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文档简介
第三章第二节基因工程载体第1页,共29页,2023年,2月20日,星期一质粒载体
一、质粒的一般生物学特性二、质粒DNA的分离与纯化三、质粒载体的构建及类型四、常用质粒载体举例第2页,共29页,2023年,2月20日,星期一一、质粒的一般生物学特性(一)、质粒DNA1、质粒是细菌染色体外能够自主复制的环形双链的DNA分子。2、质粒DNA分子可以持续稳定地处于染色体外地游离状态,但在一定地条件下又会可逆地整合到寄主染色体上,随着染色体地复制而复制,并通过细胞分裂传递到后代。3、质粒DNA不仅能在细菌中复制,并且在添加真核复制信号和启动子后,可以构建出能在原核和真核细胞中均可复制的穿梭质粒,并在真核细胞中表达,因此这类载体在基因工程中应用广泛。4、环形双链的质粒DNA分子具有三种不同的构型:共价闭合环状DNA(cccDNA),开环DNA(ocDNA),线性DNA(cDNA),具有不同的电泳迁移率,可在琼脂糖凝胶电泳中分开。第3页,共29页,2023年,2月20日,星期一第4页,共29页,2023年,2月20日,星期一(二)、质粒的拷贝数与不亲和性1、质粒的拷贝数是指某种质粒在一个细菌细胞内的数目。根据每个寄主细胞中质粒拷贝数的多少,把质粒分为严紧型复制质粒(拷贝数少,为1-5个)与松弛型复制质粒(拷贝数多,可达10-200份拷贝)。因此,作为载体的质粒应该是松弛型的。2、质粒的不亲和性,有时也称为不相容性,是指在没有选择压力的情况下,两种亲缘关系密切的不同质粒,不能够在同一个寄主细胞系中稳定地共存的现象。在细胞的增殖构成中,其中必然有一种会被逐渐地排斥(稀释)掉。这样的两种质粒称为不亲和质粒。第5页,共29页,2023年,2月20日,星期一二质粒DNA的分离与纯化常规的方法:煮沸裂解法SDS裂解法碱裂解法第6页,共29页,2023年,2月20日,星期一三、质粒载体的构建及类型(一)质粒载体的发展概况;(二)质粒载体的特点(基本条件);(三)遗传标记基因(四)质粒载体的类型第7页,共29页,2023年,2月20日,星期一(一)发展概况
1.
第一阶段(1977年前):天然质粒和重组质粒的利用,如pSC101,colE1,pCR,pBR313和pBR322(1977,Bolivaretal)
2.
第二阶段:增大载体容量(降低载体长度),建立多克隆位点区和新的遗传标记基因。如pUC系列载体。
3.第三阶段:进一步完善载体功能以满足基因工程克隆中的不同要求,如M13mp系列载体,含T3,T7,sp6启动子载体,表达型载体及各种探针型载体。
第8页,共29页,2023年,2月20日,星期一(二)载体特点1、至少有一个复制起点2、
至少应有一个克隆位点。3、
至少应有一个遗传标记基因,以指示载体或重组DNA分子是否进入宿主细胞。4、具有较小的分子量和较高的拷贝数。注:前三个特点必不可少。第9页,共29页,2023年,2月20日,星期一(三)遗传标记基因1、标记基因的作用
1)指示外源DNA分子(载体或重组分子)是否进入宿主细胞这种指示可以是选择性的(Ampr
,Tetr
,Kanr),也可以是非选择性的(如lacZ)
2)指示外源DNA分子是否插入载体分子形成了重组子。*这种指示也可以是选择性的(如TcS),也可以是非选择性的(如TcS,
lacZα),绝大多数为后者。
**有的遗传标记基因可以完成上述两项作用。当充任第一作用时,最好是选择性标记基因;当完成第二作用时,目前多采用非选择性的—检测性标记基因。有的基因是不能用作选择性标记基因(lacZ等)。第10页,共29页,2023年,2月20日,星期一2、
标记基因的种类
