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文档简介
2、组:泛指一个有生命体、或细胞器的全部遗传物质;在真核生物,组是指一套(单倍体3、组学:指从组水平研究遗传的学科4、C值:通常是指一种生物单倍体组DNA的总量,在真核生物中,C值一般随着生物的进化而增加,高等生5、C值:指一个有机体的C值和其编码能力缺乏相关性6、RNA组学对细胞中全部RNA分子的结构与功能进行系统的研体水平阐明RNA的生物学意义即为RNA组8、转录组学:就是在组学后新兴的一门学科,即研究细胞在某能状态下所含mRNA的类型与拷贝数。即研,10酶的活性单位:在特定的条件下,111为1个酶的单位(国际单位IU)。11、酶的比:酶的与蛋白质的量相联系的1种单位。如每mg酶蛋白所具有的酶(单位/mg蛋白),每ml酶制剂含有的酶(单位/m1),或每g酶制剂具有的单位(单位/g)等。对同一种酶来讲,比12、PH:pHpH 蛋白质组:由一个组所表达的全部相应的蛋白质,同一组在不同细胞、不同组织中的表达情况各不相同;在空间和时间上动态变化。16、蛋白质组学:从整体的角度分析细胞内动态变化的蛋白质组成、结构、表达水平与修饰状态,了解蛋白质之间的相互作用与联系,揭示蛋白质功能与细胞生命活动规律。应用各种技术来研究蛋白质组的一门新兴科、电场下对蛋白质进行等电聚焦(IEF),再在第一向垂直方向上进行第二向SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳SDS)。 生物:通过将大量的特异性分子固定到固相支持物上,再与标记的样品分子进行杂交,通过检每个分子19、技术:通过微阵列技术,将高密度DNA片段阵列通过高速机器人或原位合成方式以一定的顺序使20、生物信息学:是一门交叉科学,它包含了生物信息的获取、加工、、分配、分析、解释等在内的所有(HGP,21、RFLP:用于分析相关多态性的技术。即用同一种限制性内切酶,完全酶切来源于同一物种不同的基DNA,DNA22、SNP:DNADNA的某一位点处的核苷酸,A、T、G、C都有可能出现而且概率均大于1%,称之。SNP最多四种,但人类组很大,平均每1000对就有一个。SNPDNA EST:从互补DNA(cDNA)分子所测得部分序列的短段DNA(通常300~500bp)。基本原理:蛋白质推测mRNA的序列,mRNA反转录为cDNA,然后利用其与所列进行杂交,鉴别出与转录有关的。组可由DNA组成,也可由RNA组成,但不能共存于同一。DNA:多数为双链(ds)、环状或线性;RNAmRNA。二、试述原核组结构与功能的特点色体。细菌DNA在胞内形成一个致密区域,即类核(nucleoid,类核无核膜将之与胞浆分开。结 无现象 在原核生物组中含有编码同工酶的在不同原核生物组中GC含量变化很大除细菌外,还有能自主的双链环状DNA分子,称为质粒。3、不存在子结构,功能相关分散在不同的上。都由一个结构与相关的调控区组成,转mRNA<103子使外显子拼接,才能形成成mRNA。7、功能相关的构成各种,它们可串联在一起,亦可相距很远,但即使串联在一起的成簇的也是分8、组中也存在一些可移动的遗传因素,这些DNA顺序并无明显生物学功能,似乎为自己的目的而组织,故有自私DNA之称,其移动多被RNA介导(如在哺乳动物及人类组中发现的逆转座子,也有被DNA介导的(如在果蝇DNA。四、试述人类组结构特点3、编码序列只占组总DNA量的5%以下,非编码区占95%以上,大量为重复序列。构建BAC克隆;限制性酶处理获得;根据方法组建BAC克隆群;根据STS标记,将BAC克隆群标定在物理图上;每个BAC克隆内部采用鸟枪法,组装;将BAC插入顺序与BAC克隆 群六、试述RNA研究领域有何新发现完全没有蛋白质的电子云存在。说明肽健的形成是由rRNA2、RNAФ29RNA(pRNA)装配成分子马达,依赖此分子马达的转动,将噬菌体DNA装入外壳。3、RNA具调控功能:①女性Xist编码不表达蛋白质的RNA,它与2条X中的一条结合,使其失活。②细胞时,DNA每一次,端粒DNA缩短点,直到端粒全部。此时细胞再也不能,。可说是端粒RNA,控制了细胞的和的发生。4、RNA调控遗传信息:通过"再编码"的方式或不同方式的RNA剪接,-种可在不同的发育分化阶段、不同的生理病理条件或不同的细胞、组织中合成不同的蛋白质。