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文档简介
第八章
微生物遗传学(1)微生物遗传学第1页遗传(heredity
):
上一代生物将本身一整套遗传基因稳定地传递给下一代特征。变异(variation):
生物体在某种外因或内因作用下,发生遗传物质结构或数量改变,而且这种改变稳定,含有可遗传性。引言1.遗传与变异遗传确保了微生物种相对稳定性、种存在和延续,而变异则推进了种进化和发展。微生物遗传学第2页2.遗传型和表型遗传型(genotype)表型(phenotype)某一生物体个体所含有全部遗传因子,即基因总和
,又称为基因型。某一生物体所含有一切外表特征及内在特征总和。
表型实现是由生物体遗传型和环境条件共同作用结果。微生物遗传学第3页饰变(modification)
表型差异只与环境相关。不包括遗传物质结构改变而只发生在转录、转译水平上表型改变。
谷氨酸发酵温度敏感菌株在30℃时菌体生长而不产生氨基酸,不过当温度提升到37℃时,菌体大量合成谷氨酸。变异遗传物质改变,造成表型改变
3.饰变与变异(遗传型变异,基因突变)特点:遗传性、群体中极少数个体行为
(自发突变频率通常为10-6-10-9)特点:暂时性、不可遗传性、表现为全部个体行为。微生物遗传学第4页微生物是遗传学研究中明星:微生物细胞结构简单,营养体普通为单倍体,方便建立纯系。很多常见微生物都易于人工培养,快速、大量生长繁殖。对环境原因作用敏感,易于取得各类突变株,操作性强。
微生物遗传学第5页第一节遗传变异物质基础一、证实核酸是遗传物质基础三个经典试验二、遗传物质在细胞内存在部位和方式微生物遗传学第6页经典转化试验:
证实DNA是遗传变异物质基础。Avery在四十年代以更精密试验设计重复了以上试验分别用S型菌中提取DNA、RNA和蛋白质转化R型菌且DNA被酶降解破坏抽提物无转化活性DNA是转化所必需转化因子一、三个经典试验微生物遗传学第7页T2噬菌体感染试验2.噬菌体感染试验(1952年,A.D.Hershey和M.Chase)微生物遗传学第8页3.植物病毒重建试验证实杂种病毒蛋白质外壳来自TMV还是HRV,可用血清学反应判定证实核酸(RNA)是遗传物质基础血清学反应说明病毒蛋白质特征由核酸而定H.Fraenkel-Conrat(1956年)病斑特征和病毒核酸一致微生物遗传学第9页二、遗传物质在细胞内存在部位和方式(一)七个水平细胞水平(单核,多核)细胞核水平(真核,拟核)染色体水平核酸水平(DNA,部分病毒为RNA;双链,少数病毒为单链)基因水平(遗传功效单位)密码子水平(遗传信息单位)核苷酸水平(最低突变单位和交换单位)周德庆p192-197;自学(一套,两套,核外染色体)微生物遗传学第10页基因(gene)是什么?
