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文档简介
第六章基因的概念和结构复等位基因(multiplealleles)顺反子(cistron)超基因(supergene)假基因(pseudogene)可动基因(mobilegene)染色体外基因第一节基因的概念与发展一、发展历程1.1865年
Mendel——遗传因子2.1909年丹麦Johanssen——基因3.1910年—40年代
Morgan等认为基因是三合一体,即基因既是一个功能单位,也是一个突变单位和一个交换单位。4.1944年Avery首次证实基因是由DNA构成,及1953年DNA双螺旋模型的提出,人们认为基因是具有一定遗传效应的DNA片段。5.1955年,Benzer通过顺反互补实验发现一个基因内部的许多位点上可以发生突变,并且可能在这些位点间发生交换,说明一个基因并不是一个突变单位和一个交换单位。6.操纵子的发现修正了有一个基因就有一条多肽或决定一个蛋白质功能的就是基因的说法。
1944年Beadle研究脉胞菌突变——提出一基因一酶学说;后来研究血红蛋白时发现蛋白质可由不同肽链组成,而突变只影响一条肽链——提出了一基因一多肽学说;
60年代,Jacod和Monod研究细菌基因调控时发现基因是可分的,功能上是有差别的。结构基因—决定合成某种蛋白质调节基因—编码阻遏或激活结构基因转录的蛋白质基因无翻译产物的基因7.新的发现——断裂基因,重叠基因,跳跃基因比较DNA序列和成熟mRNA——内含子和外显子①基因是实体,它的物质基础是DNA(或RNA);②基因是具有一定遗传效应的DNA分子中的特定核苷酸序列;③基因是遗传信息传递和性状分化发育的依据④基因是可分的按原初功能(基因的产物)基因可分为编码蛋白质的基因(结构基因+调节基因)无翻译产物的基因(如rDNA,tDNA,SnDNA)不转录的DNA区段(如启动子,操纵基因等)二、基因概念的发展初期的基因概念:
最初由孟德尔的杂交试验提出“遗传因子”(1900年W.Johanson丹麦)首先使用,后来,称为基因,此时为一逻辑推理产物,是一种与生物状状相应的符号,无实质内容。基因与染色体的关系
摩尔根(Morgan)通过对果绳各种突变体的研究,阐明了连锁交换规律和伴性遗传,并进一步推理出基因在染色体上呈直线排列,因此基因是一种化学实体,并决定性状。通过对各种遗传性状的研究。认为基因是决定遗传性状的功能单位是实变和重组的最小单位。
1944年,O.T.Avery等通过肺炎球菌的转化实验,证实了基因的本质为DNA,为DNA上的功能单位。1953年,J.D.Watson,F.H.Crick根据对DNA化学的研究,提出DNA结构的右手双螺旋模型。基因的本质——DNA顺反子概念的提出1955年,S.Benzer通过对T4噬菌体精细结构的研究提出了顺反子(Cistron),突变子(muton)和重组子(recon)的概念。顺反子:为一种多肽链编码的核苷酸序列,是一个功能单位。经进一步研究证明,突变子和重组子均为一核苷酸对。顺反子学说否定了一个基因一个酶的假说,因而也否定了基因是决定遗传性状的功能单位,突变和重组的最小单位等概念,从基因的产物来看,基因概念经历了从性状——酶——多肽链的发展过程。基因的分子生物学定义基因是编码有功能的蛋白质多肽链或RNA所必需的全部核苷序列。包含:编码蛋白质肽链或RNA的核酸序列,转录所必须的调控序列,编码区上游区域的非编码序列,内含子,编码区下游区域的非编码序列。基因的不连续性
在1977年以前,都认为基因是一种为蛋白质或多肽编码的连续的核苷酸序列,因为当时对基因各种精细结构的研究都是从原核生物开始的,而在原核基因中很少有基因是间断的。后来在对真核生物基因进行研究时经常发现,真核基因比其相应的mRNA长得多,开始也未认为真核基因是间断的,因为真核基因在表达方面存在明显的时空特异性,因此认为基因的一端或两端存在一些不转录的序列,但对基因表达的调节具有重要作用的序列。但从核RNA(hnRNA)和mRNA的大小进行比较发现,核RNA比相应的mRNA长,而与真核基因的大小相似,因此有一部分序列在初始转录中存在,而在mRNA从核转运到胞质之前被除去了,也即是说真核基因中存在着一些可能被转录但不为蛋白质或多肽编码的序列——真核基因是间断。