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文档简介
1、海南省汉、黎族人群缺失型-地中海贫血的研究 关键词:地中海贫血;聚合酶链反应(PCR);少数民族;海南省 摘要:目的 研究海南省汉、黎族人群中东南亚型缺失(- SEA )、右侧缺失(- 3.7 )和左侧缺失(- 4.2 )三种-地中海贫血缺失突变的携带率、基因频率及基因型的分布特点。 方法 应用聚合酶链反应(PCR)技术直接筛查海南省汉、黎族人群中的东南亚型缺失(- SEA )、右侧缺失(- 3.7 )和左侧
2、缺失(- 4.2 )三种-地中海贫血缺失突变。 结果 在197例海南汉族人中检出25例-地中海贫血携带者,携带率为12.69%;三种-地中海贫血缺失突变的基因频率为0.0635,其中- SEA 、- 3.7 和- 4.2 的基因频率分别为0.0127、0.0305、0.0203,共发现- SEA /、- 3.7 /和- 4.2 /三种基因型,其中- SEA /5例,- 3.7 /12例,-
3、0;4.2 /8例。在201例海南黎族人中检出114例-地中海贫血携带者,携带率为56.72%,三种-地中海贫血缺失突变的基因频率为0.3607,其中- SEA 、- 3.7 和- 4.2 的基因频率分别为0.3607、0.0075、0.1891,共发现- SEA /、- 3.7 /、- 3.7 /- 3.7 、- 3.7 /- 4.2 、- 4.2 /、和- 4.2
4、;/- 4.2 六种基因型,其中- SEA /3例,- 3.7 /39例,- 3.7 /- 3.7 6例,- 3.7 /- 4.2 18例,- 4.2 /38例,- 4.2 /- 4.2 10例。 结论 海南省汉、黎族人群是-地中海贫血的高发群体。 关键词:地中海贫血;聚合酶链反应(PCR);少数民族;海南省
5、60; Investigation into the deletion types of-thalassemia in Han and LI Nationalities in Hainan Province. Abstract:Objective To investigate the incidences、the allelic frequencies and t
6、he genotypes frequencies of three-tha-lassemia deletion types(- SEA 、- 3.7 、- 4.2 )and their distributions in Han and Li nationalities in Hainan Province. Methods Three-thalassemia
7、 deletion types,i.e Southeast Asia deletion(- SEA ),right deletion(- 3.7 )and left deletion(- 4.2 ),were screened based on polymerase chain reaction(PCR)in Han and Li nationalities
8、 in Hainan. Results 25carriers were detected in197Han individuals,and the incidence of carriers was12.69%.The gene frequency of these three deletion types was0.0127,0.0305and0.0203respectively,to
9、tally0.0635in Han nationality in Hainan.Three genotypes of5(- SEA /)cases,12(- 3.7 /)cases and8(- 4.2 /)cases were detected.On the contrary,114carriers were detected from201individuals in Li
10、 nationality,and the incidence of carriers was56.72%.The gene frequency of these three deletion types was0.0075,01716and0.1891respec-tively,totally0.3607in Li nationality.Six genotypes were detected i
11、ncluding3(- SEA /)cases,39(- 3.7 /)cases,6(- 3.7 /- 3.7 )cases,18(- 3.7 /- 4.2 )cases,38(- 4.2 /)cases and10(- 4.2 /- 4.2 )cases. Conclusion There is a high incidence of-
12、thalassemia in Han and Li nationalities in Hainan province. Key words:Thalassemia;Polymerase chain reaction(PCR);Minority nationality;Hainan Province -地中海贫血(-地贫)是一种严重危
13、害人类健康的遗传病,其主要特征是-珠蛋白链合成减少( + 地贫)或缺如( 0 地贫)。-地贫分子缺陷有基因的大片段缺失和非缺失突变两大类 1 ,-珠蛋白基因缺失是导致-地贫的主要原因。目前全世界已发现了35种-珠蛋白基因缺失突变,在中国人中已发现7种,其中东南亚型缺失突变(- SEA )、右侧缺失型突变(- 3.7 )和左侧缺失型突变(- 4.2 )三种突变类型是我国南方最常见的缺失类型 24 。为了研究海南省汉、黎族人群中-地中海贫血的发病率及其基因型的
14、分布特点,我们应用聚合酶链反应(PCR)技术直接筛查197例海南汉族人和201例海南黎族人中的东南亚型缺失、右侧缺失和左侧缺失这三种最常见的缺失型-地贫突变类型,现将结果报告如下。 1 材料与方法 1.1 DNA样品 用EDTA抗凝,采取海南省白沙、昌江、陵水、琼中、保亭等县正常体检、兵检和中小学生黎族人末梢血;采取海南省文昌市正常体检、兵检的海南籍汉族人群末梢血,按Lahiri等方法 5 提取DNA,阳性对照标本由南方医科大学医学遗
15、传学教研室徐湘民教授惠赠。 1.2 PCR扩增 东南亚型缺失突变分析按文献 6 进行;右侧缺失型突变和左侧缺失型突变分析参照Amold S.-C.Tan 7 等报道合成引物。扩增- SEA 、- 3.7 和- 4.2 的多重PCR体系均采用TaKaRa LA Taq TMJ 及缓冲液(宝生物工程有限公司产品),PCR反应体积为25l,在PCR缓冲液(1×G
16、C Buffer,2.5mmol/L MgCl 2 )中含模板DNA0.2g,引物0.20.5mol/L,dNTP为200mol/L,1U Taq DNA聚合酶,循环参数为99变性5min,85加酶,56退火1min,72延伸2min,然后951min,561min,722min,30个循环后72延伸7min。扩增产物在1%琼脂糖凝胶中电泳,经EB染色在紫外光灯下观察结果并照相。 2 结果 2.1 - SEA 、- 3.7 和
17、- 4.2 缺失型突变的多重PCR扩增 在PCR反应体系中同时扩增了2基因的一个1800bp的片段,用以判断样品DNA的2基因是否缺失,从而判断-地中海贫血突变患者是杂合子还是纯合子。无- SEA 、- 3.7 和- 4.2 缺失型突变的正常人DNA样品经PCR扩增后只出现一条1800bp的2基因扩增片段;东南亚缺失型杂合子(- SEA /)的DNA样品经PCR扩增后除出现一条1800bp的2基因扩增片段外,还出现一条740bp的特异扩增片段;右侧缺失型杂合子(- 3.7
18、160;/)的DNA样品经PCR扩增后除出现一条1800bp的2基因扩增片段外,还出现一条2022bp的特异扩增片段;右侧缺失型纯合子(- 3.7 /- 3.7 )的DNA样品经PCR扩增后只出现一条2022bp的特异扩增片段;左侧缺失型杂合子(- 4.2 /)的DNA样品经PCR扩增后除出现一条1800bp的2基因扩增片段外,还出现一条1628bp的特异扩增片段;左侧缺失型纯合子(- 4.2 /- 4.2 )的DNA样品经PCR扩增后只出现一条1628bp的特异扩增片段;右侧缺失型并左侧缺失型双重杂合子(- 3.7 /- 4.2 )的DNA样品经PCR扩增后同时出现2022bp和1628bp两条特异扩增片段。见图1。 图1 - SEA 、- 3.7 和- 4.2 缺失型突变的多重PCR检测结果(略) Fig1 The PCR-amplified result of- SEA 、- 3.7
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