蛋白质组信息学智慧树知到期末考试答案章节答案2024年中南大学

蛋白质组信息学智慧树知到期末考试答案+章节答案2024年中南大学Ensembl是非冗余的已测序的脊椎动物的基因组信息。（）

答案:错SILAC即细胞培养条件下稳定同位素标记技术。（）

答案:对MaxQuant能在苹果系统上运行。（）

答案:错Mascot被认为是蛋白质质谱鉴定行业标准。（）

答案:对固定修饰是指某一种氨基酸残基可能会被某种基因修饰。（）

答案:错六框翻译数据库是识别6个氨基酸信息作为翻译数据库。（）

答案:错ProteoSuite是可视化mzQuantML文件的工具。（）

答案:对修饰肽段鉴定可以使用denova方法计算。（）

答案:错2020年4月，Luck等在自然《Nature》杂志上发表了《人类二元蛋白质相互作用的参考图谱》是迄今为止规模最大的人类蛋白互作组数据库。（）

答案:对缺失值过多蛋白通常不具有分析价值。（）

答案:对蛋白组数据可以推导出基因序列。（）

答案:错修饰肽段可以不经过富集直接检测。（）

答案:对TraML是一种基于xml的编码转换表，用于靶向蛋白质组学方法，如选择反应监测（SRM）。（）

答案:对UniProt中的数据都是经过审核验证，并保证格式一致性。（）

答案:错UniProt为科学界提供全面、高质量和免费获取的蛋白质序列和功能信息资源。（）

答案:对有关mzML描述正确的是（）

答案:mzML是一种基于XML的质谱数据格式;吸取了mzData和mzXML两种格式的优点;mzML框架具有较好的灵活性与稳定性;存储从质谱仪输出的质谱数据及其元数据ProteomeXchangeConsortium成员中，来自美国的有（）

答案:MassIVE;PeptideAtlas;Panorama以下哪些属于蛋白基因组学工具（）。

答案:MutationDB;customProDB;Pypgatk如何计算聚类分析里的“相似”程度（）。

答案:距离度量;相似度度量进行蛋白质的功能富集分析常用的工具有和（）。

答案:Metascape;DAVID将蛋白质酶切成肽段，（）。

答案:减少了蛋白质的复杂性;低丰度蛋白质的鉴定概率;提高了蛋白质的采样率;翻译后修饰的鉴定概率研究蛋白质的相互作用方法主要有（）。

答案:信息分析学方法;分子生物学方法;遗传学方法;生物物理化学方法利用蛋白质组信息学对细胞和组织进行哪维度的蛋白质组分析（）

答案:总蛋白丰度、活性和磷酸化计量化学;蛋白质理化特性;组织分布、翻译后修饰、细胞周期、周转、丰度、同源异构体、定位和相互作用等;细胞周期、定位和周转率肽质量指纹图谱存在的主要问题有（）。

答案:蛋白数据库中，肽段的数量是很庞大，很多肽段的质量非常接近;长链蛋白里的多肽数目较多，被随机匹配的概率加大;不适合分析复杂样品一个mzTab文件最多包括几个部分。（）

答案:元数据;肽;肽谱匹配（PSM）;小分子;蛋白质PNGaseF（）。

答案:是一个酶;是糖基化修饰肽段鉴定中需要用到的一个试剂构建特定样本的蛋白质序列数据库的流程包括（）

答案:采用下一代全基因组和转录组测序;取得某一组织样本;识别和量化肽和蛋白质;基因突变分析、选择剪接、基因融合和从头表达MassIVE提供的功能有（）

答案:获取公共数据集;结果比较;搜索识别（初始和重新分析）;重新分析质谱;共享重新分析蛋白质组学(Proteomics)是（）

答案:揭示蛋白质功能与细胞生命活动规律;当前生物学研究的热点和发展最快的学科领域;分析细胞内动态变化的蛋白质组成成分、表达水平与修饰状态;了解蛋白质之间的相互作用与联系质谱由三部分组成（）。

