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文档简介
细菌的分类与命名
动植物林奈分类体系细菌细胞不同于动植物细胞前
言第一节细菌分类地位
一、分类地位
细菌过去归属植物界,自1974年以来,划为原核生物。细菌作为另一个系统进行类别的原核生物,包括对动物和人具有致病作用的衣原体、立克次体、霉形体、螺旋体、放线菌等,此外还涉及蓝细菌、紫色光合细菌等。第一节细菌分类地位
二、分类单元
属种菌株具有共性的若干种的组合,应与其他属有明显的差异。不同属之间的16SrRnA序列有较大的差异,但尚未提出差异的量化标准。是微生物学分类的最基本单元,种可认为是一群性质相似的菌株,它与其他菌株群体有明显差异。凡是16SrRNA序列同源性大于97%的两株细菌即可确定为同一种。是不同来源的某一种细菌的纯培养物。同一种细菌可以有许多菌株,其主要性状应完全相同,其次要性状可稍有差异。第二节细菌的命名
一、俗名法
二、学名法
约定俗成的名字细菌的命名依据“国际细菌命名法规”的规定,学名用拉丁文,遵循“双名法”。所谓“双名法”就是每一种细菌的拉丁文名称由属名和种名两部分构成,属名第一个字母必须大写,其余均应小写,即使科名是以人名或地名命名的,种名头一个字母也用小写。整个属名及种名在出版物中应排成斜体。第三节细菌分类鉴定的标准
一、表型特征鉴定
二、种系发生关系鉴定
测定DNA中G+Cmol%核酸杂交法
16sRNA寡聚核苷酸序列
长期以来,细菌分类鉴定的主要依据是其表型特征,即形态、染色、培养、细胞壁结构、生理生化及抗原性的特征。第四节细菌分类的方法
一、条目分类法
长期以来,细菌分类采用传统的双歧检索条目分类法。此法首选要在细菌的各种性状中,选择一项或数项被认为是最主要的基本性质,作为分类指征,在最高一级的分类等阶上将细菌分成若干类别;然后在这些类别中选择数项次要性状为指征,将细菌作次一等阶分类,依此类推,一直划分到种。第四节细菌分类的方法
二、数值分类法
原理是根据数值分析,借助电子计算机,将拟分类的细菌按其性状相似程度归类定位。第五节细菌的分类体系
一、伯吉氏系统学手册二、原核生物
三、国际系统与进化微生物学杂志
四、国际著名的菌种保藏机构
第六节细菌的鉴定
一、分类培养
一般只有纯培养的细菌才能进行鉴定。第六节细菌的鉴定
二、鉴定方法
除按表型特征、DNA同源性或rRNA序列比较等方法鉴定细菌外,还有用其他方法,如测定细菌的脂肪酸组成,用气相-液相-质谱分析细菌的脂肪酸谱,每一种细菌的脂肪酸谱是恒定的,可重复性好,因此此法可用于细菌的鉴定或分类,往往结合常规方法参照应用。在有条件的单位可用PCR技术检测鉴定细菌。第六节细菌的鉴定
三、鉴定程序
革兰氏阳性细菌球菌杆菌丝状及树枝状产生芽孢革兰氏阳性大杆菌无芽孢抗酸染色阳性抗酸染色阴性革兰氏阴性细菌球菌/球杆菌杆菌MZN染色阳性MZN染色阴性弧状杆菌丝状菌中等大小杆菌螺旋状菌本次课小节4.《伯吉氏细菌学手册》和《伯吉氏细菌鉴定手册》建立了细菌分类的公认体系。建立了一套动物致病菌检测程序,商品化的快速鉴定系统已应用于常规细菌学鉴定。
1.细菌的分类基本单元是种,属和菌株也是动物微生物学中常用的单元,细菌种命名遵循双名法。2.细菌分类标准长期以来以细菌的表型特征为依据的。3.近年来人们采用核酸分类方法逐渐得到认识,特别是根据16SRNA基因序列进行分类显示出极大的优越性。讨论、思考题、作业1.细菌分类基本单元是什么,其概念如何。细菌属和菌株的概念。
2.利用细菌株的概念分析“三株口服液”的科学性
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