随着对真核基因的深入研究,现已发现,绝大多数真核基因都是间断的,包括外显子(exon)和内含子(intron)两个大的部分。基因结构基因的不同类型结构基因:为蛋白质或RNA编码的基因,其产物为酶促反应的有关的功细胞组分,它不影响其它基因的表达。调节基因:为RNA或蛋白质编码的基因,但其产物的主要作用是调节其它基因的表达。操纵基因:无编码产物的一段DNA序列为DNA阻碍蛋白或其它调节因子的结合位点,当该位点被相应的蛋白质结合后影响从邻近基因启动子的转录起始。(也要曾使用启动基因,但与操纵基因相似不编码相应产物,现在称为启动子)。功能性基因(functionalgene):基因家族中,仍然为蛋白质或RNA编码的家族成员称。假基因(Pseudogene):基因家族中已不为蛋白质或RNA编码的家族成员。第二节复等位基因(multiplealleles)复等位基因:一个群体中,一对同源染色体的同一基因座上存在着2个以上的等位基因,这就是复等位基因(multiplegene)。复等位基因是生物遗传多态性在遗传上的直接原因。几个概念野生型:自然界中常见的基因型和表型非等位基因之间的相互作用互补基因、抑制基因、上位效应(书37页)一个2倍体的正常细胞最多只能有复等位基因中的2个。
2个等位基因,可以组成3种基因型
3个等位基因,可以组成6种基因型
4个等位基因,可以组成10种基因型
n个等位基因,可以组成n+n(n-1)/2种基因型。其中纯合体为n个,杂合体为n(n-1)/2个。血液成分抗凝离心处理:上层成分:血浆,抗体,蛋白质中层成分:白细胞,血小板下层成分:红细胞不抗凝处理上层成分:血清,抗体,无纤维蛋白原下层成分:红细胞,白细胞,血小板
血型遗传学1667年法国Denys首次把羊血输给病人。1818年英国Blundell首次人之间输。1900年奥地利Landsteiner发现了ABO血型系统1926年奥地利Landsteiner发现了MN血型系统1927年奥地利Landsteiner发现了P血型1939年奥地利Landsteiner发现了Rh血型ABO血型系统的抗原与抗体
A抗原A抗体B抗原B抗体A血型+--+B血型-++-AB血型+-+-O血型-+-+ABO血型系统遗传方式IA;IB;i;这些基因编码特定的红细胞抗原
A血型:IAIA;IAiB血型:IBIB;IBiAB血型:IAIBO血型:iiABO血型系统遗传方式
一对分别都是AB血型的夫妻,所生的子女
A型AB型B型
¼½¼某一人群B血型占0.45,O血型占0.36,计算该群体中A和AB血型的比例。估测人群中血型比例设IA基因的频率为P,IB基因的频率为Q,I的基因频率为r,A型人的比率为A,O型人的比率为O。O=r2r=√A+OA+O=p2+2pr+r2=(p+r)2=(1-q)21-q=√A+OQ=1-√A+OP=1-q-rABO血型的遗传特例
ABOA
OAB(?)孟买血型
1952年在印度孟买市发现,在我国极其稀有,有这种血型的人在全国所占的比率仅为十几万分之一,国内仅有约30例报道。正因为“类孟买血型”非常珍稀,其价值和意义也就尤显重大。
其红细胞上没有或有少量A、B抗原而无H抗原,血清中除有抗A、抗B抗体外,尚有抗H抗体,唾液中有A、B、H物质。这种血型的人需要输血时有3个途径:自身储血、亲属间同型互助、他人捐献。
ABO血型系统遗传方式前体H物质A抗原
B抗原无抗原
双亲血型基因型:HhAoXHhBo
子女血型基因型:hhBoXHHAA
HhABABO血型系统遗传方式
特例:临床中发现有一位病人在验血中确定为B血型,在接受O型血的输血后,引起凝血反应。在对供血者血液重新检测时发现,其血细胞在与抗A血清反应时,初时无反应,2个小时后呈凝集反应。所以确定供血者为A型,而不是O型。
ABO血型系统遗传分析
ZHA抗原前提B抗原
z无抗原
hSeH孟买型类孟买型
seHA,B抗原
H(h)无抗原无抗原
有一犯罪嫌疑人在犯罪现场留下的唾液鉴定血型是O型,但是在重点检查某一嫌疑人时,检测出该人的血型是B型,在其它举证都确凿的情况下,已经确认该人是犯罪人,为什么会出现体液与血液血型不一致的现象?A基因座的多态
