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文档简介
1、实验一实验一 组织细胞中基因组组织细胞中基因组DNA的提取的提取 实验二实验二 琼脂糖凝胶电泳分离琼脂糖凝胶电泳分离DNA片段片段 (水平潜水式)(水平潜水式) 实验一实验一 原理原理 样品研磨或者匀浆后加入细胞核裂解液,样品研磨或者匀浆后加入细胞核裂解液, 1、首先在强去污剂或者和蛋白酶、首先在强去污剂或者和蛋白酶K协同下裂解细协同下裂解细 胞释放出基因组胞释放出基因组DNA; 2、接着加入、接着加入RNase A去除去除RNA; 3、然后蛋白沉淀液选择性沉淀去除蛋白;、然后蛋白沉淀液选择性沉淀去除蛋白; 4、最后纯净的、最后纯净的DNA通过异丙醇沉淀并重溶解于通过异丙醇沉淀并重溶解于 DN
2、A溶解液。溶解液。 操作步骤操作步骤 1、600l冰预冷的冰预冷的细胞核裂解液细胞核裂解液加入加入10-20mg新鲜组织用小匀新鲜组织用小匀 浆器匀浆浆器匀浆10s,将裂解物转入,将裂解物转入1.5ml EP管管 ; (4ml) 2、将裂解物放置在、将裂解物放置在65水浴水浴10min; 3、冷却,加入、冷却,加入Rnase A(10mg/ml) 1.8l至裂解物中裂解物中至裂解物中裂解物中 至终浓度至终浓度30g/ml,颠倒混匀,颠倒混匀,37温育温育10min去除残留去除残留 RNA;室温冷却室温冷却; 4、裂解物中加入、裂解物中加入200l 蛋白沉淀液蛋白沉淀液,涡旋振荡器上高速连续,涡
3、旋振荡器上高速连续 振荡混匀振荡混匀25s,然后,然后冰浴冰浴3min; 5、13,000rpm离心离心5min; 6、小心缓慢吸取、小心缓慢吸取600ul上清到一个新的上清到一个新的1.5ml EP管中,管中,勿吸动沉勿吸动沉 淀淀; 7、加入等体积的室温异丙醇(约、加入等体积的室温异丙醇(约600 l ),颠倒),颠倒30次混匀或直次混匀或直 到出现棉絮状(丝状)白色到出现棉絮状(丝状)白色DNA沉淀,沉淀,12,000rpm离心离心1min; 8、弃上清液,加入、弃上清液,加入1ml 70%乙醇后,颠倒漂洗乙醇后,颠倒漂洗DNA沉淀,沉淀, 12,000rpm离心离心1min,弃上清液,
4、倒置在吸水纸上轻敲几下,弃上清液,倒置在吸水纸上轻敲几下, 空气晾干沉淀几分钟空气晾干沉淀几分钟; 9、加入、加入100l 溶解液,溶解液,EP管做好标记,冰箱管做好标记,冰箱-20保存至下周保存至下周。 1、DNA溶液放置在溶液放置在65温育温育20min,中间不时轻弹管壁帮,中间不时轻弹管壁帮 助重新水化助重新水化DNA; 操作步骤操作步骤 二(接上周实验)二(接上周实验) 实验二实验二 琼脂糖凝胶电泳分离琼脂糖凝胶电泳分离DNA片段(水片段(水 平潜水式)平潜水式) 原理原理 :分子筛效应:分子筛效应 溴乙锭溴乙锭(ethidium bromide, EB),其分,其分 子可插入子可插入
5、DNA的碱基之间,形成一种络合的碱基之间,形成一种络合 物,在物,在254365nm波长紫外光照射下,呈波长紫外光照射下,呈 桔红色荧光,籍此可分析实验结果。桔红色荧光,籍此可分析实验结果。 1. 凝胶槽准备:凝胶槽准备:将电泳槽内的有机玻璃内槽(制胶槽)洗干净、晾将电泳槽内的有机玻璃内槽(制胶槽)洗干净、晾 干,放入制胶玻璃板。取透明胶带将玻璃板与内槽两端边缘封好,干,放入制胶玻璃板。取透明胶带将玻璃板与内槽两端边缘封好, 形成模子。将内槽置于水平位置,并在固定位置放好梳子。形成模子。将内槽置于水平位置,并在固定位置放好梳子。 2. 制备琼脂糖凝胶:制备琼脂糖凝胶:按照被分离的按照被分离的D
6、NA分子的大小选择合适浓度的分子的大小选择合适浓度的 琼脂糖凝胶琼脂糖凝胶。称取一定量的琼脂糖,置于锥形瓶中,加入电泳缓冲。称取一定量的琼脂糖,置于锥形瓶中,加入电泳缓冲 液液1TAE,置微波炉或水浴锅中加热至琼脂糖全部融化。,置微波炉或水浴锅中加热至琼脂糖全部融化。 3.灌胶:灌胶:待凝胶冷却至待凝胶冷却至60左右加入左右加入溴化乙啶溴化乙啶 (终浓度终浓度0.5g/mL), 混匀后小心地倒入内槽玻璃板上,使胶液缓慢展开,直到整个玻璃混匀后小心地倒入内槽玻璃板上,使胶液缓慢展开,直到整个玻璃 板表面形成均匀胶层(应注意胶面平整,无气泡),室温下冷却凝板表面形成均匀胶层(应注意胶面平整,无气泡
7、),室温下冷却凝 固。待完全凝固后,垂直轻拔梳子,取下胶带,将凝胶及内槽放入固。待完全凝固后,垂直轻拔梳子,取下胶带,将凝胶及内槽放入 电泳槽中。添加电泳槽中。添加1TAE电泳缓冲液电泳缓冲液使之高出胶面使之高出胶面13mm。 4. 加样:加样:在点样板上混合在点样板上混合DNA样品和上样缓冲液样品和上样缓冲液(上样缓冲液的最(上样缓冲液的最 终稀释倍数应不小于终稀释倍数应不小于1),然后加入胶板的样品小槽内。在样品),然后加入胶板的样品小槽内。在样品 一侧的样品小槽中加入分子质量标准(一侧的样品小槽中加入分子质量标准(DNA Ladder)。注意加样前)。注意加样前 要先记下加样的顺序,每加完一个样品,应更换一个加样头,以防要先记下加样的顺序,每加完一个样品,应更换一个加样头,以防 污染,加样时勿碰坏样品孔周围的凝胶面。污染,加样时勿碰坏样品孔周围的凝胶面。 5. 电泳:电泳:加样后的凝胶板立即通电进行电泳,电压加样后的凝胶板立即通电进行电泳,电压100V,样品由负,样品由负 极(黑色)向正极(红色)方向移动。当溴酚蓝移动到距离胶板下极(黑色)向正极(红色)方向移动。当溴酚蓝移动到距离胶板下 沿约沿约1cm处时,停止电泳。处
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