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文档简介
第六章
真核生物的遗传分析基因组(genome)是指一个细胞中遗传物质的总量。核型(Karyotype)C值(Cvalue)原核基因组含有大量(unique-sequences),仅有少量的重复顺序。
真核基因组含少量和大量重复顺序。原核生物的细胞中除了主染色体以外,还含有各种质粒和转座因子。真核生物除了核染色体以外,还存在细胞器DNA。
第一节
原核生物基因组的结构特点E.coli2.4×109Da,42000Kb(1300微米),闭合环状,约编码2000个基因。类核(nucleoid)。支架(scafford)100个DNA环组成,每个环长40Kb,13微米。每200bp就有一个负超螺旋(=0.05),即基因组中含5%的负超螺旋。超螺旋以两种状态存在:(1)自由状态的超螺旋,可在环内传递张力。(2)超螺旋受到束缚,不能传递张力。表10-1
E.coli含有的各种DNA结合蛋白蛋白结构功能含量/每细胞相当于其核蛋白基因HUα和β亚基,每个9KD使DNA压缩、类核凝聚,刺激复制,和1HF有关4万个二聚体H2BhupA.BH两个相同亚基,各28KD促使双链的互补、复性3万个二聚体H2A?IHFα:10.5KD;β:9.5KD有助于att位点配对重组??himA.D.H1(H-NS)15KD亚基和DNA结合,与DNA拓扑结构有关1万?osZbglYpilGHLP117KD单体?2万?firAP3KD亚基??鱼精蛋白(DNA结合蛋白)?
二
重叠基因(overlappinggene)
莲人在绿杨津采一玉漱声歌新阙
采莲人在绿杨津,在绿杨津一阙新;一阙新歌声漱玉,歌声漱玉采莲人。1977年Sanger首先发现重叠基因他对单链环状的噬菌体X174进行了测序。5386Nt11基因,3个转录单位,由3个启动子(pA,pB,pD)启动。X174含有的5386Nt最多能编码1795个氨基酸,若每个氨基酸的平均分子量为110,则总的蛋白质分子量为197,000Da,但实际蛋白质总分子量却为262,000D。将全部DNA顺序和蛋白质的氨基酸顺序进行比较,发现了重叠基因重复基因OverlappingGenes三.质粒(plasmid)1.抗性质粒(Resistance(R)plasmids):2.
致育因子(Fertility(F)plasmids)3.
Col质粒:有编码大肠杆菌素(colicins)基因。4.
降解质粒(degradativeplasmids)。这种质粒编码一种特殊蛋白,可使宿主菌代谢特殊的分子,如甲苯或水杨酸。5.
侵入性质粒(virulenceplasmids)。这些质。如Ti
质粒,此是在根癌农杆菌(Agrobacterium
tumefaciens)中发现的
RenatoDulbecco于1986年首先提出了“人类基因组计划”,原计划约10-15年完成,耗资30亿美元,其宏伟的程度堪与Manhatto原子弹计划和Appolo登月计划相提并论。
1990年开始实施1999破译出人类第22号染色体的遗传密码。2000完成了人类第21号染色体的测序。预计从原定的2003年6月提前到2001年6月完成。2000年6月26日美,英,日,德,法,中六国共同宣布人类基因组工作草图绘制成功。2000年3月塞莱拉公司宣布完成了果蝇的基因组测序。12月14日英美等国科学家宣布绘出拟南芥基因组的完整图谱。这是人类首次全部破译一种植物的基因序列。2001年:1、2月,HGP和美国塞莱拉(Sequencing)公司将各自测定的人类基因组工作框架图分别发表在Nature和Science上,这表明人类基因组计划(HGP)进入了一个展新的阶段。2000,4,5:以杨焕明为首的中国科学家在Science发表了水稻全基因组框架序列图。基因总数:46022~55615,约为人类的2倍;其中10000个基因的功能已确定;水稻的“垃圾”序列多位于基因外,人类的“垃圾”序列多位于基因内;水稻的基因平均长度为4500bp,人类基因平均长度为72000bp,拟南芥约有25000个基因,80%在水稻中都存在,二者之间有关信号传导的基因差别最大第三节
单一顺序和重复顺序一.单一顺序(Uniquesequence)二.重复顺序短片段的重复顺序可分为三种类型:(1)正向重复(directrepeats)又叫顺向重复;(2)反向重复(invertedrepeats);(3)回文顺序(Palindromicsequence)5‘GTGAGCTCAC3’3’CACTCGAGTG5’
画上荷花和尚画书临汉字翰林书三.
轻度重复顺序和中度重复顺序轻度重复顺序在基因组中含有2-10拷贝,酵母tRNA基因、人和小鼠的珠蛋白基因等。中度重复顺序长约300bp基因组中约有10-几千个拷贝的顺序如rRNA和tRNA基因tRNA基因一般都分布于基因组中,而rRNA常集中分布于核仁形成区。
AluI30bpAlu序列五.高度重复顺序
卫星DNA(satelliteDNA)隐蔽卫星DNA(crypticsatellite)自私DNA(selfishDNA)伊甸园DNA(GardenofEdenDNA)小卫星(minisatellite)重复序列可变数(variablenumbertandemrepeatVNTRs)DNA指纹(DNAfingerprints)
L1家族
长6500bp左右称为长的分散因子(longinterspersedelements,LINEs)在基因组中约6万个拷贝由RNA多聚酶II转录的。属于一种转座因子基因簇(genecluster)基因家族(genefamily)假基因(pseudogene)加工假基因(processedpseudogenes)。有以下的特点:⑴缺少正常的内含子;⑵3’末端有多聚腺苷酸;⑶5’端的结构和mRNA的5’端十分相似;⑷两侧有顺向重复顺序的存在。
对以上特点作何推论?因此人们推测它似乎和mRNA一样经过了转录后加工,因此也称其为加工假基因;第四节 C-值矛盾C值矛盾(C-valueparadox)可能产生的原因是什麽?第五节
断裂基因
间隔顺序(spacer)
间插顺序(interveningsequence)
内含子(intron)等一
内含子的发现1977[美]Sharp&Roberts同时发现了断裂基因(splitgene)[法]Chambon失机鸡的输卵管分泌卵清蛋白、卵粘蛋白和伴清蛋白,而其红细胞(鸟类的红细胞上有核的)只合成血红蛋白,那么两种组织之间DNA有什么不同呢?
southern杂交Berget,Sharp小组和Roberts小组用R环法DNA和mRNA之间形成特殊的RNA-DNA异源双链分子结构断裂基因SplitGenes二.内含子的结构特点
(一)内含子和外显子的分布(二)内含子的相对性经过删除和连接,除去无关的DNA间序(即内含子),便形成了成熟的mRNA分子断裂基因SplitGenes三.
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