1)抗性标记基因(可直接用于选择转化子)主要是抗生素抗性基因:Ampr
,Tetr
,Cmlr,Kanr,Strr2)生化标记基因
其表达产物可催化某些易检测的生化反应,如lacZ3、常用的遗传标记基因及其作用机制
1)四环素抗性基因(Tetr
,Tcr)
Tetracycline可结合在核糖体30s亚基中的一种蛋白质分子上,抑制核糖体的转位过程。四环素抗性基因编码一种399AAs蛋白质,与细菌细胞膜结合,阻止四环素分子进入细菌细胞。
2)氨苄青霉素抗性基因(Ampr
,Apr)
Ampicillin可抑制细菌细胞膜上参与细胞壁合成酶类的活性。Apr抗性基因编码一种分泌到细菌细胞周间质的酶,可特异地切割氨苄青霉素的β—内酰胺环,使氨苄青霉素失活。第11页,共29页,2023年,2月20日,星期一3)氯霉素抗性基因(Cmlr
,Cmr)
Chlorophenicol可结合在核糖体50S亚基上,阻止蛋白质合成。Cmr基因编码氯霉素乙酰转移酶,使氯霉素乙酰化,导致乙酰化的氯霉素不能结合在核糖体上。4)卡那霉素(Kanr),新霉素(Neor)和G418抗性(G418r)基因
Kanamycin,Neomycin和G418均属脱氧链霉胺氨基葡萄糖苷类抗生素,可结合在核糖体上阻止蛋白质的合成。Kanr等抗性基因均可使这类抗生素磷酸化,使之不能进入细胞内。第12页,共29页,2023年,2月20日,星期一5)β—半乳糖苷酶基因(lacZ和lacZα)
β—半乳糖苷酶基因有1021AAs,基因产物装配为四聚体后才有酶活。该蛋白质可分为两部分:α链和β链。前者负责四聚体装配,后者具β—半乳糖苷酶活性;只有当两者都存在时,才会表现出酶活性,该作用称之为α-互补作用。这两个部分可独立存在,分别由两个基因编码。为α链编码的基因称之为lacZα(编码145AAs)。这两个基因(LacZ和LacZα)均可作为标记基因。
lacZ(lacZα)中含有多克隆位点,当无外源DNA片段插入时,质粒表达β—半乳糖苷酶的α-肽,与缺失突变体宿主菌(不能编码α-肽)表达的lacZ基因产物(β链)互补,产生有活性的β—半乳糖苷酶,在含有指示剂X-gal和诱导剂IPTG的存在下,菌落呈现兰色;外源基因的插入后,破坏了lacZα-肽基因的结构,细菌内不能产生β—半乳糖苷酶活性,菌落呈白色。β—半乳糖苷酶基因的优点:
a.
酶催化X-Gal水解为兰色产物,检测直观
b.
lacZα编码5‘-端可容许很大的变化(如加入多克隆位点)而不影响酶活性
c.lacZα和β链基因的分别表达可使载体小而容量大第13页,共29页,2023年,2月20日,星期一
PLacZαLacZβ
转录
翻译
αβLacZ基因的结构与产物pUC18BamHI片段重组DNA分子转化E.coli
外源DNABamHI片段
涂布在含X-Gal和Ap的平板上,白色菌落为重组子,兰色菌落为原载体利用LacZ基因筛选重组子第14页,共29页,2023年,2月20日,星期一(四)、质粒载体的类型1、根据载体的分子生物学特性划分
(1).
质粒型载体:
环状dsDNA分子,自主复制(2).
病毒型载体:
环状、线状、ss-和ds-DNA分子,形成病毒颗粒(3).混合型载体:
具质粒和病毒特性,特性的转换依赖于宿主细胞生物学特性
第15页,共29页,2023年,2月20日,星期一2、根据载体功能划分
(1).普通型载体
(1)特点:至少有一个以上的克隆位点和两个标记基因,其中一个用于转化体选择,另一个用于重组子检测。
(2)用途:基因组或cDNA文库的构建;亚克隆(subcloning)或限制酶谱分析;外源DNA扩增。例子:pBR322和pUC载体。
上述两例中的非重组子来源有两个:
a.
