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文档简介

分子生物学

在白血病中的应用1.分子生物学

在白血病中的应用1.

一、白血病相关基因改变的常见类型融合基因基因突变基因表达异常2一、白血病相关基因改变的常见类型融合基因基因突变基因表达异1.融合基因:

所谓融合基因,是指将两个或多个基因的编码区首尾相连.置于同一套调控序列(包括启动子、增

强子、核糖体结合序列、终止子等)控制之下,构成的嵌合基因。

概念Chr9Chr22ABLBCRBCR-ABL融合基因31.融合基因:概念Chr9Chr22A2.基因突变:

错义突变(点突变)插入突变缺失突变移码突变42.基因突变:4错义突变(点突变):

DNA分子中一个碱基对被另一个不同的碱基对取代所引起的突变。

如:JAK2V617FJAK2基因

mRNA水平(cDNA水平):第1849位点G突变为T

蛋白水平:第617位氨基酸位点由缬氨酸(V)突变为笨丙氨酸(F)5错义突变(点突变):DNA分子中一个碱基对被另一插入突变:

较长片段的DNA的插入而发生突变,但不改变阅读框

如:NOTCH1H1590-L1592insFGPNOTCH1基因

mRNA水平(cDNA水平):c.47754776ins(TGGGCC)

蛋白水平:H1590-L1592insFGP6插入突变:较长片段的DNA的插入而发生突缺失突变:

较长片段的DNA的缺失而发生突变,但不改变阅读框

如:JAK2N542-E543del

JAK2基因

mRNA水平(cDNA水平):c.1624-1629del6bp

蛋白水平:N542-E543缺失N、E氨基酸

7缺失突变:较长片段的DNA的缺失而发生突变移码突变:DNA片段中某一位点插入或丢失一个或几个(非3或3的倍数碱基对时,造成插入或丢失位点以后的一系列编码顺序发生错位的一种突变。

如:CALRL367fs(46)突变

CALR基因

mRNA水平(cDNA水平):c.1179_1230del52bp

蛋白水平:第367位氨基酸(亮氨酸)位点发生移码,在

367位点起后的46位氨基酸终止。8移码突变:DNA片段中某一位点插入或丢失一个或几个(非3或3

癌基因或抑癌基因表达异常如:WT1定量3、基因表达异常9癌基因或抑癌基因表达异常3、基因表达异常9二、白血病基因检测的临床意义1、辅助诊断2、指导治疗3、评估预后4、微小病变残留检测10二、白血病基因检测的临床意义1、辅助诊断10三、白血病相关基因分类BCR-ABLFLT3-ITDJAK2V617FC-KIT……PML-RARaNPM1RUNX1AML1-ETO……DNMT3ATET2ASXL1/ASXL2IDH1/IDH2……SF3B1SRSF2U2AF1……

Class1

增殖Class2分化Class3

表观遗传Class4

剪切因子11三、白血病相关基因分类BCR-ABLPML-RARaDNMT四、白血病相关常见基因AMLCMLMPNALLCLLMDS12四、白血病相关常见基因AMLALLMDS12AML相关基因异常融合基因:1、

PML-RARa:95%AML-M3分为三型L型、S型、V型

PLZF-RARaNPM1-RARa2、

AML1-ETO:40%AML-M2(主要为M2b)3、

CBFβ-MYH11:90%AML-M4Eo4、

MLL-AF17

MLL-AF6AML-M4/M5

MLL-AF913AML相关基因异常融合基因:1、PML-RARAML相关基因异常基因突变:FLT3-ITDNPM1(A/B/D型)c-KitIDH1IDH2ASXL2NRASKRASP53DNMT3A基因定量分析:WT1定量FLT3-ITD:AML-M3中发生频率较高c-Kit:50%AML1-ETO阳性AML

CBFβ-MYH11阳性AMLASXL2:AML1-ETO阳性AML14AML相关基因异常基因突变:FLT3-ITD基因CML相关基因异常BCR-ABL:95%CMLCML特异marker

亚型:

cDNAProtein

b3a2、b2a2型P210e19a2型P230e1a2型P19015CML相关基因异常BCR-ABL:95%CMPN相关基因异常PV、ET、PMF的诊断BCR-ABL排除早期慢粒PV:JAK2V617FJKA2exon12ET:JAK2V617FMPLCALRPMF:JAK2V617FMPLCALRBCR-ABLJAK2V617FMPLCALRJAK2exon1216MPN相关基因异常PV、ET、PMF的诊断BCRMDS相关基因异常WT1定量DNMT3ATET2ASXL1SF3B1SRSF2RUNX1SF3B1:主要见于50-70%环形铁粒幼增多性贫血SRSF2

:主要见于CMML17MDS相关基因异常WT1定量SF3B1:主要见ALL相关基因异常BCR-ABL:35%成人ALLTEL-AML1:儿童ALL预后好E2A-PBX1:预后不好MLL-AF4:婴幼儿多见NOTCH1:预后好FBXW7:预后不好PTENNRASKRASB-ALLT-ALL18ALL相关基因异常BCR-ABL:35%成CLL相关基因异常P53NOTCH1NOTCH1:见于B系或T系CLL在CLL中为预后不好指标19CLL相关

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