A1A2A血型的基因型:
A1A1;A2A2;A1A2;A1O;A2O
杂合子基因的衰退作用A:80万B:75万AB:各42万血型的表型改变病人住院时检测为B血型---出院以后为O型。消化道E.coliK12感染,产生类B抗原物质。ABO血型的异常遗传现象
有一AB血型男子与O血型女子结婚,生了一个O型孩子,分析其原因。
CISAB9q34同源染色体不等交换。
ABO血型的新生儿溶血症
O血型的母亲怀有A,B,AB型血型的胎儿,在母亲胎盘异常情况下,临产时会出现母亲的抗体进入新生儿血液中,与婴儿的抗原产生免疫反应,造成婴儿溶血。Rh血型的遗传机制
恒河猴红细胞(Rhesusmonkeys抗原)免疫家兔兔抗猴血清检测人红细胞。85%产生凝集反应15%无凝集反应定名恒河猴红细胞抗原为Rh抗原。1952年Murray发现动物的Rh抗血清与人类的Rh抗原不反应,提出动物与人的抗原是两种不同抗原。1963年定名:人类为Rh抗原,动物为LW抗原Rh血型的新生儿溶血症
Rh阳性血型的红细胞带有Rh抗原,无抗体。
Rh阴性血型的红细胞没有Rh抗原,有抗体
Rh阴性血型的母亲怀有Rh阳性血型的胎儿,在母亲胎盘异常情况下,临产时会出现母亲的抗体进入新生儿血液中,与婴儿的抗原产生免疫反应,造成婴儿溶血。Rh血型的遗传机制
Rh抗原受控与3个紧密连锁的基因座:
Cc;Dd;Ee。以单倍型方式传递。当D基因存在时,为Rh阳性。d基因没有相应的抗原,是Rh阴性血型。单倍型:一条染色体上的基因组成。CDE;CDe;CdE;Cde;cDE;cDe;cdE;cde;
Rh血型的遗传机制
例题:具有CcDEe抗原的个体,可能由哪些基因型组成?
CDE/cDe;CDe/cDE;CdE/cDe;
CDE/cde;CDe/cdE;(?)
Rh血型的遗传机制
复合抗原:ce复合抗原;CE复合抗原;
cE复合抗原…….
当ce基因在一个单倍型上时,会出现ce复合抗原。其抗体可与CDE/cDe的细胞反应。如果母亲具有C,D,E抗原,父亲具有c,E,e抗原,子女可能的表型是什么?如果子女中有一个具有CcDEe抗原,怎样推测他的单倍型和基因型?
CDE/CdE(CDE/CDE)XcdE/cde
Rh血型的遗传机制
表型为Rh阴性的母亲与Rh阴性的父亲生有一女和一子。女儿为Rh阴性,抗原与父亲相同为c,e,儿子是Rh阳性,抗原是C,D,e,分析其遗传机制。母亲CDe/cde父亲cde/cde
女儿cde/cde儿子CDe/cdeX1前体D有Rh抗原
X0无前体D无Rh抗原
母亲:X0X0CDe/cde,无D抗原,是Rh阴性。父亲:X1X1cde/cde,无D抗原,是Rh阴性。女儿:X1X0cde/cde,无D抗原,是Rh阴性。儿子:X1X0CDe/cde,有D抗原,是Rh阳性。MN血型的遗传分析
人群中存在着MN血型系统,受M和N两个基因控制,并显性。
MNMMMMNNMNNNMN血型的遗传分析
MNSs是紧密连锁的血型基因单倍型是:MS;NS;Ms;Ns基因型有10种:MS;NS;Ms;NsMS/MS;Ms/MsNS/NS;Ns/NsMS/NS;MS/MsMS/Ns;Ms/NsNS/Ms;NS/NsMN血型的遗传分析
用M和N血清检查一个家庭,确定父亲基因型是NN,母亲是MM,儿子是MM。结论:儿子不是该夫妻的亲生孩子。但是其它血型和方法证明孩子的确是亲生的。发现了Mg抗原亚型。Mg抗体不能与M抗原反应。检测结果,父亲表型是具有Mg和N抗原,基因型是MgN。儿子基因型是MgMXg血型的遗传分析Xg抗原是目前发现的第一个与性别有关的抗原基因:Xga有Xg抗原
Xg无Xg抗原
Xga对Xg显性
Xg血型的遗传分析Xg抗原XgaXg
Xga
人类白细胞抗原(hunmanlecucocyantigen,HLA)生物体对异种移植或同种异体移植物常发生排斥作用(GVHR)
