真菌类染色体作图教案专家讲座

怎样利用遗传图距计算各种配子基因型出现频率实例：果蝇y、sn、v三对等位基因遗传图是yvsn1510将基因型为++v果蝇与基因型为ysn+果蝇杂交，写出F1雌雄配子基因型，在没有干扰情况下，各基因型频率。真菌类染色体作图教案专家讲座第1页试题分析雌果蝇与雄果蝇杂交，假如杂交后代是雄果蝇，则基因之间不发生交换，表现为完全连锁，只产生二种配子；假如杂交后代是雌果蝇，则依据连锁等位基因对数，以及基因之间发生交换类型，能够产生各种类型配子。真菌类染色体作图教案专家讲座第2页试题分析从三对等位基因遗传图距能够得知，同源染色体三对非等位基因之间必定发生二次单交换。杂交后代出现了重组基因型个体。而且己经通知三个基因之间遗传图距，按照Morgan连锁遗传规律，我们能够得到三因子杂交，假如基因之间发生交换,并存在双交换前提下,会产生8种配子(如没有双交换呢？会产生多少种配子…?)。各种配子基因型符号及基因型简化符号分别列表以下：真菌类染色体作图教案专家讲座第3页杂交F1配子种类及百分比配子类型配子基因型基因型简化符号交换类型配子百分比①亲本型YSNv++v②亲本型ysnVys+③重组型YsnV+s+Y与S单交换④重组型ySNvy+v⑤重组型YSNV++vS与V单交换⑥重组型ySnvysv⑦重组型Ysnv+sv双交换⑧重组型ySNVy++真菌类染色体作图教案专家讲座第4页假如三基因之间发生了双交换，在没有干扰前提下：则双交换频率为15%×10%=1.5%,则类型7、8双交换配子百分比是0.75%;因为单交换值=单交换频率+双交换频率，所以单交换频率=单交换值-双交换频率，则类型3与4配子比是15-1.5=13.5;各种配子百分比是6.75%一样方法,类型5与6配子百分比为10-1.5=8.5;各种配子百分比是4.25%亲本型配子百分比是(100-13.5-1.5-8.5)/2=76.5/2=38.25%真菌类染色体作图教案专家讲座第5页将以上数据填入表中配子类型基因符号百分比①亲本型++v38.25%②亲本型ys+38.25%③重组型+s+6.75%④重组型y+v6.75%⑤重组型++v4.25%⑥重组型ysv4.25%⑦重组型+sv0.75%⑧重组型y++0.75%.真菌类染色体作图教案专家讲座第6页假如干扰值为0.4因为I=1-实际双交换值/理论双交换值=0.4,则实际双交换值=理论双交换值×0.6=1.5×0.6=0.9

其它计算方法与没有干扰情况相同.(没有干扰时双交换值为1.5)真菌类染色体作图教案专家讲座第7页第二节

真菌类着丝粒作图真菌类染色体作图教案专家讲座第8页

一、着丝粒作图

以着丝粒作为一个座位，测定某一基因与着丝粒之间距离，并进行基因在染色体上位置作图。

1、概念:真菌类染色体作图教案专家讲座第9页A：假如着丝粒与某一对杂合基因之间未发生交换,则该基因与着丝粒同时分离。此时，一对等位基因分离为减数第一次分裂分离，即M1，形成非交换型子囊。2、原理：真菌类染色体作图教案专家讲座第10页

第一次分裂分离（M1）及非交换型子囊形成真菌类染色体作图教案专家讲座第11页B：假如基因与着丝粒之间发生了交换,则该基因与着丝粒分离不一样时。此时，一对等位基因分离为减数第二次分裂分离，即M2，形成交换型子囊。真菌类染色体作图教案专家讲座第12页

