耳聋基因检测

1、背景介绍耳聋基因检测的意义产品介绍案例分享2听觉障碍，不能听到外界声响的表现，轻者听而不真，重者不闻外声。WHO 耳聋分级标准：4级别级别表现表现纯音听阈纯音听阈轻度聋近距离听一般谈话无困难2640dB中度聋近距离听话感到困难4160dB 重度聋在耳边大声呼喊方能听到6180dB全聋听不到耳边大声呼喊的声音超过80dB耳聋分为传导性耳聋、感音性耳聋、混合性耳聋遗传因素；母亲怀孕期间的药物使用史；孕母宫内感染:如巨细胞病毒、疱疹、毒浆体原虫病；母亲的生产史；新生儿高胆红素血症；颅面部畸形；早产或体重低；各种后天因素，如外伤67常染色体隐性遗传方式：有25%的几率生育聋儿。线粒体母系遗传：母系成员

2、均会有聋病常染色体显性遗传：有50%的几率生育聋儿。 听力障碍的发病率听力障碍的发病率：新生儿1；青年人1%；45-64岁人群14%；65-75岁为30%-60%；75岁以后达50%-70%存在不同程度的听力损失。 中国残疾人联合会公布： 1987年的第一次全国残疾人抽样调查各类残疾人总数约为5164万，其中听力言语残疾为1770万人，占总残疾人总数的34.28%，是各类残疾的首位。 2006年的第二次全国残疾人抽样调查，全国各类残疾人总数为8296万人，听力残疾2004万人占残疾人总数24.16%，位于第二位，仅次于肢体残疾。在对四岁及四岁以内的听力损失患儿病因进行分析时，遗传因素所占比例为

3、71%，高于出生时新生儿听力损失中遗传因素占据了65%的病因N Engl J Med, 2006. 354: p. 2151-2164.SLC26A43%GJB2基因21%综合征11%非综合征型30%其他环境因素14%临床明确的感染因素10%临床不明确的感染因素11%出生时发病率（出生时发病率（186/100,000)186/100,000)SLC26A412%迟发型听力损失10%GJB2突变15%综合征型11%非综合征型22%线粒体mtDNA1555G1%其他环境因素14%临床确定的感染因素7%临床不确定的感染因素8%4 4岁时的发病率（岁时的发病率（270/100,000270/100,0

4、00） 确立了中国聋哑人群常见的3个易感基因及突变热点药物敏感性耳聋（mtDNA 1555AG)： 占我国2780万听力残疾者的5-12%,意味着139-333万人可以通过用药警示而避免致聋。先天性重度耳聋(GJB2)： 占听力残疾者的20%,意味着556万人可以明确病因，早期发现，早期干预，聋而不“哑”。大前庭水管综合征(SLC26A4)： 占听力残疾者的16%,意味着445万人通过早期发现可以避免永久性听力损失。 纯音测听，阈值在4090dB（中度重度耳聋）都应建议配用。1）先天性双耳重度-极重度感音性耳聋；Audiol Neurootol. 2004 Jul-Aug;9(4):224-3

5、32）语后聋及成年患者有基本语言识别能力及辨音能力且佩戴助听器无效者。 节省财政支出 提高出生缺陷防治水平；同时推进计生、卫生服务水平 分析耳聋基因在当地的流行病学分布 发现的药物敏感性耳聋和迟发性耳聋的个体提高诊断效率，减少漏诊率指导婚育。实现优生优育早发现、早干预，实现聋而不哑4个基因20个位点非综合征型耳聋基因检测-51单个耳聋基因sanger全测序遗传性听力损失基因检测-127三个耳聋基因高通量测序Base Molecular Weight A 313.21 C 289.18 G 329.21 T 304.19 CddATPddCTPddGTPddTTPG单碱基延伸技术单碱基延伸技术（

6、iPLEXiPLEX ）检测位点多：可同时检测20个基因位点；灵敏度高：能分辨质量差别为1 Da的分子；准确率高：99%；通量大：每天可检测3000份以上；自动化程度高：检测数据自动分析；检测周期短：收到样本后5个工作日可出报告。突变基因GJB2SLC26A4 (PDS)12S rRNAGJB3突变位点35delG、167delT、 176-191del16、299_300delAT、 235delC281CT、589GA、IVS7-2AG、1174AT、1226GA、1229CT、1975GC、2027TA、2162CT、2168AG、IVS15+5GA1494CT 1555AG538CT5

7、47GA染色体13q11-127q31mtDNA1p33-p35表达蛋白缝隙连接蛋白Connexin 26多次跨膜蛋白Pendrin线粒体功能损失缝隙连接蛋白Connexin 31临床表现常染色体隐性遗传。变异较大，可由轻度到极重度，但多数为重度或极重度耳聋常染色体隐性遗传。先天性或后天性耳聋，耳聋发生或加重与外伤、感冒有关氨基糖甙类药物性致聋，无法逆反常染色体显性遗传。我国本土克隆和鉴定的第一个耳聋致病基因新生儿婚前、孕前和产前人群各种原因不明的耳聋，包括先天性聋 和后天性聋人群听力正常，但有耳聋家族史的人群受检人群检测医院 初筛TEOAE/DPOAE 结果不通过结果通过复筛(TEOAE/D