异体移植的免疫作用:抗宿主反应:受体抗原-供体抗体排斥反应:受体抗体-供体抗原主要组织相容性抗原系统(majorhistocompatibilityantigensystem)主要组织相容性复合体基因(majorhistocompatibilitycomplexgene,MHC)次要组织相容性系统(minorhistocompatibilityantigensystem)HLA的遗传机制主要组织相容性抗原按免疫性分为三类:第一类:移植抗原(transplantationantigen),
位于T淋巴细胞上,编码基因为:HLA——A,B,C第二类:免疫反应的信息传递抗原。编码基因为:HLA——DR,DQ,DZ/,DODP第三类:补体蛋白,与抗原-抗体复合物作用。编码基因为:HLA——C2,C4,Bf同一条染色体上的基因组成被称为单倍型(haplotype)抗宿主反应:受体抗原-供体抗体排斥反应:受体抗体-供体抗原主要组织相容性抗原系统(majorhistocompatibilityantigensystem)主要组织相容性复合体基因(majorhistocompatibilitycomplexgene,MHC)白细胞抗原基因连锁图HLA6p21-23.DPDQDRC4C2BCA411232125155第II类第三类第一类一组功能相近,紧密连锁的基因,称为超基因(Supergene)。白细胞抗原的基因
HLA-AHLA-BHLA-CHLA-DRHLA-DQHLA-DPA1B5Cw1DR1DQ1DPw1A2B7Cw2DR2DQ2DPw2A3B8Cw3DR3DQ3DPw3A9B12Cw4DR4…..DPw4A11B13Cw5DR5…..Aw19B14Cw6DRw6Aw33Bw22Cw7DR7Aw36Bw59Cw8DRw8…..…..…..…...白细胞抗原的分型
淋巴细胞毒试验:
HLA-A,B,C抗原来源于T淋巴细胞,HLA-DR,DQ来源
B淋巴细胞,抗血清来源于孕妇,(由于胎母HLA不合,母亲产生抗体)或免疫抗血清分型。纯合子分型细胞分型(HDC):由于HLA-D抗原不同,引起混合淋巴细胞增殖(MLR),用已知D抗原的纯合子分型淋巴细胞,检测待测细胞是否反应,可作分型。预处理淋巴细胞分型(PLT):根据同抗原细胞不反应原理,预处理两种细胞后,得到识别HLA-DP抗原的能力,可作分型。白细胞抗原的基因分布HLA-A白人黑人黄种人
A10.150.03/A20.260.150.30A30.120.070.01A110.060.010.25A250.02//白人抗原Aw43/0.01/南非黑人抗原Aw36/0.02/黑人人抗原白细胞抗原的基因分布HLA-B白人黑人黄种人
Bw40.410.410.35B70.090.090.02B130.030.010.03B380.03/0.02Bw450.040.04/Bw46//0.05黄种人抗原
白细胞抗原的基因分布强关联:连锁基因实际出现的频率的大于理论频率的现象A26B38A2Bw46犹太人单倍型黄种人单倍型Bw45在黄种人中极少,在美洲的印第安人,爱斯基摩人等人群中,该抗原也极少,推测与种族的起源有关。白细胞抗原与人类疾病
B27抗原与强直性脊椎炎强关联。患者中90%以上都是B27抗原。如果一个人有50%的可能是强直性脊椎炎,检查他的白细胞抗原,有B27抗原,他的患病的机会就大大增高。反之,则减少有病的可能性。白细胞抗原的单倍型分析父抗原:A2,A11,B13
,Bw46母抗原:A3
,A9
,B5
,B7子1抗原:A2A3B7Bw46子2抗原:A11A9B5B13子3抗原:A2A9B5Bw46子4抗原:A3A11B7B13子5抗原:A3A11B7Bw46第三节顺反子(cistron)早期的基因概念:基因是一个功能单位,重组单位,突变单位(三位一体)。发展的基因概念:基因是一个功能单位,基因内部可突变和重组。一个基因就是一个顺反子。基因的顺式和反式排列Fig15.10Thearrangementofgeneticmarkersincisandtransheterozygotes.©2003JohnWileyandSonsPublishersFig15.11Thecis-transpositioneffectobservedbyEdwardLewiswiththeaprandwmutationsofDrosophila.Fig15.12Thecistest.
