第十三章基因表达调控课件

第十三章基因表达调控课件第一页，共62页。第十三章基因表达调控通常情况下，真核生物细胞只有2-15%的基因处于有转录活性的状态。表达调控是研究不同的环境和条件以及各种因素如何令基因表达或不表达，而且按一定的时间、空间有次序高效地运作。调控水平：转录、转录后、翻译、翻译后第一页第二页，共62页。第十三章基因表达调控调控：细胞代谢的调控（细胞生存、适应内环境）基因表达的调控（生命延续、适应大环境）多水平的调控、多途径的调控调控特点：复杂、多变、灵敏、准确第二页第三页，共62页。第一节、原核生物的操纵子调控模式操纵子：几个相关基因排列在一起，转录出一个mRNA，翻译出多种具相关功能的蛋白质，完成一个功能。有一个调控成分。是原核生物的转录单位。第三页第四页，共62页。

第一节、原核生物的操纵子调控模式一、酶的诱导（enzymeinduction）二、操纵子（operon）的结构与功能三、乳糖操纵子（Lacoperon）与色氨酸操纵子（Trpoperon）四、

cAMP对转录的调控五、原核生物转录的整体调控模式第四页第五页，共62页。induceraddedinducerremoved酶蛋白合成量细胞孵育时间一、诱导现象由底物导致利用该底物的酶的合成增加。第五页第六页，共62页。一、诱导现象葡萄糖乳糖

无半乳糖苷酶乳糖葡萄糖+半乳糖第六页第七页，共62页。一、诱导现象酶的诱导是生物进化中的一种合理、经济地利用有限资源的本能。酶的诱导是低等生物的普遍现象。1961年，JacobandMonod提出了操纵子学说。酶诱导的本质：代谢物对催化本身代谢的酶的合成量调节。第七页第八页，共62页。二、操纵子的结构与功能

操纵子阻遏物基因上游启动子操纵基因一组结构基因

R(i)POSinhibitorpromotoroperatorstructuralgenegene第八页第九页，共62页。二、操纵子的结构与功能启动子是结合RNA聚合酶的DNA序列强：-35TTGACA、-10TATAAT弱：-35区共有序列-10Pribnow不一致一般：基因工程选用强启动子，或杂交融合生成新启动子第九页第十页，共62页。二、操纵子的结构与功能Lacoperon的启动子Plac的-10Trpoperon的启动子Ptrp的-35PtacPtac-17第十页第十一页，共62页。二、操纵子的结构与功能操纵基因是结合阻遏物的部位，位于启动子和结构基因之间，可与启动子部分重叠。是RNA聚合酶是否能通过的开关。无阻遏物时，O区开放让酶通过并转录下游的结构基因有阻遏物时酶就不能通过第十一页第十二页，共62页。二、操纵子的结构与功能阻遏物基因：产生阻遏物，位于离操纵子较远的上游区。负调控：起调控作用的蛋白质分子抑制转录关闭的基因由代谢底物开放（诱导）-----阻遏物失活开放的基因由代谢底物关闭（阻遏）-----阻遏物激活第十二页第十三页，共62页。二、操纵子的结构与功能操纵子：结构基因、上游启动子(P)和操纵基因(O)组成。P和O合称调控区第十三页第十四页，共62页。可诱导和可阻遏的操纵子LacTrp第十四页第十五页，共62页。三、乳糖操纵子和色氨酸操纵子第十五页第十六页，共62页。乳糖操纵子操纵子的三个结构基因为-半乳糖苷酶、-半乳糖苷通透酶和-半乳糖苷乙酰转移酶。在无乳糖时，阻遏蛋白与O区结合，阻止RNA聚合酶的转录在有乳糖时，乳糖与阻遏蛋白结合后，改变了阻遏蛋白的结构，使其不能与O区结合。第十六页第十七页，共62页。(1kb)(155000)

DDRPDDRP第十七页第十八页，共62页。色氨酸操纵子色氨酸操纵子有5个结构基因D、E基因：共产生邻氨基苯甲酸合成酶C基因：产物是吲哚甘油磷酸合成酶B、A基因：共同产物是色氨酸合成酶这些基因一起转录翻译后可进行色氨酸的合成。色氨酸合成仅限细菌。第十八页第十九页，共62页。色氨酸操纵子调控方式（-）（+）第十九页第二十页，共62页。乳糖和色氨酸操纵子的共同点以负调控方式为主：蛋白质分子（阻遏物）对受调控的区域起抑制作用。由低分子物质（底物或产物）影响蛋白质对DNA的结合。结果：既满足细胞生长需求，又不无谓浪费。第二十页第二十一页，共62页。乳糖和色氨酸操纵子的不同点乳糖操纵子色氨酸操纵子