RNA编辑是以另一RNA为模板来修饰mRNA前体,可以给mRNA前6、RNA携带遗传信息:HIV(、丙肝(肝癌)等是RNA8、组研究中的“”可能是RNA七、试从结构特点及作用机制比较siRNA和miRNA的差异前 内源或外源长双链RNA诱导内源发夹环结构的转产 产结 双链分功 降解 八、试比较转录组和组的区别40%左右。代谢物的种类要远小于和蛋白的数目,每个生物体中代谢产物大103数量级,细菌组中几千导致代谢物的化学复杂性。技术难题:代谢组学中的主要技术难点在于分析物浓度的动态范围?(ml2)提高的倍数:是表示提纯方法有效的程度,比较每一步纯化的效率。纯化倍数是指提纯前后比之比,pH十二、试述酶测定中常用的对照方法。测定管中产物量须减去照管中产物量是正由酶促应所生的产物白管和照管易空管”“”。制剂与酶接触时间而增大。按照抑制剂对酶作用时选择性不同,又将不可逆的抑制剂分为专一性和非专一性的。Ks型不可逆抑制剂;是根据底物的结构设计的,具有和底物相似的结构,可和相应的酶结合,同时还带有一Kcat型不可逆抑制剂;是根据酶催化过程设计的,具有和底物相似的被酶结合和被酶催化反应的性质,还1、竞争性抑制剂(competitiveIESVmKm增大低,KmESISEII和E,Vm,Km一.表达调控的基本方式1、组成型表达(constitutivegene:组蛋白、核糖体蛋白、糖酵解酶(基原表答、基原;持续性、恒定表达诱导表达(induction):在特定环境因素下,激活蛋白被激活,表达产物水平增高的表达。阻遏表达(repression):在特定环境因素下,阻遏蛋白被激活,表达产物水平减少的表达。组突变:DNA调控序列突变,使适应性表达转变为组表达,这种突变称之。3(coordinate顺式调节:调控蛋白结合自身的DNA调控序列,调节自身的表达,为分子内调节方式,称为顺式(cis)反式调节:调控蛋白特异识别、结合另一的DNA调控序列,调节另一的开启和关闭,为分子间的调节二.乳糖子表达调控机制CAPGAC↓→cAMP↓→CAPGAC↑→cAMP↑→CAP↑→CAPCAPsite协调调节:低乳糖,低G:CAP能与CAPsite结合,促进表达,但阻遏蛋白与结合—不表达;低乳糖,高G:CAP与CAPsite结合少,基础表达,且阻遏蛋白与结合—不表达;高乳糖,高G:CAPCAPsite结合少,基础表达,阻遏蛋白与别乳糖结合——基础表达;高乳糖,低G:CAPCAPsitetrpO色氨酸浓度高:前导序列延长到终止子,核糖体通过1区,终止2区前,覆盖2区。不能形成2/3发夹结构。可以形成3/4发夹结构,转录终止。Trp结构不表达。色氨酸浓度低:前导序列翻译终止在Trp子核糖体不能覆盖2区形成2/3发夹结构,不能形成3/4发夹结构,转录不终止。Trp结构表达。四.顺式作用元件分类及其在真核表达调控中的作用::启动子转录起始点及其上游200bp。启动子元件:7~20bp。分为启动子、启动子上游元件UPE。前者结合通用转录因子和RNA聚合酶,决定转录起点。UPE与转录因子结合,调节启动子与通用转录因子的结合,影响RNA聚合酶作用,增强转录效率。::(enhancer点:序列长度:在100~200bp之间多个短序列组成:对碱基顺序有严格要求序列:8~12bp组成回文结构:部分序列的特征。间。③无定位(silncer淋巴细胞T抗原受体T淋巴细胞辅助受体CD4/CD8等③有些DNA序列既有增强子作用也有沉默子作用,(insulator没有正或负的调控作用。绝缘子增强子活性五.增强子及其结构和作用特点序列长度:100~200bp多个短序列组成:对碱基顺序有严格要求序列:8~12bp组成。回文结构:部分序列的特征。具有组织特异性或细胞特异性,一个可以受一个以上的增强子调控。基础转录因子:每一RNApol启动子都需要的调控蛋白,又称通用转录因子,参与RNApolⅡ转录的是通用转录Ⅱ(TFⅡ强子要求有不同的激活蛋白。激活蛋白与增强子结合的远距离作用:DNA链结构发生变化,或成环,使各种(coactivatorsa.活化蛋白(转录因子)结合;c.ATPATP,提供能量;甲基化程度与表达活性呈反比关系DNADNADNADNADNAH3-H4H3-H4八、siRNAmiRNAsiRNARNaseⅢ(DicerdsRNAsiRNAcomplexRISC5、RISC的解旋酶解开siRNA双链,靶mRNA与正义siRNA进行交换,与反义siRNA特异识别结合。