医学课件数据库查询系列讲座

数据库查询系列讲座

主讲：刘春华.数据库查询系列讲座

主讲：刘春华.1外文医学信息检索

MEDLINE数据库.外文医学信息检索

MEDLINE数据库.2MEDLINE是美国国立医学图书馆(TheNationalLibraryofMedicine,简称NLM)生产的国际性综合生物医学信息题录型数据库，是当前国际上最有权威的生物医学文献数据库。内容包括美国《医学索引》（IndexMedicus,IM）的全部内容和《牙科文献索引》（IndextoDentalLiterature）、《国际护理索引》（InternationalNursingIndex）的部分内容，涉及基础医学、临床医学、环境医学、营养卫生、职业病学、卫生管理、医疗保健、微生物、药学、社会医学等领域。概况.MEDLINE是美国国立医学图书馆(TheNational3收录范围Medline数据库收录了1966年以来世界上70多个国家和地区出版的生物医学及其相关学科期刊4000多种，涉及43个语种，其中80%为英文刊物，大多数有英文文摘。该库每月以3万条记录的进度更新，每年增加的文献量约36万条。该数据库包含四十多种中文(含台湾）医学杂志，如中华系列杂志等。.收录范围Medline数据库收录了1966年以来世界上70多4一数据库的库结构MEDLINE光盘数据库的记录由26个字段组成。其中限制性字段11个，常用的有：CP（出版国）、ISSN（国际标准刊号）、LA（语种）、PT(出版物类型）、PY（出版年）。

例如：若特指在限制性字段检索文献，输入的检索词必须加以限定。如：Englishinla或la=English；

健入一个检索词时，将在所有非限制字段内检索，如果在检索词后加上字段代码，可将检索字段限制在某个字段内。检索式则只能是：Johnsoninau.一数据库的库结构MEDLINE光盘数据库的记录由5二MEDLINE光盘的运算符布尔逻辑运算符

逻辑与（AND)：AANDB目的：缩小检索范围，提高查准率逻辑或（OR）：AORB目的：扩大检索范围，增加命中文献率逻辑非（NOT)：ANOTB目的：缩小检索范围ABABAB.二MEDLINE光盘的运算符6截词符所谓截词，就是以符号取代检索词中部分字母。有左截断、中间截断和右截断。

如：physic*可检出的词汇有：physic,physical,physician,physicians,physicist,physicists…..可以看出，截词检索具有“OR”的运算特性。中间截断：m?n；wom?n左截断：“*mycin”可检出Garamycin,Karamycin等。

目的：用截词符可以解决检索词拼法及单负数形式不同造成的漏检。.截词符所谓截词，就是以符号取代检索词中部分字母。有左7位置算符用于表示检索词间的相邻位置关系。NEAR：表示检索词在同一句子中，次序可以颠倒。（ANEARB)NEAR后加正整数N：表示检索词之间最多可插入N-1个词。(ANEAR6B)WITH：表示检索词存在于同一字段中，如：篇名、摘要等，次序可以颠倒。（AWITHB).位置算符用于表示检索词间的相邻位置关系。.8范围算符1.时间及内容限定：表示对检索结果进行时间或内容的限定，有“=”、“>=”、“<=”、“>”、“<”等。如：“PY>=1998”表示检索1998年以来的文献。“PY=2002”表示检索2002年发表的文献。“TA=中华内科学杂志”表示查找刊名为“中华内科学杂志”上的所有文献。目的：利用范围算符可以缩小检索范围。2.字段限定：表示将检索限制在某一个字段内。如：高血压IN主题词.范围算符1.时间及内容限定：表示对检索结果进行时间或内容的限9三数据库检索系统主要检索界面启动

WinSpirs软件后，点击start，然后在数据库中选择年份，继续点击OK，系统显示WinSpirs主要检索屏幕。主要检索屏幕分检索区、检索史区、检出记录区和工具拦。工具拦上的按钮是NEDLINE最常用的检索指令。.三数据库检索系统10..11点击.点击.12选择数据库.选择.13WinSpirs主要检索界面菜单栏工具栏检索区检索历史窗口检索结果区.WinSpirs主要检索界面菜单栏工具栏检索区检索历史窗口检14四基本操作及检索基本检索（1）选择数据库

检索前，需要先确定数据库检索年限，点击“Add”按钮，所选数据库进入空白处，然后再点击“OK”按钮，检索就在所选数据库中进行。.四基本操作及检索基15(2)自由词检索数据库默认的是自由词检索。操作时直接在“search”框内输入检索词或检索式，点击“search”或“回车”，即开始检索。