阻遏物阻遏物R基因R基因阻遏物阻遏物代谢物基因开放基因关闭第二十一页第二十二页，共62页。四、cAMP对转录的调控在乳糖和葡萄糖都存在时，哪种糖被优先利用？

第二十二页第二十三页，共62页。四、cAMP对转录的调控乳糖操纵子的启动子属于弱启动子正调控方式CAP：catabolitegeneactivatorprotein分解代谢基因活化蛋白，受cAMP激活cAMP-CAP复合物：结合于DNA上游的CAP位点，促进分解代谢基因表达CAP位点：位于PO上游，属正调控位点第二十三页第二十四页，共62页。四、cAMP对转录的调控培养基中有葡萄糖时：葡萄糖代谢引起细胞内cAMP水平下降，乳糖操纵子基因关闭。培养基中葡萄糖不足时：cAMP水平升高，cAMP-CAP复合物生成，cAMP使CAP变构，而与CAP位点结合，促进乳糖操纵子基因的转录，以便细胞利用乳糖。第二十四页第二十五页，共62页。四、cAMP对转录的调控1第二十五页第二十六页，共62页。阿拉伯糖操纵子B、A、D：编码三种酶，共催化阿拉伯糖的代谢。C：R1（阻遏蛋白），变构后成R2。起始区：initiator（I）R1和R2在变构前后，分别执行负和正调控功能。诱导物可以使抑制蛋白在R1和R2两种构象之间转变。第二十六页第二十七页，共62页。阿拉伯糖操纵子第二十七页第二十八页，共62页。五、原核生物转录的整体调控模式调节子：regulon操纵子是基因表达的基本单元，成群操纵子所组成的高一级的调控网络称为调节子调节原理：内、外环境的变化通过传感器使膜内产生信号，这种信号可同时作用于多个操纵子，或激活或抑制，从而达到群体协调的目的。第二十八页第二十九页，共62页。调节子模式第二十九页第三十页，共62页。SOS修复系统的调节子DNA损伤和复制受阻是刺激因子和信号。LexA蛋白是一系列操纵子的阻遏物。

recA基因转录产物RecA蛋白可水解LexA蛋白。LexA阻遏recA基因，RecA蛋白可水解LexA蛋白，二者之间的平衡移动，使细胞在应急时可迅速启动大量基因的转录。第三十页第三十一页，共62页。SOS修复系统的调节子第三十一页第三十二页，共62页。第二节、真核生物的基因转录调控真核生物的基因转录调控更为复杂：总量大：30亿bp，10万基因分散在各染色体上，23对染色体：定位大量的内含子：比结构基因多十数倍大量的重复序列：重复次数可达几千~百万次更多的蛋白质参与基因的多态性：不同的地域、人种、个体第三十二页第三十三页，共62页。一、人类基因的研究基因组：DNA双螺旋天书人类基因组即将全部破译，一本书已通读一遍，但阅读理解的任务还刚开始。第三十三页第三十四页，共62页。一、人类基因的研究人类基因组计划：（HGP）

