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文档简介
1、第十三章 RNA生物合成和加工 本章重点讨论RNA的生物合成, 对RNA的合成后加工和RNA的复制作一般介绍。 返回思考第一节 DNA指导下RNA的合成(转录)第二节 RNA转录后加工第三节 RNA指导下RNA的合成(RNA的复制)第四节 核酸生物合成的抑制剂遗传信息传递的 中心法则蛋白质翻译转录逆转录复制复制DNARNA 中心法则总结了生物体内遗传信息的流动规律,揭示遗传的分子基础,不仅使人们对细胞的生长、发育、遗传、变异等生命现象有了更深刻的认识,而且以这方面的理论和技术为基础发展了基因工程,给人类的生产和生活带来了深刻的革命。第一节 DNA指导下的RNA合成一、转录的概念二、RNA聚合酶
2、及催化反应三、RNA合成过程四、启动子和转录因子五、终止子和终止因子一、转录及转录单位(一)概念:转录是在 DNA的指导下的RNA聚合酶催化下,按照碱基配对原则,以四种核苷酸为原料合成一条与模板DNA互补的RNA 的过程。RNA的转录从DNA模板的特定位点开始,并在一定的位点终止。此转录区域为一个转录单位。 启动子(promoter) 终止子(terminator)非信息区DNA5533非信息区启动子(promotor):模板DNA分子中,由RNA聚合酶识别、结合并确定转录起点的特定序列。转录因子:RNA聚合酶起始转录需要的蛋白质辅助因子称为转录因子。原核生物的启动子约有40-60bp:转录起
3、点 1214bp 56bp5 TGTTGACAATTTTATATGPu 3 (+)3 ACAACTGTTAAAATATACPy 5 ()识别部位(-35顺序,是RNApol的亚基识别的部位)结合部位(-10顺序,又称TATA box或Pribnow box,该区域双链易解开)终止子和终止因子协助RNA聚合酶识别终止信号的辅助因子(蛋白质)称为终止因子 (termination factor)。提供转录停止信号的DNA序列称为终止子( termter)。有的终止信号的作用可被特异的因子所阻止,使RNA聚合酶得以越过终止子继续转录,这称为通读(readthrough),这类引起抗终止作用的蛋白质称
4、为抗终止因子(antitermination)。原核生物转录终止有两种类型: 1)不依赖因子的终止子:终止子中有一段富含GC的反向重复,以及紧密相连的ATbp,导致转录生成的RNA形成发夹样结构,使转录终止。 2)依赖因子的终止子:模板终止信号区域中GC及随后的AT碱基较少,当RNA聚合酶滑行至此处时, 因子进入终止区域,使RNA链延伸终止。因子:帮助RNA聚合酶识别终止信号的辅助因子,称因子终止因子。 C U A U C U U U G U U GC AU AU GC CG CG CG UA GC AU CG UA CG GC5 CAGCAUUUU-OH3 UA GU 5 -GUCAAUCA
5、-OH3不依赖因子的终止子依赖因子的终止子转录是基因表达的第一步,也是最关键的一步。基因表达的产物: 转录产物RNA 翻译产物蛋白质一个转录单位可以是一个基因(真核),也可以是多个基因(原核)。转录起点核苷酸为+1 ,起点右边为下游(转录区),用正数表示;转录起点左侧为上游,用负数表示:-1,-2,-3。 模板:DNA的反义链(二)转录的基本条件:合成原料:NTP(ATP、GTP、CTP、UTP)不需要引物RNA聚合酶:5个亚基和两个Zn+ 。n1ATPn2GTPn3UTPn4CTPRNA+(n1+n2+n3+n4)ppiRNA聚合酶DNA模板(三)转录的总反应:(四)RNA聚合酶催化的反应及
6、链的延长方向ACGACGUU模板DNA5353新合成RNA在转录过程中,DNA双链中只有一条链作为模板指导RNA的合成,这种转录方式称不对称转录.(五)转录的方式:不对称转录 启动子(promoter) 终止子(terminator)模板链(templatte strand) 反意义链(antisense strand)有意义链(sense strand)编码链(正链)非信息区DNA5533 在转录过程中指导RNA合成的DNA链,称模板链,又称无意义链、负链。在转录过程中与模板链对应的DNA链,称编码链,又称有意义链、正链,与mRNA碱基序列相同的一条链。非信息区AUGGUUCGGGCG3转录
7、转录起点+15模板链、无意义链、负链5 编码链、有意义链、正链、翻译Met Val Arg AlaATGGTTCGGGCGTACCAAGCCCGC5 3 35二、RNA聚合酶(一)、原核生物RNA聚合酶2 = 2 + 核心酶起始因子全酶(5个亚基)大肠杆菌RNA聚合酶的结构示意图核心酶(2)起始因子和模板DNA结合起始和催化聚合反应与DNA上启动子结合全酶(2 )亚基: 亚基能识别启动子,与 DNA上启动子结合,促进转录的起始,亚基自身无催化活性。亚基:参与转录全过程,催化核苷酸形成 3,5 -磷酸二酯键,使RNA延长亚基:与模板DNA结合在任何时刻,大部分聚合酶(5000左右)正在参与RNA