是实体,其物质基础是DNA
(或RNA);
是一个含有特定遗传信息DNA分子区段;
是遗传信息传递和性状分化发育依据;
基因是可分,依据功效不一样,分为:编码蛋白质基因结构基因(结构蛋白,酶)调整基因(阻遏蛋白或激活蛋白)无翻译产物基因tRNA基因(简称tDNA)
rRNA基因(简称rDNA)不转录DNA区段开启子(promotor)操纵基因(operator)基因是一个含有特定遗传信息核苷酸序列,它是遗传功效单位。微生物遗传学第11页第二节质粒P196质粒(plasmid)一个独立于染色体外,能进行自主复制细胞质遗传因子,主要存在于各种微生物细胞中。附加体(episome)指哪些既能够整合到核染色体上,作为染色体一部分而进行复制,又能够再游离出来或携带一些寄主染色体基因游离出来,这类质粒被称为附加体。
微生物遗传学第12页1、质粒分子结构(1)结构通常以共价闭合环状(covalentlyclosedcircle,简称CCC)超螺旋双链DNA分子存在于细胞中;也发觉有线型双链DNA质粒和RNA质粒;质粒分子大小范围从1kb左右到1000kb;(细菌质粒多在10kb以内)微生物遗传学第13页2.质粒分离碱提取法:①菌体培养和搜集:普通采取丰富培养基对菌体进行培养,当细胞生长到指数期后期时,离心搜集细胞。②溶菌:普通用溶菌酶去壁以形成原生质体或原生质球。③碱变性处理:在SDS等表面活性剂存在下加NaOH液使pH升至12.4,可使菌体蛋白质、染色体DNA以及质粒DNA变性。④质粒复性:加入pH4.8KAc-HAc缓冲液,将提取液调至中性,因为质粒分子量小而轻易复性,并稳定存在于溶液中;染色体DNA分子量太大,在复性过程中形成DNA之间交联造成其形成更大分子不溶性物质。⑤离心分离:经高速离心能够使细胞碎片和已变性菌体蛋白及染色体DNA一起沉淀,上清液中主要是质粒DNA,经乙醇沉淀后,可取得质粒DNA。微生物遗传学第14页(参见P197)3.质粒检测提取全部胞内DNA后电镜观察;氯化铯-溴化乙啶密度梯度超速离心;
对于试验室惯用菌,可用质粒所带一些特点,如抗药性初步判断。对于因为三种构型同时存在时造成多带现象(提取质粒时造成或自然存在),能够进行特异性单酶切,使其成为一条带。
琼脂糖凝胶电泳后观察;微生物遗传学第15页4.质粒特征(1)位于核基因组外;(3)自主复制;(2)cccDNA链霉菌和酵母菌中发觉了线状dsDNA质粒和RNA质粒(4)有质粒可整合到核染色体上;(5)可重组(质粒与质粒间,质粒与染色体间);(6)人为消除(丫叮类,UV,电离辐射,利福平等)(7)有质粒可在细胞间转移(F因子,R因子)质粒所含基因对宿主细胞普通是非必需;有时能赋予宿主细胞以特殊机能,从而使宿主得到生长优势微生物遗传学第16页5、质粒主要类型依据质粒所编码功效和赋予宿主表型效应分类:致育因子(Fertilityfactor,F因子)抗性质粒(Resistancefactor,R因子)产细菌素质粒(Bacteriocinproductionplasmid)毒性质粒(virulenceplasmid)代谢质粒(Metabolicplasmid)隐秘质粒(crypticplasmid)2µm质粒微生物遗传学第17页(参见P197)(1)致育因子(Fertilityfactor,F因子)又称F质粒,其大小约100kb,这是最早发觉一个与大肠杆菌有性生殖现象(接合作用)相关质粒。携带F质粒菌株称为F+菌株(相当于雄性),无F质粒菌株称为F-菌株(相当于雌性)。F因子能以游离状态(F+)和以与染色体相结合状态(Hfr)存在于细胞中,所以又称之为附加体(episome)。在志贺氏菌属(Shigella)、沙门氏菌属(Salmonella)和链球菌属(Streptococcus)等其它细菌中也发觉了与大肠杆菌类似致育因子。在放线菌中,天蓝色链霉菌含有SCP1和SCP2两种致育质粒,这两种质粒在天蓝色链霉菌接合过程中起主要作用,带动染色体从供体细胞向受体细胞转移。微生物遗传学第18页(参见P197)(2)抗性因子(Resistancefactor,R因子)包含抗药性和抗重金属二大类,简称R质粒。