医学信息检索与利用概论

《医学信息检索与利用》概论南昌大学医学院文献检索教研室钟丽萍Whereisthewisdomwehavelostinknowledge?

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——T.S.Eliot(1888-1965)我们在信息里面失去的知识，到哪里去了？我们在知识里面失去的智慧，到哪里去了？艾略特（1888-1965）第一节基本概念1信息（Information)英国科学家K.Popper认为信息可分为：有关客观物质世界的信息有关人类主观精神世界的信息有关概念世界的信息基本概念2知识(knowledge)人类在认识世界、改造世界的过程中，不断接受客观事物发出的信息，经过思维加工，获得对事物本质及其运动规律的认识，由此信息转化为知识。国际经济合作与发展组织提出知识的4W概念：know-what;know-why;know-how;know-who基本概念3情报（Information)当人们为了解决某一特定问题去搜寻所需要的知识，那一部分知识就是情报，是被传递的知识或事实。情报的三个基本属性：知识性、传递性、效用性基本概念4文献（document,literature)文献是记录有知识的一切载体。4个概念之间的关系信息知识系统化文献记录情报交流网络环境下的信息资源1电子信息资源文本型(text)多媒体型(multimedia)超文本型(hypertext)网络环境下的信息资源2传统文献印刷型缩微型声像型按文献发布的类型分类图书期刊特种文献按揭示文献内容程度分类一次文献二次文献三次文献第二节计算机检索与数据库计算机检索：利用计算机从文献数据库或因特网上查寻所需文献信息的过程。包括：联机检索、光盘检索、网络检索计算机检索发展简史脱机检索(off-lineretrieval)联机检索(on-lineretrieval)光盘检索(opticaldiscretrieval)网络检索数据库的类型与结构数据库是指有计算机进行处理的一定数量同类信息的有序集合，是用来存储和查找文献的电子化检索工具。数据库的类型书目型数据库(bibliographicdatabase)事实型数据库(factdatabase)数值型数据库(numericdatabase)全文数据库(fulltextdatabase)图像型数据库(imagedatabase,atlasonline)书目数据库(BibliographicDatabase)存储的是二次文献,包括文献的外部特征、题录、文摘和主题词等，检索结果是所需文献的线索而非原文。许多书目数据库是印刷型文献检索工具的机度版，如MEDLINE、CBMDISC等数值数据库（NumericDatabase)

主要包含的是数字数据，如各种统计数据、科学实验数据、科学测量数据等。例如医学上使用的化学制剂、药物的各种理化参数、人体生理上的各种数值，人口统计数据都可收入数值数据库。美国国立医学图书馆编制的化学物质毒性数据库RTECS，包含10万多种化学物质的急、慢性毒理实验数据。事实数据库（FactDatabase)存储的是用来描述人物、机构、事物等信息的情况、过程、现象的事实数据。如名人录、机构指南、大事记等，均可归入事实数据库。美国MEDLARS系统的医生咨询数据库（PDQ），能提供有关癌症治疗和临床实验的相关病因、诊断标准、治疗方案以及最新研究进展等信息。全文数据库（FullTextDatabase)存储的是原始文献的全文，如杂志论文、报纸新闻、法院案例等。全文检索可直接获取原始资料，而不是书目检索时的线索，提高了用户的检索效率。在DIALOG中有48种医药期刊全文数据库，我国有《中国学术期刊》数据库、万方数据库、维普数据库等全文数据库。图像数据库（ImageDatabase)以图像为信息主体，配有文字解释，如：解剖图谱、中药图谱、诊断图谱、手术图谱等。如：NLM的ThevisibleHumanProject;哈佛大学医学院的TheWholeBrainAtlas等。数据库的结构文档(file)记录(record)字段(field)数据库的结构文档（file)数据是能满足某种特定目的或某一特定数据处理系统需要的一种数据集合，由一个或多个文档构成现期文档、回溯文档（如MEDLINE）顺排文档、倒排文档记录（record)数据库中基本文献单元一个记录在数据库中通常记录着一篇文献的相关信息字段（field)组成记录的基本信息单元。每一个字段都描述文献的某一方面特征，包括外表特征和内容特征。每个字段有自己的名称和缩写，如：题名(ti)、著者(au)、文摘(ab)、出版年(py)等计算机检索的途径检索途径是指用记录的某一特征为检索切入点进行检索。自由词检索自由词又称文本词（textword),是作者写文章时所使用的自然词语，包括：标题词(titleword)关键词(keyword)文摘词(abstractword)全文词(fulltextword)主题词检索主题词（subject,subjectheadings)又称叙词，是一种规范化的检索语言。主题词的规范作用在于：对同义词、近义词、异形词、全称与缩写进行归并，以保证一词输入，多词命中。规范的依据：医学主题词表（MESH）例：renalfailureseekidneyfailure分类检索分类法（Classification):利用学科、专业、概念之间的逻辑关系建立起来的一种等级体系。分类号：由数字或数字加字母构成，代表一个个概念；概念间有上下隶属关系，也有同位间的并列关系。国内常用的分类法是：《中国图书资料分类法》著者检索著者（author)检索是用文献上署名的作者或编者的姓名作为检索入口词。检索时注意著者姓名的处理：姓前，名后；姓用全称，名用首字母。如：CharlesGreenberg处理为:Greenbergc闻玉梅处理为：wenym引文检索参考文献：在学术论文、综述、专著文献后面，列有的著者撰文借鉴利用过的书目清单。引用文献：列有参考文献的文献。参考文献又称为被引用文献。引文检索：以被引用文献为检索起点来查找引用文献的过程。机构检索以机构名称为检索词，来查找该机构学者发表的文献。刊名检索检索指定刊物上发表的文章。有的数据库提供刊名浏览，只需点击刊名链接即可有的数据库则需输入刊名：刊名全称或刊名缩写刊名缩写全称转换可查Pubmed的JournalDatabase()默认检索默认检索又称缺省检索、隐含检索，是指在检索系统预先设定的多个字段中进行检索。如：在WinSPIRS系统的MEDLINE数据库中，Search状态为默认检索所有非限制字段，包括：ti,ab,MH等字段。CBMdisc中的“缺省”检索是在中文标题、文摘、主题词、关键词、特征词、刊名等6个字段中搜词检索。限定检索不少数据库提供limit检索功能,用来对检出结果进行数量限制.常用的限定检索有:语种(language)、文献类型(publicationtype)、出版日期(publicationdate)、只要含有全文的记录(fulltextonly)、限于临床医学期刊(clinicaljournals)等。其他检索途径专利号、国际连续出版物编号、化学物质登记号检索，分子式检索、特征词检索、记录顺序号检索等。计算机检索途径的另一划分法简单检索复合检索高级检索目录检索导航检索专家检索简单检索(SimpleSearch)也称初级检索、自由词检索、基本检索。指在数据库首页的检索词输入框（查询提问框）内输入一个单词或词组，提交检索工具查询的一种检索方式。基本检索说明基本检索说明检索字段基本检索复合检索（CombineSearch)也称布尔逻辑组配检索（BooleanSearch)，或简称组配检索。复合检索指在任意字段情况下在检索词输入框中输入复合逻辑检索式提交检索工具查询的一种检索方式。高级检索(AdvancedSearch)高级检索指在已设定的高级检索窗口中输入多个检索词，运用逻辑组配关系，查找同时满足多个检索条件的数据，在高级检索界