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多功能穿梭载体的构建

许多干草杆菌和大肠杆菌之间的飞行都具有各自的优缺点和用途。随着基因工程的发展,对载体也提出了新的要求,即多种功能和高效表达等。到目前为止,pUB110仍是芽孢杆菌中重要的载体之一。它的特点是较稳定,拷贝数多,单酶切位点也不少。pGEM3是大肠杆菌的多用途载体,它具有两个强启动子和一个多酶切位点,分子量小、扩增率高,双启动子和双向转录,保证了任何插入方向都可以有正确的RNA转录。它除了可以作为基因工程常规的载体外,还可用于体外转录、翻译的研究,以及基因产物的微量分析和DNA序列分析等。本文报道了用pUB110和pGEM3载体构建的两个多功能穿梭载体。材料和方法(一)材料表面1.菌2.限制酶、溶菌酶和抗菌酶核糖核酸酶、限制酶EcoRⅠ和HindⅢ为BRL公司产品。限制酶PvuⅡ、T4DNA连接酶,MungBean核酸酶和CIP酶为Sino-AmericanBiotec公司产品。溶菌酶为上海生化所产品。SPPI噬菌体DNA为本所郑文尧赠送。3.新霉素贮液浓度氨苄青霉素贮液浓度为25mg/ml,工作浓度为50μg/ml;新霉素贮液浓度为1mg/ml,工作浓度为5μg/ml。以上两种抗生素均需过滤灭菌,然后放4℃贮存备用。4.基本培训LB液体和固体培养基用干大肠杆菌和枯草杆菌的培养。枯草杆菌转化用培养基按郭兴华的方法配制。(二)ccc酶基因的纯化大肠杆菌质粒提取按分子克隆一书方法;枯草杆菌质粒提取按Hardy的方法,快速提取质粒按Hopwood的方法。纯化质粒采用北京东方仪器厂生产的DNA回收仪,回收cccDNA。携带淀粉酶基因的噬菌体ρ11amy1的提取和纯化按郭兴华等方法。酶切、MungBeanNuclease去尾以及T4DNA连接酶的连接按Maniatis的方法。枯草杆菌转化按郭兴华等的方法。大肠杆菌的转化按Maniatis的方法。α-淀粉酶摇瓶发酵按贾士芳方法。α-淀粉酶活力测定按部颁方法。结果与讨论(一)运营载体pbe2的构建1.菌落的筛选和培养经纯化的pUB110和pGEM3质粒DNA,分别用EcoRI酶切,两个质粒各有一个EcoRI切点(图1),为了防止在连接过程中质粒DNA自身环化,对酶切后的pGEM3DNA进行脱磷酸化处理。将等量的EcoRI酶切的pUB110和脱磷酸的pGEM3DNA用T4DNA连接酶连接,然后转化大肠杆菌HB101,结果在含Amp(50μg/ml)的平板上长出25个菌落,把25个菌落分别挑到含Neo(5μg/ml)和双抗的(Amp+Neo)平板上,37℃培养24h,在含Neo和双抗平板上都长的只有5个菌落。将5个转化子快速提取质粒,经电泳检测,5个转化子所含质粒的带均在pUB110和pGEM3之上,另外将pUB110、pGEM3和重组质粒分别用EcoRⅠ酶切,电泳后的结果为:重组质粒的两条带分别与pUB110和pGEM3的带相对应(图版Ⅰ-B),因此可以证实5个转化子都含有重组质粒。2.重组质粒的连接方式从图1中可以知道,重组质粒可以顺向和反向连接,顺向连接时,重组质粒上的PvuⅡ酶切位点相距较远,将重组质粒分为大小几乎相等的两个片段。反向连接时两个PvuⅡ切点的距离较近,将重组质粒分为一大片段和一小片段。为了验证重组质粒的连接方式,用PvuⅡ酶切5个重组质粒,电泳后均显示了一条大片段(约为4.2Md)和一条小片段(约为0.64Md)(图版I-C)。