R100质粒(89kb)可使宿主对以下药品及重金属含有抗性:汞(mercuricion,mer)四环素(tetracycline,tet)链霉素(Streptomycin,str)、磺胺(Sulfonamide,sul)、氯霉素(Chlorampenicol,cml)夫西地酸(fusidicacid,fus)负责这些抗性基因是成簇地存在于抗性质粒上。抗性质粒在细菌间传递是细菌产生抗药性主要原因之一。微生物遗传学第19页(3)Col质粒:产细菌素质粒(Bacteriocinproductionplasmid)细菌素结构基因、包括细菌素运输及发挥作用(processing)蛋白质基因、赋予宿主对该细菌素含有“免疫力”相关产物基因普通都位于质粒或转座子上,所以,细菌素能够杀死同种但不携带该质粒菌株。细菌素:许多细菌都能产生一些代谢产物,抑制或杀死其它近缘细菌或同种不一样菌株,因为这些代谢产物是由质粒编码蛋白质,不象抗生素那样含有很广杀菌谱,所以称为细菌素(bacteriiocin)微生物遗传学第20页细菌素种类很多,普通依据产生菌种类进行命名:大肠杆菌(E.coli)产生细菌素为colicins(大肠杆菌素),而质粒被称为Col质粒。另外还有枯草杆菌素、乳酸菌素、根瘤菌素等。由G+细菌产生细菌素或与细菌素类似因子与colicins有所不一样,但通常也是由质粒基因编码,有些甚至有商业价值,比如一个乳酸细菌产生细菌素NisinA能强烈抑制一些G+细菌生长,而被用于食品工业保藏。大肠杆菌素是产自大肠杆菌一个蛋白质,含有专一性地杀死其亲缘关系很近、不具Col质粒其它肠道细菌功效。微生物遗传学第21页(4)毒性质粒(virulenceplasmid)许多致病菌致病性是由其所携带质粒引发,这些质粒含有编码毒素基因,其产物对宿主(动物、植物)造成伤害。产毒素大肠杆菌是引发人类和动物腹泻主要病原菌之一,其中许多菌株含有为一个或各种肠毒素编码质粒。苏云金杆菌含有编码δ内毒素(伴孢晶体中)质粒根癌土壤杆菌所含Ti质粒是引发双子叶植物冠瘿瘤致病因子微生物遗传学第22页(5)
代谢质粒(Metabolicplasmid)
质粒上携带有有利于微生物生存基因,如能降解一些基质酶,进行共生固氮,或产生抗生素(一些放线菌)等。将复杂有机化合物降解成能被其作为碳源和能源利用简单形式,环境保护方面含有主要意义。假单胞菌:含有降解一些有毒化合物,如芳香簇化合物(苯)、农药(2,4dichlorophenoxyaceticacid)、辛烷和樟脑等能力。降解质粒TOL质粒:含分解甲苯基因;CAM-OCT质粒:含分解樟脑辛烷基因微生物遗传学第23页(6)隐秘质粒(crypticplasmid)它们存在生物学意义,当前几乎不了解。在应用上,很多隐秘质粒被加以改造作为基因工程载体(普通加上抗性基因)隐秘质粒不显示任何表型效应,它们存在只有经过物理方法,比如用凝胶电泳检测细胞抽提液等方法才能发觉。微生物遗传学第24页(7)2μm质粒
大多数酵母菌含有一个称为2μm质粒
,属隐秘质粒
-长为2m6kb环状双链DNA分子
-位于酵母细胞核内,50~100拷贝
-只携带与复制和重组相关4个基因,无遗传表型
-质粒上有两个600bp长IR,被一个2.7kb区域和一个2.3kb小区域所间隔
-两个IR上都有一个专一重组位点(FRT),经过重组,可使质粒互变异组成A型和B型。意义:2μm质粒是酵母菌中进行分子克隆和基因工程主要载体,所以以它为基础构建克隆和表示载体已得到广泛应用。另首先,该质粒也是研究真核基因调控和染色体复制一个十分有用模型
微生物遗传学第25页依据拷贝数或复制特点,质粒可分为:高拷贝数(highcopynumber)质粒(每个细胞中能够有10~100个拷贝,其复制和染色体复制不一样时)如ColE1、ColE2等
———————松弛型质粒(relaxedplasmid)低拷贝数(lowcopynumber)质粒(每个细胞中只有1~2个拷贝,其复制行为与染色体复制同时)如F因子,R100
———————严谨型质粒(stringentplasmid)窄宿主范围质粒(narrowhostrangeplasmid)(
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