答案:离子源;检测器;质量分析器mzIdentML不包括以下信息（）

答案:原始质谱数据RefSeq的显著特征（）

答案:非冗余一级质谱所测量的碎裂前的离子称为（）。

答案:母离子蛋白组学的质谱数据通常（）。

答案:由色谱图和质谱图组成目前多肽谱匹配鉴定的统计学评估算法有基于概率模型的方法和（）。

答案:PSM可信度评估方法当前蛋白质组分析的主流技术是（）

答案:串联质谱技术质谱图的横轴就是质荷比，纵轴是离子强度。（）。

答案:质荷比，离子强度使用参考基因组注释数据库进行蛋白组分析（）。

答案:可以对蛋白质进行定量下列哪一个数据仓储不是ProteomeXchangeConsortium成员。（）

答案:GPMDBBottom-up又被称为（）。

答案:鸟枪法蛋白质组学磷酸化的修饰位点不包括（）。

答案:精氨酸STRING数据库中设置更改互作网络的标签为（）。

答案:Settings以下哪种不是分类方法（）。

答案:主成分分析下列哪一个软件工具未采用mzIdentML格式（）

答案:PASSELBottom-up方法基本思路是：先用蛋白酶把蛋白序列进行酶切，再（）。

答案:针对酶切后的肽段进行鉴定突变蛋白研究的数据库的构建需要（）。

答案:基因组上蛋白编码区上的错义突变信息二级质谱检测是（）。

答案:肽段的碎片下列哪一个数据仓储不是以物种为中心的联盟（）

答案:EnsemblR语言可以进行质谱定量数据分析，但是不能鉴定谱图特征。（）

答案:错R语言是（）。

答案:可以在苹果系统上使用;一个免费的软件R语言有Bioconductor和CRAN2个官方在线仓库。（）

答案:对R语言（）。

答案:可以直接读取文件PSM是质谱图与理论肽段谱图匹配程度高，通过了统计学校正的图谱数据表。（）

答案:对蛋白基因组目前的主要研究方向（）。

答案:基因注释;宏蛋白质组;突变蛋白检测以下哪个选项不属于目前蛋白质组学实验步骤（）。

答案:肽段富集蛋白基因组和蛋白质组最大的区别是提取蛋白质的方法不一样。（）

答案:错肽段鉴定离不开好的谱图质量。（）

答案:对蛋白基因组学是（）。

答案:探讨基因组和蛋白质之间联系目前翻译后修饰相关数据库多集中在泛素化和糖基化。（）

答案:错蛋白质修饰类型包括（）。

答案:糖基化;磷酸化;甲基化;泛素化翻译后修饰检索的参数设置不包括（）。

答案:设置碎裂电压蛋白质翻译后修饰的预测工具通常是根据临近序列特征进行预测。（）

答案:对翻译后修饰肽段的鉴定步骤（）。

答案:定量肽段表达值;识别具有修饰的肽段;确定化学修饰位置分层聚类是把原本多个变量化为少数几个综合指标的一种统计分析方法。（）

答案:错聚类算法对基因表达数据的分析主要是分为以下几个层次（）。

答案:分析单个基因的表达水平;将基因分组，研究基因的共同功能、相互作用及调控等;推断潜在的基因调控网络从整体上来看GO注释系统是一个有向无环图。（）

答案:对内质网和核糖体属于哪一类GO术语（）。

答案:细胞组分质心法定义（）。

答案:两个类的质心间的距离作为两类间距离石油醚自上而下运动的一相，一般是气体或液体，称为（）。

答案:流动相质谱仪是用来测定气态离子质荷比（m/z）的仪器。（）

答案:对可以使用低温条件下操作来减少蛋白质降解。（）

答案:对串联质谱鉴定蛋白质的方法主要包括和（）。

答案:基于蛋白质数据库搜索;从头测序对蛋白质进行变性的作用是打开蛋白质的高级结构，同时（）。

答案:增加蛋白质的溶解度基于XML的质谱相关的数据格式是（）

答案:mzML;mzQuantML;mzIdentMLmzML格式吸取了哪些格式的优点（）

答案:mzData;mzXMLHUPO-PSI制定的蛋白质组信息学标准属于ISO标准。（）

答案:错质谱数据标准的制定组织主要有（）

答案:EBI;PSI;ISBHUPO-PSI制定的质谱相关的受控词表主要有（）

答案:PSI-MSProteomeXchangeConsortium成员有（）

答案:JPOST;PRIDE;Panorama;MassIVE;iProx;PeptideAtlasUniProt包括（）

答案:UniProt参考集（UniRef）;UniProt知识库（UniProtKB）;UniProt存档库（UniParc）;物种蛋白质组(SpeciesProteomes)下列哪一个数据库不是以物种为中心的联盟（）

答案:EnsemblRefSeq是非冗余的参考序列数据库（）

答案:对Ensembl的显著特征是（）

答案:基于证据的物种基因集蛋白质组信息学应用于（）

答案:发育研究;肽、蛋白质和蛋白质复合物研究;亚细胞和细胞上研究;细胞外和细胞内研究属于无凝胶的蛋白质组学技术的是（）

答案:LC-MS;Proteinchip蛋白质组学源于基因组学，但是超越了基因组学，这是因为：（）

答案:由于选择性剪接等原因，