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第十四章氨基酸蛋白质核酸

蛋白质存在于所有的生物体中,在生物体中占有特殊的地位,是生命的物质基础。第一节氨基酸

一、氨基酸的结构、分类和命名氨基酸是一类取代羧酸。目前在自然界中已发现的氨基酸有三百多种,但由天然蛋白质水解得到的氨基酸仅20种左右。这些氨基酸都是

-氨基酸,通式为:

除甘氨酸外,各种天然氨基酸的

-碳原子都是手性碳原子,具有旋光性。

构成蛋白质的氨基酸的构型都是L型;除半胱氨酸外,都是S型。

-氨基酸的构型习惯上用D/L法标记。

L-氨基酸L-(+)-丙氨酸L-(-)-丝氨酸由蛋白质水解所得的20种氨基酸的分类方法很多。按R基的结构,可分为脂肪族、芳香族和杂环氨基酸。按分子中所含氨基与羧基的相对数目,可分为中性氨基酸、酸性氨基酸和碱性氨基酸三类。

根据侧链R基的极性及所带电荷,分为以下四类:非极性R基的中性氨基酸;不带电荷的极性R基中性氨基酸;带负电荷R基的酸性氨基酸;带正电荷R基的碱性氨基酸。

二、氨基酸的性质(一)与亚硝酸的反应

范斯莱克(VanSlyke)氨基氮测定法。(二)与2,4-二硝基氟苯反应在室温和近中性条件下,氨基酸中的氨基(-NH2)可与2,4-二硝基氟苯(CNFB)反应生成稳定的二硝基苯基氨基酸(DNP-氨基酸)。

DNFBAADNP-AADNP-氨基酸呈黄色,使用纸层析与标准DNP-氨基酸比较,可用于氨基酸之检出。英国科学家桑格尔(Sanger)用此法首次阐明了组成胰岛素的氨基酸的种类、数目和排列顺序,为认识蛋白质的结构作出了重要的贡献。(三)氧化脱氨基反应氨基酸经氧化剂或氨基酸氧化酶的作用,可脱去氨基生成酮酸。此反应在脱氨前涉及脱氢与水解两个步骤。

上述过程,也是生物体内氨基酸分解代谢的重要方式。(四)

与茚三酮的反应

此反应在氨基酸的分析化学中具有重要意义。是鉴别

-氨基酸的一种常用方法。(五)

脱羧反应

在生物体内,脱羧反应也可因某种酶作用而发生。例如,蛋白质腐败时,由鸟氨酸可生成腐胺,由赖氨酸可生成尸胺,由组氨酸可生成组胺。(六)成肽反应

在适当条件下,氨基酸分子间氨基与羧基相互脱水缩合生成的一类化合物,叫做肽。由二分子氨基酸缩合而成的肽叫二肽。

肽分子中的酰胺键(-CO-NH-)叫做肽键。许多氨基酸分子通过多个肽键互相连接起来,便形成多肽。

(七)两性和等电点溶液中,氨基酸能以正离子、负离子和两性离子三种形式存在,形成一个动态平衡体系。

负离子两性离子正离子

pH>pIpH=pIpH<pI氨基酸在溶液中的荷电状态与溶液的pH值有关。氨基酸分子内羧基和氨基的电离度相等,则氨基酸形成两性离子的浓度最高,净电荷为零,氨基酸在电场中既不向正极移动,也不向负极移动,此时溶液的pH值就称为该氨基酸的等电点,常用符号pI(isoelectricpoint)表示。

等电点时,氨基酸溶液的pH=pI,氨基酸主要以电中性的两性离子存在;溶液的pH<pI时,即在pI的酸侧,氨基酸带正电荷,在电场中向负极移动;溶液的pH>pI时,即在pI的碱侧,氨基酸带负电荷,在电场中向正极移动。问题:已知一氨基酸溶液的pH<7,该氨基酸主要以何种离子存在?第二节肽

一、肽的组成和命名肽是氨基酸分子间通过肽键相连的一类化合物。由两个氨基酸缩合而成的叫二肽,由三个氨基酸缩合而成的叫三肽,由较多的氨基酸缩合而成的叫多肽。虽然存在着环肽,但绝大多数肽为链状分子。多肽链可简单表示如下:

多肽链中的每个氨基酸单位通常叫做残基。

在多肽链的一端保留着一个未结合的氨基,称为N-端,通常写在左边;在多肽链的另一端保留着一个未结合的羧基,称为C-端,通常写在右边。氨基酸组成肽链时,既和组成肽链的氨基酸的种类和数目有关,也和肽链中各氨基酸的排列顺序有关。

甘氨酰丙氨酸(甘丙肽)丙氨酰甘氨酸(丙甘肽)(Ⅰ)(Ⅱ)

肽的命名方法是以含C-端的氨基酸为母体,将肽链中其它氨基酸名称中的酸字改为酰,按它们在肽链中的排列顺序由左到右逐个写在母体名称前。如(Ⅰ)应命名为甘氨酰丙氨酸,简称甘丙肽;(Ⅱ)则命名为丙氨酰甘氨酸,简称丙甘肽。但是,即使是较简单的肽,写结构式也很麻烦。因此,在大多数情况下,常使用缩写式。

名称:甘氨酰丙氨酰丝氨酸(甘丙丝肽)缩写式:Gly-Ala-Ser或G-A-S

二、肽键的结构

大量实验研究已证明,肽键是构成肽和蛋白质分子的基本化学键,肽键与相邻的两个

-碳原子所组成的基团,称为肽单位(-C

-CONH-C

)。多肽链就是许多重复的肽单位连接而成,它们构成多肽链的主链骨架。各种多肽链的主链骨架都是一样的,但侧链R基的结构和顺序可以不同,这种不同对多肽和蛋白质的空间构象有重要影响。

图14-1肽键平面及各键长、键角数据(一)谷胱甘肽

谷胱甘肽学名

-谷氨酰半胱氨酰甘氨酸,其结构特点是谷氨酸与半胱氨酸之间的肽键是通过谷氨酸的

-羧基而不是通常的

-羧基与半胱氨酸的

-氨基形成的。因为含有游离的巯基,称为还原型谷胱甘肽,常用G

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