如何判断突变是在一个顺反子内还是2个不同的非等位基因
a1a1xa2a2a1a1xa2a2
突变型突变型突变型突变型
a1a2突变型a1a2突变型
突变型野生型突变型同一顺反子的不同位点同一顺反子的相同位点如果F1代是野生型,说明a1,a2
是两个非等位基因。Fig15.16Intrageniccomplementationsometimesoccurswhentheactiveformofanenzymeorstructuralproteinisamultimerthatcontainsatleasttwocopiesofanyonegeneproduct.©2003JohnWileyandSonsPublishers顺反子:
是一个遗传单位,一个顺反子决定一个多肽链突变子:
是DNA中构成基因的一个或若干个核苷酸重组子:
重组子代表一个空间单位,它有起点和终点,可以是若干个密码子的重组,也可以是单个核苷酸的互换。操纵子操纵基因(operon):与由它操纵的几个结构基因连锁在一起,几个结构基因由一个启动子转录成为一个mRNA分子,然后翻译成为几种蛋白质,这样的结构称为一个操纵子。乳糖操纵子:包括3个结构基因β-半乳糖苷酶、乳糖透性酶、乙酰化酶
lac操纵子模型的内容(1):lacEYA转录为一多顺反子mRNA;(2):启动子位于调节基因(lacI)和操纵基因(oporater)之间而启动子不能单独起始mRNA的合成;(3):操纵基因为阻遏物(lacI产物)结合位点;(4):当阻遏制物与操纵基因结合时lacmRNA转录起始受到抑制;(5):在诱导物存在时,诱导物与阻遏物结合,改变阻遏物构象使之不能与操纵基因结合因此起始lacmRNA合成。Repressormaintainsthelacoperonintheinactiveconditionbybindingtotheoperator;additionofinducerreleasestherepressor,andtherebyallowsRNApolymerasetoinitiatetranscription.
超基因真核生物中的超基因结构超基因(supergene):是指作用于一种性状或作用于一系列相关性状的几个紧密连锁的基因。基因家族:真核生物中由同一祖先基因在进化过程中经突变,重复和倒位等演变而成的具有相同或相似作用的所有基因,称基因家族。这些基因家族或成员可位于同一染色体式不同染色体上。如脊椎动物的血红蛋白基因:血红蛋白为四聚体,由两条a链和两条β链组成,在不同发育阶段血红蛋白的组成不同。
发育阶段血红蛋白的组成胚胎期(≤8周)ξ2ε2ξ2γ2α2ε2胎儿期(3-9月)α2γ2成人期(出生后)α2δ2α2β2
类α基因包括:ξ、ψξ、ψα、α1、α2、θ类β基因包括:ε、Gr、Ar、ψβ、δ、β在类α基因中,首先是ξ表达不久即被α取代。在类β基因中,首先是ε和γ表达,不久即被δ和β取代,在成体中,α2β2占成体血红蛋白的97%,α2δ2约占2%,而α2γ2则约为胎儿的1%。类α和类β基因在染色体的排列
ξψξψαψααθ
εGrArψβδβ基因簇:指基因家族的成员以串联重复方式排列在一起或不同家族的成员构成一重复单位,以串联重复方式排列在一起。如上述α,β及rDNA(原核;5SRNA,16SRNA,23SRNA,真核:(5.8SRNA,18SRNA,28SRNA)、tRNA簇。假基因(pseudogene):在基因家族中与功能基因相似的序列,但有许多突变以致于失去了原有的功能,假基因是没有功能的基因。在爪蟾5S基因、珠蛋白基因簇、免疫球蛋白基因簇及组织相容性抗原基因簇中都发现有假基因。真核生物的断裂基因断裂基因的发现1)1977年Flavell和Jeffreys用兔珠蛋白基因cDNA与DNA杂交2)同年Chambon用鸡卵清蛋白的杂交真核生物的基因是断裂的基因的可变剪切黑腹果蝇tra基因、果蝇的dsx基因、肌钙蛋白T基因
promoterexon1exon2exon3exon4exon5terminatorA:利用不同的启动子(例:鸡的强心肌和砂囊肌)
B:利用不同的终止子(鼠降钙素基因)
C:改变拼接方式(例鼠鸡钙蛋白T)
12345