8、的合成,具体数量依生长条件而定。原核生物只有一种RNA聚合酶,能合成各种RNA(mRNA、tRNA、rRNA)。一个E.coli细胞中约有7000个RNA聚合酶分子, (二)真核生物RNA聚合酶 由多个亚基(8-14)组成的含Zn2+寡聚酶,分别转录不同RNA。核仁 rRNA前体 不敏感核质 m RNA前体 低浓度敏感核质 tRNA和 高浓度敏感 5SrRNA前体酶 分布 合成的RNA 对-鹅膏蕈 碱的敏感性RNApolRNApolRNApol四、RNA的转录过程(以大肠杆菌为例)1.RNA聚合酶沿DNA链移动,识别转录起点(启动子)打开螺旋,形成聚合酶-DNA-RNA复合体。2.复合体甩掉亚
9、基,随RNA聚合酶移动,沿53转录RNA链。3.DNA螺旋前开、后合,RNA延伸,不断脱离DNA。4.识别终止信号(终止子),结束转录,各自分离。RNA合成过程起始双链DNA局部解开磷酸二酯键形成终止阶段解链区到达基因终点延长阶段53RNA 启动子(promoter) 终止子(terminator)5RNA聚合酶5353553离开RNA链的延伸图解35RNA-DNA杂交螺旋聚合酶的移动方向新生RNA复链解链有义链模板链(反义链)延长部位3 一个基因 55 3启动子 终止子因子识别启动子E、DNA、RNA复合物释放因子、 E、 DNA 、RNA因子与核心酶结合释放出因子因子与DNA或E结合5pp
10、p mRNA 3RNA链延长NTP五、真核生物和原核生物转录的差别DNA核核糖体新生蛋白质真核生物原核生物mRNA前体转运加工mRNAmRNA 真核生物中转录与复制在不同的区域 RNA聚合酶不相同 启动子不同 转录后RNA加工修饰不同 主要区别如下: 1、真核生物中转录与翻译处在不同区域。转录在细胞核,翻译则在核外进行。 2、RNA聚合酶不同。原核生物1种,真核生物至少3种。 3、启动子不同 保守位点:-25处 4、转录后RNA加工修饰不同 mRNA、六、DNA复制与RNA转录的异同点、1、相同点方向:53模板:DNA3 5的单链碱基的加入:严格遵循碱基配对原则。(6)底物 dNTP NTP2
11、、不同点复制转录(2)模板 两条都作为模板 一条反义链 (3)酶 多种聚合酶和蛋白质 一种酶 (4)合成方式 半保留半不连续 不对称(5)产物 双链DNA 单链RNA (1)引物 需要 不需要七、mRNA前体的加工 1、真核生物mRNA的转录后加工 原核生物的mRNA一般合成后不需加工,在转录结束前就开始蛋白质的合成,转录与翻译几乎同时进行。 真核生物mRNA的转录后加工: 1)5端接帽子 m7G5 ppp5 Nmp 2)3端接polyA 约200Nt 3)剪去内含子,拼接外显子 4)对链内特定核苷酸进行甲 基化hnRNA(核不均一RNA) 成熟mRNA真核细胞mRNA的加工5 “帽子”Pol
12、yA 3 顺反子(cistron )m7G-5ppp-N-3 pAAAAAAA-OH 5端接上一个“帽子”(CAP)结构 3端添加PolyA“尾巴”,由RNA末端核苷酸转移酶催化 剪接:剪去内含子(intron),拼接外显子(extron) hnRNA:真核生物转录的mRNA前体既有外显子也有内含子,其分子量大而不均一,称核不均一RNA。 内含子:真核基因内部间隔外显子,并从mRNA上消失的DNA序列。 外显子:真核基因中那些在mRNA上出现,能编码蛋白质的DNA序列。 数十种tRNA加工不同,大致如下: 1)切除5末端和3末端部分核苷酸 2)在3末端加上CCA-OH序列2、tRNA前体的加工
13、 3)核苷的修饰:甲基化 U 还原 DHU U 碱基转位 A 脱氨 次黄核苷酸3、rRNA前体的加工 原核生物中rRNA前体的加工甲基化作用、专一核酸外切酶、内切酶30S前体17StRNA25S专一核酸外切酶16S rRNAtRNA23S rRNA5S rRNA专一核酸外切酶30S的小亚基50S的大亚基真核生物中rRNA前体的加工甲基化作用、专一核酸外切酶、内切酶45S前体18S5.828S5S 40S的小亚基60S的大亚基图:hn RNA的拼接2 反式拼接和选择性拼接反式拼接:前体RNA分子间的拼接选择性拼接(Alternative splicing):一个基因的转录产物在不同发育阶段或生理
14、状态下,通过不同拼接方式得到不同的mRNA和翻译产物。在基因表达调控中起重要作用。选择性拼接类型(二) RNA的编辑和再编码1 RNA编辑及生物学意义RNA编辑:RNA序列中少数碱基(U为主)的插入、替代或删除现象。意义:1)消除DNA水平上的不利突变 2)增加基因产物的多样性 3)基因调控的一种方式 4)编码产生新的功能蛋白,有利于进化 5)? 与学习和记忆有关2 再编码(了解)(三) RNA的生物功能多样性传递遗传信息,决定蛋白质的生物合成。由rRNA, tRNA, mRNA合作完成。催化功能:核酶(ribozyme)(Gilbert W. 1986)各类小RNA参与转录后加工和修饰调节基因表达和细胞功能第四节 核酸合成的抑制剂 核苷酸合成抑制剂氨基酸类似物 叶酸类似物 碱基和核苷酸类似物烷化剂放线菌素嵌合剂
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