第二次分裂分离（M2）及交换型子囊形成真菌类染色体作图教案专家讲座第13页C：假如一对等位基因分离发生在第一次减数分裂，则基因与着丝粒之间未发生重组；假如，两个基因分离发生在第二次减数分裂，则说明基因与着丝粒之间发生了重组。D：判别第一次或第二次减数分裂分离,可依据8个子囊孢子基因型排列次序。真菌类染色体作图教案专家讲座第14页二、两个连锁基因作图1、四分子基因型归类在两个连锁基因++与ab杂交组合子囊中，四分子基因型能够归纳为三种类型：

亲代型（PD）

++++abab

非亲代型（NPD）

+b+ba+a+

四型（TT）

+++ba+ab真菌类染色体作图教案专家讲座第15页ab

ABab

ABNCOSCODCO二线ABab

2、两个连锁位点间不一样交换类型产生各种四分子abab＋＋＋＋aba＋＋b

＋＋abab＋＋＋＋无交换PD型单交换TT型双交换PD型真菌类染色体作图教案专家讲座第16页ABab

ab

ab

ABDCO三线TT型DCO三线TT型DCO四线NPD型aba++++b

a+ab+b++a+a++b+b真菌类染色体作图教案专家讲座第17页3、重组频率计算方法（以平均交换次数方法计算）子囊：PDNPDTT++a+ab++a+a+ab+b+bab+b++RF=1/2T+NPD/总子囊数×100%因为RF无法校正双交换，重组值可能被低估。依据PD、NPD、T三种子囊频率，能够推导出两基因间平均每次减数分裂交换数(m)，m×0.5即两基因间图距。真菌类染色体作图教案专家讲座第18页假如假设双交换在四条染色单体间随机发生：

DCO(全部双交换)=4NPD其中:DCO（3线双交换)=T（三线）=2NPD而:T（总）=SCO（单交换）+DCO（3线双交换）所以:SCO=T（总）-DCO（3线双交换）

=T（总）－

2NPD所以:m=SCO+2DCO(全部双交换)

=T（总）-2NPD+2（4NPD）

=T（总）+6NPD把m换成遗传图距单位，则Rf=50×（TT+6NPD)真菌类染色体作图教案专家讲座第19页方法二：以重组频率计算公式来计算重组频率Rf=1/2（重组型子囊数）×100

总子囊数因为在TT类型中只有1/2孢子为重组型，在NPD类型中全部孢子为重组型。那么就能够直接计算重组率

Rf=1/2TT+NPD

真菌类染色体作图教案专家讲座第20页实例1设定ab双因子杂交产生各类型孢子囊数目为112个PD，4个NPD，24个TT，计算a与b之间遗传图距方法一：用平均交换次数计算是图距=50×（24/140+6×4/140）

=17.1方法二:直接用重组率公式计算

Rf=1/2TT+NPD=1/2(24/140+4/140)=0.114经过以上二种方法比较,得知用平均交换次数方法计算能准确测定基因之间双交换频率.这种计算方法也是对用重组率计算一个校正.

真菌类染色体作图教案专家讲座第21页连锁关系判断基因连锁判断:

双因子杂交产生了三种四分子基因型PD、TT、NPD，对于连锁基因位点，不发生交换减数分裂子囊孢子总是多于发生四线双交换子囊孢子。当NPD数目低于PD数目时，表明基因之间连锁。在基因之间连锁状态下，亲本型四分孢子频率远远高于其它类型，而且连锁位点不交换和单交换频率总是大大高于双交换频率。所以，NPD类型偏少是基因之间双交换依据。真菌类染色体作图教案专家讲座第22页实例3：链孢霉nic+×+ade杂交遗传分析

亲本基因型是nic+与+ade，为了简便起见将其简化为：n+与+a，其染色体构型是：+an+粗糙链孢酶有两个突变型：烟酸依赖型(nic)----需在培养基中添加烟酸才能生长腺嘌呤依赖型(ade)---需在培养基中添加腺嘌呤才能生长真菌类染色体作图教案专家讲座第23页Pnic+×+ade

n++a(2n)