酶切反应时仍未被作用的pBR322或pUC18分子
b.酶切后的载体分子经自我连接又形成载体分子第16页,共29页,2023年,2月20日,星期一普通型载体pBR322的结构图第17页,共29页,2023年,2月20日,星期一pUC18和pUC19载体第18页,共29页,2023年,2月20日,星期一(2)、表达型载体(expressionvector)
1)
特点:
a.
基因的启动子序列和终止子序列;
b.
一般无检测标记基因;
c.
克隆位点是确定的(即位于启动子序列后);
d.
重组分子用凝胶电泳检出(依赖于分子量差异)。
2)
结构:
a.
转化单元--宿主细胞转化
b.
表达单元--外源基因表达
3)类型:
Ⅰ型:转录起始区(调控序列+启动子)+终止子
Ⅱ型:转录起始区+翻译起始区(核糖体结合序列和起始密码子)+终止子
Ⅲ型:转录起始区+翻译起始区+信号肽链编码区+终止子(常称之为表达分泌型载体)第19页,共29页,2023年,2月20日,星期一
显然,不同类型载体中所缺少的部分必须由外源基因提供。换言之,被表达的外源基因一旦确定,表达载体的类型也就确定了。
4)用途:a.
表达外源基因以产生大量外源基因产物
b.
用于构建cDNA文库第20页,共29页,2023年,2月20日,星期一三种表达型载体结构图第21页,共29页,2023年,2月20日,星期一四、常用质粒载体举例1、pBR322载体2、pUC载体第22页,共29页,2023年,2月20日,星期一1、pBR322载体优点:1、分子量较小,为4363bp。2、具有两种抗菌素抗性基因可供转化子的选择记号。3、具有较高的拷贝数,经过氯霉素扩增后,每个细胞中可累积1000-3000个拷贝,为重组体DNA的制备提供了极大的方便。第23页,共29页,2023年,2月20日,星期一
BamHI片段(Tcr)
pBR322PstI(Apr)片段
重组分子I
重组分子Ⅱ(ApsTcr)(AprTcs)
PstI片段
外源DNABamHI片段重组分子I
涂布Ap平板
Apr转化子
分别转化E.coli(ApSTcS)重组分子Ⅱ涂布Tc平板Tcr转化子影印到Tc平板上AprTcS为重组子AprTcr为原载体
影印到Ap平板上ApSTcr为重组子即为非重组子利用抗生素抗性基因筛选重组子的过程第24页,共29页,2023年,2月20日,星期一2、pUC18和pUC19
pUC系列质粒载体具有三个显著特点:(1)、分子量更小,仅为2.7KB,容纳外源DNA量增大;具有更高的拷贝数(不用氯霉素扩增,每个细胞含500-700个拷贝)。(2)、含易于检测是否有外源DNA插入的标记基因LacZα,可利用-互补原理进行蓝白筛选。(3)、多克隆位点区(MCS)由人工合成的多个单一酶切位点构成。每一种限制性内切酶会产生不同的粘性末端,可选用两种内切酶组合在质粒载体和外源DNA上产生相同的末端,进行双粘端连接,既提高克隆的效率,又可以定向克隆。其MCS区与M13mp噬菌体载体的相同,可使pUC上克隆的目的基因直接转移到M13mp载体,进行DNA测序和体外突变等研究。第25页,共29页,2023年,2月20日,星期一pUC18和pUC19载体第26页,共29页,2023年,2月20日,星期一分子克隆载体的选择1.选择克隆载体的几个重要参数(1)实验对象(2)实验性质(3)载体容量(4)合适克隆位点(5)载体的稳定性(6)载体DNA制备的难易(7)外源基因表达产物产量、产物特点等
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