物种身份证编码系统的设计与实现

物种身份证编码系统的设计与实现

根据美国国家科学委员会的“生命之树”项目，目前，大约500万人生活在地球上，但科学家可以确定只有200万人左右。这些物种绝大多数以纸质版的形式、以不同的语言文字和图片保存在世界各国的图书馆、科研单位和科学家手中,随着一代一代研究人员的退休、死亡,很多保贵的纸质版资料逐年减少,有的出现消失;在物种的研究方面,由于地理生态环境的不同,物种的分布与种类有很大的差别,各国科学家的物种研究报告大多以母语的形式发表,而使用其他文字的研究人员要全面了解这些资料就会存在困难(如到异国异地查找资料;查到不同文字的材料可能还存在翻译障碍),即使可能,在时间上也会滞后。我们已进入计算机时代,各种信息的数字化已成为时代发展的必然趋势,利用现代科学技术,建立物种身份证编码系统,将所有的纸质版物种形态学描述转变为电子版,并将所有物种资料先统一翻译成一种文字发布,然后再将统一版本翻译成其他文字,供世界各国科学研究、教学、和科学普及工作使用。这样做的优点:a.减少物种资料的消失;b.可让全世界需要这方面资料的人共享最全、最新的物种信息;c.可避免对物种的重复命名,减少同种异名的出现,规范物种的命名。在过去的几十年中,人类对物种的认识、分类、命名已有了很大进展,基本框架已经形成。但是各国科学家对物种研究的深度和广度不同,分类方法不同,超、亚阶元增多,再加上语言文字不同,致使目前无法确切统计世界物种的数量,有些物种只有名称,没有形态描述和图片,因此,制定物种编码法则,给物种建立身份证编码,以物种数据库的形式输入计算机,或刻制光盘,使物种信息系统化、规范化,推动物种研究的发展,本文介绍了建立物种身份证编码的方法。1物种身份验证编码系统的建立1.1参加人员的选择由国家农业部牵头,由某研究所或大学成立项目组;参加人员应为国内、外较有名望的生物学家、物种分类学家和有关动、植物专业研究人员参加。常年负责对物种资料的收集、整理(含翻译)、编写、输录。1.2类型签名编码的应用范围世界上所有的生物体。1.3物种分类算法在项目课题组成立、经费落实的情况下,收集全世界有关物种研究的论文和专著,然后按物种分类的界、门、纲、目、科、属、种7个分类阶元进行分类,整编超、亚阶元(如超科、亚科、总科、类、组等亚阶元)和有争议的分类,然后确定各阶元定义,并进行编码。对难以统一的分类给予保留。1.4物种的隶属关系一个物种编码的位数确定为12位,12位数码的分配方案如下:一个物种的身份证号表达了这个物种的隶属关系,第1位代表界,第2~3位代表门,第4位代表纲第5~6位代表目,第7~8位代表科,第9~10位代表属,第11~12位代表种。1.5各层元代码的说明1.5.1真核原生界5.5暂定病毒界编码为1,原核生物界为2,真核原生生物界为3,植物界为4,真菌界为5,动物界为6。那么,动物界的编码为600000000000。1.5.2设瞳体的编码暂定原生动物门为01,中生动物门为02,多孔动物门为03,扁盘动物门为04,腔肠动物门为05,栉水母动物门为06,扁形动物门为07,纽形动物门为08,……,那么,动物界扁形动物门的编码为60700000000。1.5.3定义扁平动物门的编码暂定涡虫纲为1,吸虫纲为2,绦虫纲为3,那么,扁形动物门绦虫纲的编码为607300000000。1.5.4设圆叶目的编码暂定旋缘目为01,两线目为02,鲤蠢目为03,窄沟目为04,假叶目为05,……,圆叶目为14,那么,圆叶目的编码为607314000000。1.5.5圆叶目科的编码暂定异体科为01,线带科为02,裸头科为03,中殖孔科为04,......,双壳科为09,那么,圆叶目的编码为607314030000。1.5.6莫尼茨属的编码暂定莫尼茨属为01,曲子宫属为02,斯泰属为03,无卵黄腺属为04,裸头属为05,……,那么,莫尼茨属的编码为607314030100。1.5.7ssr编码暂定扩张莫尼茨绦虫为01,贝氏莫尼茨绦虫为02,白色莫尼茨绦虫为03,那么,扩张莫尼茨绦虫的编码为607314030101。从编码(607314030101)可以看出,扩张莫尼茨绦虫(Monieziaexpansa)隶属于第6个界—动物界、第7个门—扁形动物门、第3个纲—绦虫纲、第14个目—圆叶目、第3个科—裸头科、第1个属—莫尼茨属的第一个种名。1.6种阶元的标注如果七个阶元中的某个阶元中数量超出99,如目、科、属、种数量达到3位数,可用A0-9、B0-9、C0-……的方法来表示,这样可另外再增加260种。如种阶元中有106个种时,可用6073140301A5表示。为了便于识别编码,在纲和目编码之间留一空格。1.7序列块的内在顺序原则第一,以模式科、属、种为第一序号排序;第二,其余科、属、种以年代前后(或以输入前后)排序;第三新命名的科、属、种排在最后。2分类结果及查询方法根据物种身份证编码系统的编制原则,我们设计、编制了物种身份证编码应用系统软件,并以网站的形式发布,网站名:。目前,我们输录了吸虫、绦虫、线虫、棘头虫、蚤、原虫、病毒等物种的分类和形态描述,共计6600余种,附图2600余幅,并进行了检索运行,效果很好。图1介绍了网站主页及4种查询方法。在输入框中填入正确内容,按搜索键即可。进入网站主页后,单击按阶元查询键(1),出现界的分类,根据需要,再选择界以下的各级分类,直至到种;在物种名称输入框(2)中输入种名(拉丁文或汉文),然后单击“搜索”键(4),就会出现该物种的有关信息和图片;在身份证编码输入框(3)中输入该种编码,然后单击“搜索”键(4),就会出现该物种的有关信息和图片;在物种以上分类阶元名称输入框(5)中输入种以上各阶元名称(拉丁文或汉文),然后单击“搜索”键(6),就会出现该阶元的有关信息。3建立物种身份证编码系统的必要性建立物种身份证编码系统,将所有纸质版物种描述转变为电子版,有利于物种资料的保存、积累,也有利于对世界物种数量进行统计。建立物种身份证编码系统,将所有纸质版物种描述转变为电子版,有利于世界各国的科学家(不同语言)对物种研究的交流。建立物种身份证编码系统,将所有纸质版物种描述转变为电子版,有利于对物种的查寻,对于物种的研究、教学、科普都具有重要的意义。建立物种身份证编码系统,将所有纸质版物种描述转变为电子版后,也可以光盘的形式发布,每2