8、POAE )+AABR/ABR阈值)筛选听力异常知情同意、自愿选择采取最少3个采血斑自愿选择，知情同意临床检验中心耳聋基因检测出具检测报告检测结果正常检测结果为杂合突变或纯合突变随访检测医院确诊出具确诊报告确诊结果为突变确诊结果正常干预追踪随访基因检测流程5 5个工作日个工作日PCRPCR、第一代第一代测序测序目标区域目标区域捕获、捕获、第二代高通量第二代高通量测序测序适用范围：适用范围：1）基因诊断基因诊断：对于临床表型难以确诊的病例给予分子水平的鉴别诊断；2）携带者筛查携带者筛查：对于无临床表型的致病突变携带者进行基因筛查；检测周期：检测周期：3535工作日工作日医院就诊样本采集DNA提取

9、文库制备高通量测序数据分析亲属验证发送报告检测周期：检测周期：3535个工作日个工作日疾病疾病基因基因非综合征型非综合征型耳聋耳聋ACTG1,CCDC50,CDH23,CLDN14,COCH,DFNB31,DFNA5,DFNB59,DIAPH1,ESPN,ESRRB,EYA4,GJB2,GJB3,GJB6,GRHL2,GRXCR1,HGF,KCNQ4,LHFPL5,LOXHD1,LRTOMT,MARVELD2,MIR96,MYH14,MYH9,MYO15A,MYO1A,MYO3A,MYO6,MYO7A,OTOA,OTOF,PCDH15,POU3F4,POU4F3,PRPS1,RDX,SIX1,

10、SLC17A8,SLC26A4,SLC26A5,STRC,TECTA,TMC1,TMIE,TMPRSS3,TPRN,TRIOBP,USH1C,WFS1,m.1555AG,m.1494CT综合征型耳聋综合征型耳聋基因基因Waardenburg（瓦登伯格）综合征EDN3,EDNRB,MITF,PAX3,SNAI2,SOX10遗传性共济失调性多发 性 神 经 炎 样 病（Refsum综合征）PEX1,PEX2,PEX26尤塞氏综合征（Usher syndrome）CDH23,CLRN1,GPR98,USH2AMohr-Tranebjaerg综合征TIMM8A特雷彻-柯林斯综合征（Treacher C

11、ollins syndrome）TCOF1Alport综合征（遗传性肾炎）COL4A3,COL4A4,COL4A5Wolfram综合征1型WFS1检测基因 GJB2 GJB3 SLC26A4测序采用sanger法，在以下情况可建议进行单个基因全测序 1）耳聋患者检测某个耳聋基因杂合子突变，为明确病因做该基因的全测序 2）若胎儿母亲为某个耳聋基因的携带者，为了评估胎儿患有耳聋的风险，对父亲做该耳聋基因的全测序。先天性耳聋（1/10003/1000）遗传因素 （65%）综合征型（SHL） （30%）非综合征型(NSHL)（70%）常染色体隐性（7585%）GJB2/DFNB1（50%）其他DFNB

12、（50%）常染色体显性（1524%）X-连锁 （12%）非遗传因素（35%）疾病分类疾病分类疾病中疾病中类类基因数目基因数目非综合征型非综合征型（7272个个基因）基因）常染色体隐性45常染色体显性28X-连锁3大前庭水管综合征3听神经病4综合征型综合征型（6666个基因）个基因）伴外耳畸形11伴眼病17伴代谢性疾病2伴肌肉骨骼异常10伴泌尿生殖疾病6伴内分泌疾病3伴皮肤疾病6伴神经病变2伴心脏缺陷4线粒体遗传性线粒体遗传性听力损失听力损失- -5临床服务：临床服务：127127个基因（重复个基因（重复1111个基因）个基因）技术简介：采用新一代高通量测序技术，对受检者的耳聋相关基因区域进行检

13、测和分析。目标区域捕获测序 检测时间：35个工作日（7周）检测样本：全血：5ml，EDTA抗凝 (紫盖)； DNA：6ug，OD在1.7-2.0，未降解运输条件：冰袋+干冰运输检测结果：形成报告文件 2727样本处理样本处理样本检测样本检测数据分析数据分析报告发送报告发送血样接收血样接收解读咨询解读咨询主要适用于以下情况：1：通过热点突变检测未能发现致病原因的耳聋患者2：非综合征型耳聋，无法确定致病基因及遗传方式的3：综合征型耳聋患者4：存在耳聋家族史的人群一家9口人，6人是耳聋 佛山家系为3代遗传的耳聋家系，现有家系成员9人，其中6名为耳聋患者，除由于婚姻关系成为该家系成员的2名耳聋患者外，

14、剩余的4名患者均为母系家庭成员。 30外婆同质突变外公正常 姨妈 同质突变祖父杂合突变祖母杂合突变叔叔纯和突变女：1555A纯和 235delc杂合12SrRNA A1555GGJB2 235delc母亲重聋同质突变 父亲重聋 纯和突变非常值得警惕的是：这个孩子通过了听力筛查，如果没有做基因筛查，一旦误用了氨基糖苷类药物将一针致聋，导致严重后果31患儿杜某，女，11岁；自述4岁左右，“感冒”后出现耳聋症状；临床诊断：大前庭水管综合征；否认孕期病毒感染及耳聋家族史；检测结果：患儿：SLC26A4基因1174AT+2168AG1174AT+2168AG复合突变；患儿父亲： SLC26A4基因117