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同一DNA序列可编码多种蛋白质①利用不同的启动子:有时基因不止一个启动子,或启动子中的不同成分可独立起始转录,只是效率不同,因此可转录产生不同的mRNA。②利用不同的终止子:与启动子的情况类似改变拼接方式,将不同的外显子拼接在一起,可产生不同mRNA(抗原、抗体),上述情况如下图所示:第四节重叠基因(overlappinggene)1973年Weiner研究RNA病毒Qβ时的发现1977年SangerX174Phage5387bp实际编码的蛋白质比预期要多提出了重叠基因概念:基因转录起始点不同,但是共用同一段DNA序列或几个核苷酸的不同基因。SV40病毒中也有重叠基因。真核生物也有重叠基因果蝇人秀丽新小杆线虫第五节可动基因(mobilegene)可动基因的概念:在染色体体上的位置是可以移动的基因被称为可移动基因,也可以称为转座元件或转座因子(Transposableelement)。转座同易位的概念区别(书56-57页)生物中的转座成分插入序列insertedsequence,IS转座子transposon,Tn转座噬菌体mutatorphage,Mu可动基因(mobilegene)
在基因组中可以移动的基因。原始发现:McClintockB,1951年,1984年获诺贝尔奖玉米粒颜色的遗传。正常:有色有色异常:有色色斑有色无色1932年,美国遗传学家B.McClintock发现玉米籽粒色斑不稳定遗传现象。1951年首次提出转座子的概念,认为在基因组的不同区域存在可移动的控制因子,controllingelement。1983年获诺贝尔奖。植物双受精示意图玉米的转座因子玉米色粒调控元件Ac-Ds系统第9染色体短臂,有色基因C附近C基因,色素合成基因。Ac基因,自主移动的调节因子。4.5kb,5个exon,编码转座酶。Ds基因,非自主移动的受体因子。
0.5---4.0kb,与Ac有同源序列。
插入引起色素不能合成。可动基因(mobilegene)
玉米粒颜色的遗传(C基因决定有色)。
CAc有色
CDsAc花斑
CDs无色Ac与Ds因子的结构Ac因子:4.563kb;有5个外显子,产物是转座酶,两端有11个bp的反向重复序列:5’CAGGGATGAAA….TTTCATCCCTG3’3’GTCCCTACTTT….AAAGTAGGGAC5’Ds因子:与Ac序列具有很大相同,但是中间缺失序列。有0.5-4.0kb,两端有11个bp的反向重复序列,在插入位点上有6-8bp的正向重复序列Ac与Ds因子的转座机制Ac与Ds因子的转座属于非复制机制,即不是一份拷贝后将拷贝转移,而是直接从原位置消失
插入序列(insertionsequence,IS)
仅含有转座酶基因的简单转移序列。长度多在700-1500bp左右。由末端反向重复序列(IR),转座酶基因组成。插入基因组中时,在靶位上生成正向重复序列(DR)
常见的IS结构IS长度末端IR靶位DR插入选择IS1768239随机IS213274195热点IS414281811AAAN20TTTIS51195164热点IS101329229TNAGCNIS50153199热点
对于Is成分对靶位点的同向重复最普遍的为9bp。除Is1外其余Is成分只有一个长的编码区,(为转座酶编码),编码区从倒置重复的一端始到另一端结束。转座将形成一特征性结构:未端为倒置重复,与之相邻的宿主DNA序列同为同向重复。Is成分结构特点
是一个自主复制单位。只编码自身转座所需要的蛋白质,如转座酶(transposase)。Is成分未端为倒置重复(invertedrepeat)。转座涉及Is倒置未端重复和靶位点的识别。转座的结果是靶位点出现同向重复(directrepeat)Is成分的遗传学效应能编码转座酶,自主进行转座。插入位点随机,很少是位点专一的。插入的结果是靶位点出现同向重复(directrepeat)。转座是罕见事件,与自发突变处于同一数量级,每代10-6-10-10。插入片段精确切离后,可使IS诱发的突变恢复为野生型。不精确切离后导致宿主基因发生缺失。转座子(transposon,Tn)带有转座酶基因等必需基因及抗药性等与转座无关基因的转座因子。结构特征:两端具有同向或反向插入序列,同时,两端的IS可能相同或不同。常见的转座子:转座子长度标记末端取向Tn55700KanRIS50反向Tn109300TetRIS10反向Tn92500CamRIS1正向复合转座子的结构特征