证实5个重组质粒均为反向连接。pUB110质粒没有HindⅢ切点,而pGEM3的多克隆位点区有一个HindⅢ位点。用HindⅢ酶切重组质粒,电泳结果显示了一条带(图版I-C)。证实重组质粒是由pUB110和pGEM3质粒构成的,并命名为pBE1(B代表枯草杆菌,E代表大肠杆菌)。3.质粒的提取和转化pBE1的PvuⅡ,EcoRIXbal和BamHⅠ酶切位点是重复的,为了减小它的分子量,必须去掉多余的酶切位点和无用的片段。我们采用PvuⅡ酶切重组质粒,使其形成平末端,然后用T4DNA连接酶连接,再转化大肠杆菌C600。用双抗(Amp+Neo)平板筛选,从转化子中随机挑出10个菌落,经快速法提取质粒之后,电泳显示出比pBE1重组质粒分子量小的新的重组质粒(图版Ⅰ-A)。用PvuⅡ和EcoRⅠ酶切新的重组质粒,电泳结果表明它只有一个PvuⅡ和EcoRⅠ切点,证实所含重复的4个酶切位点已被切掉。将它再转化枯草杆菌BR151,转化效率为8.6×103/μgDNA。经改造的穿梭载体定名为pBE2。(二)乳酸菌表达pbe3的制备1.重组载体的获得:用PvuⅡ和EcoRⅠ酶切pUB110质粒,把EcORⅠ到PvuⅡ这一段非主要区去掉。留下部分具有一个EcoRⅠ粘末端和一个PvuⅡ平末端,再用MungBeanNuclease处理粘末端,使其成为平末端。这样,就可以和PvuⅡ切过的pGEM3相对应了(图2),用T4DNA连接酶进行平末端连接然后转化大肠杆菌HB101的感受态细胞。在双抗的LB平板上,长出几百个菌落。把单菌挑在双抗LB平板上,进一步验证转化子。2.重组载体的检验:从几百个转化子中随机挑取20个菌落,快速提取质粒后电泳,发现它们的分子量大小不一,取其分子量约为4.2Md(理论推测)的重组质粒,进一步用EcoRI,HindⅢ酶切,都得到单一的条带。这个重组质粒被命名为pBE3(图版Ⅰ-D)。并在大肠杆菌→枯草杆菌→大肠杆菌→枯草杆菌穿梭转化,转化效率都在103—104/μgDNA以上。从以上结果证明pBE3具有pUB110和pGEM3的复制点,抗药性标记和完整的多酶切位点。(三)菌种生长和生长双抗的lb平板1为了检查载体的稳定性,将含有pBE2和pBE3质粒的大肠杆菌HB101和枯草杆菌BR151菌株,放4℃冰箱保藏一个月,另外分别每日转管一次,一个月后分别适当稀释后涂LB平板,然后再复制到含和不含抗生素的平板上,37℃培养后结果为从大肠杆菌HB101来的菌落在含双抗的LB平板上百分之百生长。由枯草杆菌BR151来的菌落在含Neo的LB平板上百分之九十八生长。分别提取质粒DNA,电泳行为都和原来的一样。(四)淀粉酶基因片段的表达我们曾用ρ11噬菌体克隆了α-淀粉酶基因。为了检验新构建的载体功能,用Sau3A酶切ρ11amy1,得到α-淀粉酶基因(分子量约为1.4Md)。把它插入到pBE2和pBE3的BamHI位点上,然后转化到BR151中,得到pBE2amy和pBE3amy。以淀粉酶基因片段的给体菌枯草杆菌168为对照,和BR151(pBE2amy)和BR151(pBE3amy)同时进行摇瓶发酵,然后测定淀粉酶活力,结果如表2。由表2看出淀粉酶基因可以在pBE2和pBE3载体上表达,而且α-淀粉酶的活力比出发菌株的活力约高5倍

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