在Search状态下,检索式可以是以下几种形式:任意的字母或数字，如:ac,28,etc.任意单词或词组;如:cancer,vitaminA连缀词组;如:liver-neoplasms，lung-disease词根(截词):computer*以前的检索式，如:#3逻辑检索式，如:childandnutrition.(2)自由词检索数据库默认的是自由词检索。操作时直接在“s16输入“针刺镇痛”后，点击“search”.输入“针刺镇痛”后，点击“search”.17检索结果检索结果.检索结果检索结果.18Thesaurus检索时，首先点击“Thesaurus”按钮，在输入框中输入检索词后，再点击“Lookup”按钮，出现以该词开始的轮排索引。双击所选的词或点击“TERMINFORMATION”则出现选定词详解，根据注释、相关参照及树状结构等信息确定所选词是否合适，如果合适再选择“SingleTerm”进行单个主题词检索，或“Explode”进行该主题及下位词的扩展检索。最后点击“SearchNow”进入副主题词选择界面，从左边的“choosefromthese

subheadings”框中选入到右边的“UsetheseSubheadings”框中，点击“OK”，即开始检索。.Thesaurus检索时，首先点击“Thes19点击.点击.20在输入框中输入检索词“kidneycancer”后点击“LookUp”按钮.在输入框中输入检索词“kidneycancer”后点击“L21轮排索引点击该词或按钮.轮排索引点击该词或按钮.22注释、相关参照树状结构号.注释、相关参照树状结构号.23单个主题词，缩小检索范围扩展检索扩大检索范围进入副主题词界面.单个主题词，扩展检索进入副主题词界面.24选择合适的副主题词.选择.25..26

索引词表辅助检索检索时，单击“Index”按钮，在输入框内输入检索词，屏幕显示输入词所在的索引片段，然后选择需要的检索词，最后单击“Search”按钮。也可从Index索引中连续选词，单击“Search”健，系统会将选中的所有词分别检索一遍，最后用“or”把检索结果合并。用索引词检索首先可以检查词的拼写，其次可以根据索引表查到与输入词词根相同的同义词等。.索引词表辅助检索检索时，单击“Index”按钮，在输27点击按钮.点击按钮.28所有的索引词.所有的.29输入检索词，点击Search文献记录数频次.输入检索词，点击Search文频次.30..31五检索史区.五检索史区.32六辅助按钮Limit

进行限制检索。Suggest提示规范化的主题词及与该主题词有关的其它相关词。Retype可将其中某个检索式直接粘贴到Search检索框内，以便重新检索或修改后检索，免去重复输词的麻烦。Clear可删除不必要的检索式。Show在检出记录区显示所选检索式的检出结果。.六辅助按钮Limit进行限制检索。.33点击“Limit”按钮出现11个限制字段.点击“Limit”按钮.34可供参考的主题词，选择后点击“search”或“explode”.可供参考的主题词，.35选择合适的副主题词.选择合适的副主题词.36AllFields显示记录的全部字段FullScreen全屏显示文献记录NextHit阅读浏览过程中的前进PreviousHit

阅览过程中的后退AddtoSearch在浏览阅读记录时，若对文中的某一词语或某一术语感兴趣，用光标加亮该术语，点击“AddtoSearch”，则此词会自动进入Search检索框内，再点击Search指令，系统即对该词进行检索。.AllFields显示记录的全部字段.37..38七检索结果的输出套录（Download)

工具条中的Download按钮提供套录功能，系统能将检索结果存入软盘。首先点击Download按钮，出现套录记录的对话框DownloadRecords。在DownloadRecords中可作各种参数设置。.七检索结果的输出39选中要存盘的记录，点击Download.选中要存盘的记录，点击Download.40..41打印（Print）工具栏中的Print按钮提供打印功能。但只对最后一次检出的记录进行打印，若要打印前面的检索结果，则必须点击以前的检索式，使其显示，方可进行打印。.打印（Print）工具栏中的Print按钮提供打印功能42八检索策略

1、分析课题，确定主题词2、用《医学主题词表》或Thesaurus将概念词规范化为主题词3.不能转化为主题词的概念词作为自由词检索；4.将主题词、自由词运用逻辑运算符组合进行检索，发挥主题词的查准性和自由词的查全特性。.八检索策略1、分析课题，确定主题词.43举例“呼吸机在慢性阻塞性肺疾病辅助治疗中的应用”（1996-2000）分析：1.慢性阻塞型肺疾病也称慢阻肺，其英文表达形式有：Chronicobstructivepulmonarydisease；pulmonarydisease,Chronicobstructive；COPD等。

MeSH词表中的规范主题词为“lungdisease,obstructive”。2.慢性用自由词chronic组配。辅助治疗一般包括治疗和药物治疗，宜选副主题词therapy，drugtherapy。3.呼吸机可用ventilatorsmechanical主题的扩展检索。.举例“呼吸机在慢性阻塞性肺疾病辅助治疗中的应用44..45网上外文医学信息检索

