基因诊断PPT学习教案

1、会计学1基因诊断基因诊断第1页/共42页第2页/共42页第3页/共42页第4页/共42页第5页/共42页第6页/共42页第7页/共42页（）单链构象多态性（）单链构象多态性（single strand single strand conformation ploymorphism,SSCP) conformation ploymorphism,SSCP)分析分析第8页/共42页第9页/共42页 限制性片段长度多态性限制性片段长度多态性 RFLPs ( restriction fragment length polymorphisms)样品一样品二1987年等人以RFLP为遗传标记绘制了第一张人

2、类遗传图谱第10页/共42页缺点：富含高熔点GC区时，则难以检测出突变第11页/共42页第12页/共42页.n第13页/共42页子数的相对量,是一种半定量方法.第14页/共42页第15页/共42页第16页/共42页第17页/共42页第18页/共42页设计探针.第19页/共42页第20页/共42页在疾病与正常样本之间寻找分子水平上的差异.第21页/共42页第22页/共42页第23页/共42页第24页/共42页短串联重复序列短串联重复序列STRs (short tendem repeats, Microsatellites )STR广泛存在于人基因组，占约广泛存在于人基因组，占约5%，基本单位是基

3、本单位是1bp-8bp的的串联重复，串联重复，重复次数重复次数 n=15-60，已知，已知8000多个，多个，主要形式为：主要形式为： (CA)n ， (GA)n ， (AA)n ， (GG)n ， (CAA)n， (CGG)n ，其中以其中以 (CA)n ， (GT)n 为多见。为多见。1992年，年，Welssenbanch等以等以STR为标记的为标记的第二代连锁图取代了第二代连锁图取代了RFLP连锁图连锁图。第25页/共42页 定义定义: :主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的变异所引起的DNADNA序列多态性。序列多态性。与与RFLPRF

4、LP与与STRSTR不同不同, ,它是直接以序列的变异作为标记它是直接以序列的变异作为标记, ,而不是以片段的而不是以片段的长度差异作为标记长度差异作为标记. . 人类基因组图谱的初步分析表明，共有人类基因组图谱的初步分析表明，共有3 3万万至万个基因。有至万个基因。有300300多万个单核苷酸多态性多万个单核苷酸多态性,SNP,SNP在在人类基因组中广泛存在，平均每人类基因组中广泛存在，平均每50050010001000个碱基个碱基对中就有对中就有1 1个，个，3-43-4个相邻的标记构成的单倍型（个相邻的标记构成的单倍型（haplotypehaplotype）就可有）就可有8-168-16

5、种。种。 19961996年，年，LanderLander报道了用单核苷酸多态性报道了用单核苷酸多态性 标记制备第三代遗传连锁图的遗传标记。标记制备第三代遗传连锁图的遗传标记。单核苷酸多态性单核苷酸多态性（single nucleotid polymorphismsingle nucleotid polymorphism，SNPSNP）第26页/共42页第27页/共42页第28页/共42页珠蛋白珠蛋白mRNAmRNA的量减少，因的量减少，因此可用此可用 RT-PCR RT-PCR定量分析定量分析mRNAmRNA的量的量以助诊断以助诊断第29页/共42页第30页/共42页第31页/共42页多重PCR法:对基因突变较集中的区域,设计多对引物,扩增基因相应的突变高发区,检测相应的基因突变.第32页/共42页第33页/共42页第34页/共42页第35页/共42页Burkitt 淋巴瘤人类乳头瘤病毒(HPV)宫