生物化学 第二章 蛋白质化学

1、第二章 蛋白质化学第一节 氨基酸n氨基酸的通式20种氨基酸的结构两种C原子的标示方法（易混淆）氨基酸的构型蛋白质中的氨基酸都是L型不常见氨基酸4-羟脯氨酸羟脯氨酸5-羟赖氨酸羟赖氨酸 硒代半胱氨酸硒代半胱氨酸 （有时被认为是第（有时被认为是第21种氨基酸）种氨基酸）氨基酸的性质n氨基酸的两性性质氨基酸的滴定曲线（甘氨酸为例）等电点（概念） 氨基酸所带净电荷为零时氨基酸溶液的pH值称为该氨基酸的等电点（pI）。侧链基团带有可解离基团的氨基酸的等电点怎么计算？pK1=2.19 pKR=4.25 pK2=9.67必需氨基酸 人体（或其它脊椎动物）必不可少，而机体内又不能合成的，必须从食物中补充的氨基

2、酸，称必需氨基酸。 对成人来说，这类氨基酸有8种，包括赖氨酸、蛋氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、苏氨酸、缬氨酸、色氨酸和苯丙氨酸。对婴儿来说，组氨酸和精氨酸也是必需氨基酸。 请记住上述必需氨基酸 携（缬）一（异）两（亮）本（苯）单（蛋）色书（苏）来（赖）携一两本单色书来 笨蛋来宿舍晾凉鞋 茚三酮反应茚三酮反应 氨基酸与茚三酮水合物共热，可生成氨基酸与茚三酮水合物共热，可生成蓝紫色蓝紫色化合物，其最大吸收峰在化合物，其最大吸收峰在570nm处。处。由于此吸收峰值与氨基酸的含量存在正比由于此吸收峰值与氨基酸的含量存在正比关系，因此可作为氨基酸定量分析方法。关系，因此可作为氨基酸定量分析方法。氨基酸参与的化

3、学反应氨基酸与茚三酮反应氨基酸与茚三酮反应但脯但脯氨酸氨酸与茚与茚三酮三酮反应反应生成生成黄色黄色纸层析法氨基酸与氨基酸与2,42,4一二硝基氟苯一二硝基氟苯(DNFB)(DNFB)的反应的反应（sangersanger反应）反应）DNFB（dinitrofiuorobenzene）DNP-AA(DNP-AA(黄色黄色) )+ HF弱碱中弱碱中氨基酸氨基酸氨基酸与苯异硫氰酯（氨基酸与苯异硫氰酯（PITCPITC）的反应）的反应（EdmanEdman反应）反应）PITC（phenylisothiocyanate）+苯乙内酰硫脲衍生物苯乙内酰硫脲衍生物(PTH-AA) （phenylisothio

4、hydantion-AA）弱碱中弱碱中(400 C)(硝基甲烷硝基甲烷 400 C)H+第二节 肽n肽是氨基酸通过肽键连接在一起形成的化合物。通常把分子量小于10000的称为肽，而分子量更大的称为蛋白质。肽键肽键(peptide bond)氨基末端氨基末端羧基末端羧基末端Ser-Gly-Tyr-Ala-Leu氨基酸残基氨基酸残基几种生物活性肽几种生物活性肽 1. 谷胱甘肽谷胱甘肽(glutathione, GSH)GSH是体内重要的还原剂是体内重要的还原剂GSH过氧过氧化物酶化物酶H2O2 2GSH 2H2O GSSG GSH还原酶还原酶NADPH+H+ NADP+ 谷胱甘肽在体内参与氧化还原

5、过程，作为某些氧化还谷胱甘肽在体内参与氧化还原过程，作为某些氧化还原酶的辅因子，或保护巯基酶，或防止过氧化物积累。原酶的辅因子，或保护巯基酶，或防止过氧化物积累。 体内许多激素属寡肽或多肽体内许多激素属寡肽或多肽2. 多肽类激素及神经肽多肽类激素及神经肽 由下丘脑分泌，其功能是促进腺垂体释放促甲状腺由下丘脑分泌，其功能是促进腺垂体释放促甲状腺素素(调节糖代谢调节糖代谢)。 当我们搬进一个新寝室时，我们会如何当我们搬进一个新寝室时，我们会如何向我们的外校的同学对其进行描述？向我们的外校的同学对其进行描述？当你看到这张图片时，你怎么向别人描述？第三节 蛋白质的结构蛋白质的分子结构包括蛋白质的分子结

6、构包括 一级结构一级结构(primary structure)二级结构二级结构(secondary structure)三级结构三级结构(tertiary structure)四级结构四级结构(quaternary structure)蛋蛋白白质质结结构构的的主主要要层层次次一级结构一级结构四级结构四级结构二级结构二级结构三级结构三级结构primary structureprimary structuresecondary structuresecondary structureTertiary structureTertiary structurequariernary structureq

7、uariernary structure超二级结构超二级结构结构域结构域 supersecondary structure supersecondary structureStructure domanStructure doman一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础。功能的基础。蛋白质一级结构蛋白质一级结构蛋白质一级结构测定流程：u确定多肽链的数目u拆开并分离出每条肽链u水解测定肽链的氨基酸组成u测定肽链两末端氨基酸残基u肽链水解为小片段并测序u片段重叠得出整个肽链的序列u确定二硫键的位置肽链末端分析 N-末端测定（1）DNFB法（2）PTH法DNP-氨基酸氨基酸 C-末端测定（1）肼解法缺点：缺点：Asn，Gln，Cys被破坏，被破坏，Arg转变为鸟氨酸。转变为鸟氨酸。（2）羧肽酶法 羧肽酶能特异水解C末端氨基酸残基，其中羧肽酶A能释放除Pro，Arg，Lys以外所有的氨基酸残基，羧肽酶B只能水解以Arg和Lys为C末端残基的肽链。 二硫键的断裂 肽链的断裂 （1） 酶裂解法（2）化学裂解法 溴化氰(CNBr)只断裂Met羧基参与形成的肽键。由于