版权说明:本文档由用户提供并上传,收益归属内容提供方,若内容存在侵权,请进行举报或认领
文档简介
1、1.1Illumina 测序的原理和应用 2.2Illumina测序流程 Data Analysis 数据分析 Sequencing 测序 Cluster Generation 簇生成 Library Preparation 文库制备测序流程3.3Adapter and Library 接头和文库接头:与flow cell结合区Read1和Read2测序引物结合区Index 用来区分不同样本4.4Illumina测序流程 Data Analysis 数据分析 Sequencing 测序 Cluster Generation 簇生成 Library Preparation 文库制备测序流程5.5
2、什么是 flow cell?Flow cell 即流动槽,如载玻片大小,有8个通道即8条lane。6.61. Single DNA libraries are hybridized to primer lawn and extended by polymerase7.72. Double-stranded molecule is denatured and original template is washed away8.83. New synthesized strand is covalently attached to flow cell surface to form a bridg
3、e and extended by polymerase4. Double-strand bridge is formed9.95. Double-strand bridge is denatured and formtwo copies of covalently bound single-stranded templates6. Bridge amplification cycle repeat10.10 Multiple bridges are formed dsDNA bridges are denatured and reverse strands are cleaved11.119
4、. Cleaved reverse strands are washed away and leaving a cluster with forward strands only在Illumina的测序过程中,无论是单单端测序端测序还是双端测序双端测序,都会用到特异选择性链切断的过程。其中单端测序的要切断1次,双端测序中的两条链要先后各切断1次(共2次)。单端测序:高碘酸希夫高碘酸希夫反应 。双端测序: Illumina巧妙地利用了“甲酰胺基嘧啶糖苷酶(甲酰胺基嘧啶糖苷酶(FpgFpg)”对“8-8-氧鸟嘌吟糖苷(氧鸟嘌吟糖苷(8-oxo-G8-oxo-G)”的选择性切断作用。12.12Ill
5、umina测序流程 Data Analysis 数据分析 Sequencing 测序 Cluster Generation 簇生成 Library Preparation 文库制备测序流程13.13Hiseq2500Two flow cell14.1410. Sequencing primer is hybridized to adapter sequence测序引物3端5端15.1511. Only one nucleotide is added every cycle as the 3 end is blocked16.1612. Cleave the fluor and free the
6、 3 end then repeat above steps for next cycle17.1713. Sequenced strand is stripped off and the index primer is added for to seq index3端5端Index primer18.1814. Repeat bridge amplification to form reverse strand after index sequencing15. Sequencing the reverse strands 19.19高通量测序的应用DNA水平RNA水平基因组denovo、重测序外显子捕获测序DNA甲基化测序Chip-Seq16s、宏基因组转录组测序数字表达谱DGESmall RNAlncRNA20.20高通量测序的应用R
温馨提示
- 1. 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
- 2. 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等,如果需要附件,请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
- 3. 本站RAR压缩包中若带图纸,网页内容里面会有图纸预览,若没有图纸预览就没有图纸。
- 4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
- 5. 人人文库网仅提供信息存储空间,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑,并不能对任何下载内容负责。
- 6. 下载文件中如有侵权或不适当内容,请与我们联系,我们立即纠正。
- 7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。
最新文档
- 吉林艺术学院《劳动教育II》2021-2022学年第一学期期末试卷
- 房产经纪人返佣协议书范本模板
- 主播外出安全协议书范文范本
- 2024年大商铺出租转让协议书模板范本
- 【初中数学】整式的加法与减法课件 2024-2025学年人教版数学七年级上册
- 2024年处理废石协议书模板范本
- 资金代管协议书范文样本
- 2025(新人教版)地理八年级下册全册复习知识清单 课件
- 吉林师范大学《数字剪辑创作》2021-2022学年第一学期期末试卷
- 吉林师范大学《量子力学》2021-2022学年第一学期期末试卷
- 2024-2030年中国虚拟专用网络(VPN)行业市场行业发展分析及发展前景研究报告
- 检验检测机构内审员检查表
- 2024中煤电力限公司面向中煤集团内部招聘15人高频难、易错点500题模拟试题附带答案详解
- 统编版(2024新版)七年级上册历史第二单元 夏商周时期:奴隶制王朝的更替和向封建社会的过渡 单元复习课件
- 第07讲 物态变化(原卷版)-2024全国初中物理竞赛试题编选
- 高危儿规范化健康管理专家共识解读
- 第13课《纪念白求恩》课件2024-2025学年统编版语文七年级上册
- 食品安全的规章制度和食品操作流程
- 《义务教育体育与健康课程标准(2022年版)》解读
- 部编版三年级上册语文第七单元大单元教学设计
- NB-T 10435-2020 电动汽车快速更换电池箱锁止机构通.用技术要求
评论
0/150
提交评论