RNAi有相当的效应,而且特异性更好,所需有效浓度更低。目前,体外合成的siRNA已成为研miRNA,属非蛋白质编码miRNA初级产物(pri-miRNA):发夹结构RNA前体(porin(p5双链):胞浆mRNA:RISC中miRNAmRNAmRNA⑶对信号转导分子与细胞信号转导SHSH:Src蛋白同源区,Src蛋白是src表达的1种膜蛋白,含3个SHSH1:Tyr22二、信号分子:cAMP、cGMP、DAG(二酰基甘油)、IP3(1,4,5Ca2+、NO。GGAC、AC-cAMP-PKA→G蛋白耦联受体→G蛋白→腺苷酸环化酶→cAMP→cAMP的蛋白激酶A→调控蛋白→转录PLC-IP3/DAG-PKCII三.参与酶偶联受体的酶有那些,介导哪些信号途径及其转导基本途径。 蛋白酪氨酸激酶受体信号传导途径EGF→TKR→Ras→MAPKJanus激酶(JAK-STAT途径) Ras受体酪氨酸激酶(RPTK)结合信号分子,形成二聚体,并发生自磷酸化而活化,活化的RPTKRAS,由活化的RAS引起蛋白激酶的磷酸化级联反应。RasGDPGTP的释放需要鸟苷酸交换因子(GEF,如Sos)SH3结构域,但没有SH2结构域,因此不能直接和受体结合,需要接头蛋白(如Grb2)的连接,接头蛋白SH2与受体的磷酸酪氨酸残基结合,再通过SH3SosSosRas接触,从而活化RasRasGTPGTP酶活化蛋白(GAP)的参与,使RasGTP水解而失活,GAPSH2结构域可直接与活化的受体结合。RasRafN端结构域结合并使其激活,Raf是丝氨酸/苏氨酸(Ser/Thr)蛋白激酶(又称活化的Raf结合并磷酸化另一种蛋白激酶MAPKK,使其活化。MAPKKMAPK的苏氨酸和酪氨酸残基使之激活。MAPK为有 原活化蛋白激酶(mitogen-activatedproteinkinase,MAPK),属丝氨酸/苏氨酸残激酶。活化的MAPK进入细胞核,可使许多转录因子活化,如将Elk-1激活,促进c-fos,c-jun的表达。RPTK-Ras信号通路可概括如下:配体→RPTK→adaptor→GEF→Ras→Raf(配体→RPTK→adaptor→GEF→Ras→Raf(MAPKKK)→MAPKK→MAPK表JAK-STATJAK:JAKTyrJAKTyr,STATSTATJAKSTATTyrTGF-βTβR-Ⅱ结丝氨酸/苏氨酸磷酸化而使TβR-Ⅰ激活,活化的SmadDNA上的Smad结合元件结合,激活特定的靶基因。Smad6和Smad7通过Smad2和Smad3Smads转录复合物的形成来抑制TGF-β 进行等电聚焦(IEF),再在第一向垂直方向上进行第二向SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS)。10~100kD分子量的蛋白质;高灵敏度和高分辨率;便于计算机进行图像分析处理;与质MS/MS电泳CE。(M+能提供的信息:12、分子式(样品的元素组成)345、人机回答,三个基本因素:1、在噬菌体PⅢ和PⅧ衣壳蛋白N端插入外源待筛编码的蛋白,形成的融合蛋白表达在噬菌体菌体的表面,其编码、可通过分泌型噬菌体的单链DNA推导出来蛋白文库4、改造和提高蛋白质的生物学和免疫学特性5、研究新型多肽药物、和抗体6、研究涉及到蛋(三胞裂解液过柱,先用低盐溶液洗脱下未结合的蛋白质,然后用高盐溶液或SDS溶液洗脱结合在柱子上的蛋白一.简述技术的概念和主要特点DNA二.试述生物制作方法和分析过程。制作方法:光刻DNA三.简述的优缺点和主要应用领域。传统方法检测众多要经历多次实验而且自动化程度低,因而每次实验之间是存在系统误差的可以克。表达检测拟南芥、酵母表达研究等DNA序列测定人类组计划、杂交等药物筛选在水平上寻找药物靶标等文库作图通过确定克隆的次序从而对酵母组进行作图。四试述原位光蚀刻合成技术 在合成碱基单体的5'羟基末端连上一个光敏保护5'端保护的核苷酸单体连接上去,这个五试述应用Geospiza对表达谱进行数据挖掘的主要流程输入http: 4,QuickLoadWizard、AdvancedUploadMetho
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