含有Is组件,常位于转座子两侧称为臂(arm)。臂的中间常带有药物抗性基因。臂为同向重复或倒置重复。臂为相同式或相关。臂都具有功能或其中之一具有功能。复合转座子结构Is组件(臂)为同向重复例In9,Is1,Cam2,Is组件功能相同Acompositetransposonhasacentralregioncarryingmarkers(suchasdrugresIstance)flankedbyIsmodules.Themoduleshaveshortinvertedterminalrepeats.IfthemodulesthemselvesareininvertedorientationIn10再次移动结果Is10组件改变方向移动形成新的转座子原核生物转座成分的基本结构转座的类型:①复制型转座(replicativetransposition):转座子被加倍将原有转座子的拷贝进行转座,因此供体位点保持不变而受体位点则获得转座子的一个拷贝。Replicativetranspositioncreatesacopyofthetransposon,whichinsertsataRecipientsite.Thedonorsiteremainsunchanged,sobothdonorandRecipienthaveacopyofthetransposon.NonreplicativetranspositionallowsatransposontomoveasaphysicalentityfromadonortoaRecipientsite.ThIsleavesabreakatthedonorsite,whichIslethalunlessitcanberepaired.②非复制型转座(noreplicotivetransposition):
转座子以物理实体从供位点移动到受体位点,结果在供体位点出现断裂,受体位点则出现-转座子。断裂可能有两种结果。其一对宿主影响小,而保留下来如拷贝其宿主重复系统将其识别并修复。③保守性转座(conservativetransposition):另一类非复制转座,转座子从供体切除和插入受体位点过程中每个核苷酸键都被保留,即供体不出现断裂。该过程与入噬体的整合过程相似,而转座酶则与a的整合酶integrase相关
。ConservativetranspositioninvolvesdiRectmovementwithnolossofnucleotidebonds;comparewithlambdaintegrationandexcIsion.
转座子在染色体上的解离方式精确解离非精确解离原位解离复制后解离变性复性emL.CaroandE.BoydelaTour短茎长度大致与IS两端的反向重复序列(IRinvertedrepeatsequence)相同反转录转座(retrotransposon)通过RNA为中介,反转录成DNA后进行转座的可动元件。病毒超家族(viralsuperfamily),可编码反转录酶或整和酶,自主转录。呈DNA时,具有LTR序列。非病毒超家族(nonviralsuperfamily),不可编码反转录酶或整和酶,不能自主转录。呈DNA时,无LTR序列。反转录转座(retrotransposon)病毒的RNA基因组RNA:RU5gagpolenvU3RDNA:U3RU5gagpolenvU3RU5
LTRLTR
基因组--DR-U3RU5gagpolenvU3RU5DR----
反转录病毒与反转录转座自学果蝇中的P因子雌M果蝇X雄P果蝇
不育雄M果蝇X雌P果蝇
育果蝇杂种不育(hybriddysgenesis)HybriddysgenesisIsasymmetrical;itIsinducedbyPmalexMfemalecrosses,butnotbyMmalexPfemalecrosses.
果蝇P因子不育机理开放阅读框ORF0…ORF1…ORF2…ORF3
内含子
123P因子表达差异:
ORF0,1,266KD,转座阻遏物
ORF0,1,2,387KD,转座酶P型细胞质:含66KD,阻遏转座细胞型(cytotype)影响子代育性
66KD阻遇物非常稳定,可影响表型HybriddysgenesIsIsdeterminedbytheinteractionsbetweenPelementsinthegenomeand66kDrepressorinthecytotype.
