5.
3、 易于导入受体细胞。1质粒: 是存在于天然细菌体内的一种独立于细菌染色体之外的双链环状DNA,具有独立复制的能力,通常带有细菌的抗药基因。 最早使用的质粒DNA是人工构建的pBR322,该质粒分子大小为4.3kb,带有抗四环素和抗氨苄青霉素基因,含EcoR,BamH,Hind等单一的限制酶切点。 质粒pUC19的分子结构2噬菌体: l可通过转染方式将其DNA送入细菌体内进行增殖。常用的为人工构建的噬菌体载体。噬菌体两端的片段对于其包装是必需的,因而应予保留;而其中间部分则可进行改造或置换,使之具有某种单一的限制酶切点。目的基因与噬菌体DNA进行重组时,可采用插入重组方式,也可采用置换重组方式。
4、 3病毒: 常用的为SV40,通过感染方式将其DNA送入哺乳动物细胞中进行增殖。目前应用相对较少。(二)目的基因: 目的基因的筛选和分离可采用以下方法进行: 1直接从染色体DNA中分离:仅适用于原核生物基因的分离,较少采用。 2人工合成: 根据已知多肽链的氨基酸顺序,利用遗传密码表推定其核苷酸顺序再进行人工合成。适应于编码小分子多肽的基因。l采用一定的方法钓取特定基因的mRNA,再通过逆转录酶催化合成其互补DNA(cDNA),除去RNA链后,再用DNA聚合酶合成其互补DNA链,从而得到双链DNA。这一方法通常可得到可表达的完整基因。 3从mRNA合成cDNA: 4从基因文库中筛选: 将某一种基
5、因DNA用适当的限制酶切断后,与载体DNA重组,再全部转化宿主细胞,得到含全部基因组DNA的种群,称为G文库(genomic DNA library)。 将某种细胞的全部mRNA通过逆转合成cDNA,然后转化宿主细胞,得到含全部表达基因的种群,称为C-文库(cDNA library)。C-文库具有组织细胞特异性。基因组文库的制作5利用PCR合成: l如已知目的基因两端的序列,则可采用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)技术,在体外合成目的基因。但此法可能会造成克隆的目的基因碱基序列的改变。 二、载体和目的基因的切断: 通常采用限制性核酸内切酶(restri
6、ction endonuclease),简称限制酶,分别对载体DNA和目的基因进行切断,以便于重组。限制酶目前已经发现400多种,所识别的顺序往往为4-8个碱基对,且有回文结构。 由限制酶切断后的末端可形成平端、3-突出粘性末端和5-突出粘性末端三种情况。形成粘性末端(cohesive end)者较有利于载体DNA和目的基因的重组。三、载体和目的基因的重组(接) 即将带有切口的载体与所获得的目的基因连接起来,得到重新组合后的DNA分子。(一)粘性末端连接法:当载体DNA和目的基因均用同一种限制酶进行切断时,二者即可带有相同的粘性末端。如将载体与目的基因混合在一起,二者即可通过粘性末端进行互补粘
7、合,再加入DNA连接酶,即可封闭其缺口,得到重组体。 较少的情况下,对产生的平端也可直接进行连接。 载体DNA与目的基因的连接 (二)人工接尾法: 即同聚物加尾连接法。当载体和目的基因无法采用同一种限制酶进行切断,无法得到相同得粘性末端时,可采用此方法。 此法首先使用单链核酸酶将粘性末端切平,再在末端核苷酸转移酶的催化下,将脱氧核糖核苷酸添加于载体或目的基因的3-端,如载体上添加一段polyG,则可在目的基因上添加一段polyC,故二者即可通过碱基互补进行粘合,再由DNA连接酶连接。 四、重组DNA的转化和扩增(转) 重组DNA需导入宿主细胞才能进行增殖或表达。重组质粒可通过转化(transf
8、ormation)方式导入宿主细胞,即将大肠杆菌用CaCl2处理,增加细菌细胞壁的通透性,再与重组质粒DNA短暂温育,质粒DNA即可导入宿主细胞。如果是用噬菌体作为载体的重组体,则需要用外壳蛋白进行包装,使之成为具有感染能力的噬菌体,再通过转染(transfection)方式将重组噬菌体DNA导入大肠杆菌等宿主细胞。 重组DNA导入宿主细胞后,即可在适当的培养条件下进行培养以扩增宿主细胞。对于质粒DNA,还可通过在培养基中加入氯霉素,抑制细菌蛋白质合成及染色体DNA的复制,以单独扩增细胞中的质粒DNA。五、重组DNA的筛选和鉴定(筛) 由于重组体导入宿主细胞的比例通常较低,因此需要对含有重组体
9、的宿主细胞进行筛选并作鉴定。可采用以下方法进行:(一)根据重组体的表型进行筛选: 对于带有抗药基因的质粒重组体,可采用插入灭活法进行筛选。如pBR322中带有抗氨苄青霉素和抗四环素基因,当将目的基因插入抗四环素基因后,就可引起该基因失活,细菌对氨苄青霉素耐药,而对四环素敏感。在含氨苄青霉素的培养基上能够生长,而在含四环素的培养基上不能生长的细菌即为带重组体的细菌。 插入灭活法筛选重组体 (二)根据标志互补进行筛选: 当宿主细胞存在某种基因及其表达产物的缺陷时,可采用此方法筛选重组体。即在载体DNA分子中插入相应的缺陷基因,如宿主细胞重新获得缺陷基因的表达产物,则说明该细胞中带有重组体。(三)根据DNA限制酶谱进行分析: 经过粗筛后的含重组体的细菌,还需进行限制酶谱分析进一步鉴定。将单一细菌进行扩增后分别提取其DNA,用重组时所用的同一限制酶进行酶切,再将其与不含目的基因的载
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