非编码RNA研究专题02circRNA的调控与应用

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知识金牌知识金牌Contents课程目录第一部分第二部分第三部分circRNA的研究背景circRNA的类型及功能研究

circRNA的高分文章解读解螺旋|陪伴

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circRNA的研究背景01知识金牌第一部分：circRNA的研究背景解螺旋|陪伴

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什么是环状RNA？Circular

RNA

(or

circRNA)

is

a

type

of

RNA

which,

unlike

the

better

knownlinear

RNA,

forms

a

covalently

closed

continuous

loop,

i.e.,

in

circular

RNA

the

3'

and

5'

ends

normally

present

in

an

RNA

molecule

have

beenjoined

together.知识金牌第一部分：circRNA的研究背景circRNA的特点：闭合环状结构：无5‘cap和3’polyA；特异性的back

splicingsite（circRNA

junction）；半衰期长，能够稳定存在于细胞中；稳定：不受外切酶影响；不翻译蛋白；组织特异性、时序特异性、疾病特异性；调控作用：ceRNA、hostgene；目前发现10%以上的基因可以产生circRNA，85%来源于外显子，含1-5个外显子。解螺旋|陪伴

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02circRNA的类型及功能研究知识金牌第二部分：circRNA的类型及功能研究一、circRNA的类型解螺旋|陪伴

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知识金牌第二部分：circRNA的类型及功能研究二、circRNA的功能研究Exonic

circRNA功能研究解螺旋|陪伴

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知识金牌二、circRNA的功能研究circular

intronicRNA（ciRNA）功能研究第二部分：circRNA的类型及功能研究解螺旋|陪伴

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知识金牌二、circRNA的功能研究exon-intron

circRNA（EIciRNA）功能研究第二部分：circRNA的类型及功能研究解螺旋|陪伴

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03circRNA的高分文章解读知识金牌第三部分：circRNA的高分文章解读一、circRNA晋升为新一代临床biomarkercircRNA的特征：成环易出膜：容易进入体液不易被RNA外切酶降解组织特异性、疾病特异性时序特异性circRNA数目相对较少理想biomarker的特征：无损伤验证：取材容易稳定性高：准确检测特异性好：组织特异性、疾病特异性灵敏度高：能够准确地指示疾病状态指标数少：减少检测复杂性，经济、快速最新的RNA研究热点易于快速发文章解螺旋|陪伴

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知识金牌第三部分：circRNA的高分文章解读qRT-PCR

analysis

of

circ-KLDHC10

levels

in

normal

serum

and

CRC

serum

(n

=

11,

respectively)解螺旋|陪伴

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Production

of

ANRIL

in

human

is

correlated

with

therisk

of

atherosclerosis(动脉粥样硬化)肿瘤代谢病知识金牌第三部分：circRNA的高分文章解读Detection

of

circRNA

for

miRNA-7

(ciRS-7)

in

sporadic

Alzheimer'sdisease

(AD)

and

age-matched

control

hippocampal

CA1神经系统解螺旋|陪伴

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知识金牌第三部分：circRNA的高分文章解读Differentially

expressed

circRNAs

between

HCC

tissues

and

adjacent

nontumorous

tissuesThe

expression

levels

of

candidate

circRNAs

for

validationin

HCC

tissue

and

adjacent

liver

tissue

samplesHsa_circ_0005075

could

serve

as

a

biomarker

for

HCC解螺旋|陪伴

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知识金牌第三部分：circRNA的高分文章解读The

predicted

hsa_circ_0005075targeted

circRNA-miRNA-mRNA/genenetwork

based

on

sequence-pairingprediction.解螺旋|陪伴

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知识金牌第三部分：circRNA的高分文章解读肝癌组织VS癌旁组织（N=3）Arraystar

Huamn

circRNA

Array检测到61个差异表达的circRNA，其中26个上调，35个下调QPCR（N=60）肝癌组织中hsa_circ_0005075显著上调临床数据证明hsa_circ_0005075可作为肝癌诊断潜在的生物标志物通过生信分析构建出circRNA-miRNA-mRNA的互作网络；GO分析揭示了hsa_circ_0005075参与肝癌发展过程中的细胞粘附作用解螺旋|陪伴

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知识金牌第三部分：circRNA的高分文章解读二、circRNA的功能研究前期研究：circ-Foxo3抑制肿瘤细胞生长，继而探究相关功能研究circ-Foxo3表达水平与G1期阻滞呈正相关功能研究：circ-Foxo3异常表达（RNAi和过表达）导致细胞周期改变、抑制细胞增殖机制研究：RIP和RNApull-down证明circ-Foxo3通过结合CDK2与p21，导致cyclin

A和cyclinE从CDK2上脱离，进而改变细胞周期，抑制细胞

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知识金牌第三部分：circRNA的高分文章解读糖尿病小鼠和野生型小鼠心肌组织（N=4）Arraystar

Huamn

circRNA

Array检测到76个差异表达的circRNA，其中45个上调，31个下调QPCR糖尿病心肌组织中circRNA_000203与其宿主基因Myo9a的表达量显著上升功能研究：过表达circRNA_000203促进纤维化基因Col1a2、Col3a1和α-SM