PubMed/pubmed.网上外文医学信息检索

PubMedwww.ncbi.nlm46概况PubMed是美国国立医学图书馆(NLM)附属国立生物技术信息中心（NCBI)研制开发的用于检索MEDLINE等数据库的网上检索系统，免费提供医学、护理学、牙科学、兽医学等领域的文献信息。收录了1953年以来的70多个国家，40多个语种，近4600种生物医学期刊的文献，至今已有书目文摘条目1400万余条。.概况PubMed是美国国立医学图书馆(NLM)附属国立生物技47一PubMed的特点1.广泛的链接：任何一个界面都有许多链接。

（相关资源链接、功能链接、检索结果显示链接等）2.收录更加广泛：MEDLINE数据库、生命科学方面的期刊论文。3.更新及时：每周增添新的内容。4.提供检索词自动转换功能：能够自动实现检索词的匹配与转换。.一PubMed的特点1.广泛的链接：任何一个界面都48二基本检索界面

.二基本检索界面491检索方法在输入框内输入检索词，点[Go]按钮或按回车检索词的输入形式：

输入单词或短语或表达式，也可用*及“”如，aspirin；stomachulcerligustrazineANDpharmacologyasthmaKamadaA或asthma,KamadaAcomputer*

著者姓名：wengxz、“wengxz”[au]

刊名标题：刊名全称、缩写、ISSN

Journalofleukocytebiology、Jleukocbiol、0741-5400.1检索方法在输入框内输入检索词，点[Go]按钮或按501.由于PubMed具有词汇自动转换匹配功能，对用户的输词要求不十分严格，只要具有实质性意义的词，一般不需要强调该词是关键词、主题词、人名、还是期刊名等。如：检索A.Kamada发表的有关哮喘的文献。在检索框内输入检索词：asthmakamadaa2.短语检索：在检索词上加上双引号“”，PubMed将不执行自动转换，而将其作为特定的短语进行检索。

“tumorgenetherapy”3.如果用字段限定，逻辑运算符一定要大写，缩写字段名置于检索词后的方括号中。

检索式：arthritis[mh]AND2000:2003[dp]

特别提示.1.由于PubMed具有词汇自动转换匹配功能，对用户的输词51..52..532显示检索结果PubMed检索结果界面设有不同的选项，可显示特定的记录和记录的不同格式。

Display:summary(题录）、abstract(摘要）等

Show:5-500条题录Sort：（Author、Journal、PubDate）排序

Sendto:Text(Files、Clipboard、E-mail、Order)存盘或打印

.2显示检索结果PubMed检索结果界面设有54..55三检索功能按钮及其应用方法1、Limits点击Limits按钮，即进入Limits界面。可通过浏览选择字段、出版物类型、年龄组、语种、时间范围、研究对象、数据库子集等下拉菜单，根据需要选取有关项目对检索结果进入限定，即可缩小检索范围，提高查准率。

例如：查找从1995年1月到2001年12月，PubMed中收录的有关高血压的英语语种的综述性文献。.三检索功能按钮及其应用方法1、Limits点击Limi56..57..582、Preview/Index：点击该按钮，进入preview/Index界面。方法A：

选择字段，输入检索词，点击需要的逻辑运算符。并以检索式方式出现在上方检索区输入框中。点击输入框中右侧之“Preview”，可显示命中的文献数；点击“go”,将直接显示命中文献记录。还可通过”Detail”按钮查看经过转换后的检索策略

满意存盘或打印不满意重新检索

.2、Preview/Index：点击该按钮，进入previ59逻辑运算符.逻辑运算符.60..61..62..63方法B：选择字段，输入检索词，通过“Index”功能健进行该字段检索内容的选择，点击需要的逻辑运算符。.方法B：选择字段，输入检索词，通过“Index”功能健进行该64..653其它功能按钮检索史（History):可查看检索策略和检索结果，包括每次检索的序号、检索式、检索时间及检出文献数目。剪贴板（Clipboard)：可将一次检索的多个检索结果存放，以便集中下载。最多保存500条记录，保存时间8小时。检索策略（Detail):点击该健可以详细地了解本次检索的细节，可根据需要进行健所策略的修改、编辑和保存。.3其它功能按钮检索史（History):可查看检索策略和检66检索史.检索史.67..68四

MeshDatabase

（医学主题词浏览器）点击PubMed主界面左边工具栏中的MeshDatabase则进入该界面。在MeshDatabase的检索框内输入检索词，如“KidneyCancer”,然后点击Go按钮，系统自动将该词转换为对应的主题词，除了出现规范性主题词“KidneyNeoplasms”外，还提示多个相关入口词的选择，如Kidneyancer,KidneyCancers等。点击主题词“KidneyNeoplasms”链接，可展开该词的全部副主题词，同样将其“Sendto”至SearchBox,最后点击“SearchPubMed”获得检索结果。.四MeshDatabase（医学主题词浏览器）点击Pu69..70..71副主题词.副主题词.72在树状结构中的位置.在树状结构.73五全文的获取在查到的文献题录中书本带“绿条”的查到免费全文。在查到的文献题录中书本带“黄绿条”的可在“PMC”