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文档简介
5基因克隆的酶学基础(1)核酸内切限制酶(restrictionendonucleases)1)寄主控制的限制(restriction)与修饰现象(modification)2)核酸内切限制酶的类型(I型、II型、III型)
3)核酸内切限制酶的基本特性同裂酶(isoschizomers)
同尾酶(isocaudamer)4)核酸内切限制酶的命名法大肠杆菌(Escherichiacoli)缩写为Eco
流感噬血菌(Haemophilusinfluenzae)缩写为Hin5)影响核酸内切限制酶活性的因素
a.DNA的纯度,b.DNA的甲基化程度,c.反应温度,
d.DNA的分子结构,e.核酸内切限制酶的缓冲液6)核酸内切限制酶对DNA的消化作用
a.结合模式,b.局部消化,c.消化作用
核酸内切限制酶EcoRI及修饰的甲基化酶MEcoRI的限制与修饰作用核酸内切限制酶HindIII对双链DNA分子的切割作用具有粘性末端的DNA片段结合方式碱性磷酸酶的脱磷酸作用阻止线性的质粒DNA分子再环化(2)DNA连接酶(Ligase)1)粘性末端DNA片段的连接2)平末端DNA片段的连接
a.同聚物加尾法(homopolymertail-joining)b.衔接物连接法(linker)c.DNA接头连接法(adapter)3)热稳定的DNA连接酶(thermostableDNAligase)a.寡核苷酸连接测定法(oligonucleotideligationassay)b.连接酶链式反应(ligasechainreaction,LCR)或连接扩增反应(ligationamplificationreaction)a)裂口连接酶链式反应
LCR探针(LCRprobe)b)不对称裂口连接酶链式反应(AG—LCR)
应用互补的同聚物加尾法连接DNA片段用衔接物分子连接平末端的DNA片段双衔接物连接法的基本程序具异常的5’-OH粘性末端结构的BamHI接头的连接机理寡核苷酸连接测定原理DNA连接酶链式反应(LCR)原理不对称裂口DNA连接酶链式反应(AG-LCR)的分子机里(3)DNA聚合酶(DNApolymerase)
1)DNA聚合酶Ia.DNA缺口转移(nicktranslation)b.DNA杂交探针的制备2)大肠杆菌DNA聚合酶I的Klenow片段与DNA末端标记3)T4DNA聚合酶取代合成法标记DNA片段4)依赖RNA的DNA聚合酶与互补DNA的合成5)T7DNA聚合酶6)修饰的T7DNA聚合酶DNA聚合酶I催化合成DNA合成链按5’—3’方向延长线性和环形DNA分子的取代缺口转移用T4DNA聚合酶的取代合成法标记DNA片段末端制备探针(4)DNA和RNA的修饰酶1)末端脱氧核苷酸转移酶与同聚物加尾(terminaldeoxynucleotidyltransferase)2)T4多核苷酸激酶(polynucleotidekinase)与DNA分子5’末端的标记3)碱性磷酸酶与DNA脱磷酸作用细菌碱性磷酸酶(bacterialalkalinephosphatase)
小牛肠碱性磷酸酶(calfintestinalalkalinephosphatase)(5)核酸外切酶(exonucleases)1)核酸外切酶VII(exoVII)2)核酸外切酶III(exoIII)3)入核酸外切酶(入exo)和T7基因6核酸外切酶
碱性磷酸酶的活性(6)单链核酸内切酶(singleendonucleases)1)SI核酸酶与RNA分子定位
2)Bal31核酸酶与限制位点的确定
SI核酸酶的活性
同摸板DNA有共同线性关系的RNA分子的定位
Bal31核酸酶的活性
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