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1、会计学1计算机辅助药物分子设计计算机辅助药物分子设计第1页/共64页第2页/共64页第3页/共64页第4页/共64页第5页/共64页第6页/共64页第7页/共64页第8页/共64页第9页/共64页第10页/共64页第11页/共64页第12页/共64页第13页/共64页第14页/共64页第15页/共64页第16页/共64页第17页/共64页白血病青光眼 第18页/共64页第19页/共64页药物设计目标:设计一个与受体结合能力强的化合物第20页/共64页第21页/共64页第22页/共64页第23页/共64页第24页/共64页第25页/共64页第26页/共64页0.51.0第27页/共64页第28页
2、/共64页第29页/共64页第30页/共64页第31页/共64页第32页/共64页第33页/共64页第34页/共64页第35页/共64页第36页/共64页第37页/共64页第38页/共64页第39页/共64页octwaterCPC第40页/共64页OH1-octanolOHHwater第41页/共64页第42页/共64页第43页/共64页Neuraminidases cleave host receptorshelp release of new virions 第44页/共64页第45页/共64页第46页/共64页第47页/共64页蛋白模型方法的应用蛋白模型方法的应用流感病毒抑制剂的设计流感
3、病毒抑制剂的设计 流感病毒的危害性:传染性强 ;威胁生命安全 ,例如H5N1、H1N1。 神经氨酸酶流感药物:扎那米韦(Zanamivir)、奥塞米韦(Oseltamivir) 。 新型流感病毒抑制剂的必要性:抗药性的新变异病毒的出现;提高药效。第48页/共64页蛋白质三维晶体结构(PDB:1FKG)受体蛋白质模型(400个原子)DFT方法优化各项构型(蛋白质模型,配体,蛋白质-配体复合体)计算各项能量受体蛋白与配体的相互作用能判断配体与受体的结合能力强弱配体设计配体设计蛋白质三维晶体结构(PDB code:1FKG)受体蛋白质模型(400个原子)DFT方法优化各项构型(蛋白质模型,配体,蛋白
4、质-配体复合体)计算各项的能量受体蛋白与配体的相互作用能判断配体与受体的结合能力强弱配体设计配体设计第49页/共64页the binding pocket of FKBP12第50页/共64页第51页/共64页第52页/共64页第53页/共64页ONHAcNH3+OOR2R1第54页/共64页磺酰脲除草剂氯嘧磺隆(CE)与拟南芥乙酰乳酸合成酶复合物的晶体结构配体分子配体分子CE第55页/共64页结论:结论:量子力学与模型蛋白相结合的方法可以作为除草剂设计的一种可靠方法,可以用来对配体-受体结合的好坏进行排序,可用来预测抑制剂的生物活性。第56页/共64页第57页/共64页第58页/共64页第59页/共64页白血病青光眼 第60页/共64页第61页/共64页第
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