humangenomicproject

对人类基因组大约30亿核苷酸对的全序列测定。在完成结构分析过程中，对基因的功能，包括其表达调控，作进一步研究，以便彻底了解生命的奥秘。第三十四页第三十五页，共62页。HGP的内容建立人类基因组高分辨率的遗传图谱完成全部人类染色体的各种物理图谱及选择某些模型生物的DNA物理图谱。人类DNA和模型生物的DNA全部序列的测定。建立收集、储存、分类和分析所有有关资料和数据的工作系统。创建完成以上目标所需的新技术、新方法。第三十五页第三十六页，共62页。二、基因转录调控元件分子辨认：molecularrecognition探讨DNA-蛋白质、蛋白质-蛋白质之间的辨认与结合的机制，以及与调控的关系。第三十六页第三十七页，共62页。二、基因转录调控元件TATAbox：-30区CAATbox启动子GCbox上游活化序列：（USA）upstreamactivatorsequence应答元件与可诱导因子：-200bp八聚体TATAbox：免疫球蛋白第三十七页第三十八页，共62页。增强子的特点增强子：enhancer它是在远距离影响启动的转录调控元件，必须被蛋白质因子结合后才能发挥增强转录的功能。增强子影响启动子，但没有严格的专一性。增强子作用无方向性。第三十八页第三十九页，共62页。二、基因转录调控元件顺式作用元件：真核生物结构基因上游的调控区，有特定的相似或一致性的序列。反式作用因子：和顺式作用元件相结合或间接影响其作用的蛋白质因子。第三十九页第四十页，共62页。真核生物RNApolII转录的基因第四十页第四十一页，共62页。RNA聚合酶II的转录因子第四十一页第四十二页，共62页。转录前起始复合物TFIID是唯一与DNA特异位点即TATA盒结合的转录因子。TATA和TFIID、TFIIA、TFIIB、RNApolII、TFIIF和TFIIE形成转录前起始复合物(PIC)。第四十二页第四十三页，共62页。反式作用因子性质同一DNA序列可被不同蛋白质识别，同一蛋白质因子也可与多种不同DNA序列结合。DNA与蛋白质的结合少数是直接结合，多数是蛋白质-蛋白质相互作用后再影响DNA。蛋白质-蛋白质或DNA-蛋白质结合后，可导致构象上的变化。反式作用因子在自身生物合成过程中，有相当大的可变性和可塑性。第四十三页第四十四页，共62页。三、顺式作用元件与反式作用因子的结合反式作用因子蛋白质至少包括三个功能域：DNA识别结合域、转录活性域和结合其它蛋白的结合域。模体：（motif）在结合域中存在的一些局部对称二聚体。在DNA的某些序列中，也存在一定的对称性。顺式作用元件与反式作用因子的结合与这些对称区域有关。第四十四页第四十五页，共62页。三、顺式作用元件与反式作用因子的结合DNA结构简单：开放或关闭序列不变蛋白质因子：复杂、多变二者结合基因表达调控的多变性第四十五页第四十六页，共62页。螺旋-转角-螺旋、螺旋-环-螺旋两个亚基通过-折叠形成二聚体，相当于DNA的一个螺距。第四十六页第四十七页，共62页。锌指锌是很多酶的辅助因子锌指：（Zincfinger）锌螯合在多肽链中，以配价键和半胱氨酸残基或组氨酸残基结合。Cys2/His2型：Cys-X2~4-Cys-X3-Phe-Leu-X2-His-X3-HisCys2/Cys2型：Cys-X2-Cys-X13-Cys-X2-Cys一个单位以指部伸入DNA双螺旋的深沟，接触5个核苷酸。第四十七页第四十八页，共62页。锌指第四十八页第四十九页，共62页。亮氨酸拉链(Leuzipper)：

两组平行的带亮氨酸的螺旋形成的对称二聚体。

DNA结合蛋白的C端，每隔7个氨基酸出现一个亮氨酸。蛋白质的螺旋每圈为3.6个氨基酸残基。每二圈出现的亮氨酸与轴平行列在同一直线上，构成拉链的一半。亮氨酸拉链第四十九页第五十页，共62页。亮氨酸拉链常出现于真核生物DNA结合蛋白的C端，与癌基因表达调控功能有关。第五十页第五十一页，共62页。第三节、癌基因癌基因：oncogene，onc能使细胞癌变的DNA序列。首先在致癌病毒中发现，现已证实它是正常存在于生物基因组内。致癌性：正常基因的不正常表达的后果癌症：基因以特殊形式表达后的性状原癌基因：（pro-onc）正常存在于生物基因组内的癌基因。第五十一页第五十二页，共62页。第三节、癌基因一、病毒癌基因和细胞癌基因二、癌基因分类三、癌基因激活四、抑癌基因第五十二页第五十三页，共62页。

病毒癌基因：V-onco细胞癌基因：c-onco把致癌病毒与正常细胞一起培养，可使正常细胞变为癌细胞，这个过程称为转化。致癌病毒存在的某些核苷酸序列称为癌基因，即病毒癌基因。一、病毒癌基因和细胞癌基因第五十三页第五十四页，共62页。癌基因表达产物功能生长因子及其类似物或生长因子的受体。酪氨酸蛋白激酶。结合GTP而影响细胞内的信号系统。结合DNA发挥转录调控的作用，甚至影响复制过程。第五十四页第五十五页，共62页。二、癌基因的分类src家族：src、abl、fes、fgr、ros