减数分裂

可归纳为７种基本子囊型36种组合真菌类染色体作图教案专家讲座第24页链孢霉n+×+a7种子囊型对应子囊数子囊型四分子基因型次序分离时期四分子类型实得子囊数（1）（2）（3）（4）（5）（6）（7）总计+a+an+n+++++nana+++an+na+ana++n++an++an+++na++na++na+an+M1M1M1M1M1M2M2M1M2M2M2M2M2M2PDNPDTTPDNPDT808190590151000真菌类染色体作图教案专家讲座第25页分析方法：第一步，判断各子囊中每一对基因分离时期1、7种基本子囊型中四个基因型次序是各不一样，分别由7种不一样交换方式而来。2、分离发生时期：分别判断每一对基因分离发生时期（M1或M2），用于计算基因与着丝粒图距。真菌类染色体作图教案专家讲座第26页判断方法：从竖排分析用亲本型子囊孢子排列次序来衡量各子囊中子囊孢子排列次序来判断分裂分离时期。子囊型1234567四分子基因型次序+a+an+n+++++nana+++an+na+ana++n++an++an+++na++na++na+an+分离时期MIMIMII

真菌类染色体作图教案专家讲座第27页第二步：判断7种类型属PD、NPD还是TT从横排来看基因是否交换产生了新类型，即是否出现了重组基因类型。从而判断是PD、NPD、TT。真菌类染色体作图教案专家讲座第28页子囊型分类：只考虑两对基因间是否发生了重组，用于计算两对基因间重组值。依据亲本四分子基因型，依次对7种子囊类型染色体图像、交换类型、所产生四分子类型、及产生重组百分比分析以下：第二步：判断7种类型属PD、NPD还是TT真菌类染色体作图教案专家讲座第29页+an+PD+a+an+n+M1M1(1)+an+NPD++++nanaM1M1(2)+an+TT+++an+naM1M2(3)子囊型染色体图象归类四分子基因型分离时期重组0100%50%真菌类染色体作图教案专家讲座第30页+an+T+ana++n+M2M1(4)+an+PD+an++an+M2M2(5)50%0真菌类染色体作图教案专家讲座第31页

+an+NPD++na++naM2M2(6)+an+T++na+an+M2M2(7)100%50%真菌类染色体作图教案专家讲座第32页第三步：连锁关系判断结论：nic与ade连锁连锁判断：

自由组合连锁实际结果

PD/NPD＝1PD/NPD＞1898/2真菌类染色体作图教案专家讲座第33页第四步：计算各基因与着丝粒之间距离①

nic基因与着丝粒距离

Rfnic=1/2第二次分离子囊数×100=1/2（5+90+1+5）×100=5.05

总子囊数

1000

②ade基因与着丝粒距离

Rfade=1/2（90+90+1+5）×100=9.301000③

n与a基因之间距离Rfn-a=1/2TT+NPD=1/2（90+5+5）+（1+1）=5.210001000真菌类染色体作图教案专家讲座第34页怎样判断哪些类型是nic、ade第二次分裂分离呢？要拿各子囊四分子类型与亲本四分子基因型比较就能够知道，比如子囊类型3：四分子是++nicnic+ade+ade++nicnicadeadeadeade亲本型①从第1竖排可知，含nic基因子囊孢子与亲本基因型排列次序完全一样，没有交换，没有产生重组。因而属于MI分离。②一样从第2竖排可知，ade与亲本型比较排列次序变了是因为ade基因与着丝粒发生了交换。所以属于MII型。真菌类染色体作图教案专家讲座第35页5、判断基因在染色体上相对位置nic基因和ade基因与着丝粒之间遗传图距已经计算出，而且nic与ade之间图距也知道了，但基因nic、ade在染色体上有三种可能排列方式：①n与a位于不一样染色体上；②n与a位于同一条染色体上着丝粒两边；③n与a位于同一条染色体上着丝粒同一边。真菌类染色体作图教案专家讲座第36页nic与ade在染色体上三种可能排列图示n5.05a9.3