营养基因组学指导慢病人群健康管理指南 (征求意见稿)

1本文件规定了营养基因组学的检测方法、试剂和仪器、样本的采集和检测、质量控制、结果判读、检测报告出具及基因位点的临床意义解读。本文件适用于医院、第三方实验室的临床研究、科研、常规检测等营养基因组学项目的结果解读。2规范性引用文件本文件没有规范性引用文件。3术语和定义下列术语及定义适用于本文件。3.1脱氧核糖核酸deoxyribonucleicacid,DNA核酸的一种，是由特殊序列的脱氧核糖核苷酸单元（dNTP）构成的多聚核苷酸，起携带遗传信息的功能。DNA为一种双链分子，通过核苷酸碱基对间的氢键维系。DNA包含的类型的DNA：来自染色体的基因组DNA（gDNA）和线粒体DNA（mtDNA）。3.2基因gene遗传物质的最小功能单位，是指具有一定生物学意义的一段DNA。3.3单核苷酸多态性Singlenucleotidepolymorphism由单个核苷酸-A、T、C或G的改变而引起的DNA序列的改变，造成包括人类在内的物种之间染色体基因组的多样性。3.4营养基因组学Nutrigenomics研究营养素和植物化学物质对机体基因的转录、翻译表达及代谢机理的科学。3.5聚合酶链式反应法polymerasechainreaction,PCR一种分子生物学技术，用于放大特定的DNA片段，可看作生物体外的特殊DNA复制。23.6实时荧光定量PCR法real-timequantitativepcr,qPCR在DNA扩增反应中加入荧光基团，以荧光信号累积实时检测每次PCR循环后产物总量，进而对待测样品中的目的序列进行定量分析的方法。3.7原位杂交法insituhybridization，ISH用特定标记的已知碱基序列核酸作为探针与组织、细胞中待检测核酸按碱基互补配对的原则在原位进行特异性结合，形成杂交体，然后用与标记物相应的监测系统，通过免疫组织化学方法在被检测核酸原位进行细胞内核酸定位。3.8Sanger测序Sangersequencing英国人FrederickSanger发现在DNA复制过程中掺入ddNTP，会产生一系列末端终止DNA链，能通过电泳按长度分辨。由此诞生了以Sanger命名的测序原理即双脱氧链终止法测序原理。3.9临床实验室自建项目LaboratoryDevelopedTest,LDT临床实验室自建项目是指医学检验部门自行开发建立，并自发在实验室和临床进行技术研发论证，遵循质量控制体系和管理标准的检测方法。4技术要求4.1营养基因组学基因检测4.1.1检测方法选择常用于靶标检测的方法包括实时荧光定量PCR法、PCR-电泳分析法、PCR-高分辨率熔解曲线法、PCR-核酸质谱法、原位杂交（ISH）法、PCR-基因芯片法、PCR-Sanger测序法、PCR-焦磷酸测序法、高通量测序法。应根据国家的体外诊断试剂分类要求和实验室基因检测的用途选择合适的检测方法。34.1.2试剂选择和要求临床检测试剂应为国家药品监督管理局（NationalMedicalProductsAdministration,NMPA）批准的试剂盒，如果无法满足临床检测需求，可采用符合国家《个体化医学检测LDT研制技术规范（试行版）》要求的实验室自用方法（Laboratorydevelopedtest,LDT）试剂，所用标准品或标准参考物应符合国家卫生健康委临床检验中心推荐的标准和要求。——对于国家批准的商业化试剂盒，可按照说明书进行性能验证。——对于LDT试剂，应按照《个体化医学检测质量保证指南（试行版）》和《个体化医学检测LDT研制技术规范（试行版）》的要求进行性能验证。4.1.3仪器选择和要求实验室可参考生产商提供的操作说明书编写书面的、有案可查的预防性维护及校准计划，确定仪器设备的维护周期，建立仪器设备日常维护的标准操作程序（StandardOperatingProcedure,SOP）。——用于基因扩增及产物分析的机器应有省级及以上药品监督管理局批准的注册号。——对于某些计量分析仪器，应依照我国计量法规定，由计量检定机构定期进行校验，并保存好校验证书。——应对加热系统及冰箱等设备的温度进行监测。——仪器维护过程中要注意清洁剂的使用，尤其是仪器的光路系统。——每台仪器应配备专用的清洁工具。——在例行仪器的维护和保养后，应填写仪器设备维修保养记录表。4.2检测流程4.2.1分析前样本处理样本的采集、运送和保存应按照NMPA批准的检测试剂说明书和LDT试剂的SOP严格进行。4.2.2样本的采集——用于基因检测的样本类型主要为全血样本，也可以为唾液样本。4——静脉血液采集之前应按要求对预采血的部位彻底消毒。——样本采集需要在密闭、一次性采样系统中完成，所用的材料如注射器、棉签、——无论采集哪种类型的样本，采样时都必须戴手套，以避免样本中病原微生物感4.2.3DNA核酸提取4.2.4靶标检测实验过程中应严格执行实验室SOP，不能擅自修改，以保证检测各环节标准、有序地进行，确保检测结果的真实性、准确性和可重复性。4.3个体化营养建议4.3.1参考标准参考美国食品药品管理局（FoodandDrugAdministration,FDA）、中国疾病预防控制中心（ChineseCenterforDiseaseControlandPrevention,CDC）和Pubmed等发布的最新指南、专家共识或公开发表的高质量临床研究，参照营养基因组学检测结果，结合慢病患者个体临床实际诊疗情况，给出个体化营养和注释。4.3.2基因结果临床解释综合分析患者的健康问题，结合基因检测结果，对患者本身存在的饮食问题进行干预。饮食建议会跟随客户的健康状况的变化而变化，有必有进行周期性随访。4.3营养相关检测位点表5盐NPPA钙铁锌碘钠钾镁NBPF3表1.营养相关检测位点表6参考文献[1]Nutrigenomics:the[3]DronamrajuK.Profilesingenetics:Ar[4]孙长颢.分子营养学的定义及发展简史[J].营养健康新观察,2004[6]RayS.PersonalizedModificationofBreastMiCommunication[J].CurrentResearchinNutrition&Food