P成分结构特点:1、具有31bp的未端倒置重复2、靶位点为8bp同向重复3、P成分表达具有组织特异性,即只在种殖系(germline)被激活4、P成分的组织特异性内拼接方式改变引起在体细胞组织前两个内含子被剪接形成ORF0-ORF1-ORF2到读区,翻译为66KD蛋白质,为转座子活性阻遏物。在种殖系组织第三个内含子被除去形成ORF0-ORF1-ORF2-ORF3的可读区,翻译为87KD蛋白质,为转座酶。ThePelementhasfourexons.Thefirstthreearesplicedtogetherinsomaticexpression;allfouraresplicedtogetheringermlineexpression.P成分结构示意图
P雌
XP雄细胞质含p因子转座阻遏物含p因子
P因子不能转移
可育
P雌
XM雄细胞质含P因子转座阻遏物无p因子
P因子不能转移
可育
P雄
XM雌
含P因子细胞质不含阻遏物
P因子能转移
不育
酵母的转座子
Ty(Transposonyeast)其它几种反转录转座子Copia因子是果蝇的一种反转录转座子.LINE序列:长6500bpRNA聚合酶ⅡSINE序列:长130-300bpRNA聚合酶ⅢAlu序列:SINE家族的一员含AluⅠ识别序列假基因转座引起的遗传效应插入突变插入失活插入带来新的基因非精确解离形成突变(缺失,重复,到位)插入激活第六节染色体外基因染色体外基因(extrachromosomalgene):在真核和原核生物细胞中有一些位于染色体外的基因叫染色体外基因一、质粒(plasmid)细菌中除了染色体外,还有大量的小环状分子,就是质粒(plasmid)质粒上有抗生素基因二、线粒体基因组
线粒体是真核细胞中的细胞器。每个细胞中含有几十至数千个线粒体。每个线粒体有多个线粒体基因组拷贝。线粒体是非孟德尔式遗传方式,在高等生物中具有母性遗传的特征。
线粒体基因组变化很大,可相差两个数量级,动物细胞的线粒体基因组较小,在人类、老鼠、牛等细胞中约为16.5kb。酵母线粒体基因组较大,但在不同菌株亦有变化,酿酒酵母约为84kb,每一细胞约有22个线粒体每一线粒体约有4个拷贝DNA,但在生长的细胞中有很大变化;mtDNA的遗传特征母性遗传:mtDNA全部来自母亲,非孟德尔式遗传,线粒体随机分配到子细胞。mtDNA无内含子,无修复系统。mtDNA复制,转录翻译所需的酶由核基因组提供。mtDNA一般没有蛋白质保护。mtDNA合成存在与细胞整个周期。具有突变和缺失热点。mtDNA致病的遗传机制线粒体基因组本身突变线粒体基因组突变可以引起视觉神经和心肌性疾病。点突变:由于mtDNA裸露,易受损伤,且无修复机制。所以突变频率较高。11778密码突变,arg-----his视觉神经性疾病。
缺失:常见5kb,8470bp---13447bp
缺血性心肌病
7.4kb,8637bp---16073bp
原发性心肌病mtDNA插入核基因组溶酶体途径:核酸水解酶下降,mtDNA不能完全消化,片段游离在细胞质中。直接游离:mtDNA复制中同源重组,产生mtDNA断片。线粒体崩解:由于理,化,病等因素,线粒体肿胀破裂,释放出mtDNA.以上DNA片段插入核基因组,造成突变。mtDNA的用途mtDNA可以用于分子系统发生研究mtDNA也可以用于分子进化研究三、叶绿体(ctDNA)遗传叶绿体是绿色植物特有的核外遗传结构。非孟德尔式遗传。裸露的环状双链DNA分子。120-217kb一个叶绿体含1-数十个叶绿体基因组。叶绿体DNA不含5’--甲基胞嘧啶,可用其于纯度鉴定。叶绿体基因组的大小与拷贝数
在高等植物中,叶绿体基因组通常约为140kb,较低等的真核生物则<200kb。在细胞器中,基因组为多拷贝,高等植物约为20—40拷贝。而每一细胞中,细胞器也是多拷贝的,通常约为20—40拷贝。(藻类—高等植物85—292kb。高等植物:120Kb—160Kb)叶绿体基因组结构叶绿